Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1Z8JJG8

Protein Details
Accession A0A1Z8JJG8    Localization Confidence Low Confidence Score 7.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-40VSSNPTRPDSRKPNQYRPLKANCGFHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.833, nucl 13, cyto 10.5, cyto_mito 6.832
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000177  C:cytoplasmic exosome (RNase complex)  
GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0000467  P:exonucleolytic trimming to generate mature 3'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0070651  P:nonfunctional rRNA decay  
GO:0071038  P:nuclear polyadenylation-dependent tRNA catabolic process  
GO:0070478  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, 3'-5' exonucleolytic nonsense-mediated decay  
GO:0070481  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, non-stop decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
Amino Acid Sequences MVLSVTESSYIYDSLVSSNPTRPDSRKPNQYRPLKANCGFLPNSNGSSRIFNADSTECITSVKAKVVRNCKKSDLINVEIDIYGERDSSTLTQHLTTMIKQSLNDSFDYSVLKLTNKYYFQLYIDVSVLYLPEDFNYSSYTLYSILSLISMGVYLALKSAKLPLLVSEKEDFEVEEEPTFSDDWEASTYLIPRDPSKSFQPALAFVVGAVGNTVIIDPSLEEEQIIEHGIGITWSNDRITTPIQSLTLSSSNTKGLKPALIFKAIEVVRNVAKDVVNALNAISEQQVDVLDTAF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.13
3 0.15
4 0.16
5 0.21
6 0.25
7 0.28
8 0.33
9 0.36
10 0.44
11 0.51
12 0.58
13 0.64
14 0.7
15 0.77
16 0.81
17 0.87
18 0.85
19 0.84
20 0.84
21 0.82
22 0.76
23 0.73
24 0.64
25 0.61
26 0.54
27 0.47
28 0.44
29 0.37
30 0.37
31 0.3
32 0.3
33 0.25
34 0.27
35 0.26
36 0.24
37 0.22
38 0.19
39 0.23
40 0.22
41 0.22
42 0.22
43 0.21
44 0.16
45 0.16
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.21
50 0.23
51 0.27
52 0.34
53 0.45
54 0.54
55 0.57
56 0.6
57 0.59
58 0.59
59 0.57
60 0.59
61 0.55
62 0.49
63 0.45
64 0.41
65 0.37
66 0.31
67 0.29
68 0.2
69 0.14
70 0.1
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.07
75 0.07
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.13
82 0.13
83 0.13
84 0.15
85 0.16
86 0.16
87 0.16
88 0.18
89 0.2
90 0.2
91 0.2
92 0.18
93 0.16
94 0.16
95 0.17
96 0.14
97 0.12
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.13
102 0.17
103 0.17
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.18
108 0.2
109 0.18
110 0.14
111 0.14
112 0.12
113 0.11
114 0.09
115 0.08
116 0.06
117 0.06
118 0.04
119 0.04
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.06
132 0.05
133 0.05
134 0.05
135 0.04
136 0.03
137 0.03
138 0.02
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.06
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.09
151 0.14
152 0.15
153 0.17
154 0.17
155 0.16
156 0.17
157 0.17
158 0.14
159 0.1
160 0.11
161 0.09
162 0.08
163 0.08
164 0.08
165 0.09
166 0.09
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.09
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.12
179 0.12
180 0.16
181 0.18
182 0.2
183 0.24
184 0.29
185 0.28
186 0.3
187 0.3
188 0.27
189 0.27
190 0.24
191 0.19
192 0.13
193 0.14
194 0.11
195 0.09
196 0.07
197 0.05
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.05
206 0.06
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.06
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.11
226 0.13
227 0.15
228 0.16
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.18
233 0.19
234 0.2
235 0.19
236 0.18
237 0.19
238 0.23
239 0.25
240 0.24
241 0.23
242 0.22
243 0.25
244 0.25
245 0.32
246 0.31
247 0.33
248 0.33
249 0.3
250 0.36
251 0.32
252 0.33
253 0.26
254 0.26
255 0.25
256 0.25
257 0.26
258 0.21
259 0.21
260 0.18
261 0.21
262 0.2
263 0.18
264 0.17
265 0.16
266 0.14
267 0.14
268 0.14
269 0.11
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.08