Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CJS8

Protein Details
Accession A1CJS8    Localization Confidence High Confidence Score 20.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
13-34RWQKQHGKRLDHDERVRKRQARBasic
45-74NLRGLRAKLYQQKRHKEKIQMRKRIKAQEEHydrophilic
141-160DTGKKTHKKSWKRMITKPTFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
29-33RKRQA
51-71AKLYQQKRHKEKIQMRKRIKA
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039411  NSA2_fam  
IPR022309  Ribosomal_S8e/biogenesis_NSA2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
KEGG act:ACLA_036050  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01201  Ribosomal_S8e  
CDD cd11381  NSA2  
Amino Acid Sequences MRLPQLKIQYIERWQKQHGKRLDHDERVRKRQAREGHKQSQDAQNLRGLRAKLYQQKRHKEKIQMRKRIKAQEEKNVKSSAPDEPSKTPLPQYLLDRSQATNAKALSSAIKDKRAEKAAKFAVPLPKVKGISEEEMFKVVDTGKKTHKKSWKRMITKPTFVGSDFTRRPVKYERFIRPMGLRYKKANVTHPELGVTVQLPILGVKKNPQNPLYTQLGVLTKGTIIEVNVSELGIVTTSGKVVWGKYAQITNTPENDGTVNAVLLV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.6
2 0.67
3 0.7
4 0.72
5 0.71
6 0.69
7 0.7
8 0.75
9 0.77
10 0.77
11 0.79
12 0.8
13 0.81
14 0.81
15 0.84
16 0.8
17 0.75
18 0.73
19 0.74
20 0.73
21 0.75
22 0.76
23 0.76
24 0.76
25 0.74
26 0.71
27 0.7
28 0.68
29 0.6
30 0.52
31 0.48
32 0.43
33 0.42
34 0.41
35 0.33
36 0.27
37 0.29
38 0.35
39 0.39
40 0.47
41 0.56
42 0.6
43 0.71
44 0.77
45 0.82
46 0.81
47 0.83
48 0.83
49 0.84
50 0.85
51 0.84
52 0.83
53 0.83
54 0.83
55 0.82
56 0.8
57 0.79
58 0.75
59 0.74
60 0.77
61 0.71
62 0.68
63 0.6
64 0.51
65 0.43
66 0.38
67 0.34
68 0.3
69 0.29
70 0.29
71 0.29
72 0.34
73 0.34
74 0.33
75 0.29
76 0.27
77 0.27
78 0.26
79 0.28
80 0.29
81 0.29
82 0.3
83 0.3
84 0.27
85 0.29
86 0.29
87 0.26
88 0.23
89 0.21
90 0.19
91 0.18
92 0.18
93 0.15
94 0.13
95 0.2
96 0.19
97 0.24
98 0.25
99 0.27
100 0.32
101 0.37
102 0.38
103 0.32
104 0.38
105 0.36
106 0.36
107 0.35
108 0.33
109 0.33
110 0.32
111 0.33
112 0.27
113 0.28
114 0.27
115 0.26
116 0.25
117 0.21
118 0.22
119 0.21
120 0.2
121 0.16
122 0.16
123 0.16
124 0.13
125 0.11
126 0.09
127 0.11
128 0.11
129 0.14
130 0.22
131 0.3
132 0.33
133 0.41
134 0.5
135 0.57
136 0.65
137 0.73
138 0.75
139 0.74
140 0.79
141 0.82
142 0.79
143 0.74
144 0.67
145 0.58
146 0.48
147 0.41
148 0.36
149 0.27
150 0.28
151 0.24
152 0.26
153 0.3
154 0.29
155 0.32
156 0.38
157 0.43
158 0.43
159 0.51
160 0.55
161 0.55
162 0.56
163 0.56
164 0.5
165 0.51
166 0.52
167 0.5
168 0.46
169 0.44
170 0.49
171 0.52
172 0.52
173 0.54
174 0.5
175 0.5
176 0.5
177 0.47
178 0.42
179 0.35
180 0.32
181 0.24
182 0.19
183 0.11
184 0.08
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.15
192 0.23
193 0.29
194 0.35
195 0.36
196 0.38
197 0.4
198 0.45
199 0.45
200 0.38
201 0.32
202 0.3
203 0.29
204 0.25
205 0.23
206 0.17
207 0.12
208 0.11
209 0.12
210 0.09
211 0.07
212 0.09
213 0.09
214 0.11
215 0.11
216 0.1
217 0.1
218 0.09
219 0.09
220 0.07
221 0.07
222 0.06
223 0.06
224 0.06
225 0.06
226 0.08
227 0.09
228 0.1
229 0.15
230 0.16
231 0.18
232 0.22
233 0.27
234 0.26
235 0.32
236 0.37
237 0.37
238 0.38
239 0.39
240 0.35
241 0.32
242 0.31
243 0.25
244 0.22
245 0.18