FuNGI

A0A395IMW2

Protein Details

Accession

A0A395IMW2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

10.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
34-56	SVESENPKRKRVTKPTQTVNAGP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR015712 DNA-dir_RNA_pol_su2 IPR007644 RNA_pol_bsu_protrusion IPR007642 RNA_pol_Rpb2_2 IPR037034 RNA_pol_Rpb2_2_sf
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0003677 F:DNA binding GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0032549 F:ribonucleoside binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
Pfam	View protein in Pfam PF04563 RNA_pol_Rpb2_1 PF04561 RNA_pol_Rpb2_2

Amino Acid Sequences

MPPKKKATGPVEATPQATSAKKVQESAQEVDDPSVESENPKRKRVTKPTQTVNAGPIPQRDDDGFAALLEPFYDGKSLTDPISTAKDKWNLVPAFLKVKGLVKQHIDSFNYFVEHEIKDIVKANKRVTSEVDKYFWLEYTDIRVGEPERMDYDDRKPQNEITPNECRLRDMTYAAPIRVDIKYMRGRTIVARKNIAIGRMPIMLKSSKCRLAGKNDRQMAHMNECALDPGGYFIVNGTEKVILVQEQLSKNRVIIEADPKKGIVSASVTSSTHERKSKKLHHELLLLVAGSDERYQDEFSVNFEEATKLGVHTQYQALEYIGARVKMGSRARQPGQPHRRNVIGDALEALSNIIITHVPVVGLEFRPKALYICFMVRRVLMAMVNPKLVDDRDYVGNKRLELAGQLLSLLFEDLFKKFNTDLKMNIDKVLKEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.48
2	0.42
3	0.36
4	0.31
5	0.29
6	0.27
7	0.32
8	0.32
9	0.34
10	0.37
11	0.42
12	0.46
13	0.46
14	0.43
15	0.38
16	0.37
17	0.36
18	0.32
19	0.24
20	0.19
21	0.18
22	0.15
23	0.16
24	0.24
25	0.33
26	0.38
27	0.43
28	0.49
29	0.56
30	0.66
31	0.73
32	0.76
33	0.77
34	0.81
35	0.85
36	0.86
37	0.83
38	0.75
39	0.68
40	0.62
41	0.55
42	0.48
43	0.42
44	0.36
45	0.32
46	0.32
47	0.27
48	0.26
49	0.23
50	0.22
51	0.19
52	0.15
53	0.15
54	0.13
55	0.12
56	0.09
57	0.09
58	0.07
59	0.07
60	0.08
61	0.07
62	0.08
63	0.11
64	0.12
65	0.12
66	0.12
67	0.12
68	0.14
69	0.21
70	0.22
71	0.21
72	0.26
73	0.31
74	0.32
75	0.34
76	0.4
77	0.34
78	0.34
79	0.36
80	0.32
81	0.32
82	0.32
83	0.3
84	0.23
85	0.27
86	0.3
87	0.3
88	0.32
89	0.31
90	0.33
91	0.38
92	0.41
93	0.39
94	0.35
95	0.34
96	0.3
97	0.27
98	0.24
99	0.2
100	0.18
101	0.16
102	0.15
103	0.15
104	0.14
105	0.14
106	0.2
107	0.25
108	0.28
109	0.33
110	0.36
111	0.38
112	0.4
113	0.4
114	0.39
115	0.42
116	0.41
117	0.4
118	0.38
119	0.34
120	0.34
121	0.32
122	0.28
123	0.21
124	0.15
125	0.12
126	0.17
127	0.18
128	0.17
129	0.16
130	0.17
131	0.16
132	0.19
133	0.19
134	0.14
135	0.13
136	0.15
137	0.17
138	0.19
139	0.23
140	0.28
141	0.3
142	0.31
143	0.31
144	0.31
145	0.36
146	0.41
147	0.39
148	0.37
149	0.43
150	0.45
151	0.47
152	0.44
153	0.38
154	0.32
155	0.32
156	0.27
157	0.22
158	0.19
159	0.22
160	0.24
161	0.23
162	0.22
163	0.18
164	0.19
165	0.17
166	0.17
167	0.1
168	0.15
169	0.21
170	0.22
171	0.24
172	0.22
173	0.23
174	0.27
175	0.36
176	0.36
177	0.33
178	0.34
179	0.33
180	0.37
181	0.37
182	0.33
183	0.24
184	0.19
185	0.17
186	0.18
187	0.18
188	0.13
189	0.14
190	0.15
191	0.15
192	0.18
193	0.2
194	0.22
195	0.24
196	0.29
197	0.3
198	0.38
199	0.48
200	0.53
201	0.57
202	0.57
203	0.55
204	0.53
205	0.53
206	0.45
207	0.38
208	0.3
209	0.22
210	0.18
211	0.17
212	0.16
213	0.13
214	0.09
215	0.06
216	0.05
217	0.05
218	0.04
219	0.04
220	0.04
221	0.06
222	0.06
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.05
230	0.06
231	0.07
232	0.11
233	0.14
234	0.16
235	0.17
236	0.17
237	0.17
238	0.18
239	0.17
240	0.14
241	0.14
242	0.23
243	0.27
244	0.28
245	0.28
246	0.26
247	0.26
248	0.25
249	0.22
250	0.13
251	0.11
252	0.1
253	0.11
254	0.13
255	0.13
256	0.13
257	0.17
258	0.19
259	0.21
260	0.27
261	0.27
262	0.32
263	0.42
264	0.51
265	0.58
266	0.65
267	0.66
268	0.65
269	0.66
270	0.6
271	0.52
272	0.43
273	0.33
274	0.22
275	0.16
276	0.11
277	0.08
278	0.08
279	0.06
280	0.06
281	0.08
282	0.08
283	0.09
284	0.11
285	0.1
286	0.12
287	0.15
288	0.14
289	0.13
290	0.13
291	0.12
292	0.11
293	0.12
294	0.1
295	0.08
296	0.09
297	0.11
298	0.11
299	0.12
300	0.14
301	0.13
302	0.14
303	0.14
304	0.12
305	0.13
306	0.12
307	0.14
308	0.14
309	0.13
310	0.13
311	0.13
312	0.14
313	0.2
314	0.25
315	0.27
316	0.32
317	0.4
318	0.43
319	0.47
320	0.53
321	0.57
322	0.64
323	0.66
324	0.65
325	0.62
326	0.64
327	0.6
328	0.55
329	0.52
330	0.42
331	0.34
332	0.29
333	0.25
334	0.2
335	0.19
336	0.16
337	0.08
338	0.07
339	0.06
340	0.05
341	0.04
342	0.04
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.07
348	0.1
349	0.11
350	0.15
351	0.15
352	0.15
353	0.17
354	0.17
355	0.17
356	0.16
357	0.18
358	0.17
359	0.24
360	0.27
361	0.27
362	0.29
363	0.27
364	0.27
365	0.25
366	0.24
367	0.18
368	0.18
369	0.23
370	0.24
371	0.25
372	0.23
373	0.23
374	0.23
375	0.23
376	0.21
377	0.17
378	0.18
379	0.25
380	0.29
381	0.32
382	0.37
383	0.39
384	0.36
385	0.36
386	0.34
387	0.27
388	0.24
389	0.24
390	0.19
391	0.16
392	0.16
393	0.14
394	0.12
395	0.12
396	0.11
397	0.08
398	0.07
399	0.09
400	0.1
401	0.12
402	0.13
403	0.16
404	0.17
405	0.23
406	0.28
407	0.29
408	0.33
409	0.4
410	0.48
411	0.46
412	0.49
413	0.48

A0A395IMW2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer