FuNGI

A0A2Z6SCB2

Protein Details

Accession

A0A2Z6SCB2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
232-251	NWELEYKKFRKNKNREKESD	Hydrophilic
411-430	IRENPRQKSRKININQRTGF	Hydrophilic
470-512	GTARSKNESKEEKKLRKQNIKSERKKRRIEKKSLKQAFAKEHT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
475-506	KNESKEEKKLRKQNIKSERKKRRIEKKSLKQA

Subcellular Location(s)

nucl 23.5, cyto_nucl 13.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MGKKPFIDRKNAKHFQVVHRSQRDPLINDNEASSRVLVEVVPSNLRGKGKQISEYNDFDDYQRRQKEIESRVGQAALYGVYFDDSEYDYLQHLRQIGESEGEAVFIEASKEEKKTVGGFELKKDFKSEDNKDVLFSSKKDRKVKILLPEEVLPSKEELEVGFLNQSAIPEDIQGFQPDMDPKLRETLEALEDDAYIKDDLDDDFFAALNAKDDKFNEEEEEDFEHDEEEVENWELEYKKFRKNKNREKESDEEDDDDKRSRTTGGYSMTSSIMFRNDKLRLLDEQFEKISKEYMEDDEDIESDDESTTSHIRQDFSQILDEFLDKYEIDGRKVVQKLEGDNVQDQLETIRKGLGKVIVNDDNSSQNETIKGEKRRDILVHVESEEKDEGQNWDCQSILSTYSNLENHPTLIRENPRQKSRKININQRTGFPIVKVATENNKDEEEEEGEEEGENGMENQENEENEKVNLGTARSKNESKEEKKLRKQNIKSERKKRRIEKKSLKQAFAKEHTKQSKISHNISKNHLDAIHLE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.74
2	0.73
3	0.75
4	0.73
5	0.73
6	0.73
7	0.73
8	0.67
9	0.68
10	0.65
11	0.57
12	0.56
13	0.54
14	0.49
15	0.47
16	0.45
17	0.39
18	0.33
19	0.31
20	0.23
21	0.15
22	0.13
23	0.13
24	0.1
25	0.12
26	0.15
27	0.16
28	0.17
29	0.18
30	0.2
31	0.24
32	0.26
33	0.25
34	0.26
35	0.31
36	0.33
37	0.4
38	0.44
39	0.46
40	0.5
41	0.52
42	0.5
43	0.45
44	0.42
45	0.36
46	0.38
47	0.36
48	0.4
49	0.41
50	0.39
51	0.37
52	0.43
53	0.51
54	0.5
55	0.55
56	0.49
57	0.48
58	0.49
59	0.48
60	0.42
61	0.33
62	0.26
63	0.16
64	0.12
65	0.08
66	0.06
67	0.06
68	0.06
69	0.06
70	0.07
71	0.08
72	0.09
73	0.09
74	0.1
75	0.11
76	0.13
77	0.13
78	0.14
79	0.15
80	0.14
81	0.15
82	0.16
83	0.16
84	0.16
85	0.15
86	0.15
87	0.13
88	0.13
89	0.11
90	0.09
91	0.08
92	0.06
93	0.07
94	0.05
95	0.08
96	0.1
97	0.11
98	0.12
99	0.13
100	0.15
101	0.16
102	0.18
103	0.21
104	0.27
105	0.28
106	0.33
107	0.41
108	0.41
109	0.39
110	0.39
111	0.35
112	0.34
113	0.42
114	0.42
115	0.41
116	0.45
117	0.44
118	0.43
119	0.42
120	0.4
121	0.33
122	0.29
123	0.32
124	0.33
125	0.42
126	0.49
127	0.51
128	0.54
129	0.6
130	0.64
131	0.64
132	0.65
133	0.59
134	0.54
135	0.52
136	0.48
137	0.4
138	0.35
139	0.26
140	0.19
141	0.17
142	0.14
143	0.12
144	0.09
145	0.11
146	0.11
147	0.11
148	0.1
149	0.09
150	0.1
151	0.1
152	0.1
153	0.08
154	0.08
155	0.07
156	0.08
157	0.08
158	0.09
159	0.1
160	0.1
161	0.09
162	0.09
163	0.11
164	0.12
165	0.13
166	0.15
167	0.15
168	0.15
169	0.2
170	0.2
171	0.17
172	0.17
173	0.18
174	0.17
175	0.17
176	0.16
177	0.12
178	0.12
179	0.12
180	0.11
181	0.09
182	0.07
183	0.07
184	0.06
185	0.06
186	0.07
187	0.08
188	0.08
189	0.07
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.13
201	0.14
202	0.15
203	0.15
204	0.14
205	0.14
206	0.14
207	0.16
208	0.14
209	0.13
210	0.12
211	0.1
212	0.09
213	0.09
214	0.07
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.08
221	0.08
222	0.09
223	0.16
224	0.19
225	0.26
226	0.33
227	0.42
228	0.51
229	0.61
230	0.72
231	0.75
232	0.82
233	0.78
234	0.79
235	0.76
236	0.7
237	0.64
238	0.54
239	0.45
240	0.37
241	0.33
242	0.28
243	0.24
244	0.19
245	0.14
246	0.13
247	0.11
248	0.11
249	0.11
250	0.14
251	0.15
252	0.16
253	0.16
254	0.17
255	0.17
256	0.16
257	0.14
258	0.11
259	0.12
260	0.11
261	0.12
262	0.16
263	0.16
264	0.19
265	0.19
266	0.21
267	0.2
268	0.22
269	0.26
270	0.23
271	0.23
272	0.22
273	0.21
274	0.2
275	0.17
276	0.16
277	0.11
278	0.11
279	0.11
280	0.12
281	0.13
282	0.13
283	0.14
284	0.12
285	0.12
286	0.11
287	0.1
288	0.08
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.05
293	0.06
294	0.07
295	0.07
296	0.09
297	0.11
298	0.12
299	0.12
300	0.17
301	0.17
302	0.18
303	0.21
304	0.19
305	0.18
306	0.17
307	0.17
308	0.13
309	0.11
310	0.11
311	0.07
312	0.08
313	0.14
314	0.14
315	0.15
316	0.16
317	0.16
318	0.22
319	0.24
320	0.24
321	0.21
322	0.22
323	0.23
324	0.25
325	0.27
326	0.23
327	0.22
328	0.23
329	0.19
330	0.17
331	0.15
332	0.13
333	0.13
334	0.11
335	0.11
336	0.12
337	0.13
338	0.13
339	0.15
340	0.19
341	0.19
342	0.21
343	0.26
344	0.28
345	0.28
346	0.28
347	0.28
348	0.26
349	0.23
350	0.25
351	0.19
352	0.16
353	0.16
354	0.17
355	0.22
356	0.26
357	0.31
358	0.33
359	0.37
360	0.39
361	0.42
362	0.42
363	0.39
364	0.38
365	0.35
366	0.33
367	0.29
368	0.3
369	0.26
370	0.27
371	0.25
372	0.18
373	0.15
374	0.14
375	0.16
376	0.15
377	0.19
378	0.17
379	0.17
380	0.16
381	0.16
382	0.16
383	0.14
384	0.15
385	0.12
386	0.12
387	0.13
388	0.17
389	0.18
390	0.17
391	0.19
392	0.16
393	0.17
394	0.18
395	0.18
396	0.16
397	0.21
398	0.28
399	0.34
400	0.43
401	0.5
402	0.59
403	0.63
404	0.66
405	0.71
406	0.72
407	0.73
408	0.73
409	0.76
410	0.75
411	0.8
412	0.78
413	0.69
414	0.67
415	0.59
416	0.51
417	0.4
418	0.37
419	0.27
420	0.25
421	0.24
422	0.23
423	0.28
424	0.32
425	0.34
426	0.31
427	0.32
428	0.3
429	0.29
430	0.28
431	0.23
432	0.19
433	0.18
434	0.16
435	0.15
436	0.14
437	0.14
438	0.11
439	0.08
440	0.06
441	0.05
442	0.06
443	0.07
444	0.07
445	0.1
446	0.13
447	0.14
448	0.17
449	0.18
450	0.18
451	0.17
452	0.18
453	0.15
454	0.15
455	0.16
456	0.15
457	0.22
458	0.25
459	0.31
460	0.35
461	0.39
462	0.4
463	0.48
464	0.56
465	0.54
466	0.62
467	0.66
468	0.71
469	0.78
470	0.84
471	0.86
472	0.86
473	0.89
474	0.89
475	0.89
476	0.89
477	0.9
478	0.92
479	0.92
480	0.91
481	0.93
482	0.93
483	0.93
484	0.92
485	0.93
486	0.93
487	0.93
488	0.94
489	0.93
490	0.89
491	0.85
492	0.82
493	0.8
494	0.78
495	0.75
496	0.7
497	0.71
498	0.72
499	0.69
500	0.66
501	0.63
502	0.64
503	0.64
504	0.66
505	0.66
506	0.67
507	0.7
508	0.72
509	0.72
510	0.63
511	0.6
512	0.52

A0A2Z6SCB2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer