FuNGI

A0A395IGD0

Protein Details

Accession

A0A395IGD0

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
129-150	TGRARFKPKNIRRDQADRERLE	Basic
415-436	ISPQQFRVQRPSKKKNNILVIQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
19-32	GRARGAARGRGRGR
120-183	ASMRARGEATGRARFKPKNIRRDQADRERLEQEERDRKAANQEKADREARRAQRGRGHTGRGRG

Subcellular Location(s)

nucl 13, mito 10, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007811 RPC4
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05132 RNA_pol_Rpc4

Amino Acid Sequences

MLSATKYATKSRERHYLAGRARGAARGRGRGRGIAIEAVETPELRGAPDQTSQSPAPVAPMVQSTGIITPKLEPNDDTFDPNTLPATVPTEPPAETSAQTTLADPSVKIESATTRGRGGASMRARGEATGRARFKPKNIRRDQADRERLEQEERDRKAANQEKADREARRAQRGRGHTGRGRGDAMGQNRGAGRGAPISSATGIFSVAPAAMDRKGGMGGFAIASARGSGGGGGSGGFGGGGGGGGGGGGGGGGGSSGLGFGGINVLSAENSAIFNPEYPDEGDGPVKKVNIEMINLIDDDDEDMVGSSRGGKGFKSRSLAPIRIKREEHKERSNMMVSEPELTEIAKKQANEEEGNQAVKDIEMTTDGMTPAEIPDELGTKGEPGLESPTMSKFPEFKAPSSPEEKRSLKKELISPQQFRVQRPSKKKNNILVIQTEEDKFEYERHLEDVEILAEELRLLRGNMDQTPKDKGKGKAVDADGDVGMDGEKEQDEFQPEANHADGRIYLFQFPPILPRLFNPQVENQEDVVVTQSSEQIDLTDDKDKVKKESEEVIIKSEPTITQENEALIGEQGYIGKLVVRKSGKVELDWGGTSMAVGRGVPASFLSQIVLAEDPKGEAPEGVATGLGKVMGKFIVTPDWEKIF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.66
2	0.68
3	0.71
4	0.68
5	0.7
6	0.65
7	0.58
8	0.54
9	0.52
10	0.48
11	0.47
12	0.46
13	0.47
14	0.48
15	0.51
16	0.52
17	0.49
18	0.49
19	0.44
20	0.41
21	0.35
22	0.32
23	0.26
24	0.24
25	0.22
26	0.2
27	0.16
28	0.14
29	0.13
30	0.13
31	0.12
32	0.14
33	0.14
34	0.16
35	0.21
36	0.24
37	0.23
38	0.29
39	0.28
40	0.27
41	0.26
42	0.23
43	0.22
44	0.19
45	0.18
46	0.14
47	0.15
48	0.15
49	0.14
50	0.14
51	0.12
52	0.15
53	0.16
54	0.15
55	0.14
56	0.16
57	0.21
58	0.24
59	0.24
60	0.22
61	0.25
62	0.32
63	0.33
64	0.34
65	0.29
66	0.29
67	0.27
68	0.27
69	0.23
70	0.16
71	0.16
72	0.13
73	0.17
74	0.16
75	0.17
76	0.19
77	0.2
78	0.19
79	0.2
80	0.21
81	0.18
82	0.17
83	0.18
84	0.17
85	0.17
86	0.17
87	0.16
88	0.16
89	0.16
90	0.16
91	0.14
92	0.15
93	0.15
94	0.15
95	0.14
96	0.14
97	0.14
98	0.19
99	0.23
100	0.22
101	0.21
102	0.22
103	0.22
104	0.22
105	0.22
106	0.25
107	0.25
108	0.3
109	0.29
110	0.3
111	0.3
112	0.29
113	0.29
114	0.27
115	0.28
116	0.31
117	0.33
118	0.35
119	0.42
120	0.45
121	0.51
122	0.56
123	0.59
124	0.62
125	0.67
126	0.72
127	0.73
128	0.79
129	0.8
130	0.8
131	0.81
132	0.72
133	0.68
134	0.63
135	0.57
136	0.51
137	0.46
138	0.44
139	0.44
140	0.43
141	0.43
142	0.41
143	0.4
144	0.47
145	0.51
146	0.48
147	0.48
148	0.53
149	0.54
150	0.58
151	0.64
152	0.55
153	0.51
154	0.55
155	0.53
156	0.56
157	0.56
158	0.56
159	0.57
160	0.62
161	0.65
162	0.62
163	0.62
164	0.56
165	0.59
166	0.57
167	0.51
168	0.47
169	0.38
170	0.36
171	0.34
172	0.32
173	0.29
174	0.25
175	0.24
176	0.23
177	0.23
178	0.19
179	0.14
180	0.13
181	0.11
182	0.12
183	0.1
184	0.11
185	0.11
186	0.11
187	0.11
188	0.1
189	0.07
190	0.07
191	0.06
192	0.06
193	0.05
194	0.05
195	0.05
196	0.05
197	0.06
198	0.06
199	0.07
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.07
204	0.07
205	0.06
206	0.06
207	0.05
208	0.06
209	0.05
210	0.04
211	0.05
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.02
226	0.02
227	0.02
228	0.02
229	0.02
230	0.02
231	0.02
232	0.02
233	0.02
234	0.01
235	0.01
236	0.01
237	0.01
238	0.01
239	0.01
240	0.01
241	0.01
242	0.01
243	0.01
244	0.02
245	0.02
246	0.02
247	0.02
248	0.02
249	0.03
250	0.03
251	0.03
252	0.04
253	0.04
254	0.04
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.04
259	0.04
260	0.05
261	0.05
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.08
267	0.1
268	0.09
269	0.1
270	0.13
271	0.12
272	0.14
273	0.14
274	0.14
275	0.12
276	0.12
277	0.14
278	0.13
279	0.13
280	0.12
281	0.11
282	0.12
283	0.12
284	0.11
285	0.08
286	0.06
287	0.06
288	0.05
289	0.04
290	0.03
291	0.03
292	0.03
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.06
298	0.07
299	0.07
300	0.13
301	0.16
302	0.2
303	0.23
304	0.23
305	0.29
306	0.33
307	0.39
308	0.4
309	0.44
310	0.46
311	0.48
312	0.49
313	0.46
314	0.52
315	0.56
316	0.55
317	0.55
318	0.54
319	0.51
320	0.52
321	0.51
322	0.41
323	0.32
324	0.27
325	0.2
326	0.17
327	0.16
328	0.12
329	0.1
330	0.09
331	0.1
332	0.09
333	0.11
334	0.11
335	0.11
336	0.12
337	0.15
338	0.18
339	0.19
340	0.19
341	0.2
342	0.2
343	0.2
344	0.18
345	0.15
346	0.12
347	0.11
348	0.09
349	0.06
350	0.05
351	0.05
352	0.06
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.07
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.06
367	0.06
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.06
372	0.06
373	0.09
374	0.09
375	0.09
376	0.1
377	0.12
378	0.13
379	0.13
380	0.14
381	0.12
382	0.14
383	0.23
384	0.24
385	0.23
386	0.3
387	0.33
388	0.35
389	0.41
390	0.42
391	0.37
392	0.44
393	0.47
394	0.44
395	0.46
396	0.48
397	0.44
398	0.45
399	0.47
400	0.47
401	0.53
402	0.56
403	0.54
404	0.52
405	0.56
406	0.55
407	0.5
408	0.52
409	0.51
410	0.52
411	0.6
412	0.67
413	0.7
414	0.76
415	0.83
416	0.81
417	0.81
418	0.78
419	0.71
420	0.64
421	0.57
422	0.49
423	0.43
424	0.35
425	0.27
426	0.22
427	0.19
428	0.16
429	0.13
430	0.14
431	0.13
432	0.14
433	0.15
434	0.15
435	0.14
436	0.14
437	0.13
438	0.11
439	0.09
440	0.08
441	0.06
442	0.06
443	0.06
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.06
449	0.08
450	0.11
451	0.15
452	0.2
453	0.22
454	0.23
455	0.31
456	0.32
457	0.34
458	0.39
459	0.39
460	0.43
461	0.47
462	0.48
463	0.48
464	0.48
465	0.46
466	0.39
467	0.37
468	0.27
469	0.21
470	0.18
471	0.1
472	0.09
473	0.06
474	0.05
475	0.04
476	0.05
477	0.06
478	0.07
479	0.08
480	0.12
481	0.13
482	0.14
483	0.16
484	0.17
485	0.18
486	0.18
487	0.17
488	0.13
489	0.14
490	0.13
491	0.13
492	0.16
493	0.15
494	0.16
495	0.16
496	0.17
497	0.18
498	0.17
499	0.19
500	0.2
501	0.2
502	0.18
503	0.2
504	0.28
505	0.31
506	0.33
507	0.33
508	0.35
509	0.4
510	0.42
511	0.44
512	0.35
513	0.31
514	0.29
515	0.25
516	0.21
517	0.14
518	0.12
519	0.1
520	0.11
521	0.1
522	0.11
523	0.11
524	0.09
525	0.11
526	0.12
527	0.14
528	0.18
529	0.18
530	0.22
531	0.27
532	0.29
533	0.31
534	0.36
535	0.37
536	0.35
537	0.42
538	0.45
539	0.48
540	0.47
541	0.48
542	0.42
543	0.39
544	0.35
545	0.3
546	0.23
547	0.2
548	0.23
549	0.19
550	0.21
551	0.22
552	0.22
553	0.21
554	0.21
555	0.17
556	0.13
557	0.12
558	0.09
559	0.08
560	0.08
561	0.07
562	0.07
563	0.06
564	0.09
565	0.11
566	0.13
567	0.21
568	0.23
569	0.25
570	0.3
571	0.38
572	0.37
573	0.36
574	0.39
575	0.34
576	0.35
577	0.33
578	0.29
579	0.21
580	0.18
581	0.17
582	0.14
583	0.12
584	0.09
585	0.08
586	0.08
587	0.1
588	0.1
589	0.11
590	0.1
591	0.11
592	0.12
593	0.12
594	0.12
595	0.11
596	0.11
597	0.12
598	0.13
599	0.11
600	0.11
601	0.11
602	0.12
603	0.12
604	0.13
605	0.12
606	0.1
607	0.11
608	0.13
609	0.13
610	0.12
611	0.11
612	0.1
613	0.1
614	0.1
615	0.1
616	0.09
617	0.08
618	0.1
619	0.1
620	0.1
621	0.1
622	0.12
623	0.17
624	0.2
625	0.23

A0A395IGD0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer