FuNGI

A0A364LCZ4

Protein Details

Accession

A0A364LCZ4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MASDKVEKKRKRDSDRHERPSKKPAIQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
8-23	KKRKRDSDRHERPSKK
319-322	RGKG

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, mito_nucl 12, mito 5.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MASDKVEKKRKRDSDRHERPSKKPAIQAQDLPPLTASVLKDDNELAPVLINAPGLQFPKKLHGFKPYTKESTTKKASSGRNKGIVSTELLLQSSEHPVLDFIGTEATEDADSQLKHYVAIVDPDQKTWQFVEVRRMTLRSSVKKHNKEVAEDDESDYETAAYRDQRKALTEAFGTKASRKAAQSEAENSMLAPAGATGAIESAILSSMPAQGIATANLKAQELQAQVQANKPIPTANLSATHPSEVYTLESLVAGGVSTLNQMPTQEWQDAVNAGEAITSTSRYVAHRVDAVVKSTNVTHLQVLRYILALIELSKNIKRGKGSDPPGSKRIPLRADLKKVLSGGSSATALLPDPVVEAIRRKYAPGGVMVAHNITLLHTTLCALSLHIPPAPAKDGGTSSLGGNTPTELATDPSDLRDDLRLDTTTVTQYFRELGCRSDKPRESEFAKFGIKTKAEAANRRVCKLRLPLDFPKVSRGGGPRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.86
2	0.91
3	0.93
4	0.93
5	0.9
6	0.86
7	0.86
8	0.85
9	0.8
10	0.77
11	0.75
12	0.74
13	0.72
14	0.73
15	0.68
16	0.69
17	0.62
18	0.54
19	0.46
20	0.37
21	0.31
22	0.27
23	0.21
24	0.16
25	0.19
26	0.19
27	0.2
28	0.21
29	0.21
30	0.19
31	0.18
32	0.14
33	0.11
34	0.11
35	0.1
36	0.1
37	0.09
38	0.07
39	0.08
40	0.11
41	0.13
42	0.15
43	0.17
44	0.18
45	0.27
46	0.34
47	0.38
48	0.39
49	0.47
50	0.53
51	0.58
52	0.65
53	0.64
54	0.62
55	0.6
56	0.63
57	0.59
58	0.61
59	0.61
60	0.55
61	0.52
62	0.55
63	0.62
64	0.66
65	0.7
66	0.68
67	0.68
68	0.66
69	0.62
70	0.57
71	0.49
72	0.41
73	0.32
74	0.27
75	0.2
76	0.2
77	0.18
78	0.15
79	0.15
80	0.16
81	0.15
82	0.12
83	0.11
84	0.11
85	0.12
86	0.12
87	0.1
88	0.07
89	0.07
90	0.07
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.07
96	0.08
97	0.1
98	0.1
99	0.11
100	0.15
101	0.14
102	0.14
103	0.14
104	0.15
105	0.12
106	0.16
107	0.17
108	0.21
109	0.22
110	0.23
111	0.25
112	0.23
113	0.24
114	0.21
115	0.24
116	0.21
117	0.24
118	0.33
119	0.34
120	0.37
121	0.37
122	0.38
123	0.34
124	0.36
125	0.41
126	0.39
127	0.43
128	0.5
129	0.58
130	0.65
131	0.7
132	0.7
133	0.65
134	0.61
135	0.59
136	0.55
137	0.49
138	0.43
139	0.38
140	0.31
141	0.29
142	0.24
143	0.19
144	0.13
145	0.09
146	0.08
147	0.09
148	0.12
149	0.16
150	0.19
151	0.21
152	0.23
153	0.24
154	0.27
155	0.26
156	0.24
157	0.21
158	0.21
159	0.21
160	0.22
161	0.21
162	0.2
163	0.22
164	0.21
165	0.24
166	0.22
167	0.23
168	0.25
169	0.27
170	0.28
171	0.28
172	0.29
173	0.26
174	0.25
175	0.21
176	0.18
177	0.14
178	0.11
179	0.07
180	0.04
181	0.03
182	0.03
183	0.03
184	0.03
185	0.03
186	0.03
187	0.03
188	0.03
189	0.03
190	0.03
191	0.03
192	0.03
193	0.03
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.05
199	0.05
200	0.07
201	0.08
202	0.07
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.11
209	0.11
210	0.11
211	0.14
212	0.14
213	0.15
214	0.17
215	0.19
216	0.17
217	0.17
218	0.16
219	0.14
220	0.13
221	0.15
222	0.14
223	0.13
224	0.14
225	0.14
226	0.17
227	0.16
228	0.16
229	0.13
230	0.13
231	0.12
232	0.1
233	0.1
234	0.08
235	0.07
236	0.07
237	0.07
238	0.06
239	0.05
240	0.04
241	0.03
242	0.03
243	0.03
244	0.02
245	0.03
246	0.04
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.06
251	0.08
252	0.1
253	0.1
254	0.1
255	0.1
256	0.11
257	0.11
258	0.11
259	0.09
260	0.07
261	0.06
262	0.06
263	0.05
264	0.06
265	0.05
266	0.05
267	0.05
268	0.06
269	0.07
270	0.08
271	0.12
272	0.12
273	0.13
274	0.13
275	0.14
276	0.19
277	0.18
278	0.2
279	0.18
280	0.18
281	0.17
282	0.16
283	0.18
284	0.14
285	0.15
286	0.14
287	0.15
288	0.16
289	0.17
290	0.17
291	0.15
292	0.13
293	0.12
294	0.1
295	0.08
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.09
301	0.1
302	0.15
303	0.16
304	0.19
305	0.2
306	0.23
307	0.29
308	0.36
309	0.4
310	0.45
311	0.51
312	0.53
313	0.56
314	0.54
315	0.51
316	0.46
317	0.47
318	0.41
319	0.39
320	0.43
321	0.45
322	0.51
323	0.52
324	0.5
325	0.44
326	0.42
327	0.37
328	0.29
329	0.22
330	0.16
331	0.12
332	0.1
333	0.08
334	0.08
335	0.07
336	0.07
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.05
341	0.05
342	0.06
343	0.07
344	0.11
345	0.13
346	0.18
347	0.19
348	0.19
349	0.21
350	0.23
351	0.24
352	0.22
353	0.22
354	0.17
355	0.18
356	0.18
357	0.16
358	0.13
359	0.12
360	0.09
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.06
366	0.07
367	0.07
368	0.08
369	0.08
370	0.07
371	0.11
372	0.13
373	0.15
374	0.15
375	0.16
376	0.16
377	0.19
378	0.2
379	0.17
380	0.16
381	0.16
382	0.17
383	0.18
384	0.19
385	0.17
386	0.14
387	0.17
388	0.17
389	0.15
390	0.14
391	0.13
392	0.12
393	0.11
394	0.11
395	0.09
396	0.1
397	0.12
398	0.14
399	0.14
400	0.15
401	0.16
402	0.16
403	0.16
404	0.19
405	0.18
406	0.18
407	0.21
408	0.2
409	0.19
410	0.21
411	0.21
412	0.22
413	0.22
414	0.21
415	0.18
416	0.19
417	0.21
418	0.2
419	0.24
420	0.21
421	0.23
422	0.3
423	0.36
424	0.41
425	0.48
426	0.53
427	0.54
428	0.58
429	0.61
430	0.58
431	0.58
432	0.56
433	0.51
434	0.5
435	0.45
436	0.44
437	0.45
438	0.42
439	0.36
440	0.39
441	0.42
442	0.44
443	0.51
444	0.55
445	0.57
446	0.6
447	0.62
448	0.63
449	0.55
450	0.56
451	0.57
452	0.58
453	0.57
454	0.61
455	0.65
456	0.68
457	0.73
458	0.66
459	0.64
460	0.57
461	0.49
462	0.47

A0A364LCZ4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer