FuNGI

A0A395IY62

Protein Details

Accession

A0A395IY62

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
14-46	APQFTRKPKAADPLRPRKKPIRRPNVPSKPAVA	Hydrophilic
473-502	DRARMTPQMKRSKRRLTRKKDEEAKAKLKA	Basic
526-551	ESSENESSRKKHKKKHAGSSQPTGTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-39	RKPKAADPLRPRKKPIRRPNV
426-440	KRKLGKGVRKALTKR
481-502	MKRSKRRLTRKKDEEAKAKLKA
534-541	RKKHKKKH

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MDELLHQPQQRWRAPQFTRKPKAADPLRPRKKPIRRPNVPSKPAVANLNGLAPVRPNGPISLNSITGPRAPGPRGPIPINGNVAPRQTYDGWTHPPKGEYTDYPLFTTRRALREGLRYHAMRFAGKKEVDPTNQDEFTRPISLHRRDPRQPPAGKALKDEDTVMEDSVDSKERERLEILRAEKEAQKAADRAQIAPTGNNTTALAARKAQSFRNEKTTQVHRLDKTAEQKKESDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYESALSEVNVIFFTEGSAFKMIPVEKWYKFTSKNKFNTLTIDEAEALLNKKTKESRWAMKTHEKNEAQRATQENIRGMNRLYTVKTESSSFKGSSRSETRDIDELDFDADDLFQDDDELATVEPDRDEDTKDAQERIRQDQRSANLFGEADEETVEKDFIKEEQEEEAKRKLGKGVRKALTKREKNFIYDSDSSNPYASTDVCILQIGFVYLLTIDRARMTPQMKRSKRRLTRKKDEEAKAKLKAEAKTATGTSSKGNNTPSGSPNLSESSENESSRKKHKKKHAGSSQPTGTSTPIPGQTQRKSSIVKMSVNPSELSRISSSPPNPQGHTSDGEATGGEMSDGAGGKKKKITLRIGGSPTTSRAGSPAPGKSASRAGSPAQTAESATPSGSGAINHT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.64
2	0.71
3	0.75
4	0.77
5	0.8
6	0.78
7	0.78
8	0.73
9	0.76
10	0.75
11	0.75
12	0.74
13	0.77
14	0.82
15	0.82
16	0.84
17	0.84
18	0.86
19	0.86
20	0.86
21	0.86
22	0.86
23	0.89
24	0.93
25	0.93
26	0.88
27	0.81
28	0.75
29	0.69
30	0.63
31	0.58
32	0.48
33	0.4
34	0.35
35	0.33
36	0.29
37	0.24
38	0.2
39	0.17
40	0.17
41	0.16
42	0.17
43	0.16
44	0.16
45	0.19
46	0.2
47	0.24
48	0.25
49	0.25
50	0.24
51	0.24
52	0.23
53	0.22
54	0.23
55	0.21
56	0.23
57	0.24
58	0.28
59	0.33
60	0.38
61	0.41
62	0.41
63	0.44
64	0.43
65	0.46
66	0.47
67	0.42
68	0.4
69	0.37
70	0.37
71	0.32
72	0.28
73	0.28
74	0.25
75	0.26
76	0.27
77	0.29
78	0.35
79	0.39
80	0.42
81	0.4
82	0.41
83	0.38
84	0.39
85	0.39
86	0.33
87	0.36
88	0.38
89	0.37
90	0.37
91	0.4
92	0.36
93	0.32
94	0.38
95	0.35
96	0.32
97	0.34
98	0.35
99	0.36
100	0.45
101	0.47
102	0.44
103	0.46
104	0.43
105	0.41
106	0.43
107	0.39
108	0.34
109	0.33
110	0.31
111	0.33
112	0.32
113	0.33
114	0.34
115	0.39
116	0.38
117	0.4
118	0.42
119	0.4
120	0.41
121	0.4
122	0.36
123	0.32
124	0.32
125	0.3
126	0.24
127	0.25
128	0.32
129	0.37
130	0.45
131	0.51
132	0.56
133	0.61
134	0.7
135	0.72
136	0.72
137	0.7
138	0.65
139	0.67
140	0.65
141	0.59
142	0.55
143	0.5
144	0.44
145	0.41
146	0.37
147	0.28
148	0.24
149	0.24
150	0.2
151	0.15
152	0.12
153	0.12
154	0.13
155	0.15
156	0.12
157	0.12
158	0.17
159	0.18
160	0.2
161	0.21
162	0.22
163	0.23
164	0.29
165	0.31
166	0.29
167	0.3
168	0.31
169	0.32
170	0.31
171	0.3
172	0.25
173	0.25
174	0.23
175	0.24
176	0.26
177	0.24
178	0.23
179	0.22
180	0.24
181	0.22
182	0.21
183	0.21
184	0.2
185	0.19
186	0.19
187	0.17
188	0.14
189	0.17
190	0.17
191	0.17
192	0.15
193	0.16
194	0.2
195	0.22
196	0.25
197	0.31
198	0.36
199	0.38
200	0.45
201	0.45
202	0.42
203	0.47
204	0.5
205	0.5
206	0.49
207	0.53
208	0.45
209	0.47
210	0.47
211	0.46
212	0.49
213	0.49
214	0.46
215	0.42
216	0.42
217	0.44
218	0.48
219	0.44
220	0.4
221	0.34
222	0.32
223	0.32
224	0.32
225	0.29
226	0.23
227	0.24
228	0.18
229	0.16
230	0.15
231	0.12
232	0.11
233	0.13
234	0.16
235	0.18
236	0.18
237	0.18
238	0.18
239	0.18
240	0.18
241	0.17
242	0.14
243	0.1
244	0.1
245	0.11
246	0.11
247	0.11
248	0.12
249	0.09
250	0.09
251	0.08
252	0.07
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.08
262	0.07
263	0.08
264	0.11
265	0.11
266	0.1
267	0.14
268	0.18
269	0.18
270	0.22
271	0.24
272	0.26
273	0.33
274	0.4
275	0.46
276	0.5
277	0.55
278	0.58
279	0.59
280	0.55
281	0.52
282	0.47
283	0.39
284	0.3
285	0.25
286	0.19
287	0.16
288	0.15
289	0.12
290	0.1
291	0.09
292	0.11
293	0.1
294	0.12
295	0.15
296	0.16
297	0.23
298	0.28
299	0.35
300	0.39
301	0.43
302	0.46
303	0.53
304	0.58
305	0.53
306	0.56
307	0.51
308	0.48
309	0.52
310	0.49
311	0.4
312	0.38
313	0.38
314	0.31
315	0.3
316	0.29
317	0.22
318	0.23
319	0.23
320	0.2
321	0.17
322	0.17
323	0.16
324	0.16
325	0.15
326	0.14
327	0.16
328	0.15
329	0.16
330	0.16
331	0.16
332	0.18
333	0.2
334	0.19
335	0.18
336	0.21
337	0.21
338	0.26
339	0.29
340	0.3
341	0.31
342	0.32
343	0.32
344	0.32
345	0.32
346	0.27
347	0.22
348	0.18
349	0.14
350	0.12
351	0.1
352	0.07
353	0.05
354	0.04
355	0.05
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.07
370	0.07
371	0.09
372	0.1
373	0.13
374	0.17
375	0.19
376	0.21
377	0.2
378	0.23
379	0.25
380	0.31
381	0.37
382	0.34
383	0.35
384	0.38
385	0.41
386	0.42
387	0.4
388	0.32
389	0.26
390	0.24
391	0.21
392	0.18
393	0.14
394	0.1
395	0.08
396	0.08
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.05
401	0.05
402	0.06
403	0.06
404	0.09
405	0.09
406	0.1
407	0.14
408	0.18
409	0.19
410	0.22
411	0.24
412	0.24
413	0.25
414	0.25
415	0.27
416	0.29
417	0.35
418	0.41
419	0.48
420	0.51
421	0.59
422	0.61
423	0.65
424	0.7
425	0.71
426	0.66
427	0.65
428	0.61
429	0.57
430	0.57
431	0.49
432	0.46
433	0.4
434	0.39
435	0.35
436	0.34
437	0.31
438	0.28
439	0.25
440	0.18
441	0.16
442	0.13
443	0.11
444	0.1
445	0.1
446	0.1
447	0.1
448	0.1
449	0.09
450	0.08
451	0.07
452	0.06
453	0.05
454	0.04
455	0.04
456	0.04
457	0.05
458	0.06
459	0.06
460	0.07
461	0.08
462	0.1
463	0.16
464	0.19
465	0.23
466	0.33
467	0.44
468	0.51
469	0.59
470	0.67
471	0.72
472	0.79
473	0.85
474	0.86
475	0.86
476	0.89
477	0.9
478	0.91
479	0.9
480	0.88
481	0.86
482	0.85
483	0.81
484	0.76
485	0.69
486	0.63
487	0.59
488	0.52
489	0.48
490	0.42
491	0.37
492	0.33
493	0.31
494	0.29
495	0.24
496	0.23
497	0.21
498	0.23
499	0.24
500	0.24
501	0.26
502	0.27
503	0.29
504	0.32
505	0.32
506	0.33
507	0.32
508	0.29
509	0.29
510	0.28
511	0.27
512	0.24
513	0.22
514	0.24
515	0.28
516	0.28
517	0.28
518	0.31
519	0.34
520	0.44
521	0.53
522	0.54
523	0.59
524	0.7
525	0.78
526	0.83
527	0.9
528	0.9
529	0.9
530	0.89
531	0.88
532	0.82
533	0.73
534	0.64
535	0.54
536	0.45
537	0.36
538	0.3
539	0.25
540	0.24
541	0.24
542	0.3
543	0.37
544	0.41
545	0.45
546	0.47
547	0.48
548	0.47
549	0.48
550	0.51
551	0.49
552	0.48
553	0.47
554	0.5
555	0.49
556	0.47
557	0.44
558	0.36
559	0.35
560	0.3
561	0.29
562	0.25
563	0.22
564	0.24
565	0.31
566	0.32
567	0.36
568	0.44
569	0.44
570	0.45
571	0.47
572	0.47
573	0.44
574	0.44
575	0.37
576	0.33
577	0.29
578	0.26
579	0.22
580	0.19
581	0.15
582	0.12
583	0.09
584	0.06
585	0.05
586	0.07
587	0.08
588	0.08
589	0.14
590	0.16
591	0.2
592	0.24
593	0.3
594	0.34
595	0.43
596	0.5
597	0.53
598	0.6
599	0.65
600	0.66
601	0.62
602	0.59
603	0.53
604	0.47
605	0.41
606	0.33
607	0.24
608	0.22
609	0.22
610	0.24
611	0.27
612	0.29
613	0.3
614	0.33
615	0.34
616	0.35
617	0.4
618	0.37
619	0.34
620	0.33
621	0.32
622	0.34
623	0.34
624	0.32
625	0.27
626	0.26
627	0.24
628	0.23
629	0.23
630	0.18
631	0.16
632	0.15
633	0.13
634	0.14
635	0.14

A0A395IY62

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer