Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A395J3V6

Protein Details
Accession A0A395J3V6    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-103GTSRYKELLETRKKRKNGKRIKLKGEFVFHydrophilic
115-137AEQTPLPKRRRGRPSKRQIDQVEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
86-98RKKRKNGKRIKLK
121-131PKRRRGRPSKR
Subcellular Location(s) nucl 26
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019258  Mediator_Med4  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF10018  Med4  
Amino Acid Sequences MIIFKAQNTNTAWIPTNTPPNCSPPNDIELRQANKVFNSALSANNLPTSPVQRYAKRITHQIESLNAENAISSKGTSRYKELLETRKKRKNGKRIKLKGEFVFSTEEVLKIIEEAEQTPLPKRRRGRPSKRQIDQVEEEMEEEEDSDSSVGSVIVVDHPVAYLVLADQELNDGLSLLNQHQKNTLKLNKLHATSAALDTQISEFLVLLTSSRSELLNTPSSQYPEEKNPVEYEELLSYARRISKFTVPPEARLPKPEESSPKQDGSATNGDTTPIVTVMGNGCERECYGYRCPINNSQRSEFFSFRSRRSIPTTSQSQPTLDPEMIRILNMGSDDRPFVPWAREDDIRIGALASIQALVDSGIDPEGWDPELEEQKKREKAEEIEREEEAARVREEERRRLEMERRNNAMGGGHDFMIMTYGQH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.33
3 0.4
4 0.38
5 0.41
6 0.4
7 0.44
8 0.49
9 0.48
10 0.48
11 0.42
12 0.48
13 0.48
14 0.47
15 0.48
16 0.5
17 0.5
18 0.5
19 0.48
20 0.44
21 0.4
22 0.41
23 0.34
24 0.26
25 0.26
26 0.22
27 0.21
28 0.24
29 0.24
30 0.22
31 0.23
32 0.22
33 0.19
34 0.21
35 0.23
36 0.21
37 0.28
38 0.34
39 0.37
40 0.44
41 0.51
42 0.56
43 0.56
44 0.61
45 0.57
46 0.57
47 0.55
48 0.51
49 0.47
50 0.44
51 0.42
52 0.35
53 0.31
54 0.24
55 0.21
56 0.19
57 0.15
58 0.1
59 0.09
60 0.1
61 0.17
62 0.22
63 0.24
64 0.29
65 0.32
66 0.34
67 0.41
68 0.46
69 0.5
70 0.56
71 0.64
72 0.69
73 0.73
74 0.78
75 0.82
76 0.84
77 0.85
78 0.85
79 0.86
80 0.87
81 0.88
82 0.92
83 0.9
84 0.86
85 0.8
86 0.75
87 0.64
88 0.55
89 0.49
90 0.39
91 0.33
92 0.26
93 0.22
94 0.15
95 0.15
96 0.13
97 0.08
98 0.09
99 0.07
100 0.07
101 0.08
102 0.11
103 0.12
104 0.13
105 0.19
106 0.26
107 0.29
108 0.35
109 0.41
110 0.48
111 0.58
112 0.69
113 0.74
114 0.77
115 0.85
116 0.89
117 0.87
118 0.86
119 0.79
120 0.75
121 0.67
122 0.59
123 0.5
124 0.4
125 0.35
126 0.26
127 0.22
128 0.14
129 0.11
130 0.08
131 0.06
132 0.06
133 0.05
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.04
148 0.04
149 0.03
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.04
154 0.03
155 0.04
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.04
162 0.05
163 0.06
164 0.12
165 0.13
166 0.14
167 0.19
168 0.21
169 0.24
170 0.31
171 0.36
172 0.36
173 0.38
174 0.45
175 0.45
176 0.44
177 0.42
178 0.34
179 0.3
180 0.25
181 0.24
182 0.17
183 0.12
184 0.1
185 0.1
186 0.1
187 0.08
188 0.06
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.06
201 0.07
202 0.11
203 0.15
204 0.15
205 0.17
206 0.18
207 0.19
208 0.19
209 0.2
210 0.19
211 0.19
212 0.24
213 0.23
214 0.23
215 0.22
216 0.22
217 0.22
218 0.19
219 0.16
220 0.11
221 0.11
222 0.11
223 0.1
224 0.09
225 0.09
226 0.12
227 0.12
228 0.13
229 0.16
230 0.23
231 0.28
232 0.31
233 0.39
234 0.37
235 0.39
236 0.45
237 0.47
238 0.4
239 0.39
240 0.4
241 0.34
242 0.36
243 0.38
244 0.38
245 0.38
246 0.44
247 0.44
248 0.41
249 0.37
250 0.37
251 0.33
252 0.31
253 0.31
254 0.25
255 0.22
256 0.2
257 0.2
258 0.18
259 0.17
260 0.12
261 0.07
262 0.06
263 0.05
264 0.06
265 0.06
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.09
271 0.1
272 0.13
273 0.14
274 0.16
275 0.19
276 0.27
277 0.3
278 0.33
279 0.38
280 0.43
281 0.51
282 0.53
283 0.56
284 0.52
285 0.53
286 0.55
287 0.55
288 0.47
289 0.4
290 0.43
291 0.41
292 0.4
293 0.44
294 0.41
295 0.4
296 0.46
297 0.48
298 0.43
299 0.46
300 0.5
301 0.46
302 0.49
303 0.46
304 0.4
305 0.37
306 0.36
307 0.33
308 0.27
309 0.23
310 0.2
311 0.23
312 0.21
313 0.19
314 0.16
315 0.12
316 0.12
317 0.12
318 0.13
319 0.09
320 0.1
321 0.12
322 0.12
323 0.14
324 0.14
325 0.16
326 0.17
327 0.19
328 0.23
329 0.26
330 0.27
331 0.27
332 0.29
333 0.29
334 0.27
335 0.23
336 0.19
337 0.14
338 0.13
339 0.11
340 0.07
341 0.06
342 0.05
343 0.05
344 0.05
345 0.05
346 0.05
347 0.05
348 0.05
349 0.05
350 0.05
351 0.06
352 0.06
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.08
357 0.13
358 0.23
359 0.26
360 0.3
361 0.33
362 0.42
363 0.48
364 0.49
365 0.48
366 0.46
367 0.51
368 0.57
369 0.63
370 0.61
371 0.58
372 0.56
373 0.54
374 0.47
375 0.41
376 0.34
377 0.27
378 0.2
379 0.19
380 0.21
381 0.28
382 0.34
383 0.42
384 0.45
385 0.48
386 0.5
387 0.54
388 0.61
389 0.63
390 0.67
391 0.67
392 0.66
393 0.63
394 0.6
395 0.54
396 0.47
397 0.4
398 0.35
399 0.27
400 0.22
401 0.2
402 0.19
403 0.18
404 0.17