Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A1CHS7

Protein Details
Accession A1CHS7    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
131-154DESEKWDKRMEKKQRHRDNVAFQDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
245-254VRLKKRKERR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG act:ACLA_049040  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPLERGNEQSAAKPSDDVAADQPASSKESQPEVLSEEPPAELKEESKENDAAAKARQRQERFKALQARAKNATERNLKETAAETQRLATDPTLLSSLSRKHAFASHNLLKADTEASGEDFERKRAWDWTVDESEKWDKRMEKKQRHRDNVAFQDYTQDARKVYKRQLREMQPDLEAYERDKMTAIEKAAANGDLEIVETNDGEMIAVDKNGTFYSTADTVGFTDNKPDRSGVDKLVADLRKAEEVRLKKRKERRGEEEADVTYINEKNKQFNQKLARFYNKTLPMKGQPAQTPADACYLAAEHQLDVTNLAKCFAPISAEAASKHALSPKSGCQILYLLCSHCTANGFVFQCLHDSIGHKIHLEWLIYHSTKKPKLVANERIELRGNKPTQCDRQREFPARIIHKRWSDEDASQVR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.29
3 0.28
4 0.25
5 0.21
6 0.23
7 0.23
8 0.22
9 0.23
10 0.2
11 0.23
12 0.23
13 0.24
14 0.22
15 0.27
16 0.29
17 0.28
18 0.29
19 0.3
20 0.31
21 0.27
22 0.24
23 0.21
24 0.19
25 0.19
26 0.18
27 0.15
28 0.12
29 0.13
30 0.17
31 0.21
32 0.23
33 0.26
34 0.27
35 0.25
36 0.29
37 0.29
38 0.26
39 0.27
40 0.33
41 0.37
42 0.44
43 0.52
44 0.55
45 0.63
46 0.69
47 0.73
48 0.69
49 0.7
50 0.72
51 0.71
52 0.71
53 0.66
54 0.65
55 0.61
56 0.59
57 0.57
58 0.51
59 0.53
60 0.55
61 0.53
62 0.51
63 0.48
64 0.45
65 0.4
66 0.37
67 0.37
68 0.33
69 0.31
70 0.26
71 0.25
72 0.27
73 0.26
74 0.26
75 0.18
76 0.16
77 0.14
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.13
82 0.15
83 0.19
84 0.21
85 0.23
86 0.22
87 0.23
88 0.29
89 0.3
90 0.32
91 0.38
92 0.38
93 0.41
94 0.41
95 0.39
96 0.34
97 0.32
98 0.28
99 0.18
100 0.12
101 0.08
102 0.09
103 0.1
104 0.1
105 0.15
106 0.15
107 0.16
108 0.17
109 0.18
110 0.19
111 0.21
112 0.23
113 0.23
114 0.26
115 0.3
116 0.35
117 0.35
118 0.33
119 0.33
120 0.4
121 0.35
122 0.34
123 0.32
124 0.32
125 0.39
126 0.49
127 0.56
128 0.59
129 0.68
130 0.78
131 0.84
132 0.87
133 0.86
134 0.83
135 0.81
136 0.79
137 0.74
138 0.64
139 0.53
140 0.49
141 0.41
142 0.36
143 0.29
144 0.21
145 0.16
146 0.2
147 0.26
148 0.27
149 0.36
150 0.4
151 0.42
152 0.49
153 0.57
154 0.61
155 0.63
156 0.62
157 0.55
158 0.5
159 0.46
160 0.38
161 0.3
162 0.22
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.13
167 0.13
168 0.13
169 0.13
170 0.15
171 0.15
172 0.13
173 0.14
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.12
178 0.09
179 0.09
180 0.05
181 0.05
182 0.05
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.03
191 0.04
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.07
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.08
210 0.14
211 0.16
212 0.17
213 0.18
214 0.18
215 0.17
216 0.21
217 0.23
218 0.18
219 0.21
220 0.19
221 0.19
222 0.25
223 0.25
224 0.2
225 0.19
226 0.19
227 0.18
228 0.18
229 0.19
230 0.19
231 0.25
232 0.36
233 0.44
234 0.47
235 0.51
236 0.61
237 0.68
238 0.73
239 0.75
240 0.73
241 0.73
242 0.74
243 0.69
244 0.64
245 0.54
246 0.45
247 0.36
248 0.28
249 0.21
250 0.18
251 0.16
252 0.18
253 0.18
254 0.23
255 0.3
256 0.39
257 0.38
258 0.44
259 0.53
260 0.53
261 0.6
262 0.6
263 0.63
264 0.57
265 0.58
266 0.59
267 0.58
268 0.56
269 0.5
270 0.48
271 0.44
272 0.46
273 0.47
274 0.43
275 0.37
276 0.37
277 0.37
278 0.34
279 0.3
280 0.26
281 0.25
282 0.19
283 0.16
284 0.13
285 0.11
286 0.11
287 0.12
288 0.11
289 0.08
290 0.09
291 0.1
292 0.1
293 0.11
294 0.12
295 0.13
296 0.12
297 0.13
298 0.12
299 0.12
300 0.12
301 0.11
302 0.11
303 0.08
304 0.12
305 0.14
306 0.16
307 0.16
308 0.18
309 0.18
310 0.17
311 0.17
312 0.19
313 0.18
314 0.18
315 0.22
316 0.25
317 0.3
318 0.31
319 0.3
320 0.26
321 0.28
322 0.26
323 0.26
324 0.23
325 0.18
326 0.18
327 0.19
328 0.18
329 0.17
330 0.17
331 0.15
332 0.14
333 0.19
334 0.2
335 0.19
336 0.21
337 0.19
338 0.2
339 0.19
340 0.19
341 0.15
342 0.15
343 0.19
344 0.23
345 0.24
346 0.22
347 0.22
348 0.26
349 0.27
350 0.26
351 0.22
352 0.21
353 0.27
354 0.27
355 0.3
356 0.31
357 0.38
358 0.41
359 0.45
360 0.48
361 0.47
362 0.56
363 0.64
364 0.68
365 0.65
366 0.69
367 0.66
368 0.64
369 0.62
370 0.55
371 0.49
372 0.48
373 0.45
374 0.41
375 0.46
376 0.52
377 0.58
378 0.64
379 0.69
380 0.65
381 0.7
382 0.76
383 0.78
384 0.74
385 0.7
386 0.71
387 0.71
388 0.75
389 0.71
390 0.69
391 0.68
392 0.69
393 0.65
394 0.61
395 0.57
396 0.5