Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CDH3

Protein Details
Accession A1CDH3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
185-210AEDAIKKHRKEKKEKKDKEDKHEHKWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
190-212KKHRKEKKEKKDKEDKHEHKWGH
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011058  Cyanovirin-N  
IPR036673  Cyanovirin-N_sf  
KEGG act:ACLA_006570  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08881  CVNH  
Amino Acid Sequences MAAQEYYNSNYTGGNKPESPYEGGYGGNGGNNGNRPWIPSSSNPTPGPDRPYSQPGDNNNYTYGSQPPQSSSYDRPHYPQQSWGGNAPGFTSQSRPQQSNNEYGYSERPPYSQNQYDSNQSQPPYPTNDTYPQQSLGQAPYPQGQQDERGLLGALGGGAAGAYAGHQAGHGILGTIGGALSGSVAEDAIKKHRKEKKEKKDKEDKHEHKWGHHHRPSSSSSSSSDDDRDHHKQRYSAQGNLRGNFSASSNEINLEHNYELVAKCRAVSGQHHRSVLPLNSVLSNRNGSFVWARGGNFSASARHVHLADGGRVLEAELADGRGGWKRAWVRLDERITNQNGHLKFLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.32
3 0.33
4 0.37
5 0.38
6 0.37
7 0.32
8 0.3
9 0.26
10 0.24
11 0.23
12 0.2
13 0.17
14 0.14
15 0.13
16 0.11
17 0.13
18 0.16
19 0.16
20 0.19
21 0.19
22 0.2
23 0.24
24 0.27
25 0.28
26 0.31
27 0.39
28 0.41
29 0.48
30 0.46
31 0.47
32 0.49
33 0.49
34 0.5
35 0.46
36 0.44
37 0.42
38 0.47
39 0.47
40 0.46
41 0.48
42 0.48
43 0.53
44 0.51
45 0.48
46 0.43
47 0.41
48 0.36
49 0.31
50 0.29
51 0.23
52 0.23
53 0.22
54 0.24
55 0.24
56 0.27
57 0.3
58 0.32
59 0.38
60 0.41
61 0.41
62 0.43
63 0.49
64 0.52
65 0.49
66 0.49
67 0.47
68 0.45
69 0.45
70 0.43
71 0.38
72 0.32
73 0.31
74 0.25
75 0.2
76 0.18
77 0.16
78 0.18
79 0.19
80 0.27
81 0.31
82 0.32
83 0.34
84 0.41
85 0.44
86 0.48
87 0.46
88 0.39
89 0.36
90 0.36
91 0.36
92 0.29
93 0.29
94 0.21
95 0.2
96 0.2
97 0.24
98 0.3
99 0.32
100 0.32
101 0.35
102 0.36
103 0.41
104 0.41
105 0.4
106 0.36
107 0.31
108 0.3
109 0.27
110 0.28
111 0.28
112 0.3
113 0.28
114 0.28
115 0.33
116 0.32
117 0.33
118 0.32
119 0.27
120 0.24
121 0.24
122 0.21
123 0.18
124 0.19
125 0.17
126 0.16
127 0.16
128 0.17
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.14
133 0.15
134 0.15
135 0.12
136 0.12
137 0.11
138 0.09
139 0.08
140 0.06
141 0.04
142 0.03
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.01
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.02
164 0.02
165 0.02
166 0.02
167 0.02
168 0.02
169 0.02
170 0.02
171 0.02
172 0.03
173 0.04
174 0.05
175 0.13
176 0.19
177 0.2
178 0.3
179 0.37
180 0.46
181 0.56
182 0.67
183 0.71
184 0.76
185 0.84
186 0.85
187 0.89
188 0.88
189 0.87
190 0.87
191 0.82
192 0.79
193 0.78
194 0.7
195 0.64
196 0.67
197 0.66
198 0.66
199 0.64
200 0.61
201 0.54
202 0.57
203 0.56
204 0.52
205 0.44
206 0.35
207 0.32
208 0.32
209 0.32
210 0.28
211 0.26
212 0.21
213 0.21
214 0.26
215 0.32
216 0.33
217 0.37
218 0.39
219 0.39
220 0.43
221 0.52
222 0.49
223 0.48
224 0.49
225 0.53
226 0.55
227 0.53
228 0.5
229 0.39
230 0.36
231 0.29
232 0.24
233 0.17
234 0.13
235 0.14
236 0.13
237 0.14
238 0.14
239 0.15
240 0.15
241 0.16
242 0.14
243 0.12
244 0.12
245 0.13
246 0.13
247 0.14
248 0.15
249 0.12
250 0.12
251 0.13
252 0.14
253 0.15
254 0.23
255 0.3
256 0.38
257 0.42
258 0.44
259 0.43
260 0.44
261 0.46
262 0.4
263 0.34
264 0.26
265 0.22
266 0.24
267 0.25
268 0.26
269 0.23
270 0.25
271 0.21
272 0.21
273 0.2
274 0.2
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.2
279 0.2
280 0.2
281 0.22
282 0.19
283 0.18
284 0.18
285 0.17
286 0.16
287 0.18
288 0.18
289 0.19
290 0.19
291 0.18
292 0.22
293 0.22
294 0.22
295 0.22
296 0.19
297 0.17
298 0.17
299 0.17
300 0.13
301 0.09
302 0.09
303 0.08
304 0.08
305 0.08
306 0.08
307 0.1
308 0.13
309 0.15
310 0.14
311 0.21
312 0.25
313 0.32
314 0.36
315 0.41
316 0.42
317 0.5
318 0.57
319 0.56
320 0.56
321 0.58
322 0.57
323 0.53
324 0.51
325 0.5
326 0.43