Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2U9R9V1

Protein Details
Accession A0A2U9R9V1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
102-123DGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 9, mito_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIISSVIDEEENPVDDIPKLVQYSDPNPNGELDNLYLDMNAIVHPCSHPENRPAPETEEEMMIEIFKYTNHVLNLARPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAKDAQIAYEEKQRELAEMEARGETIDDAIKGKKSWDSNSITPGTPFMDILAASLKYWVAYKLSTDPGWAQLQVIISDASVPGEGEHKIMNFIRSQRSRPDYDPNVSHCIHGLDADLIFLSLATHEPHFRVLREDVFAKDNNNKHLTTKDRMMMDEETKEKLKNQSQPFIWLHINVLREYLQVELQIPRLPFKYDFERAIDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDVRDSSIDILIGIWKNLLPKMKTYITCDGKLNLERVEKLLSELATKEDEIFRKRHEDDERREARFRRIDQDREQRRIVQQQLLGVVSKGKDNAPINPSQNMTLTSLSTGKLAGGLQMTNNDIVQNIESISKANTTNQSVAAVLRQNLMKEDKEASENKDSGSQEGDDAPIDVSEEPASKKRKLNDQDQGADEKGEADGDGEEEGEEEEEDDDDDDDDENPDLADTDIKLWEPGYKTRYYQHKFKTTNEKKITEIRRDMAKCYVEGISWVLLYYYQGCPSWNWYYPYHYAPFAADFVGLNEFKIEFEQGTPFQPFEQLMSVLPAASNHNLPEVFRSLMSEPDSEIIDFYPEDFEIDMNGEKQSWRGIALLPFIDENRLLSVVRSKYHELTEDEKRRNSHKQEVMFVGKQNPYFKKFAKLYNQEKKKEKVEFSFSKTHLAGTATSNEIYVPNSIFKFPFETKNDEYPNLNTSDFMLVNYTMPPKVHGKSMILTGYRPHKPVLLPEDREKIMYYKNYHNNRYQRNNGPINQFINYKEHTGPGQESMYNSRPGGYKFFTDMYEREINHQATTAAFNQGRQNFQNMYQNNYDTYVDPNQGYNTYGGGRGGYGGGRGRGGFNNRVGYGGRGRGGYNGGYNGGYNGGYNGGYNGGYRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.59
2 0.6
3 0.62
4 0.62
5 0.57
6 0.55
7 0.51
8 0.45
9 0.37
10 0.35
11 0.32
12 0.28
13 0.26
14 0.19
15 0.16
16 0.15
17 0.14
18 0.15
19 0.13
20 0.16
21 0.15
22 0.15
23 0.19
24 0.23
25 0.3
26 0.38
27 0.4
28 0.38
29 0.38
30 0.39
31 0.36
32 0.33
33 0.28
34 0.19
35 0.18
36 0.17
37 0.16
38 0.14
39 0.13
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.13
48 0.19
49 0.23
50 0.27
51 0.35
52 0.43
53 0.46
54 0.5
55 0.5
56 0.49
57 0.47
58 0.46
59 0.39
60 0.32
61 0.28
62 0.25
63 0.22
64 0.17
65 0.13
66 0.1
67 0.09
68 0.07
69 0.11
70 0.12
71 0.16
72 0.17
73 0.2
74 0.21
75 0.29
76 0.4
77 0.43
78 0.43
79 0.39
80 0.41
81 0.4
82 0.41
83 0.36
84 0.28
85 0.26
86 0.25
87 0.25
88 0.24
89 0.21
90 0.2
91 0.18
92 0.15
93 0.1
94 0.13
95 0.19
96 0.26
97 0.36
98 0.45
99 0.55
100 0.66
101 0.74
102 0.8
103 0.84
104 0.82
105 0.79
106 0.79
107 0.78
108 0.76
109 0.76
110 0.68
111 0.58
112 0.58
113 0.54
114 0.46
115 0.44
116 0.37
117 0.29
118 0.31
119 0.31
120 0.25
121 0.24
122 0.25
123 0.22
124 0.22
125 0.24
126 0.2
127 0.19
128 0.18
129 0.17
130 0.13
131 0.1
132 0.09
133 0.08
134 0.1
135 0.13
136 0.15
137 0.15
138 0.17
139 0.21
140 0.24
141 0.28
142 0.34
143 0.39
144 0.4
145 0.46
146 0.47
147 0.43
148 0.38
149 0.36
150 0.29
151 0.22
152 0.19
153 0.13
154 0.11
155 0.1
156 0.1
157 0.12
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.09
166 0.1
167 0.12
168 0.16
169 0.21
170 0.2
171 0.22
172 0.21
173 0.24
174 0.25
175 0.23
176 0.18
177 0.16
178 0.17
179 0.15
180 0.15
181 0.11
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.07
190 0.08
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.13
195 0.14
196 0.16
197 0.18
198 0.22
199 0.31
200 0.34
201 0.38
202 0.43
203 0.47
204 0.51
205 0.51
206 0.56
207 0.53
208 0.55
209 0.57
210 0.52
211 0.52
212 0.47
213 0.44
214 0.35
215 0.29
216 0.23
217 0.18
218 0.14
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.06
224 0.06
225 0.05
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.06
230 0.08
231 0.09
232 0.1
233 0.15
234 0.17
235 0.17
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.25
240 0.26
241 0.23
242 0.25
243 0.25
244 0.24
245 0.29
246 0.3
247 0.34
248 0.35
249 0.34
250 0.32
251 0.38
252 0.41
253 0.39
254 0.4
255 0.39
256 0.37
257 0.37
258 0.39
259 0.35
260 0.32
261 0.32
262 0.28
263 0.26
264 0.27
265 0.26
266 0.26
267 0.3
268 0.34
269 0.39
270 0.43
271 0.47
272 0.47
273 0.54
274 0.52
275 0.48
276 0.42
277 0.34
278 0.3
279 0.25
280 0.26
281 0.18
282 0.18
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.12
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.1
291 0.11
292 0.15
293 0.14
294 0.16
295 0.16
296 0.18
297 0.18
298 0.21
299 0.27
300 0.27
301 0.29
302 0.3
303 0.32
304 0.3
305 0.33
306 0.29
307 0.22
308 0.19
309 0.17
310 0.14
311 0.1
312 0.1
313 0.06
314 0.05
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.08
326 0.11
327 0.13
328 0.13
329 0.13
330 0.14
331 0.14
332 0.14
333 0.13
334 0.09
335 0.07
336 0.06
337 0.09
338 0.08
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.09
343 0.12
344 0.16
345 0.14
346 0.16
347 0.22
348 0.27
349 0.28
350 0.33
351 0.4
352 0.39
353 0.41
354 0.4
355 0.36
356 0.35
357 0.35
358 0.31
359 0.25
360 0.23
361 0.21
362 0.21
363 0.21
364 0.17
365 0.16
366 0.16
367 0.13
368 0.12
369 0.12
370 0.12
371 0.11
372 0.11
373 0.11
374 0.12
375 0.16
376 0.18
377 0.19
378 0.2
379 0.25
380 0.27
381 0.33
382 0.39
383 0.44
384 0.48
385 0.57
386 0.61
387 0.59
388 0.63
389 0.58
390 0.56
391 0.55
392 0.5
393 0.48
394 0.49
395 0.52
396 0.56
397 0.64
398 0.64
399 0.62
400 0.61
401 0.55
402 0.52
403 0.53
404 0.47
405 0.41
406 0.34
407 0.31
408 0.3
409 0.27
410 0.24
411 0.16
412 0.14
413 0.1
414 0.1
415 0.09
416 0.08
417 0.14
418 0.14
419 0.19
420 0.21
421 0.25
422 0.26
423 0.27
424 0.28
425 0.23
426 0.23
427 0.19
428 0.18
429 0.14
430 0.12
431 0.11
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.09
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.06
443 0.07
444 0.08
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.05
452 0.05
453 0.05
454 0.05
455 0.06
456 0.06
457 0.08
458 0.08
459 0.1
460 0.12
461 0.14
462 0.15
463 0.15
464 0.15
465 0.13
466 0.13
467 0.13
468 0.11
469 0.1
470 0.1
471 0.11
472 0.1
473 0.12
474 0.14
475 0.12
476 0.12
477 0.14
478 0.13
479 0.16
480 0.18
481 0.2
482 0.22
483 0.22
484 0.21
485 0.24
486 0.23
487 0.2
488 0.2
489 0.16
490 0.12
491 0.12
492 0.12
493 0.07
494 0.07
495 0.07
496 0.05
497 0.06
498 0.05
499 0.05
500 0.05
501 0.06
502 0.07
503 0.13
504 0.17
505 0.21
506 0.24
507 0.28
508 0.37
509 0.41
510 0.49
511 0.51
512 0.53
513 0.53
514 0.51
515 0.5
516 0.4
517 0.35
518 0.26
519 0.18
520 0.11
521 0.08
522 0.06
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.04
530 0.04
531 0.04
532 0.03
533 0.03
534 0.03
535 0.04
536 0.04
537 0.04
538 0.04
539 0.04
540 0.05
541 0.05
542 0.05
543 0.05
544 0.06
545 0.05
546 0.05
547 0.05
548 0.05
549 0.04
550 0.05
551 0.04
552 0.05
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.06
557 0.09
558 0.11
559 0.15
560 0.17
561 0.19
562 0.2
563 0.27
564 0.37
565 0.39
566 0.45
567 0.49
568 0.55
569 0.56
570 0.61
571 0.67
572 0.65
573 0.71
574 0.69
575 0.63
576 0.56
577 0.62
578 0.62
579 0.58
580 0.53
581 0.46
582 0.48
583 0.47
584 0.46
585 0.43
586 0.37
587 0.3
588 0.28
589 0.25
590 0.16
591 0.16
592 0.15
593 0.1
594 0.08
595 0.08
596 0.06
597 0.05
598 0.06
599 0.08
600 0.08
601 0.08
602 0.09
603 0.1
604 0.1
605 0.16
606 0.2
607 0.21
608 0.24
609 0.24
610 0.29
611 0.31
612 0.34
613 0.3
614 0.26
615 0.23
616 0.2
617 0.2
618 0.16
619 0.13
620 0.1
621 0.08
622 0.08
623 0.11
624 0.1
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.08
629 0.09
630 0.09
631 0.06
632 0.07
633 0.1
634 0.1
635 0.13
636 0.13
637 0.13
638 0.12
639 0.13
640 0.13
641 0.11
642 0.12
643 0.1
644 0.09
645 0.11
646 0.11
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.09
651 0.1
652 0.11
653 0.09
654 0.11
655 0.12
656 0.12
657 0.14
658 0.14
659 0.14
660 0.13
661 0.15
662 0.14
663 0.17
664 0.19
665 0.16
666 0.14
667 0.14
668 0.15
669 0.12
670 0.12
671 0.09
672 0.08
673 0.07
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.07
678 0.07
679 0.07
680 0.06
681 0.08
682 0.08
683 0.08
684 0.08
685 0.08
686 0.08
687 0.09
688 0.1
689 0.09
690 0.09
691 0.09
692 0.12
693 0.13
694 0.15
695 0.15
696 0.14
697 0.14
698 0.13
699 0.14
700 0.11
701 0.1
702 0.09
703 0.09
704 0.09
705 0.09
706 0.16
707 0.17
708 0.19
709 0.23
710 0.25
711 0.26
712 0.28
713 0.31
714 0.28
715 0.31
716 0.4
717 0.45
718 0.47
719 0.48
720 0.49
721 0.51
722 0.57
723 0.58
724 0.58
725 0.56
726 0.55
727 0.56
728 0.59
729 0.6
730 0.53
731 0.48
732 0.44
733 0.4
734 0.4
735 0.42
736 0.41
737 0.39
738 0.42
739 0.41
740 0.44
741 0.45
742 0.5
743 0.53
744 0.58
745 0.64
746 0.7
747 0.77
748 0.76
749 0.8
750 0.78
751 0.75
752 0.73
753 0.68
754 0.64
755 0.65
756 0.63
757 0.62
758 0.64
759 0.57
760 0.55
761 0.49
762 0.43
763 0.35
764 0.3
765 0.25
766 0.19
767 0.21
768 0.17
769 0.17
770 0.17
771 0.15
772 0.14
773 0.14
774 0.13
775 0.11
776 0.13
777 0.14
778 0.16
779 0.16
780 0.16
781 0.21
782 0.23
783 0.3
784 0.31
785 0.37
786 0.4
787 0.48
788 0.51
789 0.47
790 0.47
791 0.4
792 0.4
793 0.35
794 0.3
795 0.22
796 0.2
797 0.21
798 0.19
799 0.16
800 0.15
801 0.13
802 0.14
803 0.16
804 0.16
805 0.14
806 0.14
807 0.17
808 0.2
809 0.21
810 0.25
811 0.26
812 0.27
813 0.28
814 0.32
815 0.34
816 0.29
817 0.29
818 0.29
819 0.34
820 0.36
821 0.35
822 0.32
823 0.31
824 0.31
825 0.38
826 0.42
827 0.43
828 0.44
829 0.49
830 0.54
831 0.51
832 0.51
833 0.44
834 0.38
835 0.35
836 0.37
837 0.37
838 0.4
839 0.49
840 0.57
841 0.62
842 0.68
843 0.71
844 0.74
845 0.78
846 0.77
847 0.76
848 0.77
849 0.79
850 0.76
851 0.73
852 0.69
853 0.62
854 0.56
855 0.49
856 0.42
857 0.39
858 0.35
859 0.33
860 0.28
861 0.27
862 0.26
863 0.27
864 0.27
865 0.25
866 0.26
867 0.23
868 0.24
869 0.29
870 0.31
871 0.31
872 0.29
873 0.28
874 0.28
875 0.3
876 0.33
877 0.29
878 0.28
879 0.28
880 0.3
881 0.3
882 0.3
883 0.29
884 0.3
885 0.33
886 0.31
887 0.32
888 0.38
889 0.37
890 0.33
891 0.33
892 0.27
893 0.22
894 0.25
895 0.22
896 0.23
897 0.22
898 0.24
899 0.31
900 0.35
901 0.39
902 0.37
903 0.4
904 0.35
905 0.39
906 0.46
907 0.39
908 0.42
909 0.41
910 0.41
911 0.37
912 0.37
913 0.34
914 0.26
915 0.3
916 0.28
917 0.26
918 0.25
919 0.26
920 0.25
921 0.25
922 0.25
923 0.2
924 0.18
925 0.16
926 0.16
927 0.15
928 0.13
929 0.12
930 0.12
931 0.12
932 0.11
933 0.13
934 0.15
935 0.15
936 0.17
937 0.17
938 0.2
939 0.25
940 0.3
941 0.33
942 0.35
943 0.39
944 0.38
945 0.39
946 0.38
947 0.36
948 0.36
949 0.35
950 0.32
951 0.27
952 0.28
953 0.28
954 0.3
955 0.27
956 0.25
957 0.22
958 0.21
959 0.2
960 0.2
961 0.18
962 0.17
963 0.15
964 0.11
965 0.1
966 0.1
967 0.1
968 0.1
969 0.1
970 0.1
971 0.1