Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2Z6R8G6

Protein Details
Accession A0A2Z6R8G6    Localization Confidence High Confidence Score 22.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-31MSSKNSKSSVKQKKLKSKRGYGKNVAKTKVVHydrophilic
116-136FAVYQKLPKEHKKPDPRQGTIHydrophilic
250-289EFPQSTSRSKRERKRREKGERERRERERREKDKEKDKKDEBasic
307-339KEQVREKENYREKRRDKKQEKERQKLIREREKKBasic
467-494SSNFPSNESRYRRRERSRKHSTDAKTPQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-26VKQKKLKSKRGYGKNVA
257-340RSKRERKRREKGERERRERERREKDKEKDKKDERENSKDNEKTKEKESEIKEQVREKENYREKRRDKKQEKERQKLIREREKKS
364-396AKEKEKEKEKEKEKEKEKETEKEKEKEKETKRV
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSSKNSKSSVKQKKLKSKRGYGKNVAKTKVVVRRLPPLIPETLFLETVKQWVNEETCTWSRFHQGRISKSKNKESIFSRAYFHFKTVEQVLEFHRGYDNHLFIDKQGNENRAVVEFAVYQKLPKEHKKPDPRQGTIESDPDYLAFLESLKMEETQQTAKEPGVILESGATQLERLEARLANAATNAASVVEKPTTTPLLEHLRALKLGSKSKSPPLKHAQIAILSSSGLSAKGTSSRATKQSSQQTRANEFPQSTSRSKRERKRREKGERERRERERREKDKEKDKKDERENSKDNEKTKEKESEIKEQVREKENYREKRRDKKQEKERQKLIREREKKSQATEANKSEPPTITIVPRPQTEEAKEKEKEKEKEKEKEKEKETEKEKEKEKETKRVPVKITIQQRQKEQIRQFIQKTSSSPKKEVNTNENDSKEIASQESAAKESTAKDARKEEIKDTSETSLTPSSSNFPSNESRYRRRERSRKHSTDAKTPQIQILTKSQTQSTNTSESNVSTSTSSAAVSSPSSTAATSNAPSPIRRTGRGYFGKRGGRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.91
3 0.9
4 0.9
5 0.9
6 0.92
7 0.92
8 0.91
9 0.91
10 0.9
11 0.88
12 0.8
13 0.72
14 0.65
15 0.64
16 0.62
17 0.59
18 0.56
19 0.51
20 0.58
21 0.59
22 0.58
23 0.53
24 0.47
25 0.44
26 0.39
27 0.36
28 0.3
29 0.28
30 0.27
31 0.23
32 0.22
33 0.18
34 0.21
35 0.22
36 0.2
37 0.19
38 0.22
39 0.25
40 0.23
41 0.25
42 0.28
43 0.28
44 0.29
45 0.29
46 0.26
47 0.33
48 0.35
49 0.38
50 0.4
51 0.43
52 0.52
53 0.62
54 0.69
55 0.69
56 0.74
57 0.79
58 0.79
59 0.74
60 0.71
61 0.65
62 0.66
63 0.61
64 0.55
65 0.49
66 0.44
67 0.49
68 0.43
69 0.4
70 0.33
71 0.28
72 0.31
73 0.3
74 0.3
75 0.24
76 0.25
77 0.26
78 0.31
79 0.3
80 0.26
81 0.27
82 0.24
83 0.28
84 0.32
85 0.3
86 0.24
87 0.26
88 0.25
89 0.22
90 0.32
91 0.27
92 0.28
93 0.31
94 0.32
95 0.33
96 0.34
97 0.33
98 0.25
99 0.24
100 0.17
101 0.14
102 0.13
103 0.13
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.17
108 0.23
109 0.29
110 0.36
111 0.44
112 0.5
113 0.61
114 0.71
115 0.77
116 0.82
117 0.85
118 0.8
119 0.76
120 0.71
121 0.68
122 0.6
123 0.55
124 0.46
125 0.37
126 0.33
127 0.27
128 0.23
129 0.16
130 0.13
131 0.09
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.08
139 0.1
140 0.12
141 0.14
142 0.15
143 0.16
144 0.16
145 0.16
146 0.17
147 0.15
148 0.13
149 0.13
150 0.12
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.08
156 0.07
157 0.05
158 0.05
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.09
163 0.1
164 0.11
165 0.15
166 0.15
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.07
177 0.07
178 0.07
179 0.08
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.11
184 0.14
185 0.21
186 0.22
187 0.22
188 0.23
189 0.22
190 0.22
191 0.23
192 0.23
193 0.2
194 0.25
195 0.26
196 0.28
197 0.29
198 0.37
199 0.45
200 0.42
201 0.46
202 0.47
203 0.52
204 0.49
205 0.5
206 0.44
207 0.37
208 0.36
209 0.28
210 0.2
211 0.14
212 0.12
213 0.09
214 0.07
215 0.05
216 0.05
217 0.04
218 0.05
219 0.07
220 0.09
221 0.1
222 0.13
223 0.17
224 0.21
225 0.25
226 0.28
227 0.32
228 0.41
229 0.47
230 0.49
231 0.5
232 0.5
233 0.5
234 0.5
235 0.45
236 0.38
237 0.31
238 0.28
239 0.28
240 0.28
241 0.28
242 0.3
243 0.35
244 0.42
245 0.5
246 0.57
247 0.64
248 0.7
249 0.78
250 0.82
251 0.87
252 0.89
253 0.92
254 0.94
255 0.94
256 0.93
257 0.91
258 0.9
259 0.88
260 0.88
261 0.86
262 0.85
263 0.85
264 0.83
265 0.84
266 0.85
267 0.83
268 0.83
269 0.84
270 0.8
271 0.8
272 0.78
273 0.78
274 0.77
275 0.79
276 0.76
277 0.76
278 0.73
279 0.66
280 0.67
281 0.62
282 0.56
283 0.54
284 0.5
285 0.44
286 0.43
287 0.46
288 0.4
289 0.43
290 0.44
291 0.46
292 0.49
293 0.51
294 0.5
295 0.48
296 0.51
297 0.49
298 0.47
299 0.41
300 0.44
301 0.49
302 0.55
303 0.59
304 0.64
305 0.67
306 0.75
307 0.82
308 0.83
309 0.84
310 0.84
311 0.87
312 0.88
313 0.9
314 0.89
315 0.88
316 0.86
317 0.85
318 0.82
319 0.81
320 0.8
321 0.78
322 0.74
323 0.74
324 0.74
325 0.68
326 0.63
327 0.62
328 0.58
329 0.57
330 0.58
331 0.53
332 0.49
333 0.48
334 0.46
335 0.4
336 0.34
337 0.28
338 0.25
339 0.22
340 0.19
341 0.22
342 0.25
343 0.26
344 0.27
345 0.29
346 0.28
347 0.31
348 0.32
349 0.35
350 0.34
351 0.38
352 0.4
353 0.39
354 0.45
355 0.51
356 0.53
357 0.54
358 0.6
359 0.61
360 0.69
361 0.74
362 0.76
363 0.75
364 0.78
365 0.75
366 0.74
367 0.71
368 0.7
369 0.68
370 0.68
371 0.67
372 0.64
373 0.67
374 0.65
375 0.66
376 0.67
377 0.67
378 0.68
379 0.65
380 0.68
381 0.68
382 0.68
383 0.64
384 0.63
385 0.63
386 0.6
387 0.65
388 0.63
389 0.65
390 0.62
391 0.64
392 0.65
393 0.65
394 0.66
395 0.61
396 0.63
397 0.61
398 0.65
399 0.63
400 0.59
401 0.57
402 0.5
403 0.49
404 0.49
405 0.52
406 0.49
407 0.5
408 0.51
409 0.52
410 0.57
411 0.6
412 0.59
413 0.58
414 0.6
415 0.62
416 0.56
417 0.52
418 0.46
419 0.4
420 0.32
421 0.25
422 0.19
423 0.13
424 0.14
425 0.16
426 0.16
427 0.16
428 0.15
429 0.14
430 0.14
431 0.15
432 0.21
433 0.26
434 0.26
435 0.3
436 0.34
437 0.38
438 0.44
439 0.46
440 0.43
441 0.45
442 0.46
443 0.44
444 0.42
445 0.41
446 0.34
447 0.31
448 0.3
449 0.24
450 0.22
451 0.2
452 0.19
453 0.2
454 0.22
455 0.25
456 0.22
457 0.23
458 0.29
459 0.34
460 0.43
461 0.47
462 0.53
463 0.6
464 0.69
465 0.75
466 0.79
467 0.84
468 0.86
469 0.89
470 0.91
471 0.89
472 0.87
473 0.86
474 0.81
475 0.81
476 0.79
477 0.77
478 0.72
479 0.65
480 0.61
481 0.58
482 0.54
483 0.46
484 0.46
485 0.43
486 0.4
487 0.4
488 0.4
489 0.4
490 0.41
491 0.43
492 0.4
493 0.39
494 0.36
495 0.37
496 0.35
497 0.31
498 0.3
499 0.25
500 0.22
501 0.16
502 0.16
503 0.15
504 0.14
505 0.13
506 0.11
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.12
511 0.11
512 0.12
513 0.13
514 0.13
515 0.13
516 0.14
517 0.16
518 0.16
519 0.18
520 0.22
521 0.24
522 0.25
523 0.29
524 0.37
525 0.39
526 0.42
527 0.46
528 0.45
529 0.54
530 0.62
531 0.65
532 0.63
533 0.66