Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1C5H5

Protein Details
Accession A1C5H5    Localization Confidence High Confidence Score 22.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-99ASTPATKKDVKSKSKPAKKVTEKPTFMHydrophilic
651-677RIVRAERNRLRRKGLNPKALNKPKKTEBasic
689-755APAPEPKAEKKTEKKTEKKTKPTESSSKPAKKDKDVKPKSKSEEKKASKSEEAKPAKSAKKSKKASKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
5-10RRMKKQ
25-91KKRKTGDGESNAESGKKRRRAEEEEEEVLKAVPKKKLNGAVNGKGSKVASTPATKKDVKSKSKPAKK
655-755AERNRLRRKGLNPKALNKPKKTESAAEAAPETKPAPAPEPKAEKKTEKKTEKKTKPTESSSKPAKKDKDVKPKSKSEEKKASKSEEAKPAKSAKKSKKASK
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018314  Fmu/NOL1/Nop2p_CS  
IPR031341  Methyltr_RsmF_N  
IPR001678  MeTrfase_RsmB/NOP2  
IPR011023  Nop2p  
IPR023267  RCMT  
IPR023273  RCMT_NOP2  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0009383  F:rRNA (cytosine-C5-)-methyltransferase activity  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0070475  P:rRNA base methylation  
KEGG act:ACLA_003560  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01189  Methyltr_RsmB-F  
PF17125  Methyltr_RsmF_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS01153  NOL1_NOP2_SUN  
PS51686  SAM_MT_RSMB_NOP  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences MGRGRRMKKQGPPAPLDESKITLYKKRKTGDGESNAESGKKRRRAEEEEEEVLKAVPKKKLNGAVNGKGSKVASTPATKKDVKSKSKPAKKVTEKPTFMDSDDEDMSDLDEDEMLDDEFDDLDGVSDGSMDSQEEAGSDEEEEDDDEDSVMDSDEDDHPRGAMFSDDEDLSDAEERLTAANIEGLSQKLDATREAEEEEAERELQESAMQTNIAGDRPDVFADTEGKPGLAPDLQLLRTRITDTIRILGDLKTLGHPGKSRADYLQLLLDDICTYYGYTPFLAEKLFNLFTPMEAFAFFEANETPRPVVIRTNTLRTNRRSLAQALINRGVVLEPVGKWSKVGLQVFESAVPLGATPEYLAGHYILQAASSFLPVMALAPQPNERVLDMAAAPGGKTTYISALMRNTGCVVANDASKPRAKGLIGNIHRLGCKNTIVTNLDARTAFPKALGGFDRVLLDAPCTGTGVISKDPSVKTSKNERDFLAIPHMQRNLLLAAIDSVDHTSKTGGYVVYSTCSVTVEENEAVVQYVLRKRPNVKLVDTGLGDFGTPGFTAYMGKKFDPKMTLTRRYFPHRENVDGFFVSKFKKTGPTPASAAAASEPAASANKSTASTTSDDDDAVNKTPILDEDGTVPDLEGGAFGPFSDDEDQERIVRAERNRLRRKGLNPKALNKPKKTESAAEAAPETKPAPAPEPKAEKKTEKKTEKKTKPTESSSKPAKKDKDVKPKSKSEEKKASKSEEAKPAKSAKKSKKASK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.66
3 0.61
4 0.52
5 0.47
6 0.41
7 0.41
8 0.39
9 0.39
10 0.45
11 0.49
12 0.55
13 0.56
14 0.6
15 0.62
16 0.68
17 0.71
18 0.7
19 0.68
20 0.63
21 0.61
22 0.55
23 0.5
24 0.44
25 0.41
26 0.43
27 0.45
28 0.47
29 0.53
30 0.61
31 0.67
32 0.73
33 0.75
34 0.72
35 0.7
36 0.66
37 0.58
38 0.49
39 0.41
40 0.36
41 0.32
42 0.3
43 0.32
44 0.36
45 0.4
46 0.47
47 0.57
48 0.58
49 0.63
50 0.65
51 0.66
52 0.69
53 0.66
54 0.59
55 0.52
56 0.46
57 0.37
58 0.29
59 0.24
60 0.21
61 0.27
62 0.32
63 0.36
64 0.42
65 0.44
66 0.47
67 0.54
68 0.59
69 0.61
70 0.65
71 0.7
72 0.74
73 0.81
74 0.87
75 0.86
76 0.87
77 0.87
78 0.88
79 0.87
80 0.87
81 0.8
82 0.74
83 0.71
84 0.62
85 0.52
86 0.46
87 0.37
88 0.31
89 0.29
90 0.25
91 0.2
92 0.17
93 0.17
94 0.13
95 0.12
96 0.07
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.07
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.04
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.08
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.08
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.07
141 0.11
142 0.14
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.14
147 0.15
148 0.13
149 0.1
150 0.08
151 0.09
152 0.11
153 0.11
154 0.11
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.1
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.07
164 0.08
165 0.07
166 0.06
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.12
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.07
198 0.08
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.11
205 0.11
206 0.1
207 0.1
208 0.1
209 0.14
210 0.14
211 0.15
212 0.14
213 0.13
214 0.12
215 0.12
216 0.12
217 0.09
218 0.08
219 0.09
220 0.12
221 0.14
222 0.17
223 0.18
224 0.18
225 0.18
226 0.19
227 0.19
228 0.18
229 0.21
230 0.19
231 0.22
232 0.21
233 0.21
234 0.21
235 0.18
236 0.17
237 0.13
238 0.13
239 0.1
240 0.12
241 0.12
242 0.13
243 0.14
244 0.17
245 0.24
246 0.24
247 0.25
248 0.24
249 0.27
250 0.26
251 0.25
252 0.25
253 0.17
254 0.16
255 0.15
256 0.14
257 0.09
258 0.09
259 0.08
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.07
264 0.07
265 0.07
266 0.08
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.11
273 0.12
274 0.11
275 0.13
276 0.12
277 0.12
278 0.14
279 0.14
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.07
284 0.08
285 0.07
286 0.06
287 0.06
288 0.08
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.14
296 0.14
297 0.21
298 0.22
299 0.28
300 0.33
301 0.38
302 0.44
303 0.44
304 0.49
305 0.43
306 0.42
307 0.4
308 0.36
309 0.35
310 0.34
311 0.33
312 0.3
313 0.3
314 0.27
315 0.24
316 0.22
317 0.17
318 0.12
319 0.1
320 0.07
321 0.05
322 0.09
323 0.11
324 0.1
325 0.1
326 0.11
327 0.13
328 0.18
329 0.18
330 0.15
331 0.16
332 0.17
333 0.18
334 0.18
335 0.14
336 0.09
337 0.08
338 0.07
339 0.05
340 0.04
341 0.04
342 0.04
343 0.03
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.05
357 0.05
358 0.05
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.08
368 0.08
369 0.09
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.05
379 0.05
380 0.05
381 0.04
382 0.03
383 0.04
384 0.04
385 0.05
386 0.07
387 0.07
388 0.09
389 0.1
390 0.13
391 0.12
392 0.12
393 0.12
394 0.1
395 0.1
396 0.09
397 0.11
398 0.09
399 0.1
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.15
404 0.15
405 0.13
406 0.15
407 0.14
408 0.17
409 0.22
410 0.29
411 0.3
412 0.34
413 0.34
414 0.33
415 0.33
416 0.31
417 0.27
418 0.19
419 0.18
420 0.15
421 0.15
422 0.18
423 0.19
424 0.19
425 0.21
426 0.19
427 0.19
428 0.18
429 0.18
430 0.16
431 0.15
432 0.13
433 0.1
434 0.11
435 0.09
436 0.12
437 0.13
438 0.13
439 0.12
440 0.13
441 0.13
442 0.12
443 0.12
444 0.1
445 0.09
446 0.07
447 0.08
448 0.07
449 0.07
450 0.06
451 0.06
452 0.07
453 0.09
454 0.09
455 0.09
456 0.1
457 0.14
458 0.14
459 0.17
460 0.21
461 0.21
462 0.25
463 0.35
464 0.43
465 0.46
466 0.48
467 0.46
468 0.46
469 0.45
470 0.42
471 0.39
472 0.32
473 0.27
474 0.29
475 0.29
476 0.24
477 0.23
478 0.22
479 0.15
480 0.12
481 0.11
482 0.07
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.05
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.08
495 0.07
496 0.07
497 0.09
498 0.09
499 0.1
500 0.1
501 0.1
502 0.08
503 0.09
504 0.09
505 0.08
506 0.09
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.09
513 0.08
514 0.08
515 0.09
516 0.14
517 0.19
518 0.22
519 0.26
520 0.3
521 0.38
522 0.45
523 0.46
524 0.43
525 0.45
526 0.45
527 0.45
528 0.41
529 0.34
530 0.26
531 0.22
532 0.18
533 0.12
534 0.09
535 0.06
536 0.05
537 0.05
538 0.05
539 0.05
540 0.08
541 0.1
542 0.15
543 0.17
544 0.18
545 0.23
546 0.24
547 0.29
548 0.3
549 0.31
550 0.36
551 0.43
552 0.52
553 0.51
554 0.56
555 0.57
556 0.62
557 0.65
558 0.58
559 0.6
560 0.53
561 0.56
562 0.52
563 0.5
564 0.45
565 0.39
566 0.37
567 0.28
568 0.26
569 0.23
570 0.21
571 0.19
572 0.17
573 0.24
574 0.25
575 0.34
576 0.36
577 0.39
578 0.39
579 0.4
580 0.41
581 0.32
582 0.31
583 0.21
584 0.18
585 0.13
586 0.11
587 0.08
588 0.07
589 0.08
590 0.08
591 0.08
592 0.09
593 0.1
594 0.11
595 0.12
596 0.12
597 0.14
598 0.16
599 0.17
600 0.18
601 0.17
602 0.17
603 0.17
604 0.17
605 0.17
606 0.17
607 0.16
608 0.14
609 0.13
610 0.13
611 0.14
612 0.17
613 0.15
614 0.13
615 0.15
616 0.18
617 0.18
618 0.17
619 0.16
620 0.11
621 0.1
622 0.1
623 0.07
624 0.05
625 0.05
626 0.05
627 0.05
628 0.06
629 0.06
630 0.09
631 0.11
632 0.12
633 0.14
634 0.17
635 0.19
636 0.18
637 0.2
638 0.18
639 0.18
640 0.24
641 0.24
642 0.33
643 0.4
644 0.5
645 0.59
646 0.64
647 0.69
648 0.71
649 0.78
650 0.78
651 0.81
652 0.81
653 0.78
654 0.8
655 0.84
656 0.86
657 0.86
658 0.81
659 0.79
660 0.75
661 0.75
662 0.72
663 0.67
664 0.61
665 0.58
666 0.52
667 0.46
668 0.42
669 0.34
670 0.3
671 0.26
672 0.21
673 0.16
674 0.17
675 0.17
676 0.22
677 0.28
678 0.34
679 0.4
680 0.5
681 0.55
682 0.6
683 0.64
684 0.68
685 0.71
686 0.76
687 0.78
688 0.79
689 0.83
690 0.87
691 0.91
692 0.92
693 0.93
694 0.92
695 0.92
696 0.91
697 0.9
698 0.89
699 0.85
700 0.84
701 0.84
702 0.83
703 0.8
704 0.8
705 0.78
706 0.79
707 0.81
708 0.82
709 0.83
710 0.85
711 0.87
712 0.87
713 0.89
714 0.87
715 0.87
716 0.86
717 0.85
718 0.86
719 0.85
720 0.86
721 0.84
722 0.83
723 0.81
724 0.79
725 0.77
726 0.76
727 0.75
728 0.68
729 0.67
730 0.69
731 0.67
732 0.7
733 0.72
734 0.72
735 0.75