Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395J027

Protein Details
Accession A0A395J027    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-118GGRASGEKQKPKKKSSGKKVDTIKEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
98-111GEKQKPKKKSSGKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 13.333, nucl 13, cyto 12.5, mito_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MAEPIEPPITLSKQASDDMEAYNSAKVSLAEYCAKGTAEYAQKRYEDAVDHYAQASELQAEINGEMSPENAEILFLYGRALFKVAQQQSDVLGGRASGEKQKPKKKSSGKKVDTIKEEDETVKAEEEQKDENLKTEGEQKADEVAEEAVAIIANGGAAKKEESSSKDPKKPLFTFTGDENFEDSDEEEEEEGEEEEEEDDPLNLAFDILDLTRVLFEKRLQADEGEGKGKETGDNAMTTHIKERLADTRDLLGEISLENERFPAAVSDFRESLALKGSLFPEEDEQIAEAHYKLSLALEFASITQTETDDNKPNAGADNVDEEMRAEAVKELELAIKSTKLKLHNQEVELAETAIAEDNDVTRHRIADVKSIVADMELRLKELRAPPVDINKAVAAALAPAGAPQSNSTSGILGNILGESASETAARVEEAKKTATDLTGLVRHKKKETKDLPIQAAGAKRKAEDEPEVKGESSDGAKEKKAKAEVASVEGA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.29
3 0.27
4 0.26
5 0.23
6 0.23
7 0.22
8 0.2
9 0.19
10 0.18
11 0.15
12 0.14
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.17
17 0.19
18 0.2
19 0.21
20 0.22
21 0.22
22 0.2
23 0.19
24 0.22
25 0.27
26 0.32
27 0.35
28 0.38
29 0.38
30 0.4
31 0.41
32 0.37
33 0.31
34 0.29
35 0.32
36 0.29
37 0.3
38 0.29
39 0.27
40 0.24
41 0.21
42 0.16
43 0.1
44 0.08
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.07
51 0.07
52 0.06
53 0.07
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.06
58 0.07
59 0.06
60 0.08
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.11
68 0.1
69 0.13
70 0.23
71 0.25
72 0.25
73 0.25
74 0.26
75 0.25
76 0.29
77 0.26
78 0.17
79 0.14
80 0.12
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.18
85 0.25
86 0.34
87 0.43
88 0.53
89 0.61
90 0.65
91 0.74
92 0.77
93 0.81
94 0.83
95 0.85
96 0.81
97 0.81
98 0.83
99 0.8
100 0.75
101 0.7
102 0.61
103 0.51
104 0.48
105 0.4
106 0.32
107 0.27
108 0.22
109 0.17
110 0.15
111 0.19
112 0.19
113 0.21
114 0.22
115 0.22
116 0.26
117 0.25
118 0.26
119 0.23
120 0.21
121 0.19
122 0.25
123 0.25
124 0.22
125 0.22
126 0.2
127 0.21
128 0.21
129 0.19
130 0.12
131 0.1
132 0.08
133 0.08
134 0.07
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.03
141 0.03
142 0.03
143 0.03
144 0.04
145 0.05
146 0.06
147 0.07
148 0.1
149 0.16
150 0.23
151 0.33
152 0.42
153 0.48
154 0.52
155 0.56
156 0.61
157 0.58
158 0.55
159 0.5
160 0.45
161 0.4
162 0.39
163 0.4
164 0.32
165 0.3
166 0.27
167 0.21
168 0.18
169 0.16
170 0.13
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.05
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.05
189 0.04
190 0.04
191 0.04
192 0.03
193 0.03
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.07
203 0.08
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.17
208 0.17
209 0.18
210 0.2
211 0.21
212 0.17
213 0.15
214 0.14
215 0.14
216 0.14
217 0.12
218 0.1
219 0.1
220 0.08
221 0.09
222 0.09
223 0.11
224 0.11
225 0.11
226 0.13
227 0.13
228 0.12
229 0.12
230 0.14
231 0.18
232 0.21
233 0.21
234 0.2
235 0.19
236 0.19
237 0.19
238 0.17
239 0.1
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.06
244 0.06
245 0.05
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.09
253 0.11
254 0.13
255 0.13
256 0.13
257 0.14
258 0.13
259 0.12
260 0.12
261 0.11
262 0.09
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.07
294 0.09
295 0.13
296 0.18
297 0.19
298 0.19
299 0.19
300 0.19
301 0.19
302 0.17
303 0.14
304 0.08
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.09
310 0.09
311 0.09
312 0.08
313 0.05
314 0.06
315 0.06
316 0.06
317 0.06
318 0.06
319 0.08
320 0.09
321 0.1
322 0.09
323 0.12
324 0.13
325 0.16
326 0.2
327 0.22
328 0.29
329 0.36
330 0.44
331 0.47
332 0.47
333 0.5
334 0.47
335 0.44
336 0.37
337 0.3
338 0.2
339 0.14
340 0.13
341 0.09
342 0.08
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.08
347 0.09
348 0.11
349 0.1
350 0.11
351 0.12
352 0.17
353 0.18
354 0.24
355 0.25
356 0.24
357 0.23
358 0.23
359 0.22
360 0.17
361 0.17
362 0.09
363 0.15
364 0.13
365 0.14
366 0.15
367 0.15
368 0.2
369 0.24
370 0.31
371 0.26
372 0.3
373 0.33
374 0.41
375 0.44
376 0.39
377 0.37
378 0.3
379 0.27
380 0.23
381 0.19
382 0.11
383 0.08
384 0.07
385 0.05
386 0.05
387 0.04
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.07
392 0.1
393 0.12
394 0.14
395 0.14
396 0.14
397 0.14
398 0.14
399 0.13
400 0.1
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.05
405 0.05
406 0.05
407 0.05
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.11
416 0.15
417 0.17
418 0.19
419 0.19
420 0.21
421 0.23
422 0.21
423 0.2
424 0.17
425 0.19
426 0.24
427 0.28
428 0.35
429 0.39
430 0.43
431 0.5
432 0.57
433 0.59
434 0.63
435 0.68
436 0.69
437 0.73
438 0.77
439 0.74
440 0.69
441 0.63
442 0.56
443 0.55
444 0.5
445 0.45
446 0.38
447 0.33
448 0.34
449 0.35
450 0.37
451 0.38
452 0.37
453 0.38
454 0.41
455 0.43
456 0.4
457 0.37
458 0.32
459 0.26
460 0.24
461 0.23
462 0.23
463 0.24
464 0.29
465 0.37
466 0.41
467 0.46
468 0.48
469 0.48
470 0.46
471 0.51
472 0.49