Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1C4R7

Protein Details
Accession A1C4R7    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
563-584YKAMSRCFQRLRFERNRLKEFLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
248-264RGAKRKHGSKSADAPNK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013197  RNA_pol_III_RPC82-rel_HTH  
IPR008806  RNA_pol_III_Rpc82_C  
IPR039748  RPC3  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0003697  F:single-stranded DNA binding  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
KEGG act:ACLA_000960  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08221  HTH_9  
PF05645  RNA_pol_Rpc82  
Amino Acid Sequences MASQYAAELCALLVEDNFGELFARIFSTLTRYDRLNLPRLKFHSGLSNRQLLPALAAMIQQHLVYHYTSYDDGVTYYEANLQSAYYLVRAGKILEFVEERLGKYAATVMSSIMYLGHAQVSHLENLPELQPEQSHTNGVDKEHDEVDGDEEQPNGLSGDHSDQQPALLHPTLKVLAAHGYIIRVREAQFQSHADNILDAERVLKSRPEIKAMKGKRMEEAVIEGTLELLKERTDGDLTRGLMVQGVPRGAKRKHGSKSADAPNKKARVDFASVDEDDEQDEEENEWSDDEMGYDTTPMESGLVVRVNYNKLDVALRNCRFIQIAEQDASPATAEVYECLLRRIEYQTHQCRDTVEIPREGEEGEQYSVPIALSAVAEDVDPRLDLSGSIGPMEISQPDNRRGKRPLEDDVNGTNHEGANGLSSGGNRTFEVDQHLCLLAQPPHNLTSKRIVSGLITWTVEFRHLARKLRHLELERMIEARYGDVALRVVRVLHAKGKLDEKRLQEISLLPFKDLRQVLASMQAGGFVDLQEVPRDAQRQPSRTIYLWYYDPDRICNSVLQDTYKAMSRCFQRLRFERNRLKEFLEKTERSDVKGNEERYLSEGELALLQQWKAKEALLIGEVARLDEMVAVMRDY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.07
4 0.07
5 0.07
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.09
14 0.13
15 0.19
16 0.22
17 0.24
18 0.25
19 0.28
20 0.36
21 0.42
22 0.46
23 0.48
24 0.49
25 0.55
26 0.58
27 0.61
28 0.55
29 0.5
30 0.51
31 0.5
32 0.55
33 0.52
34 0.55
35 0.49
36 0.49
37 0.49
38 0.38
39 0.34
40 0.26
41 0.21
42 0.13
43 0.14
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.1
54 0.12
55 0.13
56 0.13
57 0.13
58 0.12
59 0.11
60 0.12
61 0.12
62 0.1
63 0.11
64 0.14
65 0.14
66 0.14
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.11
72 0.07
73 0.09
74 0.09
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.13
79 0.14
80 0.14
81 0.15
82 0.16
83 0.15
84 0.22
85 0.22
86 0.21
87 0.22
88 0.22
89 0.18
90 0.17
91 0.2
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.07
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.11
107 0.13
108 0.15
109 0.16
110 0.15
111 0.14
112 0.15
113 0.16
114 0.14
115 0.12
116 0.11
117 0.11
118 0.14
119 0.17
120 0.17
121 0.18
122 0.17
123 0.22
124 0.22
125 0.23
126 0.24
127 0.22
128 0.24
129 0.22
130 0.22
131 0.17
132 0.16
133 0.18
134 0.15
135 0.15
136 0.13
137 0.12
138 0.12
139 0.11
140 0.11
141 0.08
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.11
146 0.13
147 0.14
148 0.14
149 0.14
150 0.15
151 0.16
152 0.15
153 0.15
154 0.15
155 0.15
156 0.14
157 0.17
158 0.17
159 0.16
160 0.15
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.1
166 0.11
167 0.12
168 0.12
169 0.13
170 0.12
171 0.13
172 0.21
173 0.22
174 0.22
175 0.24
176 0.26
177 0.26
178 0.26
179 0.26
180 0.17
181 0.16
182 0.14
183 0.12
184 0.1
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.09
189 0.09
190 0.1
191 0.12
192 0.19
193 0.2
194 0.26
195 0.28
196 0.33
197 0.42
198 0.43
199 0.5
200 0.48
201 0.48
202 0.43
203 0.43
204 0.39
205 0.29
206 0.29
207 0.21
208 0.16
209 0.15
210 0.12
211 0.09
212 0.09
213 0.08
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.06
220 0.08
221 0.08
222 0.11
223 0.15
224 0.16
225 0.16
226 0.16
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.12
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.11
235 0.18
236 0.18
237 0.26
238 0.3
239 0.37
240 0.41
241 0.49
242 0.53
243 0.52
244 0.61
245 0.62
246 0.66
247 0.58
248 0.59
249 0.58
250 0.57
251 0.52
252 0.43
253 0.36
254 0.31
255 0.33
256 0.29
257 0.25
258 0.25
259 0.24
260 0.24
261 0.22
262 0.18
263 0.14
264 0.13
265 0.1
266 0.06
267 0.06
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.04
283 0.05
284 0.04
285 0.04
286 0.03
287 0.04
288 0.05
289 0.06
290 0.07
291 0.07
292 0.09
293 0.1
294 0.11
295 0.11
296 0.1
297 0.09
298 0.11
299 0.12
300 0.15
301 0.23
302 0.24
303 0.26
304 0.26
305 0.25
306 0.24
307 0.22
308 0.22
309 0.15
310 0.17
311 0.15
312 0.15
313 0.15
314 0.14
315 0.14
316 0.09
317 0.07
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.06
323 0.07
324 0.07
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.13
330 0.15
331 0.18
332 0.28
333 0.36
334 0.38
335 0.39
336 0.37
337 0.35
338 0.36
339 0.37
340 0.35
341 0.3
342 0.3
343 0.3
344 0.3
345 0.3
346 0.26
347 0.19
348 0.13
349 0.11
350 0.09
351 0.09
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.06
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.07
381 0.07
382 0.11
383 0.14
384 0.22
385 0.29
386 0.31
387 0.37
388 0.41
389 0.45
390 0.49
391 0.49
392 0.49
393 0.48
394 0.48
395 0.45
396 0.44
397 0.4
398 0.33
399 0.29
400 0.23
401 0.16
402 0.15
403 0.12
404 0.08
405 0.07
406 0.07
407 0.07
408 0.07
409 0.07
410 0.09
411 0.1
412 0.11
413 0.09
414 0.12
415 0.12
416 0.12
417 0.19
418 0.18
419 0.17
420 0.18
421 0.18
422 0.16
423 0.15
424 0.18
425 0.16
426 0.18
427 0.19
428 0.19
429 0.22
430 0.27
431 0.28
432 0.27
433 0.31
434 0.3
435 0.3
436 0.29
437 0.26
438 0.23
439 0.24
440 0.24
441 0.18
442 0.16
443 0.15
444 0.15
445 0.15
446 0.15
447 0.13
448 0.12
449 0.18
450 0.23
451 0.3
452 0.34
453 0.42
454 0.47
455 0.51
456 0.56
457 0.51
458 0.52
459 0.5
460 0.51
461 0.43
462 0.38
463 0.34
464 0.28
465 0.24
466 0.19
467 0.13
468 0.1
469 0.08
470 0.08
471 0.1
472 0.09
473 0.09
474 0.09
475 0.08
476 0.1
477 0.13
478 0.14
479 0.18
480 0.22
481 0.24
482 0.27
483 0.36
484 0.39
485 0.43
486 0.47
487 0.46
488 0.5
489 0.49
490 0.46
491 0.39
492 0.38
493 0.37
494 0.38
495 0.34
496 0.27
497 0.28
498 0.27
499 0.33
500 0.3
501 0.26
502 0.21
503 0.22
504 0.22
505 0.26
506 0.26
507 0.19
508 0.18
509 0.18
510 0.15
511 0.15
512 0.14
513 0.07
514 0.08
515 0.08
516 0.09
517 0.1
518 0.1
519 0.11
520 0.14
521 0.17
522 0.17
523 0.26
524 0.34
525 0.37
526 0.41
527 0.46
528 0.47
529 0.46
530 0.49
531 0.41
532 0.37
533 0.35
534 0.33
535 0.31
536 0.31
537 0.31
538 0.3
539 0.3
540 0.29
541 0.28
542 0.28
543 0.27
544 0.28
545 0.29
546 0.28
547 0.27
548 0.26
549 0.26
550 0.3
551 0.27
552 0.23
553 0.27
554 0.29
555 0.37
556 0.44
557 0.48
558 0.53
559 0.6
560 0.7
561 0.74
562 0.79
563 0.8
564 0.82
565 0.82
566 0.75
567 0.73
568 0.7
569 0.64
570 0.64
571 0.64
572 0.55
573 0.54
574 0.61
575 0.57
576 0.53
577 0.56
578 0.48
579 0.47
580 0.54
581 0.51
582 0.45
583 0.45
584 0.42
585 0.37
586 0.38
587 0.29
588 0.23
589 0.2
590 0.16
591 0.16
592 0.15
593 0.15
594 0.15
595 0.14
596 0.16
597 0.16
598 0.18
599 0.18
600 0.18
601 0.17
602 0.16
603 0.19
604 0.16
605 0.17
606 0.15
607 0.17
608 0.16
609 0.15
610 0.14
611 0.1
612 0.09
613 0.08
614 0.08
615 0.08