Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A1CHC1

Protein Details
Accession A1CHC1    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAEKRKLSTRDRREPSAKRRASEBasic
107-134DGILERYYTKPKKSKREQIEGKNPPKESHydrophilic
612-636TTTRAKGKSAKSKKADKSNDKDKKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-33RKLSTRDRREPSAKRRASEVAPQGSSKKK
118-121KKSK
615-637RAKGKSAKSKKADKSNDKDKKAG
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037651  Swc3  
Gene Ontology GO:0000812  C:Swr1 complex  
GO:0140849  F:ATP-dependent H2AZ histone chaperone activity  
KEGG act:ACLA_047450  -  
Amino Acid Sequences MAEKRKLSTRDRREPSAKRRASEVAPQGSSKKKGSTPSVAPTPPPALPATPAPVEKPLPTKIKDGEALPTVSSPQPAELPDTEYQSIAESAVLLASLERSKKKWLSDGILERYYTKPKKSKREQIEGKNPPKESMVKVGSCNIAVGPHLFDAMLYTVKDPNAPPPIQYTPPQRPMVHYGHPNFQQYQSYPHPPSSQQSRQQSHHSPAHSASPQPGYHQGQHPPPQPARTSNQPPPPHHPPHPPYNPQSAQRPPPSQHTQPPKPPKPSPDPVIQMLATRAASDPELKALMRVVASSKASQEQLRAFQAHIDELNAIIRAREQQQQRQLQAQSQVQAGRQTPQTPHPPQQKPSQPPPSSQKPQQQHQQANQQHGHSLPQQGSTPQHRPQSQGQQHSMPRVEVQVPKPSPAFKLNSQHPGQNSPKQLQTPAAQKSAATPQLKQEPGVASTVQMPSTGVPGSNVVVVPPPASGPGSGPPQLSPSPAVRPTPNQPTSTQGSTPRSGGQYPPYQAQSPAIQSRPPPHGSSAPYYRPAPPPPPPARFAYKSVVFEFTSPLTPYGSSTSGHAGSGDRYLFPEYSILEWLPGGNTVLASFLLTRKVDPNTPFPIEIASAATTTRAKGKSAKSKKADKSNDKDKKAGDKAEEPGKDQENGQPQQEPTPADAGPKPSTSEPVKTSEDKGDQKGQPTETPSKVKLDSEKQPSKEKQEDAGKTNLKEYYQPVTLRIYSANPKFLEPLGRVVKPPEEVRKYMNEIMDRAERAPDGFLAMRLPRETKDDGHEPEEIRKSGTPAPAVMSGARGRALRGKAAEEDSEIENINTPAEEEEEEEELKDFYGPPTGLPPLRV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.86
2 0.86
3 0.87
4 0.82
5 0.73
6 0.71
7 0.68
8 0.62
9 0.62
10 0.6
11 0.57
12 0.53
13 0.54
14 0.54
15 0.56
16 0.56
17 0.5
18 0.47
19 0.44
20 0.49
21 0.55
22 0.57
23 0.57
24 0.6
25 0.64
26 0.6
27 0.57
28 0.54
29 0.5
30 0.42
31 0.38
32 0.31
33 0.24
34 0.25
35 0.27
36 0.27
37 0.26
38 0.27
39 0.27
40 0.3
41 0.31
42 0.32
43 0.33
44 0.36
45 0.4
46 0.41
47 0.46
48 0.44
49 0.47
50 0.47
51 0.44
52 0.41
53 0.38
54 0.36
55 0.31
56 0.28
57 0.25
58 0.22
59 0.23
60 0.18
61 0.16
62 0.17
63 0.17
64 0.21
65 0.19
66 0.24
67 0.24
68 0.28
69 0.27
70 0.25
71 0.24
72 0.21
73 0.2
74 0.15
75 0.13
76 0.08
77 0.07
78 0.07
79 0.06
80 0.05
81 0.04
82 0.07
83 0.1
84 0.15
85 0.18
86 0.2
87 0.29
88 0.33
89 0.37
90 0.43
91 0.46
92 0.49
93 0.55
94 0.62
95 0.61
96 0.59
97 0.56
98 0.5
99 0.47
100 0.51
101 0.47
102 0.47
103 0.49
104 0.55
105 0.66
106 0.74
107 0.81
108 0.81
109 0.86
110 0.88
111 0.89
112 0.91
113 0.91
114 0.89
115 0.86
116 0.77
117 0.67
118 0.61
119 0.54
120 0.47
121 0.45
122 0.42
123 0.37
124 0.38
125 0.4
126 0.38
127 0.33
128 0.3
129 0.21
130 0.16
131 0.14
132 0.13
133 0.11
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.1
140 0.11
141 0.09
142 0.11
143 0.13
144 0.13
145 0.16
146 0.15
147 0.21
148 0.27
149 0.26
150 0.26
151 0.3
152 0.34
153 0.35
154 0.41
155 0.42
156 0.44
157 0.52
158 0.57
159 0.51
160 0.51
161 0.55
162 0.54
163 0.52
164 0.51
165 0.47
166 0.48
167 0.52
168 0.51
169 0.46
170 0.42
171 0.4
172 0.33
173 0.37
174 0.36
175 0.4
176 0.39
177 0.4
178 0.41
179 0.38
180 0.44
181 0.46
182 0.49
183 0.49
184 0.57
185 0.6
186 0.61
187 0.67
188 0.67
189 0.65
190 0.62
191 0.55
192 0.48
193 0.43
194 0.47
195 0.4
196 0.35
197 0.31
198 0.3
199 0.29
200 0.28
201 0.34
202 0.31
203 0.34
204 0.38
205 0.4
206 0.42
207 0.5
208 0.52
209 0.52
210 0.51
211 0.51
212 0.49
213 0.48
214 0.46
215 0.48
216 0.5
217 0.51
218 0.57
219 0.61
220 0.62
221 0.66
222 0.7
223 0.67
224 0.65
225 0.67
226 0.63
227 0.66
228 0.7
229 0.69
230 0.64
231 0.67
232 0.65
233 0.59
234 0.61
235 0.58
236 0.57
237 0.57
238 0.58
239 0.51
240 0.55
241 0.59
242 0.56
243 0.58
244 0.61
245 0.61
246 0.66
247 0.74
248 0.74
249 0.75
250 0.75
251 0.74
252 0.72
253 0.72
254 0.66
255 0.62
256 0.58
257 0.52
258 0.5
259 0.42
260 0.34
261 0.27
262 0.25
263 0.17
264 0.13
265 0.12
266 0.09
267 0.1
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.11
272 0.1
273 0.1
274 0.1
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.11
280 0.12
281 0.13
282 0.14
283 0.15
284 0.16
285 0.17
286 0.19
287 0.18
288 0.21
289 0.23
290 0.22
291 0.2
292 0.2
293 0.2
294 0.17
295 0.15
296 0.12
297 0.09
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.07
302 0.06
303 0.07
304 0.09
305 0.11
306 0.18
307 0.21
308 0.27
309 0.37
310 0.42
311 0.44
312 0.48
313 0.46
314 0.43
315 0.44
316 0.39
317 0.32
318 0.29
319 0.28
320 0.23
321 0.25
322 0.22
323 0.19
324 0.19
325 0.2
326 0.2
327 0.24
328 0.32
329 0.33
330 0.41
331 0.48
332 0.51
333 0.52
334 0.59
335 0.62
336 0.6
337 0.65
338 0.68
339 0.59
340 0.6
341 0.64
342 0.64
343 0.62
344 0.62
345 0.61
346 0.56
347 0.61
348 0.64
349 0.65
350 0.62
351 0.61
352 0.65
353 0.59
354 0.6
355 0.57
356 0.49
357 0.41
358 0.35
359 0.32
360 0.24
361 0.24
362 0.18
363 0.16
364 0.16
365 0.17
366 0.21
367 0.24
368 0.27
369 0.29
370 0.34
371 0.34
372 0.37
373 0.41
374 0.48
375 0.49
376 0.5
377 0.47
378 0.48
379 0.48
380 0.48
381 0.43
382 0.32
383 0.26
384 0.22
385 0.22
386 0.21
387 0.22
388 0.27
389 0.26
390 0.27
391 0.28
392 0.27
393 0.26
394 0.26
395 0.27
396 0.23
397 0.3
398 0.32
399 0.39
400 0.39
401 0.39
402 0.36
403 0.39
404 0.39
405 0.38
406 0.37
407 0.32
408 0.33
409 0.31
410 0.31
411 0.27
412 0.26
413 0.27
414 0.27
415 0.27
416 0.24
417 0.23
418 0.24
419 0.26
420 0.29
421 0.23
422 0.2
423 0.22
424 0.29
425 0.3
426 0.28
427 0.26
428 0.2
429 0.2
430 0.21
431 0.17
432 0.11
433 0.13
434 0.13
435 0.11
436 0.09
437 0.09
438 0.07
439 0.09
440 0.08
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.06
448 0.06
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.06
456 0.06
457 0.09
458 0.12
459 0.13
460 0.14
461 0.13
462 0.16
463 0.17
464 0.17
465 0.16
466 0.15
467 0.18
468 0.2
469 0.21
470 0.2
471 0.23
472 0.28
473 0.35
474 0.37
475 0.34
476 0.33
477 0.36
478 0.38
479 0.37
480 0.34
481 0.3
482 0.31
483 0.3
484 0.3
485 0.28
486 0.25
487 0.24
488 0.23
489 0.23
490 0.24
491 0.24
492 0.26
493 0.26
494 0.25
495 0.24
496 0.25
497 0.22
498 0.21
499 0.23
500 0.21
501 0.2
502 0.22
503 0.26
504 0.29
505 0.3
506 0.27
507 0.26
508 0.3
509 0.31
510 0.35
511 0.36
512 0.34
513 0.35
514 0.35
515 0.36
516 0.36
517 0.37
518 0.37
519 0.38
520 0.45
521 0.48
522 0.5
523 0.49
524 0.49
525 0.52
526 0.49
527 0.47
528 0.43
529 0.4
530 0.39
531 0.38
532 0.37
533 0.3
534 0.27
535 0.25
536 0.2
537 0.18
538 0.16
539 0.15
540 0.12
541 0.12
542 0.13
543 0.14
544 0.14
545 0.12
546 0.12
547 0.15
548 0.14
549 0.14
550 0.14
551 0.11
552 0.11
553 0.14
554 0.13
555 0.1
556 0.11
557 0.13
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.1
562 0.11
563 0.12
564 0.11
565 0.09
566 0.09
567 0.09
568 0.08
569 0.08
570 0.07
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.06
575 0.05
576 0.05
577 0.06
578 0.06
579 0.1
580 0.11
581 0.12
582 0.15
583 0.18
584 0.23
585 0.25
586 0.3
587 0.32
588 0.34
589 0.33
590 0.3
591 0.28
592 0.23
593 0.21
594 0.17
595 0.11
596 0.09
597 0.09
598 0.11
599 0.1
600 0.1
601 0.16
602 0.16
603 0.17
604 0.24
605 0.33
606 0.42
607 0.52
608 0.61
609 0.62
610 0.71
611 0.77
612 0.81
613 0.83
614 0.82
615 0.82
616 0.83
617 0.85
618 0.79
619 0.75
620 0.69
621 0.68
622 0.64
623 0.6
624 0.53
625 0.49
626 0.5
627 0.54
628 0.51
629 0.44
630 0.43
631 0.4
632 0.36
633 0.32
634 0.33
635 0.34
636 0.35
637 0.33
638 0.32
639 0.3
640 0.34
641 0.36
642 0.31
643 0.24
644 0.25
645 0.23
646 0.22
647 0.24
648 0.25
649 0.25
650 0.24
651 0.25
652 0.23
653 0.29
654 0.29
655 0.32
656 0.29
657 0.33
658 0.37
659 0.36
660 0.39
661 0.4
662 0.44
663 0.43
664 0.46
665 0.49
666 0.46
667 0.5
668 0.52
669 0.48
670 0.43
671 0.45
672 0.48
673 0.44
674 0.48
675 0.44
676 0.44
677 0.43
678 0.43
679 0.44
680 0.44
681 0.48
682 0.52
683 0.58
684 0.57
685 0.65
686 0.67
687 0.68
688 0.68
689 0.62
690 0.6
691 0.62
692 0.63
693 0.58
694 0.62
695 0.58
696 0.51
697 0.53
698 0.47
699 0.38
700 0.36
701 0.35
702 0.32
703 0.32
704 0.32
705 0.3
706 0.33
707 0.33
708 0.31
709 0.29
710 0.28
711 0.31
712 0.34
713 0.38
714 0.34
715 0.34
716 0.35
717 0.35
718 0.36
719 0.29
720 0.34
721 0.34
722 0.34
723 0.34
724 0.35
725 0.37
726 0.36
727 0.4
728 0.42
729 0.42
730 0.43
731 0.46
732 0.49
733 0.52
734 0.52
735 0.51
736 0.44
737 0.39
738 0.41
739 0.42
740 0.37
741 0.32
742 0.29
743 0.24
744 0.22
745 0.22
746 0.18
747 0.16
748 0.15
749 0.15
750 0.17
751 0.18
752 0.2
753 0.21
754 0.23
755 0.21
756 0.26
757 0.29
758 0.29
759 0.34
760 0.39
761 0.41
762 0.42
763 0.45
764 0.41
765 0.46
766 0.49
767 0.42
768 0.38
769 0.35
770 0.36
771 0.37
772 0.4
773 0.34
774 0.29
775 0.31
776 0.3
777 0.3
778 0.26
779 0.25
780 0.21
781 0.21
782 0.22
783 0.19
784 0.19
785 0.25
786 0.28
787 0.29
788 0.3
789 0.32
790 0.34
791 0.37
792 0.36
793 0.31
794 0.31
795 0.27
796 0.26
797 0.23
798 0.19
799 0.18
800 0.17
801 0.15
802 0.12
803 0.11
804 0.1
805 0.12
806 0.12
807 0.12
808 0.14
809 0.16
810 0.17
811 0.16
812 0.16
813 0.14
814 0.14
815 0.13
816 0.11
817 0.1
818 0.16
819 0.16
820 0.16
821 0.21
822 0.26