FuNGI

A1CH60

Protein Details

Accession

A1CH60

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
2-28	SSFFTLPASQRKRKRDDRGAAPASKKR	Hydrophilic
191-219	SAATDGRPPRPQRKKPKQVKFARGLRKVA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-41	RKRKRDDRGAAPASKKRGVDADGGSGAKSK
197-217	RPPRPQRKKPKQVKFARGLRK

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, mito 9, cyto_nucl 8, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0031428 C:box C/D RNP complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0032040 C:small-subunit processome GO:0034511 F:U3 snoRNA binding GO:0000480 P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000447 P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000472 P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	act:ACLA_046810 -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MSSFFTLPASQRKRKRDDRGAAPASKKRGVDADGGSGAKSKSRTRERDESISGSDIDEDVESVELELSEEESGSESEQGETAAERRLKLAERYLENVREEVDDYGFDAAEIDRDLIAERLKEDVDEFKGRAYRQIASDLAFATATPTFFRADTQSTTSIAVHPPYVYTVSKDKTLIKWELATPSQSSAAPSAATDGRPPRPQRKKPKQVKFARGLRKVAETGEEHGHTKAVLSVAVSPSGKFVATGGEDRKLIIWDAATLTPMKTFTQHRDAVSGLAFVRHISTMNSGEQLFTGSYDRTIKTWSLSSAGHAYVETLFGHQDNVSSVAAMTIDQCISVGARDRTARLWKVAEESQLVFRGGSQKHAYQDNTIDCVAPLPPSHFVTGSDSGALSLWSIHKKKPLHTIQCAHGLDPLPPLDELSSEVDPQLAGTNTRFMRQMPRWITALATVPGTDVVLSGSWDGFIRAWKISEDKKTILPLGPIGVGKLGSAAPDTPSRQLKQTLEFDADGMSVDEPQKDQSKDAASEEVEPLVKGVINDIAVFERRAETKKPGQIPSESKSKSSEPEPRGLCIVAAVGKEHRFGRWKCFTSNFHQGSAPDGRNGAVVFEVPFISDSKQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.79
2	0.86
3	0.86
4	0.87
5	0.87
6	0.89
7	0.87
8	0.85
9	0.83
10	0.78
11	0.74
12	0.69
13	0.59
14	0.51
15	0.48
16	0.43
17	0.42
18	0.38
19	0.36
20	0.34
21	0.34
22	0.32
23	0.3
24	0.27
25	0.24
26	0.26
27	0.27
28	0.33
29	0.44
30	0.52
31	0.58
32	0.68
33	0.71
34	0.75
35	0.74
36	0.68
37	0.61
38	0.55
39	0.47
40	0.37
41	0.3
42	0.21
43	0.17
44	0.13
45	0.09
46	0.08
47	0.07
48	0.07
49	0.06
50	0.07
51	0.06
52	0.06
53	0.06
54	0.07
55	0.06
56	0.06
57	0.06
58	0.07
59	0.08
60	0.08
61	0.09
62	0.09
63	0.09
64	0.1
65	0.1
66	0.09
67	0.09
68	0.1
69	0.16
70	0.17
71	0.17
72	0.18
73	0.22
74	0.25
75	0.28
76	0.34
77	0.35
78	0.36
79	0.41
80	0.45
81	0.46
82	0.44
83	0.41
84	0.34
85	0.28
86	0.26
87	0.23
88	0.17
89	0.13
90	0.12
91	0.12
92	0.11
93	0.09
94	0.08
95	0.07
96	0.07
97	0.07
98	0.07
99	0.06
100	0.07
101	0.08
102	0.09
103	0.1
104	0.1
105	0.1
106	0.11
107	0.11
108	0.12
109	0.12
110	0.15
111	0.19
112	0.21
113	0.21
114	0.23
115	0.27
116	0.27
117	0.31
118	0.3
119	0.28
120	0.26
121	0.3
122	0.28
123	0.26
124	0.27
125	0.21
126	0.19
127	0.16
128	0.13
129	0.11
130	0.11
131	0.1
132	0.09
133	0.1
134	0.1
135	0.1
136	0.12
137	0.13
138	0.16
139	0.18
140	0.21
141	0.22
142	0.22
143	0.23
144	0.22
145	0.21
146	0.2
147	0.18
148	0.15
149	0.13
150	0.12
151	0.13
152	0.15
153	0.14
154	0.15
155	0.2
156	0.21
157	0.23
158	0.25
159	0.27
160	0.27
161	0.33
162	0.33
163	0.29
164	0.29
165	0.29
166	0.31
167	0.29
168	0.28
169	0.22
170	0.21
171	0.21
172	0.19
173	0.18
174	0.14
175	0.13
176	0.11
177	0.1
178	0.12
179	0.12
180	0.12
181	0.14
182	0.18
183	0.23
184	0.3
185	0.35
186	0.43
187	0.53
188	0.63
189	0.7
190	0.77
191	0.83
192	0.87
193	0.92
194	0.92
195	0.91
196	0.91
197	0.89
198	0.87
199	0.87
200	0.82
201	0.74
202	0.65
203	0.58
204	0.49
205	0.4
206	0.34
207	0.25
208	0.22
209	0.23
210	0.22
211	0.2
212	0.19
213	0.18
214	0.14
215	0.13
216	0.11
217	0.08
218	0.07
219	0.07
220	0.09
221	0.09
222	0.12
223	0.12
224	0.1
225	0.1
226	0.11
227	0.1
228	0.08
229	0.07
230	0.07
231	0.08
232	0.12
233	0.13
234	0.14
235	0.14
236	0.14
237	0.15
238	0.13
239	0.12
240	0.09
241	0.08
242	0.06
243	0.08
244	0.08
245	0.08
246	0.08
247	0.08
248	0.08
249	0.09
250	0.09
251	0.1
252	0.13
253	0.17
254	0.24
255	0.27
256	0.27
257	0.27
258	0.27
259	0.25
260	0.22
261	0.19
262	0.12
263	0.09
264	0.09
265	0.07
266	0.07
267	0.06
268	0.07
269	0.06
270	0.09
271	0.1
272	0.1
273	0.12
274	0.11
275	0.11
276	0.1
277	0.11
278	0.08
279	0.07
280	0.08
281	0.06
282	0.08
283	0.1
284	0.1
285	0.1
286	0.12
287	0.11
288	0.12
289	0.13
290	0.12
291	0.12
292	0.12
293	0.13
294	0.13
295	0.13
296	0.11
297	0.1
298	0.1
299	0.08
300	0.08
301	0.07
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.06
308	0.05
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.06
315	0.06
316	0.06
317	0.04
318	0.04
319	0.04
320	0.04
321	0.04
322	0.04
323	0.05
324	0.09
325	0.08
326	0.11
327	0.12
328	0.13
329	0.16
330	0.22
331	0.22
332	0.2
333	0.21
334	0.2
335	0.23
336	0.24
337	0.23
338	0.19
339	0.19
340	0.18
341	0.18
342	0.18
343	0.13
344	0.12
345	0.17
346	0.16
347	0.19
348	0.2
349	0.21
350	0.24
351	0.28
352	0.28
353	0.23
354	0.28
355	0.25
356	0.25
357	0.22
358	0.2
359	0.15
360	0.15
361	0.13
362	0.1
363	0.09
364	0.08
365	0.11
366	0.12
367	0.13
368	0.13
369	0.13
370	0.18
371	0.19
372	0.18
373	0.15
374	0.14
375	0.13
376	0.13
377	0.12
378	0.06
379	0.05
380	0.08
381	0.14
382	0.16
383	0.18
384	0.25
385	0.28
386	0.32
387	0.42
388	0.49
389	0.51
390	0.57
391	0.59
392	0.56
393	0.62
394	0.59
395	0.48
396	0.42
397	0.34
398	0.27
399	0.24
400	0.21
401	0.13
402	0.12
403	0.13
404	0.09
405	0.09
406	0.1
407	0.12
408	0.12
409	0.11
410	0.11
411	0.11
412	0.1
413	0.1
414	0.11
415	0.08
416	0.08
417	0.08
418	0.15
419	0.15
420	0.17
421	0.17
422	0.16
423	0.25
424	0.28
425	0.37
426	0.35
427	0.37
428	0.37
429	0.37
430	0.36
431	0.29
432	0.29
433	0.2
434	0.16
435	0.13
436	0.11
437	0.11
438	0.11
439	0.08
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.06
448	0.07
449	0.07
450	0.09
451	0.11
452	0.11
453	0.12
454	0.13
455	0.19
456	0.24
457	0.31
458	0.34
459	0.34
460	0.36
461	0.38
462	0.39
463	0.36
464	0.31
465	0.24
466	0.21
467	0.21
468	0.18
469	0.15
470	0.13
471	0.11
472	0.1
473	0.1
474	0.08
475	0.07
476	0.08
477	0.08
478	0.09
479	0.14
480	0.16
481	0.21
482	0.26
483	0.28
484	0.31
485	0.37
486	0.38
487	0.41
488	0.44
489	0.42
490	0.39
491	0.38
492	0.34
493	0.28
494	0.25
495	0.18
496	0.14
497	0.1
498	0.09
499	0.1
500	0.1
501	0.1
502	0.14
503	0.2
504	0.21
505	0.22
506	0.25
507	0.29
508	0.3
509	0.32
510	0.32
511	0.26
512	0.28
513	0.27
514	0.24
515	0.2
516	0.17
517	0.15
518	0.12
519	0.12
520	0.09
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.1
525	0.11
526	0.13
527	0.13
528	0.14
529	0.14
530	0.14
531	0.17
532	0.21
533	0.25
534	0.3
535	0.37
536	0.45
537	0.52
538	0.55
539	0.56
540	0.6
541	0.63
542	0.6
543	0.61
544	0.54
545	0.49
546	0.47
547	0.46
548	0.43
549	0.44
550	0.5
551	0.44
552	0.51
553	0.52
554	0.5
555	0.49
556	0.44
557	0.36
558	0.26
559	0.23
560	0.18
561	0.16
562	0.16
563	0.18
564	0.19
565	0.23
566	0.23
567	0.27
568	0.33
569	0.35
570	0.43
571	0.49
572	0.51
573	0.54
574	0.61
575	0.62
576	0.61
577	0.69
578	0.62
579	0.54
580	0.53
581	0.47
582	0.45
583	0.48
584	0.41
585	0.32
586	0.3
587	0.28
588	0.27
589	0.27
590	0.21
591	0.13
592	0.12
593	0.11
594	0.12
595	0.12
596	0.1
597	0.11

A1CH60

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer