Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2U9R1M5

Protein Details
Accession A0A2U9R1M5    Localization Confidence High Confidence Score 21.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-112NISKSMGKKRGRKPGKLKVVEBasic
114-136KEENTVKKRGRGRPRTRPPEDEEBasic
277-301EMEDERKRENKLKRREIIKHKALFSBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
96-130SMGKKRGRKPGKLKVVELKEENTVKKRGRGRPRTR
235-297LRKADAARKRKTFNARKLEAEKKETLRKLLHRKIDKAEVKRQEMEDERKRENKLKRREIIKHK
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR006880  INO80B_C  
Gene Ontology GO:0031011  C:Ino80 complex  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04795  PAPA-1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MVNYRCNTKQNTPKGTTMSDEDEDLLSLGYEHELGSDEEKEPELIKDMVSIKKDQSKNKSLTLKFQFTDKMKLKNMESESRASSNSSNSGGNISKSMGKKRGRKPGKLKVVELKEENTVKKRGRGRPRTRPPEDEEEEEIEFDEDEEEEEYDGEEYNSSDDEELMRMIEQGEVDEKNVDLSKLSDRQRAKYLGQSEEPEELNAEFYNGKKLPKSVLALMKGNEKKKVLTPEEIELRKADAARKRKTFNARKLEAEKKETLRKLLHRKIDKAEVKRQEMEDERKRENKLKRREIIKHKALFSYVSKKVGEEIQSFYSMQL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.67
2 0.63
3 0.56
4 0.51
5 0.46
6 0.38
7 0.34
8 0.29
9 0.25
10 0.23
11 0.19
12 0.14
13 0.08
14 0.07
15 0.07
16 0.06
17 0.06
18 0.05
19 0.05
20 0.07
21 0.08
22 0.11
23 0.12
24 0.13
25 0.14
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.16
31 0.14
32 0.13
33 0.17
34 0.2
35 0.24
36 0.26
37 0.28
38 0.28
39 0.37
40 0.43
41 0.47
42 0.52
43 0.57
44 0.59
45 0.65
46 0.7
47 0.62
48 0.66
49 0.66
50 0.63
51 0.54
52 0.53
53 0.52
54 0.45
55 0.53
56 0.48
57 0.48
58 0.47
59 0.51
60 0.5
61 0.5
62 0.53
63 0.5
64 0.47
65 0.43
66 0.41
67 0.38
68 0.37
69 0.31
70 0.27
71 0.23
72 0.22
73 0.21
74 0.18
75 0.16
76 0.19
77 0.18
78 0.18
79 0.16
80 0.15
81 0.18
82 0.21
83 0.27
84 0.32
85 0.39
86 0.48
87 0.55
88 0.65
89 0.68
90 0.75
91 0.79
92 0.81
93 0.84
94 0.79
95 0.75
96 0.72
97 0.69
98 0.64
99 0.55
100 0.46
101 0.41
102 0.4
103 0.38
104 0.34
105 0.35
106 0.32
107 0.37
108 0.44
109 0.48
110 0.56
111 0.64
112 0.7
113 0.75
114 0.84
115 0.88
116 0.85
117 0.81
118 0.76
119 0.74
120 0.67
121 0.59
122 0.51
123 0.43
124 0.37
125 0.31
126 0.25
127 0.16
128 0.13
129 0.09
130 0.06
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.05
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.04
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.06
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.07
164 0.07
165 0.07
166 0.06
167 0.07
168 0.11
169 0.17
170 0.2
171 0.26
172 0.27
173 0.3
174 0.36
175 0.38
176 0.35
177 0.35
178 0.37
179 0.34
180 0.34
181 0.33
182 0.3
183 0.29
184 0.27
185 0.21
186 0.17
187 0.14
188 0.12
189 0.1
190 0.09
191 0.07
192 0.08
193 0.14
194 0.15
195 0.16
196 0.17
197 0.18
198 0.2
199 0.23
200 0.26
201 0.25
202 0.3
203 0.32
204 0.34
205 0.34
206 0.4
207 0.41
208 0.41
209 0.39
210 0.35
211 0.33
212 0.36
213 0.44
214 0.39
215 0.39
216 0.39
217 0.41
218 0.48
219 0.47
220 0.43
221 0.34
222 0.32
223 0.28
224 0.26
225 0.26
226 0.26
227 0.35
228 0.42
229 0.49
230 0.51
231 0.57
232 0.66
233 0.71
234 0.73
235 0.74
236 0.69
237 0.7
238 0.74
239 0.76
240 0.71
241 0.67
242 0.63
243 0.59
244 0.64
245 0.6
246 0.58
247 0.56
248 0.59
249 0.64
250 0.66
251 0.69
252 0.68
253 0.71
254 0.71
255 0.74
256 0.73
257 0.7
258 0.71
259 0.7
260 0.68
261 0.67
262 0.62
263 0.59
264 0.59
265 0.61
266 0.61
267 0.59
268 0.6
269 0.61
270 0.66
271 0.67
272 0.69
273 0.69
274 0.71
275 0.75
276 0.77
277 0.81
278 0.86
279 0.88
280 0.88
281 0.88
282 0.84
283 0.77
284 0.71
285 0.63
286 0.57
287 0.53
288 0.51
289 0.46
290 0.43
291 0.4
292 0.37
293 0.39
294 0.4
295 0.39
296 0.33
297 0.33
298 0.31
299 0.33