Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1C6F1

Protein Details
Accession A1C6F1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MEQDEHPRKRLKRSPIDQPPDAHydrophilic
39-60RSITPPSSRSRRPPSNLQPRTSHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010347  Tdp1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0008081  F:phosphoric diester hydrolase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG act:ACLA_070030  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06087  Tyr-DNA_phospho  
CDD cd09123  PLDc_Tdp1_2  
cd09194  PLDc_yTdp1_1  
Amino Acid Sequences MEQDEHPRKRLKRSPIDQPPDATEAISELGANGLASLHRSITPPSSRSRRPPSNLQPRTSTGKEDTTQSGEPVGNRPRLIPSPIQLTHIRDLSAASGNNVDTVRLRDILGDPMIRECWQFNFLFDVDFLMNQFDEDVRRLVQVKVVHGSWKKDAPNRIRIEEACPRYPNVEAIVAYMPEPFGTHHSKMMILLRHDDLAQVVIHTANMIPGDWANMCQAVWRSPLLPLQKVEHIAEEPGTIGSGARFKRDLLAYLNEYGAKKTGPLVKQLARFDFSSVRAALIASVPSKQKLASLDLQRKTLWGWPALRETTRQIPLTREQGSETATPHIITQISSIATLGQTDKWLKDVFFNSLAPTSNPTPPTKSKYSIVFPTPDEIRRSLNGYGSGGSIHMKLQSTTQHKQLQYMRPYLRHWAGDSSTHSSDGRGETSTTKTQEAGRRRAAPHIKTYIRFADANRMNAIDWAMVTSANLSTQAWGAAVNSNGEVRICSWEVGVMVWPQLFAEKAEQQQQQAMMVPCFRRDLPVDCPVQPAKCDVLVGLRMPYDLPLTSYRADEVPWCATATHMEPDWLGQTWEG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.81
2 0.83
3 0.86
4 0.8
5 0.74
6 0.68
7 0.61
8 0.53
9 0.42
10 0.31
11 0.23
12 0.2
13 0.16
14 0.11
15 0.07
16 0.07
17 0.07
18 0.07
19 0.05
20 0.05
21 0.05
22 0.07
23 0.08
24 0.09
25 0.11
26 0.13
27 0.16
28 0.23
29 0.29
30 0.31
31 0.39
32 0.47
33 0.53
34 0.62
35 0.69
36 0.72
37 0.72
38 0.8
39 0.82
40 0.84
41 0.85
42 0.79
43 0.75
44 0.69
45 0.71
46 0.62
47 0.57
48 0.49
49 0.48
50 0.45
51 0.44
52 0.42
53 0.4
54 0.38
55 0.33
56 0.32
57 0.27
58 0.26
59 0.3
60 0.33
61 0.32
62 0.32
63 0.33
64 0.35
65 0.37
66 0.41
67 0.37
68 0.33
69 0.38
70 0.38
71 0.41
72 0.4
73 0.41
74 0.41
75 0.38
76 0.34
77 0.26
78 0.25
79 0.23
80 0.24
81 0.19
82 0.15
83 0.16
84 0.15
85 0.18
86 0.17
87 0.15
88 0.12
89 0.15
90 0.17
91 0.16
92 0.16
93 0.16
94 0.17
95 0.2
96 0.21
97 0.19
98 0.17
99 0.18
100 0.19
101 0.18
102 0.17
103 0.15
104 0.15
105 0.18
106 0.17
107 0.16
108 0.19
109 0.18
110 0.18
111 0.17
112 0.17
113 0.13
114 0.13
115 0.12
116 0.09
117 0.09
118 0.08
119 0.09
120 0.07
121 0.08
122 0.1
123 0.11
124 0.11
125 0.13
126 0.15
127 0.15
128 0.18
129 0.19
130 0.21
131 0.23
132 0.23
133 0.28
134 0.3
135 0.33
136 0.32
137 0.36
138 0.38
139 0.41
140 0.49
141 0.49
142 0.55
143 0.57
144 0.55
145 0.54
146 0.5
147 0.5
148 0.51
149 0.49
150 0.44
151 0.4
152 0.39
153 0.36
154 0.36
155 0.3
156 0.23
157 0.2
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.15
162 0.14
163 0.13
164 0.1
165 0.08
166 0.08
167 0.06
168 0.1
169 0.16
170 0.17
171 0.18
172 0.19
173 0.2
174 0.21
175 0.25
176 0.24
177 0.2
178 0.22
179 0.21
180 0.21
181 0.21
182 0.19
183 0.14
184 0.11
185 0.1
186 0.07
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.05
192 0.05
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.06
198 0.06
199 0.07
200 0.07
201 0.07
202 0.07
203 0.08
204 0.09
205 0.1
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.13
210 0.17
211 0.19
212 0.2
213 0.2
214 0.21
215 0.23
216 0.25
217 0.23
218 0.2
219 0.17
220 0.15
221 0.14
222 0.11
223 0.09
224 0.07
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.1
230 0.1
231 0.11
232 0.12
233 0.12
234 0.16
235 0.16
236 0.18
237 0.16
238 0.19
239 0.19
240 0.2
241 0.2
242 0.19
243 0.18
244 0.17
245 0.14
246 0.1
247 0.09
248 0.11
249 0.17
250 0.16
251 0.2
252 0.25
253 0.28
254 0.34
255 0.36
256 0.34
257 0.3
258 0.29
259 0.27
260 0.25
261 0.21
262 0.19
263 0.16
264 0.15
265 0.13
266 0.12
267 0.11
268 0.08
269 0.08
270 0.06
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.15
279 0.19
280 0.26
281 0.34
282 0.35
283 0.37
284 0.35
285 0.34
286 0.31
287 0.28
288 0.22
289 0.18
290 0.18
291 0.19
292 0.22
293 0.24
294 0.23
295 0.21
296 0.23
297 0.24
298 0.27
299 0.26
300 0.24
301 0.26
302 0.28
303 0.33
304 0.32
305 0.26
306 0.24
307 0.23
308 0.24
309 0.22
310 0.2
311 0.16
312 0.14
313 0.13
314 0.12
315 0.12
316 0.1
317 0.09
318 0.08
319 0.08
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.07
324 0.06
325 0.07
326 0.07
327 0.06
328 0.08
329 0.1
330 0.1
331 0.12
332 0.13
333 0.12
334 0.16
335 0.17
336 0.18
337 0.19
338 0.19
339 0.18
340 0.18
341 0.19
342 0.15
343 0.17
344 0.17
345 0.18
346 0.21
347 0.21
348 0.26
349 0.3
350 0.36
351 0.36
352 0.37
353 0.37
354 0.39
355 0.42
356 0.42
357 0.4
358 0.37
359 0.33
360 0.33
361 0.32
362 0.31
363 0.29
364 0.25
365 0.25
366 0.23
367 0.26
368 0.24
369 0.23
370 0.21
371 0.19
372 0.18
373 0.16
374 0.14
375 0.11
376 0.11
377 0.09
378 0.08
379 0.1
380 0.1
381 0.1
382 0.12
383 0.19
384 0.26
385 0.28
386 0.35
387 0.4
388 0.4
389 0.46
390 0.52
391 0.53
392 0.52
393 0.57
394 0.54
395 0.51
396 0.52
397 0.53
398 0.49
399 0.41
400 0.37
401 0.33
402 0.3
403 0.31
404 0.33
405 0.32
406 0.28
407 0.28
408 0.27
409 0.23
410 0.24
411 0.22
412 0.19
413 0.15
414 0.15
415 0.16
416 0.21
417 0.26
418 0.25
419 0.24
420 0.24
421 0.29
422 0.36
423 0.42
424 0.44
425 0.46
426 0.51
427 0.52
428 0.6
429 0.63
430 0.59
431 0.58
432 0.6
433 0.58
434 0.53
435 0.56
436 0.5
437 0.45
438 0.42
439 0.36
440 0.37
441 0.36
442 0.38
443 0.34
444 0.31
445 0.27
446 0.26
447 0.26
448 0.16
449 0.11
450 0.09
451 0.08
452 0.07
453 0.07
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.08
462 0.07
463 0.07
464 0.08
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.11
469 0.11
470 0.11
471 0.11
472 0.11
473 0.09
474 0.14
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.14
479 0.14
480 0.14
481 0.15
482 0.11
483 0.11
484 0.11
485 0.11
486 0.1
487 0.1
488 0.1
489 0.1
490 0.14
491 0.17
492 0.21
493 0.29
494 0.31
495 0.32
496 0.35
497 0.34
498 0.3
499 0.32
500 0.31
501 0.25
502 0.28
503 0.28
504 0.27
505 0.29
506 0.28
507 0.26
508 0.27
509 0.3
510 0.31
511 0.38
512 0.4
513 0.38
514 0.43
515 0.43
516 0.42
517 0.38
518 0.35
519 0.3
520 0.27
521 0.26
522 0.21
523 0.22
524 0.23
525 0.23
526 0.22
527 0.19
528 0.19
529 0.19
530 0.19
531 0.16
532 0.13
533 0.15
534 0.16
535 0.2
536 0.21
537 0.21
538 0.22
539 0.2
540 0.21
541 0.2
542 0.22
543 0.22
544 0.21
545 0.21
546 0.19
547 0.19
548 0.23
549 0.23
550 0.22
551 0.2
552 0.19
553 0.19
554 0.21
555 0.22
556 0.19