FuNGI

A1C9W8

Protein Details

Accession

A1C9W8

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-27	MPSEKVEKKRKRASDRHERPSKKPALE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
7-24	EKKRKRASDRHERPSKKP
478-507	KGGKAEAAARRVVRLKVPVEFPKVSRGGRR

Subcellular Location(s)

nucl 12, mito 9, cyto_nucl 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR009668 RNA_pol-assoc_fac_A49-like
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006351 P:DNA-templated transcription
KEGG	act:ACLA_009590 -
Pfam	View protein in Pfam PF06870 RNA_pol_I_A49

Amino Acid Sequences

MPSEKVEKKRKRASDRHERPSKKPALELQDLPPLAASLVDEHSELAPVIVTTPGVSAPRNLRLTPYLKTRAKTSSSANRNKGIVSSELLLQSSEHQKLDFVGREAEEDADSQLKHYIAVVDPEKKTWQLVEVRKLTVRGTVRRNKLVEDEEESSEEEEEVKTMRSQRTELTNTFGTKQSRKAAQSMAENAQLSSAPAGTANAAESAILSSMPVDAAADMASKAAAVQAQVQANKPIPVANLDATHPSDVYPIDVLVPNGLATLRQLPGIKEWVDTVAAGLPVSTTSRYVSRRVEAVVKSGNTTHVQLLRFILLLLEFARCLRAGRDPKSSSGPGSKRLPPRDELRRILSSSTGSLPTASSSSASTSAAAPSASDTIPDPVIDAIRRKFAPQGSHLTKHDLTFLHTSICALSLHIPPQPAKDGGASSLGGNSPNELATDPSDLRDDLRLDNAAILQYFRELGCRVDKPRESEFAKWGIKGGKAEAAARRVVRLKVPVEFPKVSRGGRR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.91
2	0.91
3	0.92
4	0.92
5	0.88
6	0.84
7	0.84
8	0.83
9	0.75
10	0.71
11	0.69
12	0.66
13	0.66
14	0.64
15	0.57
16	0.56
17	0.52
18	0.45
19	0.37
20	0.29
21	0.22
22	0.18
23	0.14
24	0.08
25	0.1
26	0.11
27	0.11
28	0.11
29	0.12
30	0.12
31	0.12
32	0.09
33	0.07
34	0.07
35	0.07
36	0.07
37	0.06
38	0.06
39	0.07
40	0.08
41	0.1
42	0.11
43	0.15
44	0.2
45	0.28
46	0.31
47	0.31
48	0.33
49	0.38
50	0.41
51	0.42
52	0.46
53	0.48
54	0.49
55	0.51
56	0.52
57	0.52
58	0.53
59	0.51
60	0.51
61	0.51
62	0.57
63	0.65
64	0.66
65	0.63
66	0.59
67	0.56
68	0.49
69	0.42
70	0.33
71	0.26
72	0.22
73	0.2
74	0.2
75	0.2
76	0.18
77	0.15
78	0.17
79	0.21
80	0.22
81	0.2
82	0.19
83	0.19
84	0.21
85	0.27
86	0.25
87	0.21
88	0.21
89	0.21
90	0.22
91	0.23
92	0.22
93	0.16
94	0.14
95	0.13
96	0.13
97	0.12
98	0.12
99	0.14
100	0.12
101	0.12
102	0.12
103	0.13
104	0.11
105	0.17
106	0.2
107	0.24
108	0.25
109	0.27
110	0.28
111	0.27
112	0.27
113	0.22
114	0.23
115	0.26
116	0.32
117	0.39
118	0.41
119	0.43
120	0.43
121	0.44
122	0.39
123	0.36
124	0.36
125	0.34
126	0.4
127	0.46
128	0.51
129	0.57
130	0.57
131	0.53
132	0.52
133	0.48
134	0.42
135	0.38
136	0.35
137	0.3
138	0.3
139	0.28
140	0.23
141	0.2
142	0.17
143	0.12
144	0.08
145	0.07
146	0.07
147	0.07
148	0.09
149	0.14
150	0.17
151	0.19
152	0.2
153	0.23
154	0.31
155	0.35
156	0.33
157	0.33
158	0.33
159	0.33
160	0.33
161	0.35
162	0.31
163	0.29
164	0.33
165	0.34
166	0.37
167	0.37
168	0.38
169	0.37
170	0.37
171	0.38
172	0.37
173	0.34
174	0.31
175	0.29
176	0.26
177	0.23
178	0.18
179	0.14
180	0.1
181	0.08
182	0.05
183	0.04
184	0.05
185	0.05
186	0.05
187	0.05
188	0.05
189	0.05
190	0.04
191	0.04
192	0.04
193	0.04
194	0.04
195	0.03
196	0.03
197	0.03
198	0.03
199	0.03
200	0.03
201	0.03
202	0.03
203	0.03
204	0.03
205	0.03
206	0.03
207	0.03
208	0.03
209	0.03
210	0.03
211	0.04
212	0.04
213	0.06
214	0.09
215	0.11
216	0.13
217	0.13
218	0.15
219	0.16
220	0.16
221	0.15
222	0.12
223	0.11
224	0.11
225	0.12
226	0.11
227	0.11
228	0.11
229	0.13
230	0.13
231	0.13
232	0.11
233	0.09
234	0.09
235	0.08
236	0.08
237	0.06
238	0.05
239	0.06
240	0.07
241	0.06
242	0.05
243	0.05
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.06
250	0.06
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.11
255	0.14
256	0.14
257	0.12
258	0.12
259	0.11
260	0.11
261	0.1
262	0.09
263	0.07
264	0.06
265	0.06
266	0.05
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.05
272	0.06
273	0.11
274	0.13
275	0.18
276	0.2
277	0.21
278	0.22
279	0.23
280	0.28
281	0.23
282	0.25
283	0.24
284	0.22
285	0.22
286	0.21
287	0.22
288	0.17
289	0.18
290	0.17
291	0.17
292	0.18
293	0.18
294	0.18
295	0.16
296	0.15
297	0.13
298	0.11
299	0.06
300	0.07
301	0.06
302	0.06
303	0.05
304	0.05
305	0.06
306	0.06
307	0.07
308	0.08
309	0.16
310	0.23
311	0.27
312	0.36
313	0.37
314	0.4
315	0.45
316	0.45
317	0.39
318	0.41
319	0.39
320	0.37
321	0.4
322	0.45
323	0.48
324	0.53
325	0.54
326	0.49
327	0.55
328	0.59
329	0.61
330	0.58
331	0.56
332	0.53
333	0.5
334	0.47
335	0.41
336	0.31
337	0.26
338	0.23
339	0.18
340	0.15
341	0.14
342	0.13
343	0.12
344	0.12
345	0.1
346	0.08
347	0.08
348	0.09
349	0.1
350	0.1
351	0.1
352	0.1
353	0.1
354	0.1
355	0.09
356	0.08
357	0.08
358	0.1
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.1
363	0.11
364	0.11
365	0.1
366	0.09
367	0.11
368	0.13
369	0.17
370	0.17
371	0.22
372	0.23
373	0.23
374	0.28
375	0.3
376	0.34
377	0.33
378	0.42
379	0.43
380	0.49
381	0.49
382	0.51
383	0.48
384	0.43
385	0.42
386	0.32
387	0.3
388	0.28
389	0.27
390	0.22
391	0.2
392	0.2
393	0.16
394	0.16
395	0.12
396	0.09
397	0.13
398	0.14
399	0.16
400	0.18
401	0.2
402	0.2
403	0.23
404	0.26
405	0.23
406	0.21
407	0.21
408	0.2
409	0.19
410	0.21
411	0.18
412	0.14
413	0.15
414	0.15
415	0.14
416	0.13
417	0.13
418	0.11
419	0.11
420	0.11
421	0.1
422	0.11
423	0.11
424	0.16
425	0.15
426	0.16
427	0.17
428	0.17
429	0.18
430	0.2
431	0.21
432	0.18
433	0.21
434	0.2
435	0.19
436	0.2
437	0.19
438	0.17
439	0.15
440	0.14
441	0.11
442	0.1
443	0.11
444	0.1
445	0.12
446	0.12
447	0.15
448	0.21
449	0.27
450	0.32
451	0.4
452	0.45
453	0.48
454	0.52
455	0.58
456	0.55
457	0.54
458	0.54
459	0.53
460	0.52
461	0.46
462	0.45
463	0.41
464	0.4
465	0.38
466	0.35
467	0.31
468	0.3
469	0.34
470	0.35
471	0.34
472	0.36
473	0.35
474	0.37
475	0.37
476	0.38
477	0.39
478	0.4
479	0.41
480	0.41
481	0.48
482	0.5
483	0.53
484	0.54
485	0.5
486	0.52
487	0.54

A1C9W8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer