Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CJP0

Protein Details
Accession A1CJP0    Localization Confidence High Confidence Score 21.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-67SKSSQSPKAKSKQIARELASKEKSKRKKKEPTPSSSSESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-58SKVKDAGVSKSSQSPKAKSKQIARELASKEKSKRKKKE
87-97PAKKEVKKAKK
234-237KKRK
454-502APGGGRGGGRGGGRGGFGRGGPRGGGGRGGRGGRGGFGGRDGAPNKARG
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG act:ACLA_035670  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MSKTKSVTKKGGDKPVDKALSKVKDAGVSKSSQSPKAKSKQIARELASKEKSKRKKKEPTPSSSSESESDEEMESSSSSSESEEEKPAKKEVKKAKKEAESSSESESDSDEEMNDASSSESESEDEKPAKKVAKKAESSSESEDSESEEEEKVTKKEVKAKAESSDSDSDSSDSEEEAPKKATKESSDSSDSESDSDSEDEAPAKAKKAEKESSEDSDDSSDDSSDSEEEKPSKKRKAEEESASTPKKSKQAEEETGASANLFIGNLSWNVDEDWLRQEFETFGELSGVRIVTDRDSGRSRGFGYVEYVSAADAAKAYKAKKDTELDGRKINLDYATGRPANNQQGGGFQDRAQARARSFGDQSSPESDTLFVGNLPFSANEDSVQELFGEKGSIVGIRLPTDPDSGRPKGFGYVQFASVDEAREAFNSLNGAELDGRPVRLDFSTPRPSNGGAPGGGRGGGRGGGRGGFGRGGPRGGGGRGGRGGRGGFGGRDGAPNKARGGIPEYKGTKVTF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.73
3 0.71
4 0.61
5 0.57
6 0.56
7 0.53
8 0.51
9 0.49
10 0.42
11 0.42
12 0.44
13 0.45
14 0.39
15 0.35
16 0.36
17 0.4
18 0.43
19 0.44
20 0.49
21 0.51
22 0.57
23 0.63
24 0.7
25 0.69
26 0.74
27 0.76
28 0.79
29 0.8
30 0.74
31 0.74
32 0.7
33 0.71
34 0.68
35 0.65
36 0.64
37 0.66
38 0.73
39 0.75
40 0.8
41 0.82
42 0.86
43 0.9
44 0.92
45 0.92
46 0.91
47 0.89
48 0.84
49 0.79
50 0.71
51 0.63
52 0.54
53 0.47
54 0.39
55 0.31
56 0.27
57 0.21
58 0.19
59 0.16
60 0.14
61 0.11
62 0.1
63 0.09
64 0.08
65 0.07
66 0.08
67 0.09
68 0.11
69 0.14
70 0.21
71 0.25
72 0.3
73 0.32
74 0.37
75 0.44
76 0.45
77 0.51
78 0.56
79 0.62
80 0.68
81 0.75
82 0.78
83 0.79
84 0.8
85 0.77
86 0.73
87 0.67
88 0.6
89 0.55
90 0.46
91 0.38
92 0.33
93 0.27
94 0.21
95 0.17
96 0.14
97 0.1
98 0.09
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.08
108 0.08
109 0.1
110 0.12
111 0.16
112 0.2
113 0.21
114 0.22
115 0.26
116 0.32
117 0.35
118 0.4
119 0.45
120 0.51
121 0.54
122 0.56
123 0.61
124 0.58
125 0.58
126 0.56
127 0.49
128 0.4
129 0.36
130 0.32
131 0.25
132 0.21
133 0.18
134 0.13
135 0.11
136 0.11
137 0.12
138 0.14
139 0.13
140 0.17
141 0.21
142 0.22
143 0.31
144 0.38
145 0.43
146 0.47
147 0.49
148 0.48
149 0.48
150 0.46
151 0.42
152 0.39
153 0.33
154 0.28
155 0.26
156 0.22
157 0.18
158 0.18
159 0.13
160 0.09
161 0.1
162 0.13
163 0.14
164 0.15
165 0.17
166 0.18
167 0.19
168 0.21
169 0.23
170 0.21
171 0.26
172 0.27
173 0.3
174 0.32
175 0.32
176 0.33
177 0.31
178 0.28
179 0.23
180 0.21
181 0.16
182 0.13
183 0.13
184 0.1
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.11
190 0.1
191 0.11
192 0.14
193 0.18
194 0.21
195 0.28
196 0.33
197 0.32
198 0.37
199 0.4
200 0.4
201 0.4
202 0.36
203 0.29
204 0.25
205 0.23
206 0.17
207 0.14
208 0.1
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.08
214 0.08
215 0.1
216 0.12
217 0.16
218 0.24
219 0.3
220 0.37
221 0.39
222 0.44
223 0.51
224 0.57
225 0.61
226 0.59
227 0.59
228 0.57
229 0.6
230 0.56
231 0.48
232 0.41
233 0.36
234 0.37
235 0.32
236 0.29
237 0.3
238 0.37
239 0.4
240 0.41
241 0.39
242 0.34
243 0.32
244 0.3
245 0.21
246 0.13
247 0.09
248 0.06
249 0.04
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.05
256 0.05
257 0.06
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.1
266 0.1
267 0.1
268 0.11
269 0.08
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.07
280 0.1
281 0.11
282 0.13
283 0.16
284 0.18
285 0.18
286 0.19
287 0.2
288 0.18
289 0.18
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.14
294 0.13
295 0.12
296 0.09
297 0.09
298 0.08
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.09
304 0.1
305 0.14
306 0.17
307 0.18
308 0.24
309 0.27
310 0.3
311 0.38
312 0.44
313 0.43
314 0.44
315 0.43
316 0.39
317 0.37
318 0.33
319 0.23
320 0.17
321 0.16
322 0.14
323 0.19
324 0.19
325 0.18
326 0.19
327 0.24
328 0.29
329 0.29
330 0.27
331 0.22
332 0.23
333 0.26
334 0.27
335 0.23
336 0.17
337 0.22
338 0.21
339 0.23
340 0.24
341 0.25
342 0.22
343 0.28
344 0.29
345 0.27
346 0.28
347 0.27
348 0.27
349 0.26
350 0.28
351 0.25
352 0.25
353 0.21
354 0.21
355 0.19
356 0.16
357 0.15
358 0.12
359 0.08
360 0.07
361 0.07
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.08
366 0.1
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.12
372 0.13
373 0.1
374 0.09
375 0.09
376 0.08
377 0.08
378 0.06
379 0.06
380 0.06
381 0.06
382 0.06
383 0.09
384 0.09
385 0.11
386 0.12
387 0.13
388 0.15
389 0.18
390 0.18
391 0.21
392 0.27
393 0.29
394 0.29
395 0.28
396 0.28
397 0.28
398 0.32
399 0.3
400 0.3
401 0.29
402 0.29
403 0.29
404 0.28
405 0.27
406 0.23
407 0.21
408 0.14
409 0.13
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.1
414 0.1
415 0.1
416 0.09
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.12
421 0.12
422 0.15
423 0.16
424 0.16
425 0.14
426 0.15
427 0.16
428 0.15
429 0.19
430 0.18
431 0.25
432 0.36
433 0.36
434 0.38
435 0.39
436 0.4
437 0.4
438 0.4
439 0.34
440 0.25
441 0.25
442 0.24
443 0.22
444 0.21
445 0.17
446 0.13
447 0.11
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.13
452 0.12
453 0.14
454 0.14
455 0.15
456 0.13
457 0.14
458 0.18
459 0.18
460 0.18
461 0.17
462 0.19
463 0.19
464 0.19
465 0.24
466 0.21
467 0.24
468 0.27
469 0.28
470 0.27
471 0.27
472 0.27
473 0.21
474 0.23
475 0.21
476 0.16
477 0.17
478 0.19
479 0.17
480 0.24
481 0.24
482 0.28
483 0.29
484 0.32
485 0.31
486 0.33
487 0.33
488 0.3
489 0.36
490 0.37
491 0.37
492 0.44
493 0.45
494 0.43