Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CHU0

Protein Details
Accession A1CHU0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
419-440KFLERESQKGQRRSMKKYTKRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
377-411EIKKLRRADEEEKAEERRLAVEKIKKEERERLLRG
418-440RKFLERESQKGQRRSMKKYTKRA
Subcellular Location(s) cyto 12.5, cyto_nucl 10.5, nucl 7.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012879  CCDC47  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0016020  C:membrane  
GO:0005509  F:calcium ion binding  
GO:0032469  P:endoplasmic reticulum calcium ion homeostasis  
KEGG act:ACLA_049170  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07946  CCDC47  
Amino Acid Sequences MAGVFKNMFGGSQPSNPAKVEDDFADFVKAPEPSPVSIVAASSSSVPALDTQGATAVPYTKWYRVWERTSPKDFMQEAMVMPLLFLIVVFHLWGTRKNKRRAREWAQAHAPALQNEFAVVGFDGIHKSTAGGDAAAGELASPESILKEKSAQEFASYATGRQNVAFVDMTIKLPKRANPIIYWSDYALSFFFDSWQAPTETLDAIAYTFDGKEKDVVPVPGKDTSSLKVNNSTYDGFIWAVVHKNHMRNFRQDRYDASMTFTKDNAKLPPWVTVMTESAEITETLLTPELIQAIEKAGDNFKYLIITDQPIDKPTKIEETTPRKRVHLCVTLPSSSSGYAATLPLFNQFLRLPDKLVASAHFRPEVMRKIRNVREEEIKKLRRADEEEKAEERRLAVEKIKKEERERLLRGMTAEEQRKFLERESQKGQRRSMKKYTKRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.32
3 0.32
4 0.33
5 0.32
6 0.3
7 0.29
8 0.25
9 0.27
10 0.25
11 0.25
12 0.26
13 0.23
14 0.21
15 0.22
16 0.2
17 0.16
18 0.2
19 0.22
20 0.2
21 0.21
22 0.22
23 0.2
24 0.2
25 0.2
26 0.15
27 0.13
28 0.12
29 0.11
30 0.1
31 0.08
32 0.08
33 0.08
34 0.08
35 0.1
36 0.11
37 0.1
38 0.1
39 0.11
40 0.11
41 0.11
42 0.11
43 0.11
44 0.09
45 0.15
46 0.18
47 0.2
48 0.23
49 0.29
50 0.37
51 0.44
52 0.5
53 0.55
54 0.6
55 0.67
56 0.7
57 0.68
58 0.6
59 0.6
60 0.54
61 0.45
62 0.39
63 0.31
64 0.25
65 0.24
66 0.22
67 0.14
68 0.13
69 0.12
70 0.08
71 0.06
72 0.05
73 0.04
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.06
79 0.07
80 0.15
81 0.22
82 0.32
83 0.41
84 0.52
85 0.59
86 0.64
87 0.72
88 0.76
89 0.77
90 0.78
91 0.75
92 0.74
93 0.73
94 0.69
95 0.6
96 0.54
97 0.47
98 0.38
99 0.34
100 0.25
101 0.18
102 0.15
103 0.15
104 0.1
105 0.09
106 0.07
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.11
135 0.14
136 0.17
137 0.2
138 0.19
139 0.19
140 0.19
141 0.19
142 0.21
143 0.18
144 0.16
145 0.16
146 0.18
147 0.17
148 0.16
149 0.16
150 0.11
151 0.13
152 0.12
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.12
157 0.15
158 0.15
159 0.16
160 0.18
161 0.21
162 0.27
163 0.3
164 0.31
165 0.28
166 0.34
167 0.35
168 0.34
169 0.32
170 0.25
171 0.22
172 0.2
173 0.19
174 0.12
175 0.1
176 0.08
177 0.07
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.09
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.1
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.07
200 0.08
201 0.1
202 0.11
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.18
208 0.17
209 0.17
210 0.16
211 0.15
212 0.19
213 0.19
214 0.18
215 0.22
216 0.22
217 0.22
218 0.23
219 0.22
220 0.18
221 0.16
222 0.16
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.08
227 0.1
228 0.1
229 0.14
230 0.16
231 0.21
232 0.26
233 0.34
234 0.36
235 0.42
236 0.5
237 0.52
238 0.53
239 0.49
240 0.48
241 0.47
242 0.47
243 0.38
244 0.34
245 0.32
246 0.29
247 0.29
248 0.26
249 0.22
250 0.21
251 0.23
252 0.22
253 0.2
254 0.22
255 0.22
256 0.25
257 0.23
258 0.22
259 0.2
260 0.19
261 0.18
262 0.15
263 0.15
264 0.11
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.08
269 0.07
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.05
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.09
285 0.1
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.15
296 0.16
297 0.18
298 0.21
299 0.19
300 0.19
301 0.2
302 0.26
303 0.23
304 0.27
305 0.35
306 0.42
307 0.51
308 0.58
309 0.58
310 0.54
311 0.56
312 0.57
313 0.55
314 0.54
315 0.47
316 0.47
317 0.49
318 0.47
319 0.44
320 0.4
321 0.33
322 0.24
323 0.22
324 0.15
325 0.11
326 0.1
327 0.1
328 0.09
329 0.09
330 0.09
331 0.11
332 0.12
333 0.11
334 0.13
335 0.13
336 0.16
337 0.2
338 0.21
339 0.21
340 0.22
341 0.24
342 0.22
343 0.23
344 0.22
345 0.24
346 0.27
347 0.28
348 0.26
349 0.25
350 0.26
351 0.31
352 0.38
353 0.39
354 0.41
355 0.44
356 0.53
357 0.6
358 0.65
359 0.64
360 0.6
361 0.63
362 0.62
363 0.65
364 0.65
365 0.65
366 0.62
367 0.62
368 0.62
369 0.58
370 0.62
371 0.6
372 0.59
373 0.6
374 0.61
375 0.59
376 0.58
377 0.53
378 0.47
379 0.4
380 0.35
381 0.31
382 0.29
383 0.33
384 0.38
385 0.42
386 0.49
387 0.57
388 0.59
389 0.62
390 0.68
391 0.69
392 0.72
393 0.7
394 0.68
395 0.63
396 0.59
397 0.54
398 0.49
399 0.45
400 0.44
401 0.46
402 0.41
403 0.4
404 0.4
405 0.43
406 0.41
407 0.37
408 0.39
409 0.36
410 0.42
411 0.49
412 0.57
413 0.62
414 0.67
415 0.74
416 0.73
417 0.77
418 0.78
419 0.8
420 0.81