Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2U9R1W5

Protein Details
Accession A0A2U9R1W5    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-80ESQPVSAGTKKQNKNKNKTKNKNKNKNKNDIQKKGHEIIHydrophilic
99-131EIEAEKKMKKKARRKQKKQKRRQESKTESHIKPBasic
336-400KREAKLAAKKQAKKLAKKKKALKLKESEKKVPSEEKEKKKPEAGQKKKRKKSKADKNHKEHGDNABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-70KKQNKNKNKTKNKNKNKNKN
102-143AEKKMKKKARRKQKKQKRRQESKTESHIKPSRLKLRLKPKEP
330-394KKKLAEKREAKLAAKKQAKKLAKKKKALKLKESEKKVPSEEKEKKKPEAGQKKKRKKSKADKNHK
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSEQASSTDATKQIASKSKNITRHDNTGKSTNGPKNVDDRTESQPVSAGTKKQNKNKNKTKNKNKNKNKNDIQKKGHEIIDLDASLPQTEKQETKSKEEIEAEKKMKKKARRKQKKQKRRQESKTESHIKPSRLKLRLKPKEPIFKLTVRKLPPNLCQESFINKVVDFFPDFNDLVRNWYYCPGQYPDSQFEQSTLSRCYINCKSKDAMMAIGRAIKELTFVDDDKEPAVQEEGNTDVQDRPVEEKEYDNDEIYGEADEREVYKPVIEKSMYQEMPNLTKDNSVHVEQWDFFNGKLGEIAIYQRFCEAISEEGRTQLPADIFEYQTQYEKKKLAEKREAKLAAKKQAKKLAKKKKALKLKESEKKVPSEEKEKKKPEAGQKKKRKKSKADKNHKEHGDNAPASSTKSNNNKLVSTPAKGG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.38
3 0.41
4 0.49
5 0.55
6 0.62
7 0.65
8 0.68
9 0.66
10 0.72
11 0.74
12 0.71
13 0.68
14 0.66
15 0.63
16 0.57
17 0.61
18 0.57
19 0.56
20 0.53
21 0.51
22 0.52
23 0.54
24 0.53
25 0.48
26 0.45
27 0.43
28 0.48
29 0.44
30 0.37
31 0.35
32 0.33
33 0.34
34 0.34
35 0.34
36 0.36
37 0.46
38 0.54
39 0.6
40 0.69
41 0.73
42 0.8
43 0.85
44 0.87
45 0.88
46 0.91
47 0.94
48 0.95
49 0.96
50 0.96
51 0.96
52 0.96
53 0.95
54 0.95
55 0.94
56 0.93
57 0.93
58 0.92
59 0.88
60 0.86
61 0.83
62 0.77
63 0.69
64 0.6
65 0.5
66 0.42
67 0.38
68 0.3
69 0.23
70 0.19
71 0.17
72 0.15
73 0.14
74 0.13
75 0.12
76 0.15
77 0.16
78 0.2
79 0.29
80 0.32
81 0.39
82 0.44
83 0.43
84 0.45
85 0.48
86 0.5
87 0.47
88 0.53
89 0.5
90 0.49
91 0.52
92 0.56
93 0.58
94 0.61
95 0.66
96 0.67
97 0.74
98 0.8
99 0.87
100 0.9
101 0.94
102 0.95
103 0.96
104 0.97
105 0.97
106 0.96
107 0.95
108 0.95
109 0.93
110 0.9
111 0.9
112 0.88
113 0.77
114 0.76
115 0.72
116 0.65
117 0.63
118 0.63
119 0.62
120 0.6
121 0.66
122 0.64
123 0.7
124 0.75
125 0.73
126 0.73
127 0.71
128 0.75
129 0.71
130 0.68
131 0.61
132 0.58
133 0.6
134 0.57
135 0.56
136 0.49
137 0.52
138 0.52
139 0.52
140 0.52
141 0.54
142 0.52
143 0.46
144 0.45
145 0.41
146 0.41
147 0.39
148 0.34
149 0.27
150 0.22
151 0.22
152 0.2
153 0.2
154 0.16
155 0.13
156 0.12
157 0.15
158 0.15
159 0.14
160 0.15
161 0.13
162 0.15
163 0.16
164 0.15
165 0.12
166 0.15
167 0.16
168 0.14
169 0.17
170 0.17
171 0.18
172 0.21
173 0.24
174 0.25
175 0.27
176 0.28
177 0.24
178 0.22
179 0.22
180 0.2
181 0.19
182 0.17
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.21
187 0.26
188 0.32
189 0.32
190 0.34
191 0.34
192 0.34
193 0.36
194 0.3
195 0.26
196 0.19
197 0.18
198 0.15
199 0.16
200 0.15
201 0.13
202 0.12
203 0.08
204 0.08
205 0.07
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.1
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.11
214 0.09
215 0.07
216 0.08
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.09
221 0.09
222 0.09
223 0.1
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.13
230 0.15
231 0.14
232 0.15
233 0.17
234 0.22
235 0.22
236 0.19
237 0.17
238 0.15
239 0.15
240 0.13
241 0.11
242 0.07
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.09
251 0.12
252 0.12
253 0.17
254 0.16
255 0.16
256 0.2
257 0.29
258 0.29
259 0.26
260 0.29
261 0.26
262 0.29
263 0.3
264 0.26
265 0.18
266 0.2
267 0.2
268 0.21
269 0.23
270 0.21
271 0.21
272 0.2
273 0.22
274 0.2
275 0.21
276 0.19
277 0.17
278 0.15
279 0.2
280 0.18
281 0.16
282 0.16
283 0.15
284 0.12
285 0.12
286 0.15
287 0.12
288 0.13
289 0.13
290 0.13
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.11
295 0.12
296 0.14
297 0.17
298 0.17
299 0.2
300 0.2
301 0.19
302 0.18
303 0.17
304 0.15
305 0.12
306 0.14
307 0.15
308 0.16
309 0.17
310 0.18
311 0.16
312 0.21
313 0.24
314 0.24
315 0.26
316 0.28
317 0.31
318 0.38
319 0.44
320 0.49
321 0.56
322 0.61
323 0.62
324 0.69
325 0.7
326 0.66
327 0.68
328 0.65
329 0.64
330 0.66
331 0.68
332 0.67
333 0.71
334 0.76
335 0.78
336 0.81
337 0.82
338 0.83
339 0.86
340 0.88
341 0.88
342 0.9
343 0.88
344 0.88
345 0.87
346 0.88
347 0.87
348 0.85
349 0.85
350 0.79
351 0.75
352 0.7
353 0.69
354 0.64
355 0.65
356 0.67
357 0.69
358 0.75
359 0.76
360 0.76
361 0.75
362 0.77
363 0.77
364 0.79
365 0.79
366 0.8
367 0.84
368 0.89
369 0.92
370 0.94
371 0.93
372 0.93
373 0.93
374 0.93
375 0.93
376 0.94
377 0.95
378 0.93
379 0.93
380 0.9
381 0.82
382 0.77
383 0.74
384 0.73
385 0.63
386 0.55
387 0.49
388 0.42
389 0.41
390 0.39
391 0.33
392 0.32
393 0.4
394 0.47
395 0.5
396 0.53
397 0.51
398 0.5
399 0.57
400 0.53