Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1C5Z2

Protein Details
Accession A1C5Z2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
2-21PNTAVKQKTSQKAKADSRSPHydrophilic
43-63VKVKGVKEKKVREKDDAERKLBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11, cyto 5.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045161  Utp18  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0034388  C:Pwp2p-containing subcomplex of 90S preribosome  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000480  P:endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000447  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000472  P:endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000292  P:RNA fragment catabolic process  
KEGG act:ACLA_068400  -  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
Amino Acid Sequences MPNTAVKQKTSQKAKADSRSPFENGDISMPVDSNDDSDMDVDVKVKGVKEKKVREKDDAERKLERMLFGDDEGFVGALKSHQSRDLVAFGEESDVESASEGEEEEAEDSDLAGVSDADLFFLDSGSAPVSTDLAEPSESGSDSEDSEAEGTLPALWHDSDDERLTVSLASHQRLRKLRNTESEDIISGKEYVKRLRRQFLQLHPVPDWANPELNNKQEGNDSDSDRDSDMDTDEENERLSTQPLAKLLQNASELTKLDDGTRPGGKRKLRQEVIDIHRLKDIGKDQPSSVDSLMFHPHYPLLLSSGPAATLFIHHISPSAAAPNPLLTSLHIRRTPIHTSAFALPSGNKIFASGRRRYFHIWDLDTGKVEKVNGTADRKEEQKSMERFKLSPCGRYVGLVGSSRKGGGIINILDSSTGQWIAQVRVDGRGGVADFAWWGDGEGMTVASKSGEVSEWDGRLNRVVARWMDAGAVGTTTLNLGGRSGRTQLGGDRWVAVGSSSGVVNVYDRREWAAAYAAQSNSTDAKTASPIPRNPEPVRALDQLTTPISHLVFAPDGQFLVMASRWKRDALRLVHLPTCTVFRNWPTSNTPFGRISSVAVSPNSDQLAVANEQGRIRLWEIRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.81
3 0.8
4 0.77
5 0.73
6 0.71
7 0.65
8 0.57
9 0.5
10 0.43
11 0.35
12 0.31
13 0.26
14 0.21
15 0.19
16 0.17
17 0.15
18 0.15
19 0.14
20 0.12
21 0.12
22 0.11
23 0.1
24 0.11
25 0.11
26 0.1
27 0.1
28 0.1
29 0.1
30 0.11
31 0.13
32 0.14
33 0.22
34 0.28
35 0.37
36 0.46
37 0.56
38 0.65
39 0.74
40 0.78
41 0.78
42 0.79
43 0.81
44 0.82
45 0.79
46 0.74
47 0.69
48 0.64
49 0.62
50 0.56
51 0.47
52 0.39
53 0.35
54 0.3
55 0.27
56 0.26
57 0.19
58 0.17
59 0.16
60 0.13
61 0.09
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.1
66 0.12
67 0.13
68 0.17
69 0.19
70 0.21
71 0.23
72 0.25
73 0.22
74 0.21
75 0.19
76 0.16
77 0.16
78 0.14
79 0.12
80 0.1
81 0.09
82 0.08
83 0.08
84 0.08
85 0.07
86 0.07
87 0.06
88 0.06
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.04
101 0.04
102 0.06
103 0.06
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.04
111 0.05
112 0.06
113 0.06
114 0.06
115 0.06
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.08
121 0.08
122 0.08
123 0.09
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.1
128 0.1
129 0.1
130 0.11
131 0.1
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.07
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.05
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.08
145 0.09
146 0.12
147 0.13
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.11
153 0.1
154 0.14
155 0.17
156 0.19
157 0.24
158 0.26
159 0.33
160 0.39
161 0.44
162 0.45
163 0.5
164 0.55
165 0.59
166 0.65
167 0.61
168 0.59
169 0.55
170 0.47
171 0.4
172 0.33
173 0.24
174 0.17
175 0.15
176 0.15
177 0.16
178 0.23
179 0.31
180 0.39
181 0.44
182 0.51
183 0.55
184 0.59
185 0.64
186 0.65
187 0.67
188 0.62
189 0.59
190 0.52
191 0.49
192 0.42
193 0.35
194 0.31
195 0.22
196 0.21
197 0.18
198 0.24
199 0.24
200 0.26
201 0.28
202 0.24
203 0.24
204 0.25
205 0.25
206 0.24
207 0.24
208 0.24
209 0.23
210 0.23
211 0.23
212 0.2
213 0.19
214 0.14
215 0.12
216 0.11
217 0.09
218 0.09
219 0.1
220 0.11
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.1
229 0.12
230 0.13
231 0.15
232 0.15
233 0.17
234 0.17
235 0.18
236 0.18
237 0.16
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.14
242 0.15
243 0.12
244 0.12
245 0.14
246 0.14
247 0.16
248 0.2
249 0.2
250 0.23
251 0.29
252 0.33
253 0.38
254 0.45
255 0.52
256 0.51
257 0.51
258 0.52
259 0.54
260 0.55
261 0.57
262 0.49
263 0.4
264 0.38
265 0.36
266 0.31
267 0.26
268 0.24
269 0.22
270 0.24
271 0.24
272 0.23
273 0.26
274 0.27
275 0.24
276 0.21
277 0.15
278 0.13
279 0.13
280 0.16
281 0.14
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.1
286 0.1
287 0.08
288 0.08
289 0.08
290 0.08
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.07
295 0.07
296 0.05
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.06
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.07
306 0.08
307 0.07
308 0.07
309 0.07
310 0.08
311 0.08
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.13
316 0.15
317 0.21
318 0.21
319 0.22
320 0.24
321 0.29
322 0.31
323 0.28
324 0.28
325 0.23
326 0.24
327 0.26
328 0.25
329 0.2
330 0.17
331 0.14
332 0.15
333 0.15
334 0.13
335 0.1
336 0.1
337 0.12
338 0.18
339 0.24
340 0.27
341 0.33
342 0.34
343 0.37
344 0.39
345 0.41
346 0.4
347 0.4
348 0.35
349 0.32
350 0.33
351 0.31
352 0.29
353 0.26
354 0.21
355 0.15
356 0.14
357 0.11
358 0.09
359 0.12
360 0.15
361 0.19
362 0.2
363 0.22
364 0.24
365 0.26
366 0.27
367 0.26
368 0.24
369 0.29
370 0.34
371 0.38
372 0.41
373 0.41
374 0.39
375 0.39
376 0.46
377 0.39
378 0.37
379 0.32
380 0.31
381 0.28
382 0.28
383 0.27
384 0.19
385 0.2
386 0.19
387 0.19
388 0.17
389 0.17
390 0.16
391 0.15
392 0.14
393 0.11
394 0.08
395 0.11
396 0.1
397 0.12
398 0.12
399 0.12
400 0.11
401 0.11
402 0.1
403 0.07
404 0.07
405 0.05
406 0.07
407 0.09
408 0.1
409 0.11
410 0.12
411 0.12
412 0.14
413 0.14
414 0.13
415 0.11
416 0.11
417 0.1
418 0.09
419 0.08
420 0.06
421 0.05
422 0.05
423 0.06
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.04
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.07
440 0.11
441 0.14
442 0.15
443 0.16
444 0.18
445 0.17
446 0.19
447 0.19
448 0.16
449 0.14
450 0.18
451 0.17
452 0.2
453 0.2
454 0.18
455 0.17
456 0.16
457 0.15
458 0.11
459 0.1
460 0.06
461 0.06
462 0.05
463 0.05
464 0.06
465 0.05
466 0.05
467 0.06
468 0.08
469 0.09
470 0.11
471 0.13
472 0.14
473 0.14
474 0.15
475 0.18
476 0.21
477 0.21
478 0.2
479 0.19
480 0.18
481 0.17
482 0.16
483 0.13
484 0.09
485 0.08
486 0.08
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.07
491 0.09
492 0.11
493 0.13
494 0.13
495 0.14
496 0.17
497 0.17
498 0.17
499 0.17
500 0.18
501 0.17
502 0.18
503 0.22
504 0.2
505 0.2
506 0.21
507 0.21
508 0.19
509 0.17
510 0.16
511 0.12
512 0.13
513 0.15
514 0.22
515 0.27
516 0.33
517 0.36
518 0.42
519 0.48
520 0.55
521 0.54
522 0.56
523 0.52
524 0.49
525 0.51
526 0.47
527 0.43
528 0.36
529 0.35
530 0.31
531 0.29
532 0.25
533 0.19
534 0.19
535 0.17
536 0.16
537 0.15
538 0.14
539 0.13
540 0.13
541 0.14
542 0.12
543 0.12
544 0.11
545 0.11
546 0.08
547 0.09
548 0.11
549 0.16
550 0.17
551 0.21
552 0.23
553 0.26
554 0.28
555 0.33
556 0.4
557 0.39
558 0.46
559 0.49
560 0.53
561 0.53
562 0.51
563 0.46
564 0.38
565 0.36
566 0.3
567 0.26
568 0.26
569 0.27
570 0.36
571 0.37
572 0.41
573 0.44
574 0.46
575 0.52
576 0.5
577 0.51
578 0.44
579 0.44
580 0.42
581 0.36
582 0.34
583 0.29
584 0.28
585 0.27
586 0.25
587 0.27
588 0.24
589 0.27
590 0.25
591 0.22
592 0.19
593 0.16
594 0.2
595 0.18
596 0.2
597 0.19
598 0.21
599 0.21
600 0.23
601 0.23
602 0.22
603 0.24