Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1V2LLA1

Protein Details
Accession A0A1V2LLA1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-28MAKSEIKKSKKSSSKKQEEKATKAVQKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-21KKSKKSSSKKQEEKA
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12447  RRM1_gar2  
Amino Acid Sequences MAKSEIKKSKKSSSKKQEEKATKAVQKKEETSSSESSSSSSDESSSSSDSESESSSNEEEEKKEESSDSDSDSDSDSDSDSGSGSSSEKEDDDDEEKKKDESSSDSDSDSSSSDEEEKEGESSKKRKAESSEEESTTASPEPESKKAKSEEPAGEPATLFVGRLSWNIDDAWLKREFEAYPGVISARVITDRSSGRSKGFGYVDFESKSVAEKALEEMQGKEIDGRPINVDLSNAKPKQQSGAERTNERAKQYGDSKSEPSDTLFIGNLSFDSTRDSVTEFFAEYGPIMGVRLPTHPETEQLKGFGYVQFESVDAAQKALDALNGEYLNNRAVRLDFSTPKPQNERGGFGGNRGGNRGRGGFGGNRGGRDRGGFSRPTGSNNTPVAFRGNKKTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.87
2 0.88
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.87
7 0.85
8 0.84
9 0.8
10 0.78
11 0.78
12 0.75
13 0.72
14 0.7
15 0.67
16 0.64
17 0.61
18 0.59
19 0.56
20 0.51
21 0.46
22 0.41
23 0.35
24 0.3
25 0.26
26 0.21
27 0.17
28 0.14
29 0.13
30 0.14
31 0.16
32 0.16
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.14
37 0.15
38 0.15
39 0.13
40 0.12
41 0.14
42 0.14
43 0.15
44 0.16
45 0.17
46 0.17
47 0.2
48 0.22
49 0.2
50 0.21
51 0.2
52 0.2
53 0.23
54 0.23
55 0.23
56 0.21
57 0.21
58 0.2
59 0.21
60 0.19
61 0.15
62 0.14
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.08
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.07
72 0.08
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.14
79 0.18
80 0.22
81 0.24
82 0.25
83 0.26
84 0.25
85 0.26
86 0.24
87 0.22
88 0.22
89 0.26
90 0.3
91 0.3
92 0.3
93 0.29
94 0.28
95 0.26
96 0.21
97 0.16
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.13
107 0.15
108 0.2
109 0.25
110 0.31
111 0.36
112 0.37
113 0.41
114 0.44
115 0.5
116 0.51
117 0.54
118 0.53
119 0.49
120 0.49
121 0.44
122 0.39
123 0.31
124 0.23
125 0.15
126 0.09
127 0.13
128 0.16
129 0.22
130 0.27
131 0.27
132 0.32
133 0.35
134 0.38
135 0.37
136 0.41
137 0.38
138 0.38
139 0.41
140 0.36
141 0.34
142 0.3
143 0.26
144 0.2
145 0.15
146 0.11
147 0.07
148 0.06
149 0.07
150 0.07
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.08
155 0.1
156 0.11
157 0.11
158 0.15
159 0.14
160 0.15
161 0.14
162 0.16
163 0.15
164 0.14
165 0.16
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.11
170 0.09
171 0.09
172 0.07
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.09
178 0.1
179 0.14
180 0.17
181 0.17
182 0.17
183 0.2
184 0.2
185 0.21
186 0.21
187 0.19
188 0.2
189 0.2
190 0.22
191 0.2
192 0.19
193 0.15
194 0.14
195 0.14
196 0.11
197 0.09
198 0.07
199 0.07
200 0.09
201 0.12
202 0.14
203 0.13
204 0.13
205 0.14
206 0.14
207 0.14
208 0.13
209 0.11
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.14
215 0.15
216 0.13
217 0.13
218 0.11
219 0.15
220 0.22
221 0.22
222 0.24
223 0.24
224 0.25
225 0.28
226 0.32
227 0.34
228 0.32
229 0.41
230 0.42
231 0.43
232 0.46
233 0.5
234 0.47
235 0.42
236 0.38
237 0.3
238 0.31
239 0.35
240 0.39
241 0.35
242 0.36
243 0.36
244 0.35
245 0.36
246 0.31
247 0.27
248 0.21
249 0.17
250 0.15
251 0.13
252 0.11
253 0.1
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.07
259 0.1
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.12
265 0.13
266 0.14
267 0.11
268 0.11
269 0.11
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.07
278 0.08
279 0.09
280 0.13
281 0.14
282 0.17
283 0.17
284 0.22
285 0.24
286 0.27
287 0.27
288 0.25
289 0.24
290 0.22
291 0.23
292 0.19
293 0.19
294 0.15
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.16
301 0.13
302 0.13
303 0.11
304 0.11
305 0.12
306 0.11
307 0.11
308 0.07
309 0.08
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.13
314 0.14
315 0.16
316 0.15
317 0.15
318 0.12
319 0.13
320 0.15
321 0.19
322 0.25
323 0.27
324 0.32
325 0.42
326 0.45
327 0.51
328 0.55
329 0.55
330 0.58
331 0.56
332 0.55
333 0.49
334 0.53
335 0.46
336 0.42
337 0.45
338 0.38
339 0.35
340 0.35
341 0.33
342 0.28
343 0.31
344 0.3
345 0.24
346 0.23
347 0.26
348 0.25
349 0.27
350 0.34
351 0.33
352 0.35
353 0.36
354 0.37
355 0.34
356 0.33
357 0.33
358 0.3
359 0.33
360 0.32
361 0.32
362 0.39
363 0.39
364 0.41
365 0.44
366 0.42
367 0.44
368 0.46
369 0.45
370 0.37
371 0.37
372 0.39
373 0.38
374 0.4
375 0.43