FuNGI

A0A364LCW5

Protein Details

Accession

A0A364LCW5

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
329-349	GGTPIRKKKRKGALTNPSAYS	Hydrophilic
440-468	LSGWQDRSKQAKRKGAKGKRGKNGNEVLG	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
334-339	RKKKRK
447-461	SKQAKRKGAKGKRGK

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPPRRWIDKKNATTYQLFHRSQQDPLIHDPTAEDRVLHPVYGPKQGAPTLSTTASSASHKTSRHLKELEDEFSTQNVRKNEGEAANYGIYYDDSKYDYMQHLRELGTAGGNSYFVEAAAEKAKGKGKAMKLEDALRDFSIDDSQSEFGGAASVYGSQYNPSTASSYVRKPTYQDQQNVPDAIAGFQPNMDPRLREALEALEDEAFVDDEDDQDIFGELTRNAEEVDAGEFEDTLYEDEDDGWESDATEKAYPQTSDAKTTIDKEAQEHDPSEMPDHDKPVPDLAPENSDWMREFAKFKKEGKSSDNTPAANPDAGTEKHTVASTMFTVGGTPIRKKKRKGALTNPSAYSMTSSALARTEGHRLLDDRFEKVEALYALDEEGEYDDASFADGASMISGMTGATGMTGMSAASSQAPSMVSRGDYGDVPLRSDFDNVMDDFLSGWQDRSKQAKRKGAKGKRGKNGNEVLGIAMLDEVRSGLGPARLPARGKA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.67
2	0.66
3	0.65
4	0.57
5	0.52
6	0.54
7	0.51
8	0.5
9	0.54
10	0.48
11	0.42
12	0.47
13	0.48
14	0.39
15	0.37
16	0.35
17	0.32
18	0.31
19	0.27
20	0.21
21	0.17
22	0.25
23	0.25
24	0.23
25	0.21
26	0.24
27	0.27
28	0.34
29	0.34
30	0.28
31	0.31
32	0.33
33	0.33
34	0.28
35	0.28
36	0.24
37	0.23
38	0.22
39	0.19
40	0.19
41	0.2
42	0.2
43	0.19
44	0.21
45	0.25
46	0.26
47	0.31
48	0.4
49	0.43
50	0.49
51	0.49
52	0.45
53	0.49
54	0.53
55	0.51
56	0.44
57	0.4
58	0.32
59	0.32
60	0.34
61	0.27
62	0.28
63	0.26
64	0.28
65	0.27
66	0.28
67	0.33
68	0.33
69	0.33
70	0.28
71	0.3
72	0.26
73	0.25
74	0.23
75	0.16
76	0.13
77	0.12
78	0.12
79	0.1
80	0.11
81	0.12
82	0.13
83	0.16
84	0.2
85	0.23
86	0.24
87	0.24
88	0.25
89	0.25
90	0.25
91	0.23
92	0.19
93	0.16
94	0.14
95	0.13
96	0.1
97	0.1
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.06
102	0.07
103	0.06
104	0.08
105	0.1
106	0.11
107	0.11
108	0.14
109	0.19
110	0.2
111	0.23
112	0.29
113	0.32
114	0.4
115	0.43
116	0.44
117	0.43
118	0.46
119	0.46
120	0.41
121	0.38
122	0.29
123	0.26
124	0.21
125	0.19
126	0.16
127	0.13
128	0.11
129	0.11
130	0.12
131	0.11
132	0.11
133	0.1
134	0.08
135	0.08
136	0.07
137	0.05
138	0.04
139	0.05
140	0.05
141	0.06
142	0.06
143	0.06
144	0.07
145	0.08
146	0.08
147	0.09
148	0.1
149	0.1
150	0.15
151	0.17
152	0.21
153	0.26
154	0.28
155	0.28
156	0.29
157	0.35
158	0.41
159	0.45
160	0.46
161	0.46
162	0.5
163	0.52
164	0.49
165	0.42
166	0.33
167	0.26
168	0.21
169	0.17
170	0.11
171	0.08
172	0.08
173	0.08
174	0.08
175	0.11
176	0.11
177	0.1
178	0.11
179	0.18
180	0.18
181	0.17
182	0.17
183	0.16
184	0.16
185	0.16
186	0.15
187	0.08
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.04
196	0.04
197	0.04
198	0.04
199	0.04
200	0.04
201	0.04
202	0.04
203	0.06
204	0.05
205	0.06
206	0.07
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.06
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.05
217	0.05
218	0.05
219	0.04
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.04
224	0.04
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.06
229	0.05
230	0.05
231	0.06
232	0.07
233	0.08
234	0.07
235	0.07
236	0.08
237	0.1
238	0.1
239	0.11
240	0.17
241	0.17
242	0.2
243	0.21
244	0.21
245	0.21
246	0.23
247	0.23
248	0.18
249	0.18
250	0.16
251	0.2
252	0.21
253	0.21
254	0.19
255	0.18
256	0.17
257	0.17
258	0.17
259	0.15
260	0.16
261	0.15
262	0.18
263	0.18
264	0.18
265	0.18
266	0.19
267	0.18
268	0.15
269	0.16
270	0.13
271	0.15
272	0.14
273	0.17
274	0.14
275	0.15
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.13
280	0.17
281	0.18
282	0.25
283	0.3
284	0.32
285	0.4
286	0.43
287	0.45
288	0.47
289	0.49
290	0.45
291	0.49
292	0.5
293	0.42
294	0.38
295	0.37
296	0.33
297	0.27
298	0.23
299	0.15
300	0.14
301	0.14
302	0.17
303	0.16
304	0.15
305	0.16
306	0.16
307	0.15
308	0.12
309	0.13
310	0.1
311	0.09
312	0.09
313	0.08
314	0.08
315	0.08
316	0.11
317	0.12
318	0.17
319	0.24
320	0.35
321	0.42
322	0.47
323	0.56
324	0.62
325	0.7
326	0.76
327	0.78
328	0.79
329	0.8
330	0.81
331	0.73
332	0.64
333	0.54
334	0.44
335	0.35
336	0.25
337	0.17
338	0.13
339	0.12
340	0.1
341	0.11
342	0.12
343	0.11
344	0.12
345	0.17
346	0.16
347	0.17
348	0.18
349	0.19
350	0.2
351	0.27
352	0.27
353	0.24
354	0.24
355	0.24
356	0.22
357	0.21
358	0.22
359	0.15
360	0.15
361	0.12
362	0.11
363	0.11
364	0.1
365	0.1
366	0.06
367	0.07
368	0.06
369	0.06
370	0.06
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.06
375	0.05
376	0.04
377	0.05
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.03
385	0.03
386	0.03
387	0.03
388	0.03
389	0.03
390	0.03
391	0.03
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.04
397	0.05
398	0.06
399	0.06
400	0.07
401	0.08
402	0.08
403	0.1
404	0.11
405	0.1
406	0.11
407	0.13
408	0.13
409	0.13
410	0.15
411	0.21
412	0.2
413	0.21
414	0.21
415	0.21
416	0.2
417	0.21
418	0.19
419	0.14
420	0.18
421	0.16
422	0.17
423	0.15
424	0.14
425	0.13
426	0.14
427	0.15
428	0.11
429	0.12
430	0.14
431	0.17
432	0.23
433	0.32
434	0.41
435	0.48
436	0.57
437	0.66
438	0.7
439	0.78
440	0.83
441	0.84
442	0.85
443	0.87
444	0.87
445	0.87
446	0.9
447	0.85
448	0.83
449	0.8
450	0.74
451	0.65
452	0.56
453	0.47
454	0.37
455	0.31
456	0.22
457	0.14
458	0.1
459	0.07
460	0.06
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.06
465	0.09
466	0.12
467	0.13
468	0.16
469	0.2
470	0.24

A0A364LCW5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer