Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1C655

Protein Details
Accession A1C655    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-50EESGTHRNRGPRQRPVQSATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
559-589RGRGQAPGRGGARGNAQRGGAPRGRGQPANR
Subcellular Location(s) cyto 11, cysk 8, nucl 5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR025696  rRNA_proc-arch_dom  
IPR016438  SKI2-like  
IPR012961  Ski2/MTR4_C  
IPR040801  Ski2_N  
Gene Ontology GO:0055087  C:Ski complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0030968  P:endoplasmic reticulum unfolded protein response  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
GO:0070481  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay  
KEGG act:ACLA_069040  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF08148  DSHCT  
PF00271  Helicase_C  
PF13234  rRNA_proc-arch  
PF17911  Ski2_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd18795  SF2_C_Ski2  
Amino Acid Sequences MADQLAGTLAALDLNDQSLTGPAFDAQLAEEESGTHRNRGPRQRPVQSATHLKAELEDDFLTPSPRFSPEWLNRLQRRWDISTDYTDLFEVAPTQTRTVVRFTREGLEGRVTGYHEVTVPAAVANAKNSTSLLRRPAGRAEFVRGAAGFFPFAPGGLDGVEAIAEMESEAQAVERSRVGAKQSGLDRIINFGAEGGLLEIAPGFSRGLVFEETKSKEAVEGDKEVEHDLQQEESELHVEKDDDAVSDIGGVKIDDDELSGEEEDIDSLLPVEFPALEPRAPLLRGVKQKQGGREWAHVVDVNKHIPNFHELVPDMAREWPFELDTFQKEAVYHLENGDSVFVAAHTSAGKTVVAEYAIALASKHMTKAIYTSPIKALSNQKFRDFRTEFDDVGILTGDVQINPEASCLIMTTEILRSMLYRGADLIRDVEFVIFDEVHYVNDLERGVVWEEVIIMLPEHVTLILLSATVPNTYEFASWVGRTKKKDIYVISTAKRPVPLEHYLWAGKDKYKIVDSNKRFIESGWKEADNIVSGRDKIKAQKAAEAQAQSQAQRGGQQGRGRGQAPGRGGARGNAQRGGAPRGRGQPANRGTGNIARTGRGGGRTTAAQDKTIWVQLVGHLRKENLLPGCIFVFSKKRCEENADSLSNQDFCNATEKSLIHMFIEKSLTRLKAEDRTLPQILRLRELLSRGIAVHHGGLLPIMKEIVEILFAKSLVKILFATETFAMGLNLPTRTVVFSGFRKHDGRGFRDLLPGEYTQMAGRAGRRGLDTVGYVIIVNAGRDEAPPAGALRKMILGDPTKLRSQFRLTYNMILNLLRVEALKIEEMIKRSFSENATQALLPEHEKQVQLSEASLAKIKREPCDICDIDLVACHGAAIEYEKLTSELHVGLLASPVGKRLFMPKRLIVYQKDGYRTAGIIVREGIGGGASPSIQVLEIGKLGSRRHPSDILPFLPGFRHLLQSLPKRAADMNLKVCKIPLSDLECITNTMVKLGGPTWYLNIRKEAMKFADKELAKLCASWTSPVWDEMDWGRIKELQVRDILEKRQAQAAIAQSCRCLQCPTFLKHFEMQHDEWQVKENISQLKQLMSDQNLQLLPDYEQRIQVLRDLGFIDEQSRVQLKGKVACEIHSADELVLTELVLENVLAEFEPEEIVALLSAFVFQEKTENVPTLTPRLEKGKEAIIRIAEKVNDLQIQYQVIQSSEDSNDFASQPRFGLAEVVYEWAKGMSFNRITDLTDVMEGTIVRTITRLDETCREVKNAAKLVGDPTLYTKMQQAQELIKRDVIFAASLYM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.09
6 0.09
7 0.09
8 0.09
9 0.09
10 0.1
11 0.1
12 0.1
13 0.09
14 0.11
15 0.12
16 0.11
17 0.11
18 0.11
19 0.13
20 0.21
21 0.22
22 0.23
23 0.26
24 0.35
25 0.44
26 0.55
27 0.61
28 0.65
29 0.73
30 0.79
31 0.82
32 0.79
33 0.77
34 0.74
35 0.75
36 0.67
37 0.64
38 0.55
39 0.47
40 0.44
41 0.39
42 0.32
43 0.25
44 0.23
45 0.16
46 0.18
47 0.19
48 0.2
49 0.17
50 0.18
51 0.17
52 0.19
53 0.21
54 0.22
55 0.32
56 0.37
57 0.44
58 0.5
59 0.58
60 0.61
61 0.66
62 0.7
63 0.66
64 0.65
65 0.63
66 0.59
67 0.56
68 0.54
69 0.53
70 0.49
71 0.43
72 0.37
73 0.32
74 0.28
75 0.21
76 0.17
77 0.13
78 0.11
79 0.16
80 0.17
81 0.18
82 0.22
83 0.24
84 0.25
85 0.31
86 0.35
87 0.33
88 0.35
89 0.37
90 0.37
91 0.39
92 0.39
93 0.35
94 0.34
95 0.3
96 0.28
97 0.27
98 0.24
99 0.22
100 0.21
101 0.18
102 0.14
103 0.15
104 0.14
105 0.12
106 0.11
107 0.09
108 0.09
109 0.1
110 0.1
111 0.11
112 0.13
113 0.13
114 0.13
115 0.14
116 0.17
117 0.2
118 0.25
119 0.29
120 0.32
121 0.35
122 0.38
123 0.46
124 0.46
125 0.47
126 0.44
127 0.45
128 0.44
129 0.41
130 0.4
131 0.32
132 0.29
133 0.23
134 0.21
135 0.15
136 0.11
137 0.12
138 0.1
139 0.1
140 0.1
141 0.09
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.05
149 0.05
150 0.04
151 0.03
152 0.03
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.06
159 0.07
160 0.09
161 0.09
162 0.11
163 0.13
164 0.16
165 0.19
166 0.22
167 0.23
168 0.27
169 0.3
170 0.34
171 0.34
172 0.34
173 0.31
174 0.3
175 0.29
176 0.23
177 0.19
178 0.14
179 0.12
180 0.09
181 0.08
182 0.05
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.05
189 0.05
190 0.05
191 0.05
192 0.05
193 0.06
194 0.09
195 0.12
196 0.13
197 0.14
198 0.22
199 0.25
200 0.26
201 0.26
202 0.23
203 0.22
204 0.24
205 0.26
206 0.23
207 0.22
208 0.23
209 0.24
210 0.24
211 0.24
212 0.22
213 0.18
214 0.17
215 0.15
216 0.14
217 0.13
218 0.13
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.11
223 0.1
224 0.1
225 0.11
226 0.1
227 0.12
228 0.11
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.06
239 0.06
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.06
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.04
254 0.04
255 0.04
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.04
260 0.05
261 0.1
262 0.11
263 0.11
264 0.12
265 0.14
266 0.17
267 0.17
268 0.19
269 0.2
270 0.25
271 0.35
272 0.39
273 0.44
274 0.48
275 0.51
276 0.55
277 0.56
278 0.56
279 0.51
280 0.52
281 0.49
282 0.42
283 0.4
284 0.37
285 0.32
286 0.29
287 0.28
288 0.28
289 0.26
290 0.26
291 0.25
292 0.23
293 0.26
294 0.24
295 0.22
296 0.21
297 0.19
298 0.22
299 0.23
300 0.22
301 0.18
302 0.19
303 0.17
304 0.15
305 0.16
306 0.14
307 0.14
308 0.14
309 0.15
310 0.15
311 0.17
312 0.19
313 0.17
314 0.17
315 0.17
316 0.17
317 0.19
318 0.18
319 0.17
320 0.15
321 0.15
322 0.14
323 0.14
324 0.13
325 0.1
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.05
330 0.05
331 0.05
332 0.05
333 0.06
334 0.06
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.06
343 0.07
344 0.07
345 0.07
346 0.06
347 0.06
348 0.07
349 0.08
350 0.08
351 0.08
352 0.09
353 0.09
354 0.12
355 0.14
356 0.21
357 0.22
358 0.24
359 0.25
360 0.28
361 0.28
362 0.31
363 0.37
364 0.38
365 0.46
366 0.47
367 0.51
368 0.53
369 0.54
370 0.59
371 0.51
372 0.44
373 0.42
374 0.42
375 0.35
376 0.31
377 0.3
378 0.19
379 0.18
380 0.16
381 0.09
382 0.06
383 0.07
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.07
388 0.07
389 0.07
390 0.07
391 0.06
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.05
397 0.05
398 0.06
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.11
406 0.1
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.09
420 0.07
421 0.06
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.09
426 0.09
427 0.07
428 0.09
429 0.09
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.09
434 0.08
435 0.08
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.05
441 0.03
442 0.04
443 0.04
444 0.04
445 0.03
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.03
450 0.03
451 0.03
452 0.04
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.07
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.16
466 0.22
467 0.26
468 0.29
469 0.33
470 0.37
471 0.39
472 0.45
473 0.41
474 0.41
475 0.44
476 0.47
477 0.44
478 0.43
479 0.41
480 0.37
481 0.37
482 0.31
483 0.25
484 0.25
485 0.27
486 0.25
487 0.24
488 0.26
489 0.24
490 0.24
491 0.24
492 0.2
493 0.18
494 0.2
495 0.2
496 0.19
497 0.21
498 0.25
499 0.3
500 0.39
501 0.41
502 0.45
503 0.44
504 0.44
505 0.41
506 0.36
507 0.39
508 0.32
509 0.34
510 0.29
511 0.28
512 0.27
513 0.27
514 0.28
515 0.18
516 0.16
517 0.12
518 0.1
519 0.11
520 0.12
521 0.13
522 0.14
523 0.18
524 0.24
525 0.29
526 0.28
527 0.33
528 0.34
529 0.36
530 0.38
531 0.34
532 0.28
533 0.26
534 0.26
535 0.21
536 0.2
537 0.17
538 0.14
539 0.16
540 0.18
541 0.17
542 0.2
543 0.22
544 0.24
545 0.26
546 0.29
547 0.27
548 0.27
549 0.25
550 0.25
551 0.23
552 0.24
553 0.22
554 0.2
555 0.2
556 0.18
557 0.23
558 0.23
559 0.23
560 0.2
561 0.2
562 0.21
563 0.22
564 0.26
565 0.22
566 0.2
567 0.23
568 0.26
569 0.29
570 0.3
571 0.3
572 0.34
573 0.35
574 0.38
575 0.34
576 0.3
577 0.29
578 0.3
579 0.29
580 0.25
581 0.22
582 0.17
583 0.17
584 0.18
585 0.17
586 0.16
587 0.16
588 0.11
589 0.12
590 0.12
591 0.14
592 0.18
593 0.17
594 0.16
595 0.15
596 0.16
597 0.16
598 0.17
599 0.15
600 0.09
601 0.09
602 0.11
603 0.2
604 0.19
605 0.2
606 0.19
607 0.19
608 0.2
609 0.2
610 0.21
611 0.14
612 0.14
613 0.12
614 0.13
615 0.13
616 0.12
617 0.12
618 0.09
619 0.16
620 0.16
621 0.23
622 0.24
623 0.26
624 0.26
625 0.33
626 0.35
627 0.36
628 0.4
629 0.35
630 0.33
631 0.32
632 0.31
633 0.26
634 0.21
635 0.14
636 0.09
637 0.08
638 0.13
639 0.12
640 0.12
641 0.13
642 0.14
643 0.15
644 0.16
645 0.16
646 0.12
647 0.14
648 0.14
649 0.13
650 0.15
651 0.13
652 0.13
653 0.16
654 0.17
655 0.14
656 0.15
657 0.16
658 0.2
659 0.22
660 0.26
661 0.26
662 0.3
663 0.31
664 0.3
665 0.31
666 0.29
667 0.28
668 0.24
669 0.22
670 0.19
671 0.18
672 0.2
673 0.17
674 0.12
675 0.12
676 0.1
677 0.1
678 0.09
679 0.08
680 0.07
681 0.06
682 0.06
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.04
688 0.04
689 0.04
690 0.04
691 0.04
692 0.04
693 0.05
694 0.05
695 0.05
696 0.06
697 0.06
698 0.07
699 0.06
700 0.08
701 0.07
702 0.07
703 0.06
704 0.06
705 0.08
706 0.08
707 0.09
708 0.08
709 0.08
710 0.07
711 0.08
712 0.07
713 0.06
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.07
718 0.06
719 0.07
720 0.07
721 0.07
722 0.08
723 0.1
724 0.12
725 0.18
726 0.19
727 0.23
728 0.24
729 0.25
730 0.28
731 0.31
732 0.33
733 0.34
734 0.36
735 0.32
736 0.35
737 0.34
738 0.3
739 0.27
740 0.23
741 0.17
742 0.14
743 0.14
744 0.1
745 0.1
746 0.09
747 0.08
748 0.09
749 0.11
750 0.11
751 0.12
752 0.12
753 0.12
754 0.12
755 0.12
756 0.11
757 0.09
758 0.09
759 0.08
760 0.07
761 0.06
762 0.07
763 0.06
764 0.06
765 0.05
766 0.05
767 0.05
768 0.05
769 0.07
770 0.05
771 0.06
772 0.06
773 0.07
774 0.08
775 0.08
776 0.08
777 0.07
778 0.08
779 0.08
780 0.09
781 0.13
782 0.13
783 0.16
784 0.18
785 0.21
786 0.23
787 0.25
788 0.25
789 0.25
790 0.28
791 0.32
792 0.32
793 0.37
794 0.36
795 0.38
796 0.38
797 0.36
798 0.32
799 0.25
800 0.22
801 0.15
802 0.13
803 0.09
804 0.07
805 0.06
806 0.05
807 0.06
808 0.06
809 0.07
810 0.09
811 0.11
812 0.13
813 0.14
814 0.14
815 0.15
816 0.16
817 0.18
818 0.17
819 0.2
820 0.2
821 0.2
822 0.21
823 0.2
824 0.19
825 0.17
826 0.17
827 0.15
828 0.15
829 0.15
830 0.16
831 0.16
832 0.16
833 0.17
834 0.17
835 0.14
836 0.12
837 0.12
838 0.11
839 0.12
840 0.15
841 0.13
842 0.14
843 0.18
844 0.2
845 0.21
846 0.26
847 0.27
848 0.26
849 0.36
850 0.34
851 0.32
852 0.3
853 0.28
854 0.21
855 0.2
856 0.18
857 0.09
858 0.08
859 0.06
860 0.05
861 0.04
862 0.04
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.07
867 0.07
868 0.08
869 0.08
870 0.09
871 0.08
872 0.07
873 0.07
874 0.08
875 0.07
876 0.07
877 0.07
878 0.07
879 0.06
880 0.06
881 0.08
882 0.08
883 0.08
884 0.08
885 0.17
886 0.25
887 0.3
888 0.36
889 0.37
890 0.42
891 0.46
892 0.51
893 0.44
894 0.44
895 0.45
896 0.43
897 0.43
898 0.39
899 0.37
900 0.32
901 0.29
902 0.24
903 0.21
904 0.17
905 0.15
906 0.14
907 0.13
908 0.12
909 0.11
910 0.09
911 0.05
912 0.05
913 0.04
914 0.04
915 0.03
916 0.03
917 0.03
918 0.04
919 0.04
920 0.04
921 0.05
922 0.06
923 0.06
924 0.07
925 0.08
926 0.11
927 0.12
928 0.19
929 0.24
930 0.26
931 0.29
932 0.32
933 0.33
934 0.38
935 0.42
936 0.37
937 0.34
938 0.32
939 0.28
940 0.26
941 0.25
942 0.21
943 0.16
944 0.18
945 0.15
946 0.19
947 0.26
948 0.33
949 0.37
950 0.37
951 0.36
952 0.35
953 0.35
954 0.37
955 0.37
956 0.36
957 0.4
958 0.42
959 0.43
960 0.41
961 0.41
962 0.37
963 0.31
964 0.26
965 0.23
966 0.23
967 0.25
968 0.26
969 0.28
970 0.26
971 0.26
972 0.25
973 0.2
974 0.15
975 0.12
976 0.12
977 0.09
978 0.1
979 0.09
980 0.11
981 0.1
982 0.1
983 0.12
984 0.19
985 0.22
986 0.22
987 0.25
988 0.26
989 0.28
990 0.3
991 0.33
992 0.31
993 0.35
994 0.34
995 0.34
996 0.4
997 0.36
998 0.37
999 0.33
1000 0.32
1001 0.26
1002 0.25
1003 0.22
1004 0.19
1005 0.2
1006 0.2
1007 0.19
1008 0.19
1009 0.2
1010 0.21
1011 0.22
1012 0.17
1013 0.18
1014 0.17
1015 0.22
1016 0.19
1017 0.18
1018 0.18
1019 0.19
1020 0.2
1021 0.25
1022 0.27
1023 0.24
1024 0.26
1025 0.28
1026 0.32
1027 0.35
1028 0.37
1029 0.37
1030 0.38
1031 0.35
1032 0.37
1033 0.35
1034 0.3
1035 0.29
1036 0.33
1037 0.32
1038 0.32
1039 0.31
1040 0.27
1041 0.31
1042 0.31
1043 0.28
1044 0.25
1045 0.2
1046 0.27
1047 0.34
1048 0.38
1049 0.43
1050 0.44
1051 0.48
1052 0.49
1053 0.52
1054 0.48
1055 0.48
1056 0.45
1057 0.44
1058 0.45
1059 0.41
1060 0.36
1061 0.37
1062 0.33
1063 0.27
1064 0.25
1065 0.24
1066 0.27
1067 0.28
1068 0.31
1069 0.27
1070 0.28
1071 0.28
1072 0.3
1073 0.3
1074 0.26
1075 0.3
1076 0.27
1077 0.31
1078 0.29
1079 0.28
1080 0.26
1081 0.22
1082 0.21
1083 0.21
1084 0.25
1085 0.21
1086 0.23
1087 0.24
1088 0.25
1089 0.25
1090 0.26
1091 0.24
1092 0.2
1093 0.21
1094 0.2
1095 0.2
1096 0.18
1097 0.17
1098 0.16
1099 0.13
1100 0.13
1101 0.15
1102 0.16
1103 0.16
1104 0.18
1105 0.23
1106 0.26
1107 0.32
1108 0.33
1109 0.36
1110 0.35
1111 0.35
1112 0.36
1113 0.33
1114 0.31
1115 0.25
1116 0.24
1117 0.17
1118 0.17
1119 0.16
1120 0.13
1121 0.11
1122 0.09
1123 0.07
1124 0.07
1125 0.07
1126 0.06
1127 0.05
1128 0.04
1129 0.04
1130 0.05
1131 0.04
1132 0.04
1133 0.05
1134 0.05
1135 0.06
1136 0.05
1137 0.06
1138 0.06
1139 0.06
1140 0.05
1141 0.05
1142 0.05
1143 0.04
1144 0.05
1145 0.05
1146 0.05
1147 0.05
1148 0.05
1149 0.09
1150 0.1
1151 0.14
1152 0.17
1153 0.19
1154 0.2
1155 0.23
1156 0.26
1157 0.27
1158 0.3
1159 0.28
1160 0.28
1161 0.34
1162 0.36
1163 0.35
1164 0.35
1165 0.39
1166 0.39
1167 0.4
1168 0.41
1169 0.38
1170 0.38
1171 0.37
1172 0.38
1173 0.3
1174 0.28
1175 0.27
1176 0.27
1177 0.25
1178 0.24
1179 0.24
1180 0.22
1181 0.24
1182 0.22
1183 0.22
1184 0.19
1185 0.17
1186 0.17
1187 0.16
1188 0.17
1189 0.17
1190 0.17
1191 0.16
1192 0.16
1193 0.18
1194 0.17
1195 0.2
1196 0.19
1197 0.18
1198 0.17
1199 0.18
1200 0.17
1201 0.15
1202 0.18
1203 0.14
1204 0.15
1205 0.14
1206 0.17
1207 0.15
1208 0.15
1209 0.15
1210 0.12
1211 0.12
1212 0.1
1213 0.12
1214 0.18
1215 0.21
1216 0.22
1217 0.25
1218 0.26
1219 0.28
1220 0.28
1221 0.28
1222 0.2
1223 0.18
1224 0.17
1225 0.14
1226 0.14
1227 0.12
1228 0.11
1229 0.13
1230 0.11
1231 0.1
1232 0.11
1233 0.12
1234 0.13
1235 0.19
1236 0.2
1237 0.22
1238 0.28
1239 0.34
1240 0.4
1241 0.42
1242 0.42
1243 0.39
1244 0.42
1245 0.46
1246 0.46
1247 0.43
1248 0.37
1249 0.36
1250 0.37
1251 0.39
1252 0.34
1253 0.26
1254 0.24
1255 0.27
1256 0.26
1257 0.26
1258 0.27
1259 0.3
1260 0.33
1261 0.36
1262 0.35
1263 0.38
1264 0.45
1265 0.51
1266 0.48
1267 0.45
1268 0.42
1269 0.4
1270 0.38
1271 0.3
1272 0.23