FuNGI

A0A2Z6RR27

Protein Details

Accession

A0A2Z6RR27

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
246-273	LDSSKRPAFRPPPKKPVKPQIEKKLVRE	Hydrophilic
908-928	TIIKAFRKRIHEDARNRERLL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
238-268	PRGIPRKPLDSSKRPAFRPPPKKPVKPQIEK
644-680	KGKTLVKPKATTKATVKGKTLTTPKPKSTTEKPKGKI

Subcellular Location(s)

nucl 26, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSQNPTQNNLSQTQPPNTARQNFSNTNQNLMGRTPINNLDNRTVYRGPYTNVMNNTRIIGHSQTGGLDPTISFTQMRSDTNTGLQGMLTPSYTTMQRPTSLIQSAENINSQVEVSTSNTTLQVRPAVNNMNIQSNNQSTNNLMAQAGQPVNLNIKPEADTVPNNMTNMENQSVTLNNPQSSQPSMINSIYSSGSAWASRPINPNQFTPDFPKYFKSPAEEARNKSIQDKEYEAKHLVPRGIPRKPLDSSKRPAFRPPPKKPVKPQIEKKLVREFIITGSMINAVKKVNLMRLHRGNNVLDKFQAPVKLHRRDPEASSSGTGNARQNEAVIAPTLKTTQQHTGPTTGADTSKIAPFAGARHNKKNLFKKRTTQIYLADDRQRQLKAEERLPWVLEDYDGTNTWVGQFEETDAKYGFLIKDKQDENKLRFLPSHRWYTFRPQIKYKTLTIEEAEEEMARAKKRDNDRWMMRRWGKQNDNEKKIADEEGGIVELKSVMKTVENEEDLFGSDDEGLRRPRRGIESDEEMEFEQVFEDDEEELPDDANPIDEENAEVVKLKKRAIHKPTSLEGEDENEDSFKLTQEGMQLKKLVRKFDDNEAYDDSDKESNPYASEIEESEEELSSESPARTPVIGAAGTKPTPAKIDKGKTLVKPKATTKATVKGKTLTTPKPKSTTEKPKGKIATTSKTKSTAAKPIKSLSNLSASEEASLKPKLKSSDISVATKVSSKSHVKNMTAIPMSSTPEDSMKKPSSKPKNVKSGLPAKTAASQPQIALKKQKTSTVRQPISEMATSFGKKSTAHDSFVSDDDKSIKRTKQIETTHSTATASISRLANANVSSTVRTSNGGTVKRVREGEDSTIFAGKKVRTDKPVSGPQTSTAAQVTDSSNSRLISEKEVRQIISKDSELTVTTIIKAFRKRIHEDARNRERLLEITKNVAVLKNGHLVLK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.5
2	0.49
3	0.53
4	0.59
5	0.62
6	0.59
7	0.59
8	0.63
9	0.6
10	0.61
11	0.64
12	0.56
13	0.54
14	0.52
15	0.47
16	0.4
17	0.35
18	0.36
19	0.28
20	0.29
21	0.28
22	0.31
23	0.34
24	0.37
25	0.4
26	0.41
27	0.43
28	0.44
29	0.46
30	0.41
31	0.38
32	0.4
33	0.39
34	0.35
35	0.36
36	0.4
37	0.39
38	0.44
39	0.47
40	0.43
41	0.41
42	0.4
43	0.36
44	0.31
45	0.28
46	0.24
47	0.21
48	0.2
49	0.19
50	0.19
51	0.19
52	0.19
53	0.15
54	0.13
55	0.11
56	0.13
57	0.13
58	0.14
59	0.13
60	0.12
61	0.19
62	0.21
63	0.23
64	0.25
65	0.28
66	0.28
67	0.31
68	0.33
69	0.27
70	0.24
71	0.22
72	0.18
73	0.16
74	0.15
75	0.13
76	0.11
77	0.11
78	0.13
79	0.15
80	0.15
81	0.19
82	0.21
83	0.22
84	0.25
85	0.26
86	0.29
87	0.31
88	0.3
89	0.26
90	0.27
91	0.28
92	0.28
93	0.26
94	0.21
95	0.18
96	0.17
97	0.16
98	0.12
99	0.1
100	0.09
101	0.11
102	0.13
103	0.14
104	0.14
105	0.17
106	0.19
107	0.19
108	0.21
109	0.24
110	0.23
111	0.24
112	0.28
113	0.31
114	0.31
115	0.35
116	0.34
117	0.35
118	0.34
119	0.35
120	0.35
121	0.32
122	0.34
123	0.29
124	0.29
125	0.23
126	0.26
127	0.25
128	0.21
129	0.18
130	0.15
131	0.15
132	0.2
133	0.19
134	0.16
135	0.15
136	0.15
137	0.2
138	0.19
139	0.21
140	0.16
141	0.17
142	0.18
143	0.19
144	0.21
145	0.2
146	0.2
147	0.22
148	0.27
149	0.27
150	0.26
151	0.25
152	0.23
153	0.22
154	0.25
155	0.22
156	0.16
157	0.15
158	0.17
159	0.17
160	0.18
161	0.23
162	0.22
163	0.21
164	0.22
165	0.23
166	0.25
167	0.26
168	0.27
169	0.22
170	0.22
171	0.25
172	0.24
173	0.23
174	0.21
175	0.2
176	0.17
177	0.16
178	0.13
179	0.1
180	0.11
181	0.1
182	0.11
183	0.15
184	0.16
185	0.21
186	0.27
187	0.32
188	0.4
189	0.41
190	0.43
191	0.44
192	0.44
193	0.42
194	0.44
195	0.44
196	0.39
197	0.38
198	0.4
199	0.37
200	0.39
201	0.39
202	0.37
203	0.35
204	0.4
205	0.49
206	0.52
207	0.53
208	0.57
209	0.58
210	0.53
211	0.53
212	0.5
213	0.43
214	0.4
215	0.41
216	0.37
217	0.37
218	0.4
219	0.37
220	0.35
221	0.35
222	0.35
223	0.32
224	0.31
225	0.36
226	0.4
227	0.43
228	0.45
229	0.45
230	0.46
231	0.48
232	0.54
233	0.54
234	0.55
235	0.58
236	0.62
237	0.66
238	0.62
239	0.68
240	0.69
241	0.7
242	0.73
243	0.74
244	0.76
245	0.79
246	0.85
247	0.86
248	0.86
249	0.86
250	0.85
251	0.86
252	0.86
253	0.87
254	0.83
255	0.79
256	0.78
257	0.69
258	0.6
259	0.51
260	0.41
261	0.32
262	0.31
263	0.25
264	0.15
265	0.13
266	0.14
267	0.13
268	0.13
269	0.12
270	0.09
271	0.1
272	0.12
273	0.13
274	0.16
275	0.22
276	0.26
277	0.33
278	0.41
279	0.44
280	0.45
281	0.48
282	0.44
283	0.45
284	0.43
285	0.36
286	0.29
287	0.26
288	0.24
289	0.22
290	0.25
291	0.19
292	0.27
293	0.35
294	0.41
295	0.44
296	0.47
297	0.51
298	0.48
299	0.5
300	0.48
301	0.41
302	0.35
303	0.33
304	0.29
305	0.26
306	0.24
307	0.24
308	0.2
309	0.19
310	0.19
311	0.18
312	0.18
313	0.16
314	0.15
315	0.12
316	0.09
317	0.08
318	0.07
319	0.08
320	0.09
321	0.09
322	0.1
323	0.13
324	0.17
325	0.21
326	0.25
327	0.26
328	0.27
329	0.26
330	0.25
331	0.23
332	0.19
333	0.15
334	0.12
335	0.12
336	0.11
337	0.12
338	0.12
339	0.1
340	0.1
341	0.1
342	0.12
343	0.2
344	0.27
345	0.31
346	0.37
347	0.44
348	0.49
349	0.57
350	0.65
351	0.67
352	0.67
353	0.68
354	0.69
355	0.71
356	0.75
357	0.71
358	0.64
359	0.59
360	0.56
361	0.55
362	0.51
363	0.49
364	0.41
365	0.38
366	0.38
367	0.33
368	0.28
369	0.26
370	0.29
371	0.27
372	0.3
373	0.35
374	0.35
375	0.35
376	0.35
377	0.32
378	0.26
379	0.21
380	0.16
381	0.12
382	0.09
383	0.09
384	0.09
385	0.09
386	0.08
387	0.08
388	0.08
389	0.09
390	0.08
391	0.07
392	0.06
393	0.07
394	0.11
395	0.11
396	0.12
397	0.11
398	0.11
399	0.11
400	0.12
401	0.11
402	0.12
403	0.15
404	0.14
405	0.2
406	0.21
407	0.25
408	0.32
409	0.38
410	0.37
411	0.41
412	0.41
413	0.36
414	0.37
415	0.38
416	0.38
417	0.36
418	0.43
419	0.36
420	0.38
421	0.4
422	0.47
423	0.51
424	0.49
425	0.49
426	0.46
427	0.52
428	0.55
429	0.56
430	0.48
431	0.46
432	0.4
433	0.38
434	0.32
435	0.26
436	0.2
437	0.18
438	0.16
439	0.1
440	0.09
441	0.09
442	0.11
443	0.1
444	0.1
445	0.11
446	0.17
447	0.25
448	0.33
449	0.38
450	0.45
451	0.53
452	0.58
453	0.6
454	0.64
455	0.61
456	0.59
457	0.59
458	0.59
459	0.56
460	0.57
461	0.64
462	0.64
463	0.64
464	0.6
465	0.54
466	0.46
467	0.42
468	0.34
469	0.24
470	0.14
471	0.1
472	0.08
473	0.08
474	0.07
475	0.06
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.04
480	0.04
481	0.04
482	0.05
483	0.06
484	0.09
485	0.12
486	0.12
487	0.13
488	0.13
489	0.13
490	0.12
491	0.12
492	0.1
493	0.07
494	0.06
495	0.07
496	0.07
497	0.1
498	0.13
499	0.14
500	0.15
501	0.16
502	0.19
503	0.23
504	0.25
505	0.27
506	0.28
507	0.32
508	0.33
509	0.32
510	0.29
511	0.25
512	0.22
513	0.17
514	0.13
515	0.07
516	0.05
517	0.05
518	0.04
519	0.05
520	0.05
521	0.05
522	0.05
523	0.06
524	0.06
525	0.06
526	0.06
527	0.06
528	0.05
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.05
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.05
538	0.06
539	0.08
540	0.12
541	0.14
542	0.16
543	0.19
544	0.26
545	0.36
546	0.42
547	0.5
548	0.5
549	0.53
550	0.54
551	0.55
552	0.49
553	0.4
554	0.33
555	0.27
556	0.23
557	0.18
558	0.15
559	0.1
560	0.1
561	0.1
562	0.09
563	0.07
564	0.07
565	0.06
566	0.07
567	0.13
568	0.18
569	0.19
570	0.2
571	0.23
572	0.24
573	0.29
574	0.31
575	0.31
576	0.28
577	0.34
578	0.35
579	0.41
580	0.48
581	0.44
582	0.44
583	0.41
584	0.41
585	0.34
586	0.31
587	0.24
588	0.18
589	0.16
590	0.15
591	0.14
592	0.13
593	0.13
594	0.13
595	0.12
596	0.1
597	0.11
598	0.1
599	0.1
600	0.1
601	0.1
602	0.09
603	0.09
604	0.08
605	0.08
606	0.08
607	0.07
608	0.08
609	0.08
610	0.07
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.09
615	0.09
616	0.1
617	0.1
618	0.1
619	0.11
620	0.13
621	0.13
622	0.14
623	0.14
624	0.12
625	0.15
626	0.16
627	0.2
628	0.25
629	0.3
630	0.34
631	0.4
632	0.45
633	0.48
634	0.56
635	0.56
636	0.54
637	0.53
638	0.53
639	0.56
640	0.53
641	0.52
642	0.47
643	0.51
644	0.54
645	0.53
646	0.51
647	0.46
648	0.46
649	0.46
650	0.49
651	0.48
652	0.5
653	0.53
654	0.55
655	0.56
656	0.58
657	0.59
658	0.62
659	0.65
660	0.65
661	0.68
662	0.66
663	0.68
664	0.69
665	0.63
666	0.62
667	0.57
668	0.57
669	0.56
670	0.57
671	0.51
672	0.51
673	0.51
674	0.48
675	0.46
676	0.47
677	0.47
678	0.47
679	0.47
680	0.49
681	0.51
682	0.48
683	0.46
684	0.38
685	0.36
686	0.32
687	0.32
688	0.29
689	0.25
690	0.24
691	0.22
692	0.2
693	0.16
694	0.19
695	0.18
696	0.17
697	0.21
698	0.23
699	0.25
700	0.28
701	0.3
702	0.37
703	0.39
704	0.41
705	0.38
706	0.35
707	0.33
708	0.33
709	0.28
710	0.21
711	0.23
712	0.27
713	0.3
714	0.39
715	0.44
716	0.42
717	0.47
718	0.47
719	0.48
720	0.43
721	0.38
722	0.32
723	0.27
724	0.29
725	0.24
726	0.23
727	0.17
728	0.2
729	0.23
730	0.22
731	0.28
732	0.32
733	0.35
734	0.4
735	0.49
736	0.55
737	0.64
738	0.72
739	0.73
740	0.78
741	0.76
742	0.76
743	0.74
744	0.73
745	0.67
746	0.61
747	0.53
748	0.44
749	0.45
750	0.43
751	0.38
752	0.32
753	0.28
754	0.25
755	0.32
756	0.34
757	0.33
758	0.4
759	0.4
760	0.45
761	0.45
762	0.53
763	0.5
764	0.55
765	0.62
766	0.64
767	0.64
768	0.57
769	0.58
770	0.53
771	0.52
772	0.45
773	0.35
774	0.26
775	0.27
776	0.27
777	0.25
778	0.23
779	0.2
780	0.18
781	0.22
782	0.29
783	0.27
784	0.3
785	0.3
786	0.32
787	0.33
788	0.35
789	0.33
790	0.24
791	0.21
792	0.24
793	0.25
794	0.26
795	0.3
796	0.31
797	0.37
798	0.42
799	0.47
800	0.51
801	0.56
802	0.59
803	0.59
804	0.6
805	0.54
806	0.49
807	0.44
808	0.35
809	0.3
810	0.25
811	0.2
812	0.2
813	0.19
814	0.19
815	0.2
816	0.2
817	0.2
818	0.18
819	0.18
820	0.16
821	0.16
822	0.17
823	0.16
824	0.18
825	0.16
826	0.17
827	0.17
828	0.21
829	0.27
830	0.28
831	0.32
832	0.38
833	0.41
834	0.46
835	0.46
836	0.43
837	0.41
838	0.43
839	0.45
840	0.4
841	0.38
842	0.34
843	0.37
844	0.33
845	0.29
846	0.31
847	0.25
848	0.29
849	0.34
850	0.39
851	0.42
852	0.49
853	0.55
854	0.58
855	0.66
856	0.64
857	0.61
858	0.56
859	0.52
860	0.5
861	0.43
862	0.37
863	0.28
864	0.23
865	0.19
866	0.2
867	0.2
868	0.19
869	0.21
870	0.21
871	0.23
872	0.23
873	0.24
874	0.26
875	0.26
876	0.3
877	0.36
878	0.38
879	0.43
880	0.46
881	0.46
882	0.46
883	0.47
884	0.43
885	0.41
886	0.37
887	0.32
888	0.29
889	0.3
890	0.26
891	0.25
892	0.22
893	0.17
894	0.17
895	0.18
896	0.2
897	0.25
898	0.3
899	0.35
900	0.39
901	0.46
902	0.51
903	0.59
904	0.66
905	0.71
906	0.75
907	0.79
908	0.83
909	0.83
910	0.77
911	0.69
912	0.6
913	0.55
914	0.53
915	0.5
916	0.41
917	0.4
918	0.4
919	0.4
920	0.39
921	0.36
922	0.31
923	0.26
924	0.28
925	0.28

A0A2Z6RR27

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer