Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CHD7

Protein Details
Accession A1CHD7    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
53-75APVSPPKAMARNKKSPNNRTTADHydrophilic
296-323LPSQKPSATTPRKRRRRTVHSTPKHAEPHydrophilic
399-421ESPGKPGRKTWVRKRGVRTGRELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-312PRKRRRR
403-414KPGRKTWVRKRG
Subcellular Location(s) nucl 17, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014144  LigD_PE_domain  
KEGG act:ACLA_047610  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13298  LigD_N  
Amino Acid Sequences MDSSSPSFRTILLRPILDVMKRSVEGKNGPQHPPTGKQVLQDSEPSFPLTLYAPVSPPKAMARNKKSPNNRTTADLSAKQQISNKNPEPEQDLAAIEAGEIEVTDYLGVFSARLSQCARPLVSGLPRLPIKDWVELYQRNQHPKGRHFVVHQHDHPIAGPHYDLRLQFSETSSVSWSIMYGLPGDPNSRRLNRNATETRVHCLWNHLLETASARTGSMIIWDTGEYEILPSQKVPELLETDDSRSEVSDASISLLEEKADSEKLREAFKNGKIRLRLHGTRLPEDYTIILRLDKNLPSQKPSATTPRKRRRRTVHSTPKHAEPSTTSDSNSPSEDSRQAFHRKKADASPAGSHSDSDSTIDHQIRLNNAYPGATNTIGSIHQRRWFATFDRTNSGFVAESPGKPGRKTWVRKRGVRTGRELGSDAFYVRGPDVERSVVTGRLGRDVLEDESVEGFVSRRGWRAVLE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.31
2 0.35
3 0.38
4 0.34
5 0.34
6 0.29
7 0.29
8 0.29
9 0.31
10 0.29
11 0.31
12 0.35
13 0.41
14 0.47
15 0.49
16 0.52
17 0.52
18 0.56
19 0.54
20 0.54
21 0.53
22 0.51
23 0.47
24 0.47
25 0.51
26 0.48
27 0.46
28 0.46
29 0.41
30 0.36
31 0.35
32 0.32
33 0.26
34 0.22
35 0.2
36 0.15
37 0.16
38 0.15
39 0.15
40 0.16
41 0.19
42 0.21
43 0.2
44 0.21
45 0.24
46 0.3
47 0.37
48 0.46
49 0.52
50 0.6
51 0.69
52 0.77
53 0.82
54 0.84
55 0.84
56 0.8
57 0.73
58 0.68
59 0.64
60 0.61
61 0.57
62 0.5
63 0.45
64 0.46
65 0.45
66 0.42
67 0.42
68 0.44
69 0.44
70 0.5
71 0.53
72 0.51
73 0.51
74 0.51
75 0.51
76 0.45
77 0.4
78 0.31
79 0.26
80 0.2
81 0.19
82 0.16
83 0.11
84 0.08
85 0.06
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.03
90 0.03
91 0.03
92 0.03
93 0.03
94 0.04
95 0.04
96 0.04
97 0.04
98 0.12
99 0.12
100 0.15
101 0.18
102 0.19
103 0.24
104 0.28
105 0.28
106 0.21
107 0.22
108 0.24
109 0.26
110 0.29
111 0.26
112 0.27
113 0.28
114 0.29
115 0.28
116 0.31
117 0.29
118 0.29
119 0.3
120 0.28
121 0.34
122 0.36
123 0.39
124 0.41
125 0.43
126 0.46
127 0.49
128 0.51
129 0.51
130 0.53
131 0.58
132 0.53
133 0.52
134 0.47
135 0.52
136 0.54
137 0.55
138 0.51
139 0.48
140 0.43
141 0.4
142 0.37
143 0.32
144 0.24
145 0.17
146 0.16
147 0.11
148 0.13
149 0.15
150 0.15
151 0.15
152 0.16
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.19
157 0.16
158 0.17
159 0.14
160 0.14
161 0.12
162 0.11
163 0.1
164 0.09
165 0.09
166 0.09
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.09
171 0.12
172 0.11
173 0.15
174 0.2
175 0.24
176 0.26
177 0.29
178 0.36
179 0.37
180 0.45
181 0.44
182 0.43
183 0.45
184 0.43
185 0.44
186 0.36
187 0.35
188 0.26
189 0.26
190 0.24
191 0.2
192 0.19
193 0.16
194 0.15
195 0.14
196 0.15
197 0.12
198 0.1
199 0.08
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.05
213 0.05
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.07
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.11
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.07
234 0.07
235 0.06
236 0.05
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.12
250 0.14
251 0.18
252 0.18
253 0.2
254 0.25
255 0.32
256 0.4
257 0.39
258 0.42
259 0.43
260 0.45
261 0.47
262 0.49
263 0.45
264 0.42
265 0.44
266 0.42
267 0.41
268 0.4
269 0.36
270 0.28
271 0.26
272 0.21
273 0.18
274 0.15
275 0.12
276 0.12
277 0.1
278 0.13
279 0.15
280 0.16
281 0.21
282 0.27
283 0.28
284 0.31
285 0.33
286 0.32
287 0.32
288 0.34
289 0.38
290 0.42
291 0.5
292 0.58
293 0.66
294 0.75
295 0.79
296 0.86
297 0.86
298 0.86
299 0.86
300 0.86
301 0.87
302 0.85
303 0.88
304 0.81
305 0.77
306 0.73
307 0.63
308 0.53
309 0.44
310 0.43
311 0.4
312 0.37
313 0.31
314 0.27
315 0.29
316 0.3
317 0.28
318 0.22
319 0.17
320 0.19
321 0.23
322 0.22
323 0.22
324 0.27
325 0.36
326 0.4
327 0.45
328 0.49
329 0.47
330 0.5
331 0.55
332 0.58
333 0.53
334 0.51
335 0.48
336 0.44
337 0.45
338 0.4
339 0.34
340 0.26
341 0.22
342 0.19
343 0.16
344 0.14
345 0.13
346 0.19
347 0.2
348 0.19
349 0.2
350 0.22
351 0.24
352 0.27
353 0.26
354 0.22
355 0.22
356 0.21
357 0.19
358 0.19
359 0.2
360 0.17
361 0.15
362 0.13
363 0.14
364 0.15
365 0.19
366 0.21
367 0.22
368 0.27
369 0.29
370 0.3
371 0.31
372 0.34
373 0.33
374 0.39
375 0.41
376 0.4
377 0.46
378 0.46
379 0.44
380 0.4
381 0.38
382 0.28
383 0.21
384 0.25
385 0.21
386 0.2
387 0.24
388 0.3
389 0.31
390 0.31
391 0.33
392 0.36
393 0.43
394 0.53
395 0.59
396 0.63
397 0.7
398 0.78
399 0.84
400 0.84
401 0.84
402 0.8
403 0.78
404 0.75
405 0.69
406 0.64
407 0.58
408 0.48
409 0.42
410 0.36
411 0.28
412 0.21
413 0.18
414 0.16
415 0.15
416 0.16
417 0.14
418 0.17
419 0.19
420 0.2
421 0.2
422 0.22
423 0.24
424 0.24
425 0.23
426 0.25
427 0.23
428 0.25
429 0.26
430 0.22
431 0.22
432 0.22
433 0.23
434 0.21
435 0.2
436 0.16
437 0.17
438 0.16
439 0.14
440 0.12
441 0.1
442 0.1
443 0.15
444 0.16
445 0.19
446 0.21