FuNGI

A1CBF6

Protein Details

Accession

A1CBF6

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
226-250	NNEARVFNPEKKKRKRDGYEEGDYT	Hydrophilic
362-392	ELQRLKEKESSKRKKERRKENEKKRKEIVRM	Basic
475-494	KRENRDTKLRAKKARKGYEA	Basic
696-719	MEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKSAL	Hydrophilic
734-759	AISKLMSKAVKKKPKQQVKLVVAKGA	Hydrophilic
777-796	VDSRMKKDIRAQKRLAKKKK	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-14	HGKGRLDK
19-20	AK
236-240	KKKRK
367-387	KEKESSKRKKERRKENEKKRK
482-490	KLRAKKARK
569-587	PAKKEPASEKKSAKDIKKK
674-717	KAAAAAIKEKMRAINARPIKKVMEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKS
740-796	SKAVKKKPKQQVKLVVAKGANRGISGRPRGVKGKYKIVDSRMKKDIRAQKRLAKKKK

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR002877 RNA_MeTrfase_FtsJ_dom IPR015507 rRNA-MeTfrase_E IPR012920 rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C IPR024576 rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381 IPR029063 SAM-dependent_MTases_sf IPR028589 SPB1-like
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus GO:0030687 C:preribosome, large subunit precursor GO:0070039 F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity GO:0008650 F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity GO:0000466 P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) GO:0000463 P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)
KEGG	act:ACLA_015120 -
Pfam	View protein in Pfam PF11861 DUF3381 PF01728 FtsJ PF07780 Spb1_C

Amino Acid Sequences

MAIQKKHGKGRLDKWYRLAKEKGYRARAAFKLIQLNKKYGFLEKSKVLLDLCAAPGSWCQVAAECMPTQSIIVGVDLAPIKPIPRVITFQSDITTEKCRATIRQHLKHWKADTVLHDGAPNVGTAWVQDAFSQAELVLQSMKLATEFLAEGGTFVTKVFRSKDYNPLLWVFKQLFTSVEATKPPSSRNVSAEIFVVCRGFKAPKRIDPKFLDPKHVFAELVETSHNNEARVFNPEKKKRKRDGYEEGDYTQHKEIPVTEFINTTDPIAILGSYNTLSFDQAPGGDLALATLNRLEDTTEEIKTCCQDLKVLGKKEFRNLLRWRLRVREKFGLVVKKGQSKTEDPEEVAEVAPMDEELAIQEELQRLKEKESSKRKKERRKENEKKRKEIVRMQMNMTTPMDIGMEQLGPGGDDMTFSLKRVEREGARDVIASGKVAEIESDSDDDLSDSGSEESDDEGDQLERELDSLYEQYQEKRENRDTKLRAKKARKGYEADEWDGFSDSGKEDEGSDEESSDTATPAAKAVLPHSGALSNKAAMFFDQDIFQDLEDLDDVEGEDSAIELHENDKPAKKEPASEKKSAKDIKKKVQATEDSSDSEPEEFDDPRKQNGQLDIDIITAEAMALAQQMATGEKKSQDIVDDGFNRYAFRDSDGLPEWFLDDETKHSKLQRPITKAAAAAIKEKMRAINARPIKKVMEAKGRKKMKAAQRLEKLRKKSALLADDEALSERDKSQAISKLMSKAVKKKPKQQVKLVVAKGANRGISGRPRGVKGKYKIVDSRMKKDIRAQKRLAKKKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.74
2	0.77
3	0.74
4	0.73
5	0.7
6	0.68
7	0.69
8	0.73
9	0.75
10	0.72
11	0.73
12	0.69
13	0.72
14	0.65
15	0.63
16	0.58
17	0.54
18	0.57
19	0.57
20	0.62
21	0.57
22	0.6
23	0.55
24	0.54
25	0.51
26	0.47
27	0.47
28	0.42
29	0.46
30	0.43
31	0.44
32	0.41
33	0.42
34	0.35
35	0.29
36	0.26
37	0.23
38	0.21
39	0.18
40	0.16
41	0.15
42	0.16
43	0.18
44	0.16
45	0.13
46	0.12
47	0.12
48	0.15
49	0.15
50	0.18
51	0.15
52	0.15
53	0.15
54	0.15
55	0.14
56	0.12
57	0.11
58	0.08
59	0.07
60	0.08
61	0.07
62	0.1
63	0.11
64	0.11
65	0.11
66	0.11
67	0.12
68	0.13
69	0.16
70	0.16
71	0.19
72	0.23
73	0.26
74	0.33
75	0.34
76	0.34
77	0.33
78	0.3
79	0.29
80	0.27
81	0.29
82	0.23
83	0.22
84	0.24
85	0.25
86	0.28
87	0.34
88	0.42
89	0.48
90	0.55
91	0.64
92	0.72
93	0.76
94	0.79
95	0.75
96	0.69
97	0.61
98	0.57
99	0.51
100	0.48
101	0.44
102	0.36
103	0.33
104	0.28
105	0.27
106	0.22
107	0.18
108	0.1
109	0.08
110	0.07
111	0.07
112	0.1
113	0.09
114	0.09
115	0.09
116	0.11
117	0.11
118	0.12
119	0.12
120	0.08
121	0.09
122	0.09
123	0.09
124	0.08
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.08
129	0.06
130	0.07
131	0.06
132	0.07
133	0.07
134	0.07
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.06
141	0.06
142	0.08
143	0.08
144	0.12
145	0.15
146	0.19
147	0.26
148	0.3
149	0.4
150	0.44
151	0.45
152	0.45
153	0.45
154	0.44
155	0.38
156	0.4
157	0.32
158	0.27
159	0.26
160	0.24
161	0.21
162	0.19
163	0.22
164	0.18
165	0.19
166	0.19
167	0.22
168	0.25
169	0.26
170	0.25
171	0.29
172	0.34
173	0.35
174	0.36
175	0.38
176	0.35
177	0.35
178	0.34
179	0.28
180	0.22
181	0.19
182	0.17
183	0.11
184	0.1
185	0.11
186	0.16
187	0.19
188	0.29
189	0.34
190	0.42
191	0.51
192	0.55
193	0.61
194	0.61
195	0.66
196	0.67
197	0.63
198	0.64
199	0.56
200	0.56
201	0.51
202	0.46
203	0.36
204	0.25
205	0.28
206	0.18
207	0.18
208	0.15
209	0.13
210	0.14
211	0.19
212	0.2
213	0.15
214	0.16
215	0.17
216	0.17
217	0.24
218	0.25
219	0.28
220	0.38
221	0.47
222	0.56
223	0.65
224	0.75
225	0.77
226	0.85
227	0.86
228	0.85
229	0.86
230	0.83
231	0.8
232	0.73
233	0.64
234	0.57
235	0.49
236	0.42
237	0.33
238	0.26
239	0.19
240	0.17
241	0.17
242	0.18
243	0.21
244	0.19
245	0.18
246	0.17
247	0.18
248	0.2
249	0.18
250	0.15
251	0.11
252	0.1
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.05
257	0.05
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.07
264	0.07
265	0.08
266	0.07
267	0.07
268	0.08
269	0.07
270	0.07
271	0.06
272	0.05
273	0.05
274	0.06
275	0.06
276	0.05
277	0.05
278	0.05
279	0.05
280	0.06
281	0.06
282	0.05
283	0.1
284	0.13
285	0.13
286	0.14
287	0.14
288	0.15
289	0.15
290	0.16
291	0.12
292	0.1
293	0.1
294	0.13
295	0.23
296	0.3
297	0.34
298	0.38
299	0.44
300	0.45
301	0.48
302	0.53
303	0.45
304	0.46
305	0.45
306	0.51
307	0.52
308	0.55
309	0.54
310	0.55
311	0.62
312	0.6
313	0.62
314	0.59
315	0.52
316	0.52
317	0.54
318	0.52
319	0.44
320	0.44
321	0.4
322	0.4
323	0.4
324	0.38
325	0.36
326	0.32
327	0.35
328	0.35
329	0.33
330	0.26
331	0.26
332	0.25
333	0.22
334	0.19
335	0.14
336	0.08
337	0.07
338	0.06
339	0.05
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.04
345	0.04
346	0.04
347	0.06
348	0.08
349	0.09
350	0.1
351	0.13
352	0.12
353	0.14
354	0.2
355	0.23
356	0.31
357	0.42
358	0.51
359	0.58
360	0.68
361	0.76
362	0.81
363	0.87
364	0.88
365	0.88
366	0.9
367	0.91
368	0.92
369	0.94
370	0.91
371	0.88
372	0.84
373	0.8
374	0.75
375	0.72
376	0.7
377	0.67
378	0.62
379	0.57
380	0.53
381	0.46
382	0.41
383	0.33
384	0.24
385	0.15
386	0.13
387	0.11
388	0.07
389	0.07
390	0.05
391	0.05
392	0.04
393	0.04
394	0.04
395	0.04
396	0.04
397	0.04
398	0.03
399	0.03
400	0.03
401	0.07
402	0.07
403	0.08
404	0.11
405	0.13
406	0.14
407	0.16
408	0.2
409	0.18
410	0.22
411	0.25
412	0.23
413	0.21
414	0.21
415	0.19
416	0.17
417	0.15
418	0.11
419	0.08
420	0.06
421	0.06
422	0.06
423	0.06
424	0.04
425	0.05
426	0.06
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.06
432	0.06
433	0.05
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.04
438	0.04
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.05
447	0.05
448	0.05
449	0.04
450	0.05
451	0.05
452	0.04
453	0.05
454	0.06
455	0.06
456	0.09
457	0.1
458	0.11
459	0.15
460	0.22
461	0.24
462	0.31
463	0.39
464	0.43
465	0.47
466	0.55
467	0.57
468	0.6
469	0.68
470	0.69
471	0.71
472	0.72
473	0.76
474	0.77
475	0.8
476	0.75
477	0.69
478	0.64
479	0.64
480	0.59
481	0.53
482	0.43
483	0.34
484	0.3
485	0.26
486	0.22
487	0.13
488	0.1
489	0.08
490	0.08
491	0.08
492	0.07
493	0.06
494	0.08
495	0.08
496	0.1
497	0.1
498	0.09
499	0.09
500	0.09
501	0.09
502	0.09
503	0.08
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.06
508	0.07
509	0.07
510	0.07
511	0.08
512	0.12
513	0.12
514	0.13
515	0.13
516	0.15
517	0.14
518	0.17
519	0.16
520	0.13
521	0.13
522	0.13
523	0.13
524	0.11
525	0.13
526	0.12
527	0.11
528	0.11
529	0.11
530	0.13
531	0.13
532	0.12
533	0.1
534	0.09
535	0.09
536	0.08
537	0.08
538	0.05
539	0.05
540	0.05
541	0.05
542	0.05
543	0.04
544	0.04
545	0.03
546	0.03
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.05
551	0.07
552	0.1
553	0.13
554	0.18
555	0.2
556	0.24
557	0.31
558	0.3
559	0.36
560	0.45
561	0.53
562	0.54
563	0.6
564	0.61
565	0.58
566	0.66
567	0.66
568	0.65
569	0.64
570	0.67
571	0.7
572	0.74
573	0.74
574	0.7
575	0.71
576	0.67
577	0.63
578	0.59
579	0.51
580	0.44
581	0.41
582	0.37
583	0.29
584	0.23
585	0.17
586	0.14
587	0.14
588	0.12
589	0.14
590	0.22
591	0.23
592	0.27
593	0.3
594	0.3
595	0.32
596	0.37
597	0.38
598	0.31
599	0.31
600	0.27
601	0.24
602	0.22
603	0.18
604	0.11
605	0.07
606	0.06
607	0.04
608	0.03
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.04
615	0.06
616	0.07
617	0.08
618	0.1
619	0.12
620	0.13
621	0.14
622	0.15
623	0.15
624	0.16
625	0.17
626	0.22
627	0.23
628	0.25
629	0.26
630	0.25
631	0.24
632	0.23
633	0.24
634	0.17
635	0.18
636	0.18
637	0.17
638	0.22
639	0.25
640	0.25
641	0.22
642	0.22
643	0.19
644	0.17
645	0.16
646	0.12
647	0.09
648	0.14
649	0.19
650	0.22
651	0.24
652	0.28
653	0.35
654	0.42
655	0.51
656	0.54
657	0.56
658	0.59
659	0.61
660	0.59
661	0.52
662	0.47
663	0.42
664	0.35
665	0.31
666	0.31
667	0.29
668	0.27
669	0.29
670	0.27
671	0.27
672	0.31
673	0.32
674	0.37
675	0.43
676	0.49
677	0.51
678	0.52
679	0.49
680	0.51
681	0.54
682	0.52
683	0.54
684	0.57
685	0.63
686	0.7
687	0.76
688	0.71
689	0.7
690	0.7
691	0.7
692	0.7
693	0.71
694	0.71
695	0.74
696	0.83
697	0.87
698	0.87
699	0.83
700	0.82
701	0.78
702	0.71
703	0.69
704	0.66
705	0.61
706	0.58
707	0.54
708	0.46
709	0.41
710	0.38
711	0.31
712	0.24
713	0.19
714	0.15
715	0.12
716	0.13
717	0.13
718	0.15
719	0.2
720	0.27
721	0.29
722	0.32
723	0.35
724	0.38
725	0.43
726	0.47
727	0.47
728	0.5
729	0.58
730	0.64
731	0.68
732	0.73
733	0.79
734	0.84
735	0.86
736	0.87
737	0.87
738	0.86
739	0.88
740	0.8
741	0.76
742	0.68
743	0.62
744	0.57
745	0.5
746	0.41
747	0.32
748	0.32
749	0.31
750	0.37
751	0.4
752	0.42
753	0.43
754	0.47
755	0.54
756	0.59
757	0.63
758	0.61
759	0.65
760	0.62
761	0.65
762	0.67
763	0.68
764	0.7
765	0.67
766	0.68
767	0.67
768	0.66
769	0.61
770	0.64
771	0.67
772	0.67
773	0.7
774	0.7
775	0.7
776	0.78

A1CBF6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer