FuNGI

A0A1V2LMB1

Protein Details

Accession

A0A1V2LMB1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
346-374	LPVPINQKSKKRGGRKFRKMRERMKMSEV	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
352-370	QKSKKRGGRKFRKMRERMK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 13.5, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR042239 Nop_C IPR002687 Nop_dom IPR036070 Nop_dom_sf IPR027105 Prp31 IPR019175 Prp31_C
Gene Ontology	GO:0046540 C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex GO:0000244 P:spliceosomal tri-snRNP complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF01798 Nop PF09785 Prp31_C
PROSITE	View protein in PROSITE PS51358 NOP

Amino Acid Sequences

MSLTDALLNDLSDTSDLELEGLDDQESSNFESNSLSAQPHTVRYTINDLLTLSDLGTVQSIKEMCPLLNKAILLDKRLDELHEDVGENNRLSANEQDLLSQANGMISKIFSNFSVLNAFVKGKYESVWPDLYSIVKNPLAYIRLIMGVKFDIKSFKEKVTSGDLDFLTKDQIMSLTMSNNFLIRMGQSKIPDTHIQRLILEACDIQLQINQIQQKFRSFVTDRAQKISPNLAALVGSTVAAQLLSVTSLETLSCTPACNLSSLGKSSISSEGFIYNSDIVKSVPEDFRKQALRQVCAKVVLASRIDLNASRTNTLDDSIGTRWKQEIQERLEKMMLPPENVRVKPLPVPINQKSKKRGGRKFRKMRERMKMSEVEKAQNKIAFGQQEVTRTDAFGEEIGLGMLGKESVRDIGIVRGVQLSKGTREKLTAFAKGEEQPSGNDSRLAKLL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.09
2	0.09
3	0.09
4	0.09
5	0.08
6	0.08
7	0.09
8	0.09
9	0.07
10	0.07
11	0.07
12	0.08
13	0.1
14	0.13
15	0.15
16	0.15
17	0.15
18	0.16
19	0.16
20	0.18
21	0.19
22	0.16
23	0.13
24	0.18
25	0.2
26	0.24
27	0.26
28	0.24
29	0.23
30	0.26
31	0.32
32	0.31
33	0.3
34	0.26
35	0.24
36	0.24
37	0.24
38	0.2
39	0.13
40	0.11
41	0.1
42	0.09
43	0.1
44	0.09
45	0.07
46	0.11
47	0.11
48	0.11
49	0.15
50	0.16
51	0.15
52	0.21
53	0.23
54	0.22
55	0.25
56	0.24
57	0.22
58	0.28
59	0.3
60	0.26
61	0.27
62	0.25
63	0.24
64	0.25
65	0.25
66	0.2
67	0.2
68	0.21
69	0.19
70	0.19
71	0.17
72	0.22
73	0.24
74	0.21
75	0.19
76	0.17
77	0.16
78	0.17
79	0.19
80	0.17
81	0.17
82	0.17
83	0.17
84	0.16
85	0.18
86	0.16
87	0.13
88	0.1
89	0.09
90	0.09
91	0.08
92	0.08
93	0.07
94	0.08
95	0.09
96	0.1
97	0.08
98	0.12
99	0.12
100	0.13
101	0.14
102	0.14
103	0.14
104	0.15
105	0.15
106	0.12
107	0.14
108	0.14
109	0.12
110	0.13
111	0.16
112	0.17
113	0.2
114	0.21
115	0.19
116	0.19
117	0.19
118	0.2
119	0.17
120	0.16
121	0.17
122	0.16
123	0.16
124	0.15
125	0.17
126	0.17
127	0.16
128	0.15
129	0.12
130	0.14
131	0.14
132	0.13
133	0.11
134	0.11
135	0.13
136	0.12
137	0.12
138	0.13
139	0.14
140	0.2
141	0.21
142	0.23
143	0.25
144	0.26
145	0.28
146	0.31
147	0.32
148	0.27
149	0.29
150	0.26
151	0.23
152	0.23
153	0.2
154	0.14
155	0.12
156	0.11
157	0.07
158	0.07
159	0.07
160	0.08
161	0.08
162	0.09
163	0.1
164	0.11
165	0.11
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.08
170	0.07
171	0.09
172	0.1
173	0.13
174	0.13
175	0.16
176	0.17
177	0.2
178	0.25
179	0.25
180	0.31
181	0.31
182	0.31
183	0.28
184	0.29
185	0.26
186	0.21
187	0.18
188	0.11
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.06
193	0.07
194	0.07
195	0.08
196	0.1
197	0.13
198	0.14
199	0.16
200	0.17
201	0.18
202	0.19
203	0.18
204	0.22
205	0.21
206	0.25
207	0.31
208	0.38
209	0.37
210	0.39
211	0.4
212	0.33
213	0.33
214	0.31
215	0.23
216	0.16
217	0.16
218	0.12
219	0.11
220	0.1
221	0.09
222	0.05
223	0.04
224	0.04
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.03
229	0.03
230	0.02
231	0.03
232	0.03
233	0.03
234	0.03
235	0.03
236	0.03
237	0.04
238	0.04
239	0.06
240	0.06
241	0.07
242	0.07
243	0.09
244	0.09
245	0.09
246	0.11
247	0.12
248	0.13
249	0.14
250	0.15
251	0.13
252	0.13
253	0.14
254	0.16
255	0.14
256	0.14
257	0.13
258	0.13
259	0.13
260	0.13
261	0.13
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.09
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.12
270	0.15
271	0.18
272	0.21
273	0.22
274	0.28
275	0.31
276	0.31
277	0.33
278	0.34
279	0.36
280	0.38
281	0.4
282	0.36
283	0.33
284	0.33
285	0.3
286	0.26
287	0.25
288	0.2
289	0.17
290	0.15
291	0.14
292	0.15
293	0.13
294	0.15
295	0.18
296	0.19
297	0.19
298	0.19
299	0.2
300	0.2
301	0.2
302	0.16
303	0.11
304	0.13
305	0.14
306	0.19
307	0.17
308	0.17
309	0.18
310	0.22
311	0.26
312	0.29
313	0.35
314	0.37
315	0.46
316	0.46
317	0.48
318	0.45
319	0.41
320	0.36
321	0.35
322	0.3
323	0.23
324	0.23
325	0.28
326	0.34
327	0.33
328	0.37
329	0.31
330	0.32
331	0.34
332	0.4
333	0.38
334	0.36
335	0.46
336	0.48
337	0.58
338	0.61
339	0.65
340	0.65
341	0.69
342	0.73
343	0.74
344	0.77
345	0.78
346	0.83
347	0.86
348	0.91
349	0.91
350	0.93
351	0.92
352	0.92
353	0.92
354	0.89
355	0.83
356	0.79
357	0.77
358	0.68
359	0.66
360	0.59
361	0.57
362	0.53
363	0.51
364	0.47
365	0.41
366	0.4
367	0.34
368	0.35
369	0.29
370	0.25
371	0.28
372	0.26
373	0.28
374	0.29
375	0.3
376	0.25
377	0.23
378	0.22
379	0.18
380	0.16
381	0.12
382	0.11
383	0.08
384	0.08
385	0.08
386	0.07
387	0.06
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.04
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.13
399	0.17
400	0.16
401	0.16
402	0.2
403	0.2
404	0.2
405	0.24
406	0.23
407	0.26
408	0.33
409	0.35
410	0.32
411	0.36
412	0.37
413	0.41
414	0.44
415	0.44
416	0.4
417	0.39
418	0.42
419	0.43
420	0.43
421	0.38
422	0.34
423	0.28
424	0.29
425	0.31
426	0.27
427	0.27
428	0.26

A0A1V2LMB1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer