Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395ITE0

Protein Details
Accession A0A395ITE0    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
8-31QPELRRPTSSPRPKGRENAKDTLCHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 8.5, mito 7, cyto 3.5, pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030844  PAN3  
IPR041332  Pan3_PK  
IPR000571  Znf_CCCH  
Gene Ontology GO:0031251  C:PAN complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0000289  P:nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening  
Pfam View protein in Pfam  
PF18101  Pan3_PK  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAATRFNQPELRRPTSSPRPKGRENAKDTLCRNVLIYGHCRYEDQGCAFNHDPNKGLGGVIDQPKKTLNVDSPSFTPAAIPTTNKASSITSQAVNAAPFTPRKLASGTATPTPQLDPGIPQFNPTSREFTQTYDPSHNIPTNGTNELPYGTFTMPGVSQAISNTFPNPYSDDLSNLTSGGSDATLPSIPGSYHSLVALDTTPIRSAAVFGYPSWVYKAVSVKNGKHYCLRRLEGFHLTNEKAIRAVKEWNKINLFDILQYDQQRPIKELQDEDLNLFGILMLSLATVNASITPHTNAQVIQTHVDTVVRNYSAELADTIRWLLTPPSPTETKDLQTFMRGISGRMASVFDSSLQANDELTSDLCRELENARLVRLMTKLGNINERYEFDNDPMWSENGDRYILKLFRDYVFHQVDAEGRPVTDMAWVFEMFE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.64
3 0.72
4 0.72
5 0.74
6 0.75
7 0.78
8 0.84
9 0.85
10 0.84
11 0.81
12 0.81
13 0.77
14 0.77
15 0.71
16 0.71
17 0.62
18 0.52
19 0.45
20 0.39
21 0.35
22 0.32
23 0.35
24 0.31
25 0.32
26 0.32
27 0.32
28 0.3
29 0.31
30 0.32
31 0.31
32 0.32
33 0.3
34 0.37
35 0.37
36 0.41
37 0.41
38 0.37
39 0.35
40 0.29
41 0.31
42 0.23
43 0.21
44 0.16
45 0.14
46 0.19
47 0.26
48 0.3
49 0.28
50 0.29
51 0.31
52 0.33
53 0.31
54 0.3
55 0.29
56 0.3
57 0.33
58 0.35
59 0.35
60 0.35
61 0.34
62 0.28
63 0.22
64 0.16
65 0.17
66 0.16
67 0.16
68 0.16
69 0.22
70 0.23
71 0.23
72 0.23
73 0.22
74 0.22
75 0.25
76 0.26
77 0.2
78 0.2
79 0.22
80 0.22
81 0.19
82 0.18
83 0.14
84 0.13
85 0.14
86 0.16
87 0.18
88 0.17
89 0.19
90 0.2
91 0.21
92 0.22
93 0.27
94 0.28
95 0.27
96 0.28
97 0.26
98 0.26
99 0.24
100 0.21
101 0.16
102 0.14
103 0.13
104 0.17
105 0.22
106 0.2
107 0.22
108 0.22
109 0.24
110 0.28
111 0.26
112 0.29
113 0.25
114 0.3
115 0.29
116 0.3
117 0.35
118 0.34
119 0.36
120 0.34
121 0.34
122 0.31
123 0.34
124 0.33
125 0.26
126 0.25
127 0.24
128 0.22
129 0.23
130 0.21
131 0.18
132 0.16
133 0.16
134 0.15
135 0.12
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.1
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.09
148 0.1
149 0.1
150 0.11
151 0.1
152 0.11
153 0.11
154 0.13
155 0.13
156 0.15
157 0.14
158 0.15
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.14
163 0.12
164 0.09
165 0.09
166 0.07
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.11
178 0.1
179 0.11
180 0.11
181 0.11
182 0.1
183 0.11
184 0.1
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.07
196 0.07
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.11
202 0.09
203 0.11
204 0.16
205 0.15
206 0.21
207 0.26
208 0.27
209 0.36
210 0.38
211 0.37
212 0.4
213 0.41
214 0.41
215 0.44
216 0.44
217 0.37
218 0.38
219 0.41
220 0.41
221 0.38
222 0.34
223 0.31
224 0.29
225 0.29
226 0.26
227 0.22
228 0.16
229 0.16
230 0.15
231 0.13
232 0.2
233 0.23
234 0.31
235 0.33
236 0.37
237 0.38
238 0.37
239 0.37
240 0.32
241 0.27
242 0.2
243 0.19
244 0.16
245 0.18
246 0.19
247 0.19
248 0.22
249 0.24
250 0.24
251 0.24
252 0.26
253 0.27
254 0.27
255 0.27
256 0.24
257 0.25
258 0.25
259 0.24
260 0.2
261 0.16
262 0.14
263 0.12
264 0.1
265 0.05
266 0.04
267 0.04
268 0.03
269 0.03
270 0.03
271 0.03
272 0.03
273 0.03
274 0.03
275 0.04
276 0.04
277 0.05
278 0.06
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.12
283 0.11
284 0.14
285 0.17
286 0.17
287 0.17
288 0.16
289 0.15
290 0.15
291 0.16
292 0.14
293 0.11
294 0.13
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.14
299 0.13
300 0.13
301 0.12
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.11
306 0.08
307 0.08
308 0.09
309 0.1
310 0.11
311 0.14
312 0.16
313 0.2
314 0.22
315 0.24
316 0.28
317 0.3
318 0.29
319 0.3
320 0.3
321 0.26
322 0.27
323 0.27
324 0.21
325 0.24
326 0.22
327 0.19
328 0.21
329 0.21
330 0.18
331 0.18
332 0.18
333 0.13
334 0.14
335 0.13
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.1
344 0.1
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.1
350 0.1
351 0.1
352 0.11
353 0.11
354 0.17
355 0.23
356 0.23
357 0.23
358 0.25
359 0.25
360 0.26
361 0.26
362 0.23
363 0.17
364 0.21
365 0.25
366 0.27
367 0.35
368 0.33
369 0.36
370 0.35
371 0.36
372 0.35
373 0.33
374 0.31
375 0.25
376 0.29
377 0.26
378 0.26
379 0.26
380 0.24
381 0.21
382 0.21
383 0.22
384 0.19
385 0.21
386 0.18
387 0.18
388 0.25
389 0.26
390 0.26
391 0.27
392 0.28
393 0.28
394 0.33
395 0.34
396 0.36
397 0.37
398 0.36
399 0.32
400 0.3
401 0.32
402 0.29
403 0.3
404 0.21
405 0.17
406 0.17
407 0.17
408 0.16
409 0.17
410 0.15
411 0.14
412 0.17