Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CDF5

Protein Details
Accession A1CDF5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
9-31ADNSTPRPKIARRGRGRGGRGSHBasic
156-177STVGKGKSKSAQHRPPKVTTKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-32RPKIARRGRGRGGRGSHR
60-93PRAPRGPRGGKRGGRGGGSSQDNSRRRGRGRGGE
Subcellular Location(s) mito 19, nucl 4, cyto 4, cyto_nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034078  NFX1_fam  
IPR001374  R3H_dom  
IPR036867  R3H_dom_sf  
IPR034077  R3H_FAP1  
IPR000967  Znf_NFX1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG act:ACLA_006390  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01424  R3H  
PF01422  zf-NF-X1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51061  R3H  
CDD cd06008  NF-X1-zinc-finger  
cd06006  R3H_unknown_2  
cd16492  RING-CH-C4HC3_NFX1-like  
Amino Acid Sequences MSGSPVATADNSTPRPKIARRGRGRGGRGSHRAPASATPETQPEQQSSEALATNSRSNEPRAPRGPRGGKRGGRGGGSSQDNSRRRGRGRGGEGAAVGAGGRIFEGRLTRAERAFDEETAEGTGEAQEPELRANAPDFVPGASVSGDAVVISSAASTVGKGKSKSAQHRPPKVTTKSTAPDIATRIHEDIAHNLYECPICTSELGRRSRVWSCGLCWTVFHLSCVKKWSKNEGSAAQDAARRSADGASSAPRAWRCPGCNLPHEIFPSSYTCWRWTRVRYLDFLRTPAGKLARGLVKVAHIRAMRLAMLDRVLLALRWARRRIVFAEGIRRQSVARTLITRKDGVAARYVEICFPAANTPVLGRATRGFVDSKEEEKDSQLARDEDGTIEDWVGCFSCGDQCSRPFDCGVHFCEKGCHPQDAHPAHCPRSPDVVSHCPCGKTLLADTPNFSPRTSCEDPIPNCAEACGRILPCGHSCDQVCHTGPCGPCLRKVPVNCRCGRTTVVTVCHQGTTDAPWCFRICKAGLHCGRHACAERCCPGEQKAIERQAMRRKLKSHLRPSDEDVEAEHICTRVCGRPLKCGRHTCPEICHKGPCNTCREAIFEDIPCNCGRTVLSPPLPCGTTPPACSFPCERPKPCGHPQTAHNCHTDEEGCPKCPFLTEKKCLCGKRVLKNQPCWLAETRCGQVCGEPLKCGSHFCQKTCHRPGECEDASKPCQQPCGKTKALCGHPCTDACHAPYQCPEKTPCASTVTATCGCGRLRQSRRCNAAVASKGLPQQAQKAPTLTPLTCDDECARLERNRSLASALGVEINPSTTTAAAANVSLSNLPYSTETLDMYIQLSSTSPLSTLQTYESTLHSLATSTTQRSVRFQPAKSSLRAYIHSLATDWGFASESFDPEPHRHVFVLKPTTWTAPLLGVGPENSIGIGGKSVGECVKIRERQRLKEREAQRLAAAEAKALKDAAKAQQAADSANGGWAQVAASRRTNGVGAARAALAAPGASPWSVSMYAALAGDSGGWGPPKKEKLVLRSGVGAGKKSATAPPVAMTEVADSWEEEEEKEEQEEEARERELQSETAEGKTETEVEAVMTDGLSAVETTAEPASEPVVATD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.4
3 0.44
4 0.51
5 0.54
6 0.61
7 0.66
8 0.75
9 0.81
10 0.83
11 0.84
12 0.82
13 0.8
14 0.79
15 0.77
16 0.72
17 0.69
18 0.62
19 0.57
20 0.5
21 0.48
22 0.45
23 0.41
24 0.38
25 0.33
26 0.35
27 0.37
28 0.4
29 0.37
30 0.33
31 0.31
32 0.31
33 0.3
34 0.26
35 0.26
36 0.22
37 0.2
38 0.2
39 0.2
40 0.23
41 0.24
42 0.27
43 0.27
44 0.3
45 0.38
46 0.42
47 0.49
48 0.54
49 0.59
50 0.62
51 0.7
52 0.75
53 0.75
54 0.77
55 0.77
56 0.75
57 0.73
58 0.74
59 0.67
60 0.6
61 0.54
62 0.49
63 0.47
64 0.46
65 0.42
66 0.4
67 0.46
68 0.47
69 0.5
70 0.54
71 0.54
72 0.53
73 0.61
74 0.63
75 0.64
76 0.67
77 0.71
78 0.65
79 0.59
80 0.55
81 0.46
82 0.36
83 0.26
84 0.18
85 0.1
86 0.07
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.07
92 0.09
93 0.11
94 0.16
95 0.21
96 0.25
97 0.27
98 0.3
99 0.29
100 0.34
101 0.35
102 0.3
103 0.29
104 0.25
105 0.24
106 0.22
107 0.21
108 0.13
109 0.11
110 0.12
111 0.09
112 0.09
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.13
121 0.14
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.13
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.09
130 0.09
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.05
135 0.05
136 0.04
137 0.04
138 0.04
139 0.03
140 0.03
141 0.04
142 0.04
143 0.05
144 0.1
145 0.14
146 0.19
147 0.2
148 0.23
149 0.3
150 0.4
151 0.49
152 0.56
153 0.62
154 0.68
155 0.77
156 0.8
157 0.82
158 0.83
159 0.8
160 0.76
161 0.7
162 0.68
163 0.63
164 0.61
165 0.56
166 0.48
167 0.45
168 0.4
169 0.39
170 0.33
171 0.32
172 0.29
173 0.25
174 0.25
175 0.22
176 0.24
177 0.23
178 0.21
179 0.19
180 0.17
181 0.19
182 0.18
183 0.17
184 0.15
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.17
189 0.22
190 0.29
191 0.32
192 0.32
193 0.33
194 0.37
195 0.41
196 0.42
197 0.41
198 0.35
199 0.34
200 0.39
201 0.39
202 0.34
203 0.3
204 0.31
205 0.32
206 0.3
207 0.29
208 0.28
209 0.28
210 0.3
211 0.37
212 0.38
213 0.37
214 0.41
215 0.5
216 0.51
217 0.55
218 0.58
219 0.57
220 0.57
221 0.52
222 0.5
223 0.42
224 0.37
225 0.31
226 0.27
227 0.22
228 0.17
229 0.16
230 0.16
231 0.14
232 0.12
233 0.13
234 0.14
235 0.16
236 0.17
237 0.2
238 0.2
239 0.22
240 0.25
241 0.3
242 0.29
243 0.35
244 0.42
245 0.44
246 0.48
247 0.51
248 0.48
249 0.46
250 0.46
251 0.4
252 0.33
253 0.29
254 0.28
255 0.24
256 0.27
257 0.25
258 0.27
259 0.28
260 0.32
261 0.37
262 0.39
263 0.46
264 0.5
265 0.51
266 0.52
267 0.55
268 0.58
269 0.53
270 0.5
271 0.43
272 0.36
273 0.34
274 0.34
275 0.3
276 0.22
277 0.21
278 0.25
279 0.26
280 0.25
281 0.25
282 0.21
283 0.24
284 0.26
285 0.26
286 0.26
287 0.22
288 0.22
289 0.23
290 0.23
291 0.18
292 0.16
293 0.16
294 0.11
295 0.11
296 0.11
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.11
303 0.15
304 0.21
305 0.23
306 0.26
307 0.27
308 0.31
309 0.32
310 0.33
311 0.34
312 0.32
313 0.41
314 0.42
315 0.43
316 0.41
317 0.39
318 0.33
319 0.29
320 0.3
321 0.23
322 0.21
323 0.23
324 0.27
325 0.31
326 0.34
327 0.33
328 0.28
329 0.3
330 0.3
331 0.26
332 0.28
333 0.24
334 0.22
335 0.24
336 0.24
337 0.19
338 0.17
339 0.16
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.09
344 0.09
345 0.09
346 0.09
347 0.11
348 0.12
349 0.12
350 0.11
351 0.11
352 0.13
353 0.13
354 0.15
355 0.13
356 0.12
357 0.19
358 0.2
359 0.21
360 0.21
361 0.22
362 0.21
363 0.22
364 0.26
365 0.2
366 0.2
367 0.21
368 0.19
369 0.18
370 0.19
371 0.18
372 0.14
373 0.14
374 0.13
375 0.1
376 0.09
377 0.08
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.06
382 0.04
383 0.05
384 0.08
385 0.09
386 0.12
387 0.15
388 0.17
389 0.23
390 0.24
391 0.25
392 0.22
393 0.22
394 0.23
395 0.23
396 0.26
397 0.25
398 0.24
399 0.23
400 0.26
401 0.26
402 0.31
403 0.3
404 0.28
405 0.24
406 0.29
407 0.38
408 0.39
409 0.4
410 0.39
411 0.4
412 0.4
413 0.41
414 0.38
415 0.31
416 0.34
417 0.32
418 0.27
419 0.3
420 0.37
421 0.37
422 0.38
423 0.38
424 0.31
425 0.31
426 0.3
427 0.24
428 0.17
429 0.17
430 0.2
431 0.21
432 0.21
433 0.22
434 0.23
435 0.27
436 0.26
437 0.24
438 0.18
439 0.17
440 0.26
441 0.27
442 0.25
443 0.25
444 0.31
445 0.33
446 0.38
447 0.38
448 0.3
449 0.26
450 0.26
451 0.22
452 0.15
453 0.16
454 0.13
455 0.1
456 0.11
457 0.12
458 0.13
459 0.14
460 0.17
461 0.16
462 0.17
463 0.17
464 0.19
465 0.21
466 0.23
467 0.22
468 0.19
469 0.19
470 0.21
471 0.2
472 0.21
473 0.25
474 0.22
475 0.24
476 0.28
477 0.31
478 0.31
479 0.35
480 0.42
481 0.45
482 0.52
483 0.52
484 0.52
485 0.49
486 0.46
487 0.44
488 0.37
489 0.33
490 0.29
491 0.29
492 0.27
493 0.28
494 0.26
495 0.24
496 0.2
497 0.16
498 0.13
499 0.13
500 0.16
501 0.15
502 0.15
503 0.16
504 0.17
505 0.17
506 0.17
507 0.17
508 0.13
509 0.17
510 0.19
511 0.27
512 0.32
513 0.34
514 0.36
515 0.34
516 0.34
517 0.32
518 0.33
519 0.27
520 0.25
521 0.26
522 0.26
523 0.27
524 0.27
525 0.27
526 0.26
527 0.29
528 0.26
529 0.27
530 0.31
531 0.33
532 0.34
533 0.33
534 0.36
535 0.39
536 0.47
537 0.46
538 0.44
539 0.42
540 0.48
541 0.56
542 0.6
543 0.62
544 0.61
545 0.62
546 0.61
547 0.62
548 0.6
549 0.51
550 0.41
551 0.31
552 0.26
553 0.21
554 0.19
555 0.15
556 0.09
557 0.08
558 0.09
559 0.1
560 0.09
561 0.13
562 0.19
563 0.19
564 0.29
565 0.37
566 0.44
567 0.5
568 0.55
569 0.55
570 0.58
571 0.61
572 0.53
573 0.51
574 0.52
575 0.51
576 0.45
577 0.45
578 0.4
579 0.42
580 0.46
581 0.43
582 0.41
583 0.37
584 0.37
585 0.33
586 0.33
587 0.28
588 0.26
589 0.24
590 0.19
591 0.19
592 0.18
593 0.18
594 0.15
595 0.14
596 0.11
597 0.1
598 0.1
599 0.1
600 0.14
601 0.18
602 0.23
603 0.22
604 0.23
605 0.24
606 0.25
607 0.22
608 0.21
609 0.2
610 0.18
611 0.2
612 0.22
613 0.25
614 0.25
615 0.28
616 0.28
617 0.31
618 0.38
619 0.43
620 0.42
621 0.43
622 0.49
623 0.54
624 0.59
625 0.59
626 0.53
627 0.51
628 0.55
629 0.6
630 0.61
631 0.57
632 0.5
633 0.42
634 0.39
635 0.37
636 0.31
637 0.22
638 0.22
639 0.21
640 0.22
641 0.21
642 0.21
643 0.19
644 0.2
645 0.22
646 0.24
647 0.31
648 0.37
649 0.4
650 0.45
651 0.52
652 0.51
653 0.51
654 0.51
655 0.49
656 0.51
657 0.58
658 0.63
659 0.64
660 0.7
661 0.73
662 0.71
663 0.64
664 0.58
665 0.52
666 0.44
667 0.4
668 0.37
669 0.33
670 0.27
671 0.27
672 0.23
673 0.2
674 0.21
675 0.22
676 0.19
677 0.18
678 0.17
679 0.19
680 0.19
681 0.2
682 0.2
683 0.25
684 0.27
685 0.28
686 0.37
687 0.4
688 0.5
689 0.55
690 0.6
691 0.51
692 0.51
693 0.55
694 0.54
695 0.5
696 0.43
697 0.38
698 0.35
699 0.37
700 0.4
701 0.38
702 0.3
703 0.36
704 0.35
705 0.41
706 0.41
707 0.46
708 0.44
709 0.42
710 0.47
711 0.48
712 0.54
713 0.51
714 0.48
715 0.43
716 0.43
717 0.42
718 0.4
719 0.35
720 0.3
721 0.27
722 0.3
723 0.28
724 0.26
725 0.31
726 0.33
727 0.31
728 0.32
729 0.32
730 0.3
731 0.33
732 0.33
733 0.3
734 0.28
735 0.28
736 0.25
737 0.24
738 0.24
739 0.23
740 0.22
741 0.2
742 0.19
743 0.19
744 0.21
745 0.24
746 0.29
747 0.37
748 0.46
749 0.55
750 0.6
751 0.66
752 0.64
753 0.61
754 0.54
755 0.52
756 0.46
757 0.41
758 0.34
759 0.31
760 0.31
761 0.3
762 0.29
763 0.23
764 0.27
765 0.28
766 0.29
767 0.27
768 0.26
769 0.26
770 0.29
771 0.32
772 0.25
773 0.23
774 0.24
775 0.28
776 0.26
777 0.28
778 0.24
779 0.22
780 0.23
781 0.23
782 0.24
783 0.21
784 0.25
785 0.26
786 0.29
787 0.27
788 0.27
789 0.26
790 0.23
791 0.21
792 0.18
793 0.15
794 0.12
795 0.11
796 0.11
797 0.09
798 0.09
799 0.08
800 0.08
801 0.08
802 0.06
803 0.07
804 0.07
805 0.08
806 0.07
807 0.07
808 0.07
809 0.07
810 0.07
811 0.07
812 0.07
813 0.07
814 0.07
815 0.07
816 0.08
817 0.09
818 0.1
819 0.1
820 0.1
821 0.11
822 0.11
823 0.11
824 0.11
825 0.09
826 0.08
827 0.07
828 0.07
829 0.07
830 0.07
831 0.07
832 0.07
833 0.08
834 0.1
835 0.1
836 0.11
837 0.12
838 0.13
839 0.15
840 0.16
841 0.15
842 0.16
843 0.15
844 0.15
845 0.12
846 0.12
847 0.1
848 0.13
849 0.15
850 0.15
851 0.2
852 0.23
853 0.25
854 0.29
855 0.34
856 0.4
857 0.44
858 0.44
859 0.48
860 0.53
861 0.57
862 0.55
863 0.53
864 0.48
865 0.45
866 0.45
867 0.41
868 0.38
869 0.34
870 0.32
871 0.28
872 0.24
873 0.21
874 0.19
875 0.14
876 0.09
877 0.09
878 0.08
879 0.12
880 0.11
881 0.13
882 0.13
883 0.14
884 0.17
885 0.18
886 0.23
887 0.21
888 0.23
889 0.21
890 0.23
891 0.26
892 0.32
893 0.37
894 0.34
895 0.35
896 0.35
897 0.37
898 0.36
899 0.33
900 0.25
901 0.18
902 0.18
903 0.15
904 0.14
905 0.12
906 0.11
907 0.11
908 0.1
909 0.09
910 0.08
911 0.07
912 0.07
913 0.06
914 0.06
915 0.05
916 0.06
917 0.06
918 0.08
919 0.09
920 0.11
921 0.12
922 0.17
923 0.26
924 0.32
925 0.37
926 0.46
927 0.53
928 0.6
929 0.7
930 0.75
931 0.73
932 0.75
933 0.77
934 0.78
935 0.75
936 0.67
937 0.58
938 0.5
939 0.45
940 0.4
941 0.33
942 0.25
943 0.23
944 0.21
945 0.2
946 0.18
947 0.18
948 0.15
949 0.19
950 0.22
951 0.26
952 0.26
953 0.26
954 0.29
955 0.29
956 0.28
957 0.25
958 0.2
959 0.13
960 0.14
961 0.14
962 0.1
963 0.09
964 0.08
965 0.08
966 0.1
967 0.13
968 0.14
969 0.18
970 0.19
971 0.2
972 0.21
973 0.21
974 0.21
975 0.22
976 0.22
977 0.2
978 0.2
979 0.19
980 0.18
981 0.17
982 0.14
983 0.1
984 0.07
985 0.06
986 0.05
987 0.06
988 0.06
989 0.06
990 0.06
991 0.09
992 0.1
993 0.1
994 0.1
995 0.1
996 0.11
997 0.11
998 0.1
999 0.07
1000 0.07
1001 0.06
1002 0.06
1003 0.05
1004 0.06
1005 0.08
1006 0.1
1007 0.12
1008 0.2
1009 0.25
1010 0.28
1011 0.35
1012 0.41
1013 0.46
1014 0.55
1015 0.57
1016 0.52
1017 0.5
1018 0.5
1019 0.48
1020 0.43
1021 0.37
1022 0.28
1023 0.25
1024 0.24
1025 0.22
1026 0.23
1027 0.2
1028 0.2
1029 0.2
1030 0.2
1031 0.21
1032 0.21
1033 0.19
1034 0.16
1035 0.16
1036 0.14
1037 0.15
1038 0.13
1039 0.11
1040 0.11
1041 0.14
1042 0.14
1043 0.12
1044 0.14
1045 0.14
1046 0.16
1047 0.17
1048 0.16
1049 0.14
1050 0.17
1051 0.2
1052 0.2
1053 0.21
1054 0.21
1055 0.22
1056 0.22
1057 0.25
1058 0.23
1059 0.21
1060 0.2
1061 0.23
1062 0.23
1063 0.23
1064 0.24
1065 0.21
1066 0.2
1067 0.2
1068 0.19
1069 0.15
1070 0.13
1071 0.12
1072 0.1
1073 0.1
1074 0.1
1075 0.09
1076 0.07
1077 0.06
1078 0.06
1079 0.06
1080 0.06
1081 0.05
1082 0.05
1083 0.05
1084 0.06
1085 0.08
1086 0.08
1087 0.08
1088 0.08
1089 0.09
1090 0.1
1091 0.1