Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1C5X8

Protein Details
Accession A1C5X8    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-137YKEVDEKMDKRRKARREVREQQEREEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-127KRRKARR
Subcellular Location(s) nucl 8.5, mito_nucl 8.333, cyto_mito 7.833, cyto 7.5, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR010491  PRP1_N  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR019734  TPR_repeat  
Gene Ontology GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
KEGG act:ACLA_068260  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06424  PRP1_N  
PF13428  TPR_14  
PF13432  TPR_16  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50005  TPR  
Amino Acid Sequences MSSGRKDFLNQPAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPTPEQIQAALAKRAQLLGAAPPTAYGAGREKGGKEEKEEEEEDERFQDPDNEVGLFAYGQFDQEDDEADRIYKEVDEKMDKRRKARREVREQQEREEYERKNPKIQQQFADLKRSLASVSEDEWANLPEVGDLTGKNRRAKQNLRQRFYAVPDSVIASARDSTQFETTITDDGTQTDARGPEAADGTMTNFANISAARDKVLKVRLDQAARGSTADSASGSATNIDPKGYLTSLTQSELKAGEIEIGDIKRVRVLLESVTKTNPKHAPGWIALARLEELAGRIVAARNIIAKGCELCPKSEDAWLENIRLNEGHNAKVIAANAIKNNDRSTRLWIEAMRLESDTRAKKNVLRQAILHVPQSVTIWKEAVNLEDDPADARLLLAKAVEMIPLSVELWLALARLETPENAQKVLNAARKAVPTSHEVWIAAARLQEQMGTFEKVNVMKRAVQVLARENAMLKREEWIAEAEKCEEEGAILTCGAIIRETLGWGLDEDDDRKDIWMDDAKASIAKGMYETARAIYAYALRIFVNRRSIWLAAADLERNHGTKEALWQVLEKAVEACPQSEELWLQLAKEKWQAGEIDDARRVLGRAFNQNPNNEDIWLAAVKLEADADQTDQARELLSTARREAGTDRVWIKSVAFERQLGNIDEALDLVNQGLQLYPKADKLWMMKGQIYEIQNKYPQAREAYSTGTRACPKSVPLWLLASRLEEKAGAVVKARSVLDRARLAVPKSAELWTESVRVERRANNIGQAKVLMAKALQEVPNSGLLWSESIWYLEPRAQRKARSLEAIKKVDNDPTLFITVARIFWGERRLEKAMTWFEKAIVSDSDLGDGWAWYYKFLLQHGTEEKRADVVAKCISTEPKHGEVWQSVAKDPANARKSTEEILKMVADRLTQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.41
3 0.31
4 0.26
5 0.24
6 0.2
7 0.16
8 0.13
9 0.13
10 0.12
11 0.12
12 0.07
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.15
17 0.15
18 0.16
19 0.2
20 0.23
21 0.25
22 0.29
23 0.3
24 0.29
25 0.32
26 0.34
27 0.32
28 0.38
29 0.37
30 0.32
31 0.31
32 0.28
33 0.26
34 0.3
35 0.3
36 0.26
37 0.24
38 0.26
39 0.25
40 0.26
41 0.24
42 0.19
43 0.17
44 0.18
45 0.2
46 0.18
47 0.17
48 0.17
49 0.18
50 0.17
51 0.16
52 0.13
53 0.15
54 0.16
55 0.19
56 0.22
57 0.22
58 0.29
59 0.37
60 0.36
61 0.37
62 0.43
63 0.44
64 0.47
65 0.47
66 0.43
67 0.41
68 0.4
69 0.35
70 0.3
71 0.28
72 0.22
73 0.21
74 0.22
75 0.18
76 0.2
77 0.2
78 0.18
79 0.17
80 0.16
81 0.16
82 0.11
83 0.1
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.09
90 0.09
91 0.11
92 0.11
93 0.12
94 0.12
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.12
99 0.11
100 0.12
101 0.15
102 0.2
103 0.28
104 0.32
105 0.43
106 0.51
107 0.55
108 0.62
109 0.68
110 0.71
111 0.74
112 0.8
113 0.8
114 0.82
115 0.88
116 0.89
117 0.91
118 0.84
119 0.79
120 0.78
121 0.7
122 0.66
123 0.63
124 0.55
125 0.54
126 0.62
127 0.59
128 0.58
129 0.61
130 0.64
131 0.66
132 0.7
133 0.64
134 0.63
135 0.69
136 0.64
137 0.67
138 0.58
139 0.48
140 0.42
141 0.39
142 0.3
143 0.22
144 0.22
145 0.15
146 0.16
147 0.18
148 0.18
149 0.18
150 0.18
151 0.17
152 0.15
153 0.13
154 0.11
155 0.08
156 0.09
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.12
161 0.19
162 0.24
163 0.3
164 0.37
165 0.44
166 0.53
167 0.62
168 0.68
169 0.73
170 0.78
171 0.77
172 0.73
173 0.68
174 0.63
175 0.59
176 0.57
177 0.47
178 0.37
179 0.33
180 0.31
181 0.28
182 0.26
183 0.2
184 0.13
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.14
189 0.16
190 0.16
191 0.16
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.16
196 0.15
197 0.14
198 0.12
199 0.12
200 0.14
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.13
211 0.1
212 0.09
213 0.1
214 0.14
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.1
219 0.11
220 0.11
221 0.13
222 0.12
223 0.12
224 0.13
225 0.15
226 0.16
227 0.21
228 0.27
229 0.25
230 0.24
231 0.31
232 0.36
233 0.37
234 0.38
235 0.36
236 0.32
237 0.3
238 0.29
239 0.22
240 0.17
241 0.15
242 0.14
243 0.1
244 0.08
245 0.08
246 0.08
247 0.07
248 0.07
249 0.08
250 0.1
251 0.1
252 0.1
253 0.09
254 0.1
255 0.12
256 0.11
257 0.12
258 0.1
259 0.13
260 0.14
261 0.16
262 0.17
263 0.15
264 0.16
265 0.15
266 0.15
267 0.11
268 0.1
269 0.1
270 0.08
271 0.09
272 0.1
273 0.1
274 0.11
275 0.12
276 0.12
277 0.11
278 0.11
279 0.11
280 0.09
281 0.11
282 0.14
283 0.2
284 0.23
285 0.23
286 0.26
287 0.29
288 0.28
289 0.34
290 0.34
291 0.3
292 0.3
293 0.3
294 0.32
295 0.29
296 0.35
297 0.3
298 0.27
299 0.24
300 0.22
301 0.2
302 0.15
303 0.14
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.06
308 0.05
309 0.05
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.07
315 0.08
316 0.09
317 0.08
318 0.09
319 0.1
320 0.11
321 0.17
322 0.16
323 0.17
324 0.18
325 0.2
326 0.21
327 0.22
328 0.22
329 0.17
330 0.23
331 0.23
332 0.24
333 0.23
334 0.22
335 0.19
336 0.18
337 0.18
338 0.17
339 0.17
340 0.17
341 0.16
342 0.16
343 0.15
344 0.17
345 0.16
346 0.12
347 0.12
348 0.13
349 0.13
350 0.16
351 0.17
352 0.17
353 0.19
354 0.2
355 0.22
356 0.22
357 0.27
358 0.28
359 0.28
360 0.29
361 0.27
362 0.27
363 0.26
364 0.25
365 0.2
366 0.17
367 0.15
368 0.14
369 0.2
370 0.21
371 0.2
372 0.22
373 0.22
374 0.25
375 0.33
376 0.39
377 0.37
378 0.34
379 0.33
380 0.36
381 0.4
382 0.38
383 0.32
384 0.25
385 0.21
386 0.2
387 0.2
388 0.16
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.08
393 0.1
394 0.1
395 0.1
396 0.11
397 0.1
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.08
402 0.08
403 0.07
404 0.05
405 0.05
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.05
410 0.05
411 0.05
412 0.06
413 0.06
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.03
426 0.03
427 0.03
428 0.04
429 0.05
430 0.05
431 0.07
432 0.11
433 0.11
434 0.12
435 0.12
436 0.11
437 0.13
438 0.19
439 0.22
440 0.19
441 0.19
442 0.21
443 0.22
444 0.22
445 0.21
446 0.17
447 0.16
448 0.18
449 0.19
450 0.17
451 0.16
452 0.16
453 0.16
454 0.14
455 0.12
456 0.09
457 0.08
458 0.07
459 0.07
460 0.08
461 0.07
462 0.09
463 0.1
464 0.11
465 0.1
466 0.1
467 0.12
468 0.14
469 0.17
470 0.16
471 0.16
472 0.17
473 0.17
474 0.19
475 0.18
476 0.17
477 0.17
478 0.19
479 0.19
480 0.16
481 0.15
482 0.14
483 0.15
484 0.15
485 0.14
486 0.11
487 0.11
488 0.12
489 0.12
490 0.12
491 0.12
492 0.13
493 0.14
494 0.14
495 0.13
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.09
500 0.06
501 0.06
502 0.06
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.05
507 0.05
508 0.05
509 0.04
510 0.03
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.04
516 0.05
517 0.05
518 0.06
519 0.05
520 0.06
521 0.07
522 0.08
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.12
530 0.13
531 0.13
532 0.14
533 0.14
534 0.14
535 0.13
536 0.12
537 0.08
538 0.06
539 0.06
540 0.07
541 0.08
542 0.08
543 0.09
544 0.08
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.07
549 0.08
550 0.09
551 0.09
552 0.09
553 0.09
554 0.11
555 0.13
556 0.16
557 0.21
558 0.19
559 0.21
560 0.23
561 0.23
562 0.22
563 0.2
564 0.17
565 0.13
566 0.14
567 0.13
568 0.1
569 0.12
570 0.12
571 0.12
572 0.12
573 0.11
574 0.1
575 0.1
576 0.15
577 0.17
578 0.17
579 0.17
580 0.17
581 0.17
582 0.19
583 0.18
584 0.13
585 0.1
586 0.09
587 0.12
588 0.12
589 0.12
590 0.1
591 0.11
592 0.12
593 0.11
594 0.11
595 0.09
596 0.11
597 0.11
598 0.1
599 0.13
600 0.14
601 0.15
602 0.18
603 0.19
604 0.16
605 0.18
606 0.18
607 0.15
608 0.23
609 0.23
610 0.22
611 0.23
612 0.23
613 0.21
614 0.21
615 0.2
616 0.13
617 0.15
618 0.15
619 0.23
620 0.28
621 0.36
622 0.4
623 0.42
624 0.43
625 0.42
626 0.39
627 0.31
628 0.26
629 0.18
630 0.16
631 0.13
632 0.11
633 0.07
634 0.07
635 0.06
636 0.06
637 0.06
638 0.04
639 0.05
640 0.06
641 0.07
642 0.09
643 0.09
644 0.09
645 0.1
646 0.1
647 0.09
648 0.08
649 0.08
650 0.11
651 0.14
652 0.16
653 0.17
654 0.2
655 0.19
656 0.21
657 0.22
658 0.23
659 0.22
660 0.25
661 0.26
662 0.24
663 0.25
664 0.25
665 0.23
666 0.22
667 0.23
668 0.22
669 0.22
670 0.23
671 0.23
672 0.25
673 0.28
674 0.24
675 0.22
676 0.18
677 0.17
678 0.15
679 0.14
680 0.11
681 0.08
682 0.07
683 0.05
684 0.05
685 0.05
686 0.05
687 0.05
688 0.05
689 0.06
690 0.09
691 0.1
692 0.11
693 0.12
694 0.13
695 0.16
696 0.19
697 0.26
698 0.28
699 0.29
700 0.3
701 0.3
702 0.31
703 0.33
704 0.32
705 0.32
706 0.29
707 0.31
708 0.32
709 0.34
710 0.35
711 0.32
712 0.34
713 0.31
714 0.31
715 0.3
716 0.29
717 0.32
718 0.31
719 0.31
720 0.28
721 0.28
722 0.32
723 0.3
724 0.3
725 0.26
726 0.26
727 0.29
728 0.32
729 0.29
730 0.27
731 0.3
732 0.29
733 0.29
734 0.27
735 0.26
736 0.23
737 0.22
738 0.2
739 0.16
740 0.14
741 0.16
742 0.17
743 0.14
744 0.14
745 0.15
746 0.15
747 0.18
748 0.19
749 0.16
750 0.17
751 0.2
752 0.24
753 0.25
754 0.27
755 0.29
756 0.33
757 0.33
758 0.35
759 0.34
760 0.3
761 0.29
762 0.28
763 0.23
764 0.21
765 0.22
766 0.19
767 0.21
768 0.19
769 0.22
770 0.24
771 0.28
772 0.31
773 0.32
774 0.36
775 0.4
776 0.4
777 0.44
778 0.46
779 0.43
780 0.39
781 0.35
782 0.3
783 0.27
784 0.25
785 0.18
786 0.12
787 0.12
788 0.13
789 0.18
790 0.19
791 0.16
792 0.18
793 0.19
794 0.22
795 0.21
796 0.18
797 0.14
798 0.13
799 0.13
800 0.12
801 0.12
802 0.09
803 0.1
804 0.11
805 0.11
806 0.13
807 0.16
808 0.22
809 0.26
810 0.35
811 0.39
812 0.43
813 0.5
814 0.56
815 0.57
816 0.6
817 0.63
818 0.63
819 0.67
820 0.69
821 0.62
822 0.59
823 0.55
824 0.52
825 0.48
826 0.4
827 0.33
828 0.3
829 0.3
830 0.26
831 0.24
832 0.22
833 0.2
834 0.18
835 0.17
836 0.14
837 0.13
838 0.17
839 0.23
840 0.23
841 0.25
842 0.31
843 0.33
844 0.34
845 0.35
846 0.38
847 0.42
848 0.42
849 0.42
850 0.37
851 0.35
852 0.36
853 0.35
854 0.3
855 0.22
856 0.21
857 0.2
858 0.19
859 0.2
860 0.17
861 0.17
862 0.14
863 0.13
864 0.11
865 0.13
866 0.13
867 0.11
868 0.13
869 0.15
870 0.17
871 0.19
872 0.25
873 0.21
874 0.28
875 0.36
876 0.41
877 0.42
878 0.41
879 0.4
880 0.35
881 0.34
882 0.31
883 0.25
884 0.25
885 0.27
886 0.26
887 0.27
888 0.29
889 0.35
890 0.34
891 0.39
892 0.4
893 0.38
894 0.4
895 0.41
896 0.43
897 0.38
898 0.41
899 0.39
900 0.35
901 0.32
902 0.34
903 0.33
904 0.32
905 0.35
906 0.4
907 0.4
908 0.39
909 0.42
910 0.42
911 0.45
912 0.45
913 0.47
914 0.4
915 0.36
916 0.38
917 0.37
918 0.33
919 0.32