FuNGI

A0A1V2LS88

Protein Details

Accession

A0A1V2LS88

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
436-457	ALNDKSLKKKRSKVNEQTKFGF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 5, golg 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007148 SSU_processome_Utp12 IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Pfam	View protein in Pfam PF04003 Utp12

Amino Acid Sequences

MASNSLITSEFSGIPLKGIAFTNVSLDTPVLKYQPLNNSNADSLAPLALDNTSIPSTIVWLDESYFIVMYENKPYFDLFDSNDLTKISQHVDLIVSSSNASCACAVFDATTSQLYLMDTSNRFYRYTFDKYSAHEDAKLDLLSNFVIAELTETISKMALSPQSNERIYLMSNSLYQFDLGSKTIVGSLNLFVEKTNCFQVYDDYLLISSTNDRFINVVDLNHLKTTCIFVMNAPVIKFSLVKHKKKSLLAAIDQDGFVELFSEPLEQILSSSSLSSSSSSSTASKRRRRAANAVKSIQYNSILKVAEDVSGLFTKVDNMIFDHDNLIISYLQNENFFVLDRFNWFVNPIDQLEIKIARKKSSVDALKLRTQDKASLKNYSENSQNFTIRTGDNYIDLDPISIQDTDSPQENAEDDEDDIGDDFSTLVTRLDKSTNALNDKSLKKKRSKVNEQTKFGFQVGTLTTNISQALRNNDSSLFDSIINTATDENVVKSTISQLEQHTVLKILDKLAELVYKNKFKNTNEGADLGLGNSSINLTTWIRYVLVFHGTYLIGSSNGNADLRRRLGLLALSMKKRAGNMNRLLELKGSLSLVATKAAVIREVENLETNGTIDNDELVEEDVEYIEDEEDVDMLEKDLTDSDTENEQYIAETIDEGMESEDDLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.17
3	0.15
4	0.14
5	0.15
6	0.16
7	0.15
8	0.15
9	0.18
10	0.17
11	0.17
12	0.15
13	0.15
14	0.15
15	0.15
16	0.17
17	0.16
18	0.16
19	0.18
20	0.25
21	0.35
22	0.37
23	0.39
24	0.39
25	0.41
26	0.41
27	0.39
28	0.32
29	0.23
30	0.19
31	0.16
32	0.13
33	0.09
34	0.09
35	0.08
36	0.08
37	0.07
38	0.1
39	0.1
40	0.1
41	0.1
42	0.1
43	0.11
44	0.12
45	0.12
46	0.1
47	0.1
48	0.11
49	0.12
50	0.13
51	0.12
52	0.11
53	0.11
54	0.11
55	0.12
56	0.13
57	0.2
58	0.21
59	0.2
60	0.21
61	0.21
62	0.22
63	0.23
64	0.25
65	0.19
66	0.24
67	0.26
68	0.26
69	0.28
70	0.25
71	0.23
72	0.21
73	0.21
74	0.18
75	0.16
76	0.16
77	0.15
78	0.16
79	0.15
80	0.16
81	0.15
82	0.12
83	0.11
84	0.11
85	0.11
86	0.1
87	0.1
88	0.09
89	0.08
90	0.09
91	0.09
92	0.09
93	0.08
94	0.09
95	0.09
96	0.1
97	0.11
98	0.1
99	0.09
100	0.09
101	0.09
102	0.1
103	0.1
104	0.15
105	0.15
106	0.18
107	0.22
108	0.23
109	0.23
110	0.22
111	0.25
112	0.26
113	0.33
114	0.34
115	0.35
116	0.36
117	0.39
118	0.47
119	0.47
120	0.42
121	0.37
122	0.34
123	0.31
124	0.3
125	0.27
126	0.2
127	0.15
128	0.14
129	0.11
130	0.1
131	0.09
132	0.06
133	0.06
134	0.05
135	0.06
136	0.06
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.08
141	0.08
142	0.08
143	0.07
144	0.09
145	0.14
146	0.15
147	0.18
148	0.23
149	0.3
150	0.31
151	0.31
152	0.29
153	0.24
154	0.24
155	0.23
156	0.19
157	0.13
158	0.15
159	0.15
160	0.15
161	0.14
162	0.14
163	0.12
164	0.11
165	0.12
166	0.11
167	0.11
168	0.09
169	0.09
170	0.12
171	0.12
172	0.11
173	0.1
174	0.1
175	0.12
176	0.12
177	0.12
178	0.09
179	0.11
180	0.11
181	0.12
182	0.15
183	0.14
184	0.14
185	0.15
186	0.17
187	0.19
188	0.2
189	0.18
190	0.15
191	0.14
192	0.13
193	0.13
194	0.11
195	0.1
196	0.08
197	0.11
198	0.11
199	0.11
200	0.12
201	0.12
202	0.16
203	0.15
204	0.14
205	0.14
206	0.16
207	0.17
208	0.18
209	0.18
210	0.13
211	0.13
212	0.15
213	0.13
214	0.12
215	0.11
216	0.1
217	0.15
218	0.16
219	0.18
220	0.15
221	0.15
222	0.14
223	0.14
224	0.15
225	0.11
226	0.2
227	0.28
228	0.35
229	0.4
230	0.47
231	0.53
232	0.55
233	0.6
234	0.56
235	0.53
236	0.49
237	0.46
238	0.41
239	0.36
240	0.33
241	0.27
242	0.2
243	0.13
244	0.1
245	0.07
246	0.05
247	0.04
248	0.05
249	0.05
250	0.05
251	0.05
252	0.05
253	0.04
254	0.04
255	0.05
256	0.06
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.09
267	0.11
268	0.15
269	0.23
270	0.32
271	0.4
272	0.46
273	0.53
274	0.59
275	0.63
276	0.7
277	0.72
278	0.73
279	0.73
280	0.68
281	0.62
282	0.56
283	0.51
284	0.42
285	0.33
286	0.24
287	0.17
288	0.17
289	0.15
290	0.14
291	0.14
292	0.13
293	0.11
294	0.1
295	0.1
296	0.08
297	0.08
298	0.08
299	0.07
300	0.06
301	0.06
302	0.07
303	0.07
304	0.06
305	0.06
306	0.09
307	0.09
308	0.1
309	0.1
310	0.09
311	0.09
312	0.08
313	0.09
314	0.07
315	0.06
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.08
321	0.07
322	0.07
323	0.08
324	0.07
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.09
329	0.09
330	0.09
331	0.09
332	0.1
333	0.1
334	0.11
335	0.1
336	0.1
337	0.1
338	0.1
339	0.11
340	0.13
341	0.14
342	0.18
343	0.18
344	0.19
345	0.2
346	0.21
347	0.22
348	0.28
349	0.31
350	0.31
351	0.36
352	0.38
353	0.41
354	0.43
355	0.41
356	0.35
357	0.32
358	0.34
359	0.32
360	0.37
361	0.35
362	0.37
363	0.38
364	0.41
365	0.42
366	0.37
367	0.39
368	0.31
369	0.33
370	0.3
371	0.3
372	0.25
373	0.24
374	0.24
375	0.17
376	0.18
377	0.16
378	0.14
379	0.13
380	0.14
381	0.13
382	0.12
383	0.11
384	0.1
385	0.07
386	0.07
387	0.08
388	0.07
389	0.06
390	0.07
391	0.08
392	0.09
393	0.11
394	0.11
395	0.1
396	0.1
397	0.1
398	0.1
399	0.09
400	0.09
401	0.08
402	0.07
403	0.07
404	0.07
405	0.07
406	0.06
407	0.05
408	0.04
409	0.04
410	0.03
411	0.04
412	0.04
413	0.05
414	0.06
415	0.07
416	0.08
417	0.1
418	0.11
419	0.12
420	0.17
421	0.22
422	0.24
423	0.24
424	0.25
425	0.31
426	0.36
427	0.44
428	0.47
429	0.49
430	0.54
431	0.62
432	0.68
433	0.72
434	0.78
435	0.79
436	0.83
437	0.85
438	0.82
439	0.78
440	0.72
441	0.63
442	0.52
443	0.41
444	0.3
445	0.24
446	0.19
447	0.18
448	0.15
449	0.13
450	0.13
451	0.14
452	0.14
453	0.11
454	0.12
455	0.13
456	0.19
457	0.21
458	0.21
459	0.22
460	0.22
461	0.24
462	0.24
463	0.23
464	0.18
465	0.15
466	0.15
467	0.14
468	0.15
469	0.13
470	0.11
471	0.09
472	0.08
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.08
477	0.09
478	0.08
479	0.08
480	0.11
481	0.13
482	0.14
483	0.16
484	0.17
485	0.2
486	0.22
487	0.22
488	0.2
489	0.18
490	0.17
491	0.17
492	0.16
493	0.14
494	0.14
495	0.13
496	0.14
497	0.13
498	0.17
499	0.15
500	0.2
501	0.26
502	0.31
503	0.32
504	0.37
505	0.42
506	0.41
507	0.5
508	0.5
509	0.5
510	0.45
511	0.45
512	0.39
513	0.34
514	0.32
515	0.22
516	0.16
517	0.1
518	0.07
519	0.06
520	0.06
521	0.04
522	0.05
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.1
527	0.11
528	0.12
529	0.12
530	0.13
531	0.12
532	0.16
533	0.16
534	0.15
535	0.16
536	0.15
537	0.15
538	0.14
539	0.12
540	0.08
541	0.08
542	0.09
543	0.08
544	0.1
545	0.11
546	0.11
547	0.13
548	0.18
549	0.2
550	0.21
551	0.2
552	0.19
553	0.2
554	0.21
555	0.23
556	0.26
557	0.31
558	0.32
559	0.33
560	0.34
561	0.33
562	0.34
563	0.38
564	0.38
565	0.41
566	0.48
567	0.53
568	0.55
569	0.56
570	0.54
571	0.46
572	0.39
573	0.3
574	0.23
575	0.16
576	0.12
577	0.11
578	0.13
579	0.12
580	0.12
581	0.11
582	0.1
583	0.12
584	0.12
585	0.14
586	0.13
587	0.14
588	0.17
589	0.18
590	0.19
591	0.19
592	0.19
593	0.18
594	0.17
595	0.16
596	0.14
597	0.12
598	0.11
599	0.09
600	0.09
601	0.09
602	0.09
603	0.09
604	0.08
605	0.08
606	0.08
607	0.08
608	0.07
609	0.07
610	0.08
611	0.08
612	0.07
613	0.06
614	0.07
615	0.06
616	0.06
617	0.06
618	0.07
619	0.06
620	0.07
621	0.07
622	0.07
623	0.08
624	0.09
625	0.1
626	0.1
627	0.11
628	0.13
629	0.17
630	0.18
631	0.18
632	0.17
633	0.16
634	0.16
635	0.15
636	0.14
637	0.09
638	0.09
639	0.08
640	0.09
641	0.08
642	0.08
643	0.08
644	0.07

A0A1V2LS88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer