Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A2Z6SDS2

Protein Details
Accession A0A2Z6SDS2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-296NPDGSRCKLGPPKKKKPRSFIRYFSADHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
280-287PPKKKKPR
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 13.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045072  MKRN-like  
IPR041367  Znf-CCCH_4  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
IPR017907  Znf_RING_CS  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0061630  F:ubiquitin protein ligase activity  
GO:0000209  P:protein polyubiquitination  
Pfam View protein in Pfam  
PF13920  zf-C3HC4_3  
PF14608  zf-CCCH_2  
PF18044  zf-CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
PS00518  ZF_RING_1  
PS50089  ZF_RING_2  
Amino Acid Sequences MSSHRVNASSSRTLCRYFANGNCRNGPNCHYLHTREGNSPHNRSRDGDEQNSNNIGGSSSSTLHKSNSNSNYRRSNSSNNGSSTHTRHTVTLNNRVPPENLLVCKYFLEDRCMFGDSCWYKHEKPNNTKGNNTVDSHENDLTNQNQKDKQKAKEVVVEDEYTCAICYDTPKTFGLLIHCDHIFCRDCIQVWRKTSNVSSPFQDVDTTKTCPVCRKNSPYIVPSPRYAKSGPQKEKVISTYKEKISQIPCKYFEGNGKCPFADECFYKHANPDGSRCKLGPPKKKKPRSFIRYFSADGDLDLSAISEIIDGFQLNIADWDDEEEGSWDDDDDDDEELYFQRHGSTDWSSNSNGWSWGIETNNVLDHDEECPADWRNIY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.42
3 0.4
4 0.39
5 0.44
6 0.48
7 0.52
8 0.55
9 0.6
10 0.61
11 0.59
12 0.55
13 0.53
14 0.5
15 0.44
16 0.44
17 0.43
18 0.43
19 0.49
20 0.52
21 0.5
22 0.5
23 0.53
24 0.57
25 0.59
26 0.63
27 0.61
28 0.6
29 0.59
30 0.55
31 0.57
32 0.57
33 0.56
34 0.56
35 0.56
36 0.53
37 0.55
38 0.53
39 0.46
40 0.37
41 0.29
42 0.22
43 0.15
44 0.14
45 0.12
46 0.12
47 0.14
48 0.16
49 0.17
50 0.19
51 0.23
52 0.24
53 0.31
54 0.39
55 0.47
56 0.49
57 0.55
58 0.62
59 0.61
60 0.64
61 0.6
62 0.6
63 0.58
64 0.63
65 0.62
66 0.55
67 0.54
68 0.52
69 0.51
70 0.46
71 0.42
72 0.38
73 0.33
74 0.32
75 0.33
76 0.36
77 0.38
78 0.44
79 0.45
80 0.45
81 0.46
82 0.46
83 0.44
84 0.38
85 0.37
86 0.31
87 0.27
88 0.25
89 0.24
90 0.23
91 0.23
92 0.22
93 0.22
94 0.19
95 0.25
96 0.23
97 0.24
98 0.25
99 0.27
100 0.25
101 0.2
102 0.28
103 0.22
104 0.23
105 0.24
106 0.27
107 0.28
108 0.35
109 0.44
110 0.44
111 0.52
112 0.6
113 0.67
114 0.65
115 0.65
116 0.63
117 0.62
118 0.56
119 0.48
120 0.4
121 0.34
122 0.33
123 0.35
124 0.31
125 0.23
126 0.2
127 0.22
128 0.22
129 0.25
130 0.25
131 0.25
132 0.29
133 0.32
134 0.4
135 0.44
136 0.46
137 0.49
138 0.53
139 0.51
140 0.52
141 0.52
142 0.46
143 0.41
144 0.37
145 0.28
146 0.23
147 0.21
148 0.14
149 0.12
150 0.08
151 0.06
152 0.05
153 0.07
154 0.1
155 0.11
156 0.14
157 0.14
158 0.15
159 0.16
160 0.16
161 0.17
162 0.16
163 0.16
164 0.15
165 0.15
166 0.14
167 0.13
168 0.16
169 0.15
170 0.12
171 0.14
172 0.12
173 0.13
174 0.19
175 0.25
176 0.26
177 0.28
178 0.3
179 0.28
180 0.3
181 0.3
182 0.32
183 0.31
184 0.27
185 0.26
186 0.25
187 0.25
188 0.24
189 0.24
190 0.17
191 0.17
192 0.18
193 0.18
194 0.18
195 0.2
196 0.2
197 0.26
198 0.31
199 0.34
200 0.39
201 0.45
202 0.5
203 0.55
204 0.57
205 0.54
206 0.57
207 0.56
208 0.5
209 0.45
210 0.43
211 0.37
212 0.37
213 0.34
214 0.34
215 0.37
216 0.45
217 0.49
218 0.5
219 0.53
220 0.51
221 0.53
222 0.5
223 0.47
224 0.39
225 0.39
226 0.4
227 0.39
228 0.43
229 0.41
230 0.43
231 0.44
232 0.5
233 0.49
234 0.48
235 0.48
236 0.46
237 0.47
238 0.43
239 0.44
240 0.42
241 0.44
242 0.43
243 0.42
244 0.38
245 0.38
246 0.36
247 0.31
248 0.27
249 0.21
250 0.19
251 0.22
252 0.24
253 0.24
254 0.25
255 0.28
256 0.3
257 0.31
258 0.36
259 0.39
260 0.41
261 0.42
262 0.41
263 0.43
264 0.45
265 0.52
266 0.56
267 0.58
268 0.66
269 0.75
270 0.85
271 0.87
272 0.89
273 0.91
274 0.9
275 0.88
276 0.85
277 0.81
278 0.75
279 0.68
280 0.6
281 0.53
282 0.43
283 0.33
284 0.27
285 0.2
286 0.14
287 0.12
288 0.1
289 0.06
290 0.06
291 0.05
292 0.04
293 0.04
294 0.04
295 0.05
296 0.04
297 0.05
298 0.06
299 0.06
300 0.06
301 0.07
302 0.08
303 0.08
304 0.08
305 0.1
306 0.1
307 0.1
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.11
312 0.11
313 0.09
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.09
323 0.1
324 0.09
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.1
329 0.14
330 0.2
331 0.24
332 0.27
333 0.3
334 0.31
335 0.31
336 0.32
337 0.29
338 0.25
339 0.2
340 0.18
341 0.16
342 0.19
343 0.19
344 0.19
345 0.19
346 0.19
347 0.22
348 0.21
349 0.2
350 0.17
351 0.17
352 0.17
353 0.18
354 0.16
355 0.14
356 0.17
357 0.18