Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CJ54

Protein Details
Accession A1CJ54    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21ADLTEKSHKKRKLTDVPEIEHydrophilic
24-49VSAPEPPSKKALRKAKKKSGDSTTETHydrophilic
259-288IEEEDSKKSKKSKKPRKRRVWVNQLLGRRMBasic
295-315DPTTRYKKRYGKDGEGKKRTTBasic
329-357GASEEKPQRPRFEKPKRSKPDYTRYDQDTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-41PSKKALRKAKKK
265-277KKSKKSKKPRKRR
339-345RFEKPKR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030684  C:preribosome  
GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG act:ACLA_033810  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MADLTEKSHKKRKLTDVPEIEIDVSAPEPPSKKALRKAKKKSGDSTTETATQESTTVPAKEAKEQDASKKRSEYGIWIGNLPFTVTKDDLRKFITSNCTFADTTITRIHMPKGPEKFGKPQNKGFAYIDLATEKAVQEALGASEQLLSGRRVLIKDAKNFSGRPEKSKEEGQNDSAAASGKPPSKRIFVGNLDFDATRELLEENFSQCGPVAMVHVATFQDTGKCKGYAWVTFEDLASAEAAVKGFVMVGEDDEDDEDIEEEDSKKSKKSKKPRKRRVWVNQLLGRRMRMEFAEDPTTRYKKRYGKDGEGKKRTTSDITEVEDGTFDQGASEEKPQRPRFEKPKRSKPDYTRYDQDTVQKLSGAIVESQGKKTTFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.81
3 0.79
4 0.77
5 0.71
6 0.62
7 0.52
8 0.41
9 0.33
10 0.23
11 0.15
12 0.12
13 0.11
14 0.13
15 0.14
16 0.16
17 0.24
18 0.3
19 0.37
20 0.46
21 0.56
22 0.63
23 0.72
24 0.81
25 0.85
26 0.88
27 0.88
28 0.87
29 0.85
30 0.83
31 0.78
32 0.71
33 0.65
34 0.6
35 0.53
36 0.44
37 0.36
38 0.27
39 0.21
40 0.18
41 0.16
42 0.14
43 0.14
44 0.15
45 0.2
46 0.22
47 0.28
48 0.31
49 0.33
50 0.36
51 0.38
52 0.47
53 0.52
54 0.55
55 0.53
56 0.53
57 0.51
58 0.47
59 0.46
60 0.42
61 0.39
62 0.41
63 0.37
64 0.35
65 0.34
66 0.3
67 0.29
68 0.24
69 0.17
70 0.11
71 0.14
72 0.14
73 0.18
74 0.24
75 0.27
76 0.29
77 0.31
78 0.31
79 0.29
80 0.33
81 0.39
82 0.33
83 0.34
84 0.32
85 0.33
86 0.31
87 0.3
88 0.31
89 0.21
90 0.23
91 0.23
92 0.23
93 0.21
94 0.23
95 0.25
96 0.22
97 0.25
98 0.29
99 0.32
100 0.36
101 0.39
102 0.41
103 0.47
104 0.53
105 0.6
106 0.58
107 0.59
108 0.62
109 0.59
110 0.6
111 0.52
112 0.45
113 0.38
114 0.33
115 0.27
116 0.19
117 0.17
118 0.13
119 0.13
120 0.11
121 0.08
122 0.07
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.06
127 0.05
128 0.05
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.06
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.09
137 0.1
138 0.1
139 0.13
140 0.2
141 0.24
142 0.3
143 0.33
144 0.35
145 0.36
146 0.36
147 0.38
148 0.4
149 0.36
150 0.35
151 0.37
152 0.37
153 0.38
154 0.44
155 0.46
156 0.41
157 0.43
158 0.39
159 0.35
160 0.31
161 0.29
162 0.22
163 0.17
164 0.11
165 0.09
166 0.11
167 0.14
168 0.15
169 0.18
170 0.2
171 0.22
172 0.23
173 0.25
174 0.27
175 0.27
176 0.29
177 0.27
178 0.25
179 0.24
180 0.22
181 0.19
182 0.15
183 0.11
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.05
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.05
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.09
208 0.1
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.15
213 0.19
214 0.21
215 0.21
216 0.23
217 0.22
218 0.22
219 0.22
220 0.21
221 0.18
222 0.15
223 0.12
224 0.09
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.04
233 0.03
234 0.04
235 0.04
236 0.04
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.06
242 0.05
243 0.06
244 0.05
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.08
250 0.11
251 0.12
252 0.16
253 0.25
254 0.34
255 0.44
256 0.54
257 0.65
258 0.73
259 0.83
260 0.9
261 0.93
262 0.95
263 0.96
264 0.95
265 0.95
266 0.93
267 0.91
268 0.86
269 0.8
270 0.76
271 0.67
272 0.58
273 0.49
274 0.4
275 0.32
276 0.26
277 0.27
278 0.24
279 0.26
280 0.32
281 0.3
282 0.32
283 0.38
284 0.44
285 0.39
286 0.4
287 0.44
288 0.44
289 0.49
290 0.56
291 0.57
292 0.62
293 0.71
294 0.79
295 0.81
296 0.81
297 0.79
298 0.72
299 0.66
300 0.59
301 0.53
302 0.46
303 0.42
304 0.39
305 0.4
306 0.39
307 0.36
308 0.33
309 0.28
310 0.24
311 0.19
312 0.14
313 0.09
314 0.07
315 0.07
316 0.09
317 0.11
318 0.18
319 0.24
320 0.29
321 0.4
322 0.45
323 0.54
324 0.57
325 0.66
326 0.7
327 0.74
328 0.79
329 0.8
330 0.86
331 0.88
332 0.91
333 0.91
334 0.9
335 0.89
336 0.87
337 0.84
338 0.82
339 0.78
340 0.73
341 0.66
342 0.65
343 0.61
344 0.56
345 0.49
346 0.42
347 0.35
348 0.32
349 0.31
350 0.24
351 0.18
352 0.17
353 0.24
354 0.26
355 0.28
356 0.33