Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CQI9

Protein Details
Accession A1CQI9    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MNASKASKKRKAVTRDVEEEHydrophilic
690-712ELSQRPYKTLRYHRKAIRAVKFHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
255-270KRRFVPSKHEAKRVMK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11, mito 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028598  BOP1/Erb1  
IPR012953  BOP1_N_dom  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005654  C:nucleoplasm  
GO:0070545  C:PeBoW complex  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070180  F:large ribosomal subunit rRNA binding  
GO:0043021  F:ribonucleoprotein complex binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG act:ACLA_026270  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08145  BOP1NT  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MNASKASKKRKAVTRDVEEEAGVFSGDELNADNLDGALSDNANDLSSDEDDSDSEIELVDEFSEDDEDDEELDSDEIPSDGEDAVKKKSVTTTDKSGEIAEDAESSSEEEELDFRIEKDANGNDRFIYDEINPDDNSEYSDVEENSNTIGDIPLSFYDQYPHIGYDINGKKILRPAKGEALDALLDSIEIPKGWTGLTDPSTGKPLELSQDELELLRKVQMNEIPEEGYNPYEPTVEWFTSQQEIMPLSAAPEPKRRFVPSKHEAKRVMKIVKAIREGRILPFKPPTEEDKEEDNVINYDLWADEAERPDHIMHIPAPKLPPPGYEESYHPPPEYLPDKKERKAWEEADPEDREQEFLPNDFGSLRRVPGYENFVKEKFERCLDLYLAPRVRRSKLNIDPESLLPKLPSPEELKPFPTACATVFRGHKGRVRSLAVDPSGLWLATAGDDGTVRVWELLTGRQLWSVKLSEEDPVNVVRWRPGKDALILAAAAGDDIYLAVPPIVDPEVEKASLDILDAGWGHAASVPALTPAEANKKNNPPKWIRPSSSLQESGVCAIIPLRYIAKSLSWHRRGDYFVTVCPGSSTPASVAIAIHTLSKHLTQYPFRRRIKGGGSPQAAHFHPSKPILFVANQRSIRAYDLSRQLLVKILQPGARWISSFDIHPTSSTASGGDNLIVGSYDRRLLWHDLELSQRPYKTLRYHRKAIRAVKFHPGGRYPLFADASDDGSLQIFHGSVTGDMLSNATIVPLKVLKGHKITGELGVLDIDWHPREPWCVSAGADGTCRLWM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.8
3 0.75
4 0.67
5 0.58
6 0.49
7 0.38
8 0.28
9 0.19
10 0.12
11 0.08
12 0.08
13 0.08
14 0.08
15 0.08
16 0.09
17 0.09
18 0.09
19 0.09
20 0.07
21 0.07
22 0.07
23 0.07
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.09
31 0.08
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.11
36 0.12
37 0.12
38 0.13
39 0.14
40 0.11
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.08
46 0.06
47 0.06
48 0.06
49 0.06
50 0.07
51 0.07
52 0.07
53 0.08
54 0.08
55 0.08
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.08
63 0.07
64 0.06
65 0.06
66 0.07
67 0.07
68 0.08
69 0.11
70 0.13
71 0.17
72 0.21
73 0.21
74 0.22
75 0.27
76 0.34
77 0.38
78 0.42
79 0.47
80 0.46
81 0.48
82 0.47
83 0.42
84 0.34
85 0.27
86 0.22
87 0.14
88 0.11
89 0.1
90 0.09
91 0.09
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.07
97 0.07
98 0.08
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.13
103 0.14
104 0.14
105 0.19
106 0.24
107 0.29
108 0.3
109 0.31
110 0.27
111 0.27
112 0.29
113 0.24
114 0.21
115 0.15
116 0.19
117 0.21
118 0.24
119 0.24
120 0.23
121 0.24
122 0.21
123 0.22
124 0.17
125 0.14
126 0.13
127 0.16
128 0.15
129 0.15
130 0.16
131 0.14
132 0.13
133 0.13
134 0.11
135 0.08
136 0.08
137 0.06
138 0.06
139 0.08
140 0.08
141 0.1
142 0.11
143 0.11
144 0.13
145 0.13
146 0.16
147 0.15
148 0.15
149 0.13
150 0.14
151 0.14
152 0.22
153 0.26
154 0.27
155 0.28
156 0.28
157 0.3
158 0.36
159 0.42
160 0.36
161 0.36
162 0.38
163 0.44
164 0.45
165 0.43
166 0.37
167 0.32
168 0.28
169 0.23
170 0.18
171 0.09
172 0.07
173 0.07
174 0.07
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.07
183 0.12
184 0.14
185 0.17
186 0.18
187 0.19
188 0.22
189 0.22
190 0.2
191 0.16
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.19
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.17
201 0.13
202 0.12
203 0.12
204 0.15
205 0.14
206 0.18
207 0.2
208 0.21
209 0.22
210 0.23
211 0.21
212 0.18
213 0.19
214 0.16
215 0.15
216 0.13
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.1
221 0.13
222 0.16
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.19
228 0.19
229 0.15
230 0.12
231 0.12
232 0.11
233 0.11
234 0.09
235 0.09
236 0.12
237 0.14
238 0.15
239 0.23
240 0.25
241 0.28
242 0.32
243 0.36
244 0.4
245 0.43
246 0.51
247 0.51
248 0.6
249 0.63
250 0.67
251 0.69
252 0.67
253 0.67
254 0.65
255 0.6
256 0.51
257 0.51
258 0.49
259 0.48
260 0.5
261 0.45
262 0.4
263 0.4
264 0.39
265 0.37
266 0.41
267 0.35
268 0.32
269 0.35
270 0.33
271 0.32
272 0.34
273 0.35
274 0.34
275 0.36
276 0.35
277 0.34
278 0.34
279 0.33
280 0.31
281 0.26
282 0.18
283 0.16
284 0.13
285 0.09
286 0.08
287 0.06
288 0.06
289 0.05
290 0.06
291 0.07
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.11
296 0.11
297 0.12
298 0.11
299 0.1
300 0.11
301 0.15
302 0.15
303 0.16
304 0.18
305 0.19
306 0.22
307 0.21
308 0.2
309 0.2
310 0.25
311 0.25
312 0.25
313 0.27
314 0.29
315 0.34
316 0.34
317 0.29
318 0.24
319 0.21
320 0.25
321 0.27
322 0.25
323 0.25
324 0.33
325 0.38
326 0.41
327 0.46
328 0.45
329 0.45
330 0.48
331 0.47
332 0.45
333 0.45
334 0.44
335 0.45
336 0.42
337 0.37
338 0.32
339 0.29
340 0.22
341 0.17
342 0.18
343 0.12
344 0.11
345 0.12
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.11
351 0.11
352 0.11
353 0.11
354 0.11
355 0.12
356 0.15
357 0.21
358 0.21
359 0.23
360 0.25
361 0.25
362 0.27
363 0.27
364 0.28
365 0.23
366 0.21
367 0.2
368 0.18
369 0.2
370 0.19
371 0.21
372 0.19
373 0.22
374 0.25
375 0.23
376 0.26
377 0.27
378 0.28
379 0.29
380 0.32
381 0.36
382 0.4
383 0.49
384 0.47
385 0.46
386 0.46
387 0.43
388 0.41
389 0.32
390 0.24
391 0.14
392 0.14
393 0.12
394 0.11
395 0.13
396 0.14
397 0.18
398 0.22
399 0.24
400 0.25
401 0.26
402 0.26
403 0.24
404 0.2
405 0.17
406 0.13
407 0.16
408 0.17
409 0.19
410 0.2
411 0.22
412 0.25
413 0.27
414 0.3
415 0.29
416 0.3
417 0.3
418 0.31
419 0.3
420 0.29
421 0.31
422 0.27
423 0.24
424 0.21
425 0.17
426 0.15
427 0.12
428 0.1
429 0.06
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.04
434 0.03
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.04
443 0.05
444 0.07
445 0.08
446 0.09
447 0.1
448 0.13
449 0.13
450 0.13
451 0.14
452 0.14
453 0.12
454 0.13
455 0.13
456 0.13
457 0.13
458 0.13
459 0.11
460 0.11
461 0.12
462 0.12
463 0.12
464 0.14
465 0.18
466 0.2
467 0.22
468 0.24
469 0.25
470 0.25
471 0.26
472 0.22
473 0.18
474 0.15
475 0.12
476 0.09
477 0.07
478 0.05
479 0.04
480 0.03
481 0.02
482 0.02
483 0.02
484 0.02
485 0.02
486 0.02
487 0.02
488 0.03
489 0.04
490 0.04
491 0.04
492 0.05
493 0.08
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.06
502 0.04
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.06
510 0.06
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.08
519 0.16
520 0.2
521 0.24
522 0.3
523 0.4
524 0.49
525 0.53
526 0.58
527 0.58
528 0.64
529 0.71
530 0.72
531 0.66
532 0.63
533 0.65
534 0.63
535 0.62
536 0.53
537 0.44
538 0.37
539 0.34
540 0.29
541 0.23
542 0.16
543 0.1
544 0.09
545 0.08
546 0.07
547 0.08
548 0.08
549 0.08
550 0.09
551 0.1
552 0.11
553 0.17
554 0.25
555 0.34
556 0.38
557 0.4
558 0.41
559 0.43
560 0.44
561 0.42
562 0.41
563 0.33
564 0.28
565 0.3
566 0.28
567 0.25
568 0.24
569 0.21
570 0.15
571 0.13
572 0.13
573 0.1
574 0.13
575 0.13
576 0.12
577 0.11
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.1
582 0.08
583 0.08
584 0.09
585 0.11
586 0.12
587 0.15
588 0.2
589 0.27
590 0.38
591 0.48
592 0.57
593 0.6
594 0.64
595 0.62
596 0.64
597 0.64
598 0.63
599 0.61
600 0.6
601 0.6
602 0.55
603 0.55
604 0.52
605 0.45
606 0.39
607 0.32
608 0.24
609 0.26
610 0.28
611 0.26
612 0.24
613 0.25
614 0.24
615 0.25
616 0.3
617 0.33
618 0.38
619 0.38
620 0.37
621 0.38
622 0.36
623 0.35
624 0.32
625 0.26
626 0.25
627 0.31
628 0.33
629 0.33
630 0.32
631 0.3
632 0.31
633 0.3
634 0.27
635 0.24
636 0.25
637 0.25
638 0.25
639 0.29
640 0.28
641 0.28
642 0.24
643 0.21
644 0.22
645 0.21
646 0.22
647 0.22
648 0.21
649 0.21
650 0.21
651 0.21
652 0.2
653 0.19
654 0.18
655 0.15
656 0.12
657 0.13
658 0.13
659 0.11
660 0.09
661 0.08
662 0.08
663 0.07
664 0.07
665 0.07
666 0.08
667 0.1
668 0.1
669 0.11
670 0.15
671 0.2
672 0.22
673 0.25
674 0.26
675 0.27
676 0.33
677 0.37
678 0.38
679 0.39
680 0.36
681 0.34
682 0.34
683 0.39
684 0.43
685 0.49
686 0.55
687 0.58
688 0.68
689 0.73
690 0.8
691 0.82
692 0.82
693 0.81
694 0.78
695 0.73
696 0.73
697 0.72
698 0.65
699 0.63
700 0.56
701 0.53
702 0.48
703 0.47
704 0.39
705 0.39
706 0.37
707 0.3
708 0.31
709 0.26
710 0.26
711 0.23
712 0.21
713 0.16
714 0.14
715 0.14
716 0.1
717 0.1
718 0.07
719 0.06
720 0.07
721 0.07
722 0.07
723 0.08
724 0.09
725 0.08
726 0.08
727 0.09
728 0.08
729 0.08
730 0.07
731 0.07
732 0.08
733 0.07
734 0.1
735 0.11
736 0.12
737 0.19
738 0.23
739 0.29
740 0.32
741 0.35
742 0.35
743 0.38
744 0.39
745 0.35
746 0.33
747 0.27
748 0.22
749 0.19
750 0.17
751 0.13
752 0.13
753 0.14
754 0.13
755 0.15
756 0.15
757 0.17
758 0.21
759 0.22
760 0.24
761 0.22
762 0.22
763 0.21
764 0.25
765 0.25
766 0.23
767 0.23
768 0.21