Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CIH8

Protein Details
Accession A1CIH8    Localization Confidence High Confidence Score 18.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
383-404TELDRARPSRGRKRHYDDSSFVHydrophilic
419-445FYSNSEGIGKKKRKKDHVSKVSTPLPDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
428-433KKKRKK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013942  Mediator_Med19_fun  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG act:ACLA_051550  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08633  Rox3  
Amino Acid Sequences MSDCASSASFRVGPPSPSSPASGSLKEDHPPYISSENIPQTPTSPPLMSVSAQNYATNITSSQPPSQATSQPANLSSPPSSAPMSTQTSQQPTVGMATSFPTPASSVSGHFMGPTSGEDSEQAEKAFGHARADTGTNSGTDMSAASTQQSEHRRTDHDRDLATSTSDIGIRDFANMDHQIARSDTDAMDIDKDTGASSNPNGLSLESLQQDFSSAFHLCKSSYVATGPDPTLDLISLYGLGPVAKSVARLDPNTGEKINRLRKSYEGKLKGLGLAGRNKPVKHEPNMPGGLRHLTMWPEEEWYNQKVYGKDIKVADMESALQNLQMKAMQMEPGTVPNNDYWEDVLGHEKPSKHVGHSDGKKASVPPNGPRAVSQSNGTPVPTELDRARPSRGRKRHYDDSSFVGYGEGYADDDDDGAFYSNSEGIGKKKRKKDHVSKVSTPLPDRGGSYGVGMFGIGAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.34
4 0.34
5 0.37
6 0.33
7 0.36
8 0.38
9 0.35
10 0.34
11 0.34
12 0.35
13 0.36
14 0.36
15 0.32
16 0.29
17 0.28
18 0.29
19 0.28
20 0.27
21 0.26
22 0.31
23 0.35
24 0.34
25 0.35
26 0.3
27 0.28
28 0.3
29 0.31
30 0.27
31 0.22
32 0.22
33 0.23
34 0.25
35 0.24
36 0.25
37 0.25
38 0.26
39 0.26
40 0.25
41 0.22
42 0.21
43 0.21
44 0.18
45 0.15
46 0.12
47 0.17
48 0.2
49 0.23
50 0.24
51 0.25
52 0.28
53 0.32
54 0.34
55 0.34
56 0.35
57 0.36
58 0.35
59 0.35
60 0.33
61 0.3
62 0.3
63 0.26
64 0.22
65 0.2
66 0.2
67 0.2
68 0.18
69 0.18
70 0.2
71 0.25
72 0.24
73 0.28
74 0.3
75 0.34
76 0.35
77 0.33
78 0.28
79 0.23
80 0.24
81 0.2
82 0.15
83 0.11
84 0.11
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.14
95 0.15
96 0.14
97 0.14
98 0.13
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.1
106 0.12
107 0.15
108 0.15
109 0.14
110 0.12
111 0.11
112 0.13
113 0.17
114 0.15
115 0.15
116 0.14
117 0.15
118 0.15
119 0.17
120 0.16
121 0.13
122 0.12
123 0.1
124 0.11
125 0.1
126 0.09
127 0.08
128 0.07
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.08
135 0.14
136 0.2
137 0.23
138 0.25
139 0.27
140 0.32
141 0.37
142 0.45
143 0.46
144 0.45
145 0.41
146 0.41
147 0.41
148 0.37
149 0.32
150 0.24
151 0.17
152 0.13
153 0.13
154 0.11
155 0.08
156 0.09
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.11
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.13
166 0.13
167 0.13
168 0.14
169 0.11
170 0.11
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.1
186 0.1
187 0.11
188 0.11
189 0.1
190 0.11
191 0.11
192 0.13
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.1
205 0.09
206 0.1
207 0.12
208 0.1
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.12
213 0.13
214 0.13
215 0.1
216 0.1
217 0.09
218 0.08
219 0.07
220 0.06
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.03
229 0.03
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.09
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.17
239 0.19
240 0.21
241 0.21
242 0.18
243 0.19
244 0.27
245 0.34
246 0.35
247 0.35
248 0.34
249 0.39
250 0.46
251 0.51
252 0.52
253 0.48
254 0.46
255 0.45
256 0.44
257 0.39
258 0.33
259 0.27
260 0.21
261 0.23
262 0.24
263 0.28
264 0.3
265 0.3
266 0.33
267 0.39
268 0.42
269 0.39
270 0.47
271 0.44
272 0.49
273 0.53
274 0.49
275 0.41
276 0.37
277 0.34
278 0.25
279 0.22
280 0.15
281 0.12
282 0.13
283 0.14
284 0.12
285 0.14
286 0.13
287 0.15
288 0.18
289 0.18
290 0.19
291 0.18
292 0.21
293 0.19
294 0.24
295 0.3
296 0.27
297 0.3
298 0.3
299 0.3
300 0.28
301 0.27
302 0.23
303 0.15
304 0.15
305 0.11
306 0.11
307 0.09
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.1
314 0.1
315 0.11
316 0.12
317 0.1
318 0.11
319 0.11
320 0.14
321 0.16
322 0.15
323 0.15
324 0.14
325 0.16
326 0.16
327 0.16
328 0.13
329 0.13
330 0.13
331 0.12
332 0.16
333 0.15
334 0.16
335 0.19
336 0.2
337 0.2
338 0.26
339 0.27
340 0.25
341 0.29
342 0.32
343 0.39
344 0.44
345 0.5
346 0.46
347 0.46
348 0.46
349 0.45
350 0.44
351 0.41
352 0.4
353 0.38
354 0.44
355 0.45
356 0.44
357 0.41
358 0.42
359 0.38
360 0.35
361 0.31
362 0.26
363 0.28
364 0.28
365 0.27
366 0.22
367 0.19
368 0.21
369 0.19
370 0.2
371 0.17
372 0.24
373 0.29
374 0.3
375 0.36
376 0.4
377 0.49
378 0.56
379 0.64
380 0.65
381 0.7
382 0.77
383 0.81
384 0.83
385 0.81
386 0.73
387 0.69
388 0.67
389 0.56
390 0.47
391 0.37
392 0.28
393 0.2
394 0.18
395 0.12
396 0.07
397 0.07
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.06
404 0.07
405 0.07
406 0.06
407 0.08
408 0.08
409 0.09
410 0.1
411 0.11
412 0.17
413 0.28
414 0.38
415 0.46
416 0.54
417 0.64
418 0.73
419 0.83
420 0.88
421 0.89
422 0.9
423 0.9
424 0.88
425 0.87
426 0.83
427 0.78
428 0.7
429 0.63
430 0.56
431 0.48
432 0.43
433 0.37
434 0.32
435 0.26
436 0.25
437 0.2
438 0.17
439 0.15
440 0.12