Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CQA9

Protein Details
Accession A1CQA9    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-132GSTYSSSRRSRRDDDRYEKSRREDGRGHRRSRSPERRYRDRDRDRESYRRRDRSLDRRDDYRNDGGYRSNRRDRSRDRRRSRDRGDDRDHRRRSRDRDYRSRRDDSRDKARRRTDDSADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-127RYEKSRREDGRGHRRSRSPERRYRDRDRDRESYRRRDRSLDRRDDYRNDGGYRSNRRDRSRDRRRSRDRGDDRDHRRRSRDRDYRSRRDDSRDKARRRT
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG act:ACLA_025470  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17953  DEADc_DDX46  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MARHGDTRSPSPVGSTYSSSRRSRRDDDRYEKSRREDGRGHRRSRSPERRYRDRDRDRESYRRRDRSLDRRDDYRNDGGYRSNRRDRSRDRRRSRDRGDDRDHRRRSRDRDYRSRRDDSRDKARRRTDDSADLKHKSRRDDSRTRDLDSKSRDTSKPSTPAPAAQTEDEKRAERLAKLEAWKQKQAAEKERKQREAAAAGGARSILEEIDRKSGLSPAVGSPKSPVTPTTDATPAPYAGKFDPKAIKRNAAPTPSAPLVLGNDVAVPQIAKASATFSSMNNHAQANKPAAALSTAPSTLKSKRNVGGFGLGAKQVADAEKPSAVKTLGFGEEESTRKKLERLPTPPLEDGKDETVAADMGAEDEDDDMQDGETEEENAAAARAAAERREERLQNEALRAQSSEKVPQTNGDVEMNDAPIQAEAENMEVDVEEEDVDPLDAFMSELAESAPPKKTFGTKFSKAKEQQPEAMFGDENDVDLTAVGEGDADDFLAIANKAKKKKDIPTVNHEKVEYEPFRKKFYTEPSNLAQMTDEEAASLRLELDGIKVRGVDVPKPVQKWSQCGLGVQALDVIERLGYESPTSIQSQAIPAIMSGRDVIGVAKTGSGKTVAFLIPMFRHIKDQRPLDNMEGPIGLIMTPTRELATQIHKDCKPFLKALNLRAVCAYGGAPIKDQIADLKRGAEIVVCTPGRMIDLLAANAGRVTNLRRVTYVVLDEADRMFDMGFEPQVMKIMANIRPDRQTVLFSATFPRNMEALARKALTKPIEIIVGGRSVVAPEITQIVEVRNEDTKFVRLLEILGNLYSDDANEDARSLIFVERQEAADALLRELMRKGYPCMSIHGGKDQIDRDSTIEDFKAGIFPVLIATSVAARGLDVKQLKLVVNYDAPNHLEDYVHRAGRTGRAGNTGTAVTFLTEEQERYSVDIAKALKQSGQQVPEPVQKMVDSFLEKVKAGKEKASASGFGGKGLERLDQERDAARNRERRTYKTGEEGEDEEEKEDKAEKADERFNKALSSVQSAAAAAPTLPGVPKGIDLDGKITVHRTEKDPAGTSKNPLDKVGSAVADIHARLSRAGVMRSGVPIDNRGPDAGAYHATLEINDFPQKARWAVTNRTNVAKILEATGTSITTKGSFYPPGKVPGPNENAKLYILVEGETELAVTNAMRELMRLLKEGTIAAADSDARAPVGGRYNVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.32
3 0.33
4 0.38
5 0.47
6 0.51
7 0.56
8 0.6
9 0.64
10 0.69
11 0.74
12 0.76
13 0.79
14 0.82
15 0.84
16 0.84
17 0.85
18 0.83
19 0.78
20 0.77
21 0.71
22 0.7
23 0.68
24 0.71
25 0.73
26 0.76
27 0.77
28 0.76
29 0.79
30 0.8
31 0.82
32 0.83
33 0.82
34 0.82
35 0.85
36 0.87
37 0.89
38 0.9
39 0.9
40 0.9
41 0.89
42 0.87
43 0.88
44 0.85
45 0.87
46 0.86
47 0.86
48 0.85
49 0.85
50 0.81
51 0.8
52 0.82
53 0.82
54 0.83
55 0.83
56 0.77
57 0.75
58 0.78
59 0.75
60 0.72
61 0.69
62 0.64
63 0.55
64 0.51
65 0.52
66 0.54
67 0.57
68 0.6
69 0.61
70 0.64
71 0.69
72 0.77
73 0.81
74 0.83
75 0.84
76 0.86
77 0.88
78 0.9
79 0.94
80 0.94
81 0.93
82 0.93
83 0.91
84 0.9
85 0.89
86 0.88
87 0.88
88 0.88
89 0.88
90 0.85
91 0.85
92 0.84
93 0.84
94 0.84
95 0.84
96 0.84
97 0.86
98 0.88
99 0.89
100 0.88
101 0.88
102 0.82
103 0.82
104 0.81
105 0.79
106 0.79
107 0.79
108 0.79
109 0.8
110 0.84
111 0.82
112 0.82
113 0.8
114 0.76
115 0.76
116 0.74
117 0.74
118 0.71
119 0.67
120 0.64
121 0.63
122 0.6
123 0.57
124 0.6
125 0.61
126 0.63
127 0.69
128 0.72
129 0.76
130 0.76
131 0.73
132 0.71
133 0.65
134 0.64
135 0.61
136 0.6
137 0.55
138 0.58
139 0.55
140 0.55
141 0.56
142 0.56
143 0.56
144 0.51
145 0.52
146 0.47
147 0.5
148 0.47
149 0.46
150 0.41
151 0.36
152 0.41
153 0.37
154 0.4
155 0.38
156 0.36
157 0.32
158 0.34
159 0.36
160 0.3
161 0.3
162 0.3
163 0.33
164 0.36
165 0.42
166 0.46
167 0.48
168 0.51
169 0.5
170 0.5
171 0.52
172 0.56
173 0.59
174 0.61
175 0.64
176 0.69
177 0.77
178 0.77
179 0.71
180 0.68
181 0.63
182 0.56
183 0.49
184 0.45
185 0.37
186 0.32
187 0.3
188 0.25
189 0.18
190 0.15
191 0.13
192 0.07
193 0.07
194 0.1
195 0.12
196 0.16
197 0.17
198 0.17
199 0.17
200 0.2
201 0.19
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.25
206 0.24
207 0.24
208 0.24
209 0.27
210 0.27
211 0.26
212 0.23
213 0.22
214 0.26
215 0.27
216 0.28
217 0.27
218 0.26
219 0.28
220 0.28
221 0.22
222 0.2
223 0.19
224 0.19
225 0.18
226 0.26
227 0.24
228 0.28
229 0.36
230 0.38
231 0.46
232 0.47
233 0.53
234 0.48
235 0.55
236 0.56
237 0.51
238 0.49
239 0.42
240 0.44
241 0.38
242 0.35
243 0.27
244 0.21
245 0.19
246 0.17
247 0.16
248 0.1
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.08
260 0.08
261 0.11
262 0.12
263 0.12
264 0.16
265 0.19
266 0.21
267 0.2
268 0.21
269 0.2
270 0.23
271 0.26
272 0.26
273 0.25
274 0.23
275 0.21
276 0.21
277 0.2
278 0.17
279 0.14
280 0.12
281 0.11
282 0.11
283 0.13
284 0.16
285 0.21
286 0.27
287 0.3
288 0.34
289 0.38
290 0.41
291 0.42
292 0.4
293 0.38
294 0.32
295 0.29
296 0.25
297 0.2
298 0.17
299 0.15
300 0.13
301 0.09
302 0.1
303 0.09
304 0.08
305 0.09
306 0.12
307 0.12
308 0.13
309 0.14
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.14
317 0.14
318 0.17
319 0.19
320 0.21
321 0.19
322 0.19
323 0.19
324 0.22
325 0.26
326 0.31
327 0.38
328 0.42
329 0.49
330 0.53
331 0.57
332 0.57
333 0.54
334 0.47
335 0.39
336 0.35
337 0.28
338 0.24
339 0.19
340 0.16
341 0.14
342 0.12
343 0.1
344 0.07
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.03
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.04
355 0.04
356 0.04
357 0.05
358 0.06
359 0.06
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.05
370 0.06
371 0.07
372 0.11
373 0.13
374 0.17
375 0.22
376 0.24
377 0.24
378 0.28
379 0.31
380 0.29
381 0.31
382 0.29
383 0.25
384 0.24
385 0.23
386 0.2
387 0.2
388 0.2
389 0.23
390 0.23
391 0.24
392 0.23
393 0.24
394 0.25
395 0.23
396 0.23
397 0.19
398 0.16
399 0.16
400 0.16
401 0.16
402 0.13
403 0.1
404 0.09
405 0.07
406 0.08
407 0.06
408 0.05
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.05
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.03
427 0.03
428 0.03
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.06
435 0.08
436 0.13
437 0.13
438 0.14
439 0.16
440 0.22
441 0.24
442 0.32
443 0.39
444 0.42
445 0.49
446 0.51
447 0.59
448 0.57
449 0.62
450 0.63
451 0.58
452 0.56
453 0.5
454 0.51
455 0.42
456 0.39
457 0.31
458 0.22
459 0.21
460 0.14
461 0.13
462 0.09
463 0.08
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.03
468 0.03
469 0.03
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.03
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.03
478 0.04
479 0.04
480 0.06
481 0.11
482 0.16
483 0.22
484 0.24
485 0.3
486 0.35
487 0.43
488 0.51
489 0.56
490 0.58
491 0.63
492 0.71
493 0.69
494 0.65
495 0.57
496 0.47
497 0.39
498 0.4
499 0.33
500 0.28
501 0.32
502 0.32
503 0.36
504 0.36
505 0.35
506 0.33
507 0.39
508 0.43
509 0.38
510 0.41
511 0.39
512 0.43
513 0.41
514 0.36
515 0.27
516 0.18
517 0.17
518 0.14
519 0.11
520 0.07
521 0.07
522 0.07
523 0.07
524 0.07
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.06
530 0.09
531 0.09
532 0.09
533 0.09
534 0.1
535 0.12
536 0.13
537 0.14
538 0.14
539 0.19
540 0.22
541 0.24
542 0.25
543 0.27
544 0.28
545 0.3
546 0.29
547 0.28
548 0.25
549 0.24
550 0.24
551 0.21
552 0.19
553 0.15
554 0.13
555 0.08
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.03
560 0.03
561 0.04
562 0.04
563 0.04
564 0.04
565 0.05
566 0.06
567 0.07
568 0.08
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.09
573 0.09
574 0.09
575 0.07
576 0.06
577 0.07
578 0.06
579 0.06
580 0.05
581 0.05
582 0.04
583 0.05
584 0.05
585 0.04
586 0.05
587 0.04
588 0.05
589 0.06
590 0.06
591 0.06
592 0.07
593 0.07
594 0.06
595 0.08
596 0.07
597 0.07
598 0.07
599 0.09
600 0.08
601 0.12
602 0.14
603 0.12
604 0.18
605 0.2
606 0.27
607 0.32
608 0.36
609 0.37
610 0.39
611 0.4
612 0.36
613 0.38
614 0.31
615 0.25
616 0.2
617 0.16
618 0.12
619 0.1
620 0.07
621 0.04
622 0.04
623 0.04
624 0.04
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.07
629 0.09
630 0.15
631 0.2
632 0.23
633 0.29
634 0.3
635 0.31
636 0.33
637 0.35
638 0.32
639 0.28
640 0.28
641 0.32
642 0.34
643 0.37
644 0.43
645 0.38
646 0.36
647 0.34
648 0.32
649 0.21
650 0.18
651 0.14
652 0.08
653 0.09
654 0.09
655 0.09
656 0.1
657 0.1
658 0.1
659 0.1
660 0.11
661 0.12
662 0.15
663 0.15
664 0.15
665 0.14
666 0.14
667 0.14
668 0.11
669 0.09
670 0.07
671 0.12
672 0.11
673 0.11
674 0.11
675 0.11
676 0.11
677 0.1
678 0.09
679 0.06
680 0.07
681 0.07
682 0.08
683 0.08
684 0.07
685 0.07
686 0.07
687 0.04
688 0.05
689 0.07
690 0.13
691 0.15
692 0.16
693 0.16
694 0.18
695 0.19
696 0.2
697 0.19
698 0.13
699 0.12
700 0.11
701 0.11
702 0.1
703 0.09
704 0.07
705 0.06
706 0.05
707 0.05
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.06
713 0.06
714 0.07
715 0.07
716 0.07
717 0.08
718 0.13
719 0.16
720 0.21
721 0.23
722 0.24
723 0.26
724 0.27
725 0.27
726 0.24
727 0.22
728 0.17
729 0.21
730 0.19
731 0.17
732 0.22
733 0.2
734 0.21
735 0.2
736 0.2
737 0.14
738 0.14
739 0.17
740 0.16
741 0.17
742 0.18
743 0.18
744 0.18
745 0.19
746 0.23
747 0.22
748 0.19
749 0.18
750 0.16
751 0.16
752 0.15
753 0.15
754 0.11
755 0.1
756 0.1
757 0.08
758 0.07
759 0.06
760 0.06
761 0.06
762 0.04
763 0.04
764 0.06
765 0.06
766 0.06
767 0.07
768 0.07
769 0.09
770 0.09
771 0.11
772 0.14
773 0.14
774 0.15
775 0.16
776 0.17
777 0.16
778 0.16
779 0.15
780 0.11
781 0.12
782 0.12
783 0.13
784 0.11
785 0.1
786 0.1
787 0.09
788 0.09
789 0.08
790 0.06
791 0.05
792 0.05
793 0.06
794 0.06
795 0.06
796 0.06
797 0.06
798 0.06
799 0.07
800 0.07
801 0.09
802 0.09
803 0.11
804 0.12
805 0.13
806 0.13
807 0.12
808 0.12
809 0.13
810 0.13
811 0.11
812 0.13
813 0.12
814 0.12
815 0.13
816 0.14
817 0.13
818 0.14
819 0.16
820 0.17
821 0.21
822 0.22
823 0.25
824 0.28
825 0.29
826 0.29
827 0.31
828 0.3
829 0.28
830 0.3
831 0.28
832 0.25
833 0.23
834 0.23
835 0.19
836 0.18
837 0.17
838 0.15
839 0.14
840 0.12
841 0.11
842 0.1
843 0.11
844 0.09
845 0.08
846 0.06
847 0.06
848 0.07
849 0.06
850 0.06
851 0.05
852 0.05
853 0.05
854 0.05
855 0.05
856 0.04
857 0.04
858 0.07
859 0.07
860 0.13
861 0.14
862 0.14
863 0.16
864 0.18
865 0.19
866 0.19
867 0.19
868 0.16
869 0.19
870 0.2
871 0.19
872 0.19
873 0.2
874 0.19
875 0.18
876 0.16
877 0.13
878 0.12
879 0.18
880 0.21
881 0.22
882 0.21
883 0.21
884 0.22
885 0.27
886 0.32
887 0.28
888 0.25
889 0.29
890 0.3
891 0.29
892 0.29
893 0.24
894 0.18
895 0.15
896 0.14
897 0.09
898 0.08
899 0.08
900 0.09
901 0.09
902 0.1
903 0.1
904 0.12
905 0.11
906 0.13
907 0.14
908 0.15
909 0.15
910 0.18
911 0.19
912 0.22
913 0.24
914 0.23
915 0.24
916 0.23
917 0.29
918 0.31
919 0.33
920 0.3
921 0.31
922 0.35
923 0.4
924 0.4
925 0.33
926 0.29
927 0.25
928 0.24
929 0.22
930 0.21
931 0.17
932 0.16
933 0.19
934 0.21
935 0.21
936 0.22
937 0.25
938 0.28
939 0.27
940 0.3
941 0.31
942 0.31
943 0.36
944 0.37
945 0.33
946 0.29
947 0.34
948 0.3
949 0.27
950 0.25
951 0.2
952 0.19
953 0.19
954 0.19
955 0.14
956 0.17
957 0.2
958 0.2
959 0.22
960 0.24
961 0.26
962 0.3
963 0.35
964 0.4
965 0.44
966 0.47
967 0.55
968 0.57
969 0.59
970 0.61
971 0.62
972 0.58
973 0.59
974 0.6
975 0.53
976 0.51
977 0.47
978 0.42
979 0.38
980 0.34
981 0.26
982 0.22
983 0.19
984 0.17
985 0.17
986 0.14
987 0.14
988 0.18
989 0.2
990 0.25
991 0.33
992 0.37
993 0.43
994 0.44
995 0.43
996 0.39
997 0.36
998 0.35
999 0.29
1000 0.31
1001 0.24
1002 0.23
1003 0.23
1004 0.22
1005 0.21
1006 0.17
1007 0.15
1008 0.08
1009 0.07
1010 0.06
1011 0.06
1012 0.06
1013 0.07
1014 0.08
1015 0.08
1016 0.1
1017 0.11
1018 0.13
1019 0.14
1020 0.15
1021 0.17
1022 0.18
1023 0.18
1024 0.18
1025 0.18
1026 0.2
1027 0.23
1028 0.25
1029 0.26
1030 0.29
1031 0.33
1032 0.37
1033 0.39
1034 0.41
1035 0.43
1036 0.43
1037 0.44
1038 0.47
1039 0.49
1040 0.45
1041 0.42
1042 0.41
1043 0.34
1044 0.35
1045 0.35
1046 0.27
1047 0.21
1048 0.2
1049 0.2
1050 0.19
1051 0.17
1052 0.16
1053 0.14
1054 0.14
1055 0.13
1056 0.14
1057 0.17
1058 0.18
1059 0.2
1060 0.19
1061 0.19
1062 0.2
1063 0.21
1064 0.23
1065 0.2
1066 0.18
1067 0.21
1068 0.22
1069 0.24
1070 0.24
1071 0.23
1072 0.21
1073 0.19
1074 0.19
1075 0.17
1076 0.16
1077 0.13
1078 0.13
1079 0.14
1080 0.13
1081 0.13
1082 0.14
1083 0.14
1084 0.15
1085 0.18
1086 0.18
1087 0.18
1088 0.23
1089 0.26
1090 0.25
1091 0.25
1092 0.29
1093 0.33
1094 0.41
1095 0.49
1096 0.53
1097 0.54
1098 0.57
1099 0.57
1100 0.5
1101 0.46
1102 0.41
1103 0.32
1104 0.26
1105 0.23
1106 0.18
1107 0.18
1108 0.18
1109 0.17
1110 0.14
1111 0.13
1112 0.11
1113 0.11
1114 0.12
1115 0.13
1116 0.16
1117 0.23
1118 0.24
1119 0.32
1120 0.35
1121 0.4
1122 0.43
1123 0.45
1124 0.45
1125 0.47
1126 0.53
1127 0.51
1128 0.51
1129 0.47
1130 0.45
1131 0.41
1132 0.38
1133 0.28
1134 0.24
1135 0.18
1136 0.15
1137 0.13
1138 0.12
1139 0.12
1140 0.11
1141 0.1
1142 0.07
1143 0.06
1144 0.06
1145 0.06
1146 0.06
1147 0.06
1148 0.08
1149 0.08
1150 0.08
1151 0.11
1152 0.17
1153 0.19
1154 0.2
1155 0.21
1156 0.21
1157 0.22
1158 0.22
1159 0.2
1160 0.15
1161 0.13
1162 0.11
1163 0.11
1164 0.1
1165 0.1
1166 0.11
1167 0.1
1168 0.09
1169 0.09
1170 0.09
1171 0.12
1172 0.2