FuNGI

A0A395IPD0

Protein Details

Accession

A0A395IPD0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

7.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
548-589	RDDARERSSRQNSPPPRRHDSEKDHQHPRRDDRPNRNAPIDP	Basic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 8.5, cyto_nucl 8, cyto 6.5, mito 5, plas 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040007 Tho2 IPR021726 THO_THOC2_N
Gene Ontology	GO:0000347 C:THO complex GO:0006406 P:mRNA export from nucleus GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF11732 Thoc2

Amino Acid Sequences

MRAFAKTKSETLVHEEVSMTNLTVMARNLAKIAFAFPGVVFSVALGQIEAYTNLTEVVVECGIFHDLGYDVLVWSLLSSLGGKDRNRNDTEFALLPSRWLLALSSSLATPPGNSTDLVTQGAHSQMSGIVPDTDFTDAQLAAMTGGELLRRQTLINLQETIRINKDSEKTNERVTDTKLGGQLLLSIAQHRQSAIYNVSDDEAPIKLLATMIDDTQMILFQFLDLLRSNLSIEEFDDLVPGIPELMKDFGLDPTLAFMIGRPSIAHQDVTAKDDVQMSDVKEVASPSEVAILEADPLHELLLPYINTVEMFLPEGSWAFLTSDHSYEAEISRLLKEQGDVMKDRTDMTRAEFGKQVGAFSGKKHRLLKRKNLWFSNVKGDLGVREDLSLAGNAILVQLKKKSKSWVMVQAFGYSLPLNFKPQSRANSMGVSTPKLPATNEVEDGEVDDAKLASAADPSQRWNVESGRDGTNRAPSNGYRTPDNGGRLSREAPVPPPKASVVSDRGPAINPERLALVNPERPELINPERAALISSGNEPSRSDSPRRLRDDARERSSRQNSPPPRRHDSEKDHQHPRRDDRPNRNAPIDPHNTPRGRAEDAAPPPAGPRGDDQQIECLTDRLHQKD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.32
2	0.31
3	0.26
4	0.26
5	0.24
6	0.16
7	0.11
8	0.12
9	0.11
10	0.12
11	0.13
12	0.15
13	0.15
14	0.16
15	0.17
16	0.16
17	0.16
18	0.14
19	0.16
20	0.13
21	0.12
22	0.13
23	0.11
24	0.13
25	0.13
26	0.13
27	0.1
28	0.09
29	0.11
30	0.1
31	0.1
32	0.08
33	0.07
34	0.07
35	0.08
36	0.09
37	0.08
38	0.08
39	0.08
40	0.08
41	0.08
42	0.08
43	0.07
44	0.1
45	0.09
46	0.08
47	0.08
48	0.09
49	0.11
50	0.1
51	0.1
52	0.08
53	0.08
54	0.08
55	0.09
56	0.08
57	0.06
58	0.07
59	0.07
60	0.06
61	0.05
62	0.05
63	0.05
64	0.05
65	0.05
66	0.06
67	0.12
68	0.18
69	0.2
70	0.28
71	0.35
72	0.43
73	0.46
74	0.48
75	0.46
76	0.42
77	0.45
78	0.38
79	0.34
80	0.3
81	0.26
82	0.24
83	0.21
84	0.19
85	0.15
86	0.13
87	0.11
88	0.08
89	0.1
90	0.11
91	0.11
92	0.11
93	0.11
94	0.12
95	0.11
96	0.1
97	0.1
98	0.12
99	0.12
100	0.13
101	0.14
102	0.15
103	0.17
104	0.18
105	0.16
106	0.13
107	0.14
108	0.15
109	0.13
110	0.11
111	0.1
112	0.09
113	0.09
114	0.09
115	0.08
116	0.08
117	0.08
118	0.09
119	0.1
120	0.11
121	0.1
122	0.1
123	0.11
124	0.1
125	0.1
126	0.1
127	0.08
128	0.06
129	0.06
130	0.06
131	0.04
132	0.04
133	0.05
134	0.05
135	0.06
136	0.07
137	0.08
138	0.08
139	0.1
140	0.16
141	0.2
142	0.22
143	0.23
144	0.22
145	0.28
146	0.3
147	0.31
148	0.28
149	0.26
150	0.24
151	0.27
152	0.3
153	0.3
154	0.35
155	0.38
156	0.38
157	0.42
158	0.45
159	0.42
160	0.41
161	0.39
162	0.39
163	0.34
164	0.35
165	0.32
166	0.28
167	0.25
168	0.22
169	0.19
170	0.12
171	0.13
172	0.09
173	0.09
174	0.09
175	0.11
176	0.12
177	0.11
178	0.11
179	0.11
180	0.14
181	0.15
182	0.15
183	0.14
184	0.14
185	0.15
186	0.14
187	0.12
188	0.11
189	0.09
190	0.08
191	0.07
192	0.06
193	0.06
194	0.06
195	0.06
196	0.07
197	0.07
198	0.07
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.07
203	0.08
204	0.05
205	0.05
206	0.05
207	0.04
208	0.05
209	0.05
210	0.07
211	0.07
212	0.07
213	0.07
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.09
218	0.07
219	0.07
220	0.08
221	0.08
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.05
228	0.04
229	0.04
230	0.04
231	0.05
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.07
236	0.07
237	0.08
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.07
242	0.06
243	0.06
244	0.05
245	0.07
246	0.07
247	0.07
248	0.06
249	0.07
250	0.11
251	0.12
252	0.11
253	0.1
254	0.14
255	0.15
256	0.18
257	0.17
258	0.14
259	0.14
260	0.16
261	0.15
262	0.12
263	0.13
264	0.11
265	0.12
266	0.12
267	0.11
268	0.1
269	0.1
270	0.09
271	0.08
272	0.07
273	0.06
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.08
278	0.08
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.04
283	0.04
284	0.04
285	0.04
286	0.04
287	0.04
288	0.06
289	0.06
290	0.06
291	0.06
292	0.06
293	0.05
294	0.06
295	0.06
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.05
305	0.04
306	0.05
307	0.08
308	0.09
309	0.09
310	0.1
311	0.1
312	0.1
313	0.1
314	0.1
315	0.08
316	0.07
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.09
321	0.08
322	0.08
323	0.11
324	0.13
325	0.14
326	0.15
327	0.15
328	0.17
329	0.17
330	0.18
331	0.15
332	0.15
333	0.13
334	0.14
335	0.2
336	0.19
337	0.21
338	0.22
339	0.21
340	0.23
341	0.22
342	0.19
343	0.13
344	0.15
345	0.14
346	0.15
347	0.24
348	0.24
349	0.3
350	0.37
351	0.44
352	0.51
353	0.59
354	0.68
355	0.68
356	0.75
357	0.77
358	0.73
359	0.71
360	0.66
361	0.6
362	0.58
363	0.49
364	0.39
365	0.32
366	0.29
367	0.24
368	0.22
369	0.19
370	0.1
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.09
375	0.08
376	0.06
377	0.05
378	0.05
379	0.04
380	0.05
381	0.06
382	0.06
383	0.08
384	0.13
385	0.17
386	0.19
387	0.22
388	0.28
389	0.31
390	0.37
391	0.42
392	0.47
393	0.46
394	0.49
395	0.47
396	0.42
397	0.36
398	0.3
399	0.26
400	0.15
401	0.12
402	0.1
403	0.11
404	0.14
405	0.16
406	0.18
407	0.22
408	0.28
409	0.32
410	0.34
411	0.38
412	0.36
413	0.37
414	0.35
415	0.35
416	0.31
417	0.28
418	0.24
419	0.21
420	0.2
421	0.18
422	0.18
423	0.18
424	0.22
425	0.22
426	0.23
427	0.22
428	0.22
429	0.2
430	0.21
431	0.17
432	0.11
433	0.09
434	0.07
435	0.06
436	0.05
437	0.06
438	0.05
439	0.04
440	0.05
441	0.07
442	0.09
443	0.1
444	0.13
445	0.17
446	0.18
447	0.18
448	0.21
449	0.21
450	0.22
451	0.25
452	0.26
453	0.27
454	0.28
455	0.29
456	0.29
457	0.35
458	0.33
459	0.31
460	0.31
461	0.26
462	0.33
463	0.36
464	0.36
465	0.31
466	0.31
467	0.34
468	0.35
469	0.38
470	0.34
471	0.3
472	0.32
473	0.32
474	0.32
475	0.3
476	0.28
477	0.26
478	0.29
479	0.36
480	0.36
481	0.34
482	0.35
483	0.33
484	0.33
485	0.34
486	0.33
487	0.3
488	0.29
489	0.3
490	0.29
491	0.29
492	0.27
493	0.28
494	0.27
495	0.26
496	0.23
497	0.21
498	0.22
499	0.21
500	0.21
501	0.23
502	0.25
503	0.25
504	0.26
505	0.27
506	0.26
507	0.27
508	0.28
509	0.29
510	0.28
511	0.3
512	0.3
513	0.3
514	0.29
515	0.28
516	0.27
517	0.21
518	0.17
519	0.12
520	0.14
521	0.16
522	0.17
523	0.18
524	0.17
525	0.22
526	0.26
527	0.3
528	0.34
529	0.39
530	0.49
531	0.57
532	0.64
533	0.65
534	0.65
535	0.7
536	0.75
537	0.75
538	0.73
539	0.72
540	0.68
541	0.73
542	0.76
543	0.73
544	0.7
545	0.71
546	0.73
547	0.77
548	0.82
549	0.8
550	0.8
551	0.78
552	0.79
553	0.78
554	0.77
555	0.77
556	0.79
557	0.79
558	0.82
559	0.82
560	0.83
561	0.82
562	0.82
563	0.81
564	0.81
565	0.83
566	0.83
567	0.88
568	0.88
569	0.86
570	0.82
571	0.76
572	0.7
573	0.69
574	0.66
575	0.59
576	0.56
577	0.58
578	0.55
579	0.52
580	0.54
581	0.49
582	0.46
583	0.44
584	0.4
585	0.4
586	0.42
587	0.45
588	0.4
589	0.35
590	0.32
591	0.34
592	0.31
593	0.24
594	0.24
595	0.25
596	0.3
597	0.33
598	0.34
599	0.36
600	0.37
601	0.38
602	0.34
603	0.3
604	0.24
605	0.27

A0A395IPD0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer