Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395JCA9

Protein Details
Accession A0A395JCA9    Localization Confidence High Confidence Score 20.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
7-85DVAKTLKASKRKRVEGEGKKPKEGKRDKKKRSRRDSDEDPDGMEIDGKRVRKPKRVDGERKDRDRTKERRKATPEPENDBasic
101-125AMDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEAFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-40KASKRKRVEGEGKKPKEGKRDKKKRSRR
53-78GKRVRKPKRVDGERKDRDRTKERRKA
93-116RRRRALDKAMDAALKNPNKRRRKK
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MVGIDEDVAKTLKASKRKRVEGEGKKPKEGKRDKKKRSRRDSDEDPDGMEIDGKRVRKPKRVDGERKDRDRTKERRKATPEPENDENLTPDERRRRALDKAMDAALKNPNKRRRKKDEVDLEEAFDDEIAALKLRMEEACQADNAARDANLPATRKLEMLPEVVALLNRNTIQHSIVDPDTNFLQSVKFFLEPLNDGSLPAYNIQRDLFQALARLPIEKEALLSSGIGKVVLYYTKSKRPEIGIKRIAERLLGEWSRPILKRSDDYKKRKVATKEFDHQAAQLAIRPSGSQSSQLPSQRTGLTARELERQRLLAPKIISNRARMETSNTSYSIAPRSNFDPSRGVDPNSRPIGAGGVEAFRKDDNEARKEEVMSFECMCRRSCDGGGLCY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.5
3 0.6
4 0.69
5 0.75
6 0.78
7 0.83
8 0.84
9 0.87
10 0.87
11 0.82
12 0.82
13 0.82
14 0.77
15 0.77
16 0.77
17 0.77
18 0.77
19 0.83
20 0.86
21 0.9
22 0.95
23 0.95
24 0.96
25 0.95
26 0.94
27 0.92
28 0.91
29 0.88
30 0.85
31 0.75
32 0.65
33 0.54
34 0.45
35 0.35
36 0.28
37 0.2
38 0.16
39 0.2
40 0.2
41 0.25
42 0.33
43 0.41
44 0.47
45 0.55
46 0.6
47 0.67
48 0.77
49 0.82
50 0.84
51 0.88
52 0.89
53 0.89
54 0.88
55 0.83
56 0.81
57 0.81
58 0.81
59 0.81
60 0.8
61 0.79
62 0.8
63 0.81
64 0.82
65 0.82
66 0.81
67 0.77
68 0.75
69 0.73
70 0.67
71 0.61
72 0.52
73 0.44
74 0.35
75 0.3
76 0.24
77 0.27
78 0.32
79 0.32
80 0.35
81 0.38
82 0.41
83 0.45
84 0.53
85 0.53
86 0.49
87 0.49
88 0.48
89 0.45
90 0.41
91 0.37
92 0.36
93 0.34
94 0.36
95 0.41
96 0.49
97 0.57
98 0.67
99 0.74
100 0.76
101 0.82
102 0.84
103 0.86
104 0.87
105 0.84
106 0.81
107 0.71
108 0.62
109 0.51
110 0.43
111 0.32
112 0.2
113 0.13
114 0.05
115 0.05
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.05
120 0.05
121 0.06
122 0.06
123 0.07
124 0.11
125 0.13
126 0.14
127 0.13
128 0.14
129 0.14
130 0.14
131 0.14
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.11
137 0.14
138 0.15
139 0.16
140 0.17
141 0.18
142 0.18
143 0.18
144 0.17
145 0.15
146 0.15
147 0.13
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.1
180 0.11
181 0.13
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.1
187 0.11
188 0.1
189 0.08
190 0.09
191 0.09
192 0.09
193 0.09
194 0.1
195 0.09
196 0.08
197 0.09
198 0.08
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.1
204 0.11
205 0.09
206 0.1
207 0.07
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.06
215 0.06
216 0.05
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.13
221 0.17
222 0.24
223 0.28
224 0.29
225 0.31
226 0.35
227 0.43
228 0.46
229 0.52
230 0.52
231 0.51
232 0.53
233 0.52
234 0.47
235 0.38
236 0.3
237 0.22
238 0.22
239 0.2
240 0.17
241 0.16
242 0.17
243 0.22
244 0.22
245 0.22
246 0.19
247 0.21
248 0.27
249 0.33
250 0.43
251 0.48
252 0.56
253 0.64
254 0.68
255 0.7
256 0.72
257 0.73
258 0.72
259 0.71
260 0.71
261 0.7
262 0.65
263 0.63
264 0.56
265 0.48
266 0.41
267 0.32
268 0.24
269 0.19
270 0.17
271 0.15
272 0.15
273 0.14
274 0.13
275 0.15
276 0.15
277 0.14
278 0.15
279 0.19
280 0.25
281 0.29
282 0.3
283 0.29
284 0.32
285 0.29
286 0.29
287 0.28
288 0.24
289 0.24
290 0.26
291 0.26
292 0.31
293 0.33
294 0.35
295 0.34
296 0.33
297 0.31
298 0.35
299 0.35
300 0.32
301 0.31
302 0.34
303 0.38
304 0.45
305 0.45
306 0.43
307 0.46
308 0.44
309 0.44
310 0.39
311 0.4
312 0.39
313 0.41
314 0.4
315 0.35
316 0.34
317 0.32
318 0.34
319 0.32
320 0.29
321 0.25
322 0.25
323 0.27
324 0.34
325 0.35
326 0.36
327 0.36
328 0.34
329 0.41
330 0.41
331 0.41
332 0.4
333 0.43
334 0.48
335 0.47
336 0.45
337 0.37
338 0.34
339 0.33
340 0.26
341 0.23
342 0.15
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.16
347 0.14
348 0.15
349 0.17
350 0.22
351 0.27
352 0.33
353 0.36
354 0.4
355 0.42
356 0.43
357 0.41
358 0.41
359 0.35
360 0.34
361 0.32
362 0.31
363 0.33
364 0.33
365 0.33
366 0.31
367 0.34
368 0.35
369 0.35
370 0.39