FuNGI

A1CC45

Protein Details

Accession

A1CC45

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
21-50	MMRIRRPKVADPLVRPKKRPVPNPAGPSKS	Hydrophilic
134-154	ESQFTRPVRLQRRDPRAKTQE	Hydrophilic
421-440	RVLGKKVRKALKKREKNYDY	Basic
520-543	SGTDTSRKKVKNKHPSTQPPSQTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
12-44	PPTRSQGAPMMRIRRPKVADPLVRPKKRPVPNP
413-436	EKREREARRVLGKKVRKALKKREK
490-510	SGRAKHIDALKKGPAAAPRKR

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 3, cyto 3, cyto_mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	act:ACLA_060570 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MTLPSNDPKPRPPTRSQGAPMMRIRRPKVADPLVRPKKRPVPNPAGPSKSSSGTTAKPMTSRPGFSNVKPSAQLENPIFAAPKNDFTVNGFSGHLLTDTYVDYPVVTTKRALREGLKHHIARFASKKPIDPRDESQFTRPVRLQRRDPRAKTQEINQDKDGQPTQKFTSHFGQQLGEAEREELEARKLAREKERAENLAQIAPSAGSAPKRANAPKQKTQQVSKTDMTPEEIARTRIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGNYEAALSETHAVFIPEDGKMRMIPVEKWYKFSAKNQFRALTIEEAERFMAKKVKDPRWFMEKQQEQAQRKELEQFAKQRKVYAGKQGTPAGADGLEAGEMDFEEDRFADDEEHDDLFNEDEETKAAEKRIKQDQLKANVFDLKDEKEYEEEELREKREREARRVLGKKVRKALKKREKNYDYSSGSDANPYSDEESSDESEAERLKEEERKAEEEKNKKEQGQSSKGNVTPSGRAKHIDALKKGPAAAPRKRLGSPNVSDASGTDTSRKKVKNKHPSTQPPSQTSSRVLSPAAPSGQAGKKRVRNMSGGVAGSVSDADGGAGSGAEMSESGKIKKLKLNPPLGISQNGTPQGSRAGSPTPLGGKGLSGSRASSPDSLGGHNRVSTPGPSGNLSFPTPAEIHAAIPQSGILSSDLLRIFRPRIGESKENHRKFIAIVKDVGVYGKEDRLLRPGTLKPGQK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.76
3	0.72
4	0.73
5	0.69
6	0.7
7	0.7
8	0.69
9	0.66
10	0.65
11	0.65
12	0.64
13	0.63
14	0.62
15	0.65
16	0.66
17	0.69
18	0.69
19	0.76
20	0.78
21	0.8
22	0.77
23	0.76
24	0.76
25	0.77
26	0.77
27	0.76
28	0.76
29	0.78
30	0.84
31	0.83
32	0.79
33	0.71
34	0.67
35	0.6
36	0.52
37	0.44
38	0.39
39	0.35
40	0.32
41	0.37
42	0.37
43	0.35
44	0.35
45	0.36
46	0.41
47	0.41
48	0.42
49	0.38
50	0.42
51	0.45
52	0.44
53	0.52
54	0.46
55	0.45
56	0.44
57	0.43
58	0.4
59	0.38
60	0.43
61	0.34
62	0.34
63	0.31
64	0.3
65	0.28
66	0.22
67	0.24
68	0.19
69	0.21
70	0.21
71	0.21
72	0.2
73	0.23
74	0.29
75	0.25
76	0.25
77	0.21
78	0.19
79	0.18
80	0.18
81	0.15
82	0.09
83	0.09
84	0.08
85	0.09
86	0.09
87	0.09
88	0.09
89	0.09
90	0.09
91	0.14
92	0.14
93	0.14
94	0.16
95	0.22
96	0.28
97	0.31
98	0.34
99	0.35
100	0.42
101	0.48
102	0.54
103	0.57
104	0.53
105	0.51
106	0.54
107	0.49
108	0.49
109	0.48
110	0.45
111	0.46
112	0.46
113	0.52
114	0.54
115	0.62
116	0.61
117	0.61
118	0.6
119	0.6
120	0.64
121	0.59
122	0.56
123	0.54
124	0.49
125	0.49
126	0.48
127	0.48
128	0.52
129	0.57
130	0.62
131	0.65
132	0.75
133	0.79
134	0.81
135	0.82
136	0.8
137	0.79
138	0.72
139	0.7
140	0.7
141	0.66
142	0.66
143	0.57
144	0.57
145	0.51
146	0.53
147	0.49
148	0.44
149	0.39
150	0.38
151	0.39
152	0.37
153	0.37
154	0.36
155	0.37
156	0.37
157	0.38
158	0.35
159	0.32
160	0.28
161	0.32
162	0.3
163	0.25
164	0.2
165	0.17
166	0.15
167	0.16
168	0.16
169	0.12
170	0.1
171	0.13
172	0.13
173	0.18
174	0.22
175	0.26
176	0.34
177	0.4
178	0.43
179	0.49
180	0.55
181	0.52
182	0.5
183	0.49
184	0.42
185	0.38
186	0.33
187	0.24
188	0.18
189	0.15
190	0.13
191	0.1
192	0.1
193	0.08
194	0.11
195	0.12
196	0.14
197	0.2
198	0.24
199	0.33
200	0.42
201	0.49
202	0.56
203	0.63
204	0.69
205	0.7
206	0.72
207	0.7
208	0.66
209	0.64
210	0.57
211	0.52
212	0.46
213	0.41
214	0.37
215	0.31
216	0.26
217	0.24
218	0.24
219	0.23
220	0.23
221	0.23
222	0.21
223	0.21
224	0.22
225	0.19
226	0.2
227	0.24
228	0.25
229	0.28
230	0.27
231	0.26
232	0.25
233	0.24
234	0.21
235	0.17
236	0.18
237	0.18
238	0.19
239	0.18
240	0.18
241	0.18
242	0.18
243	0.16
244	0.13
245	0.09
246	0.08
247	0.09
248	0.08
249	0.08
250	0.08
251	0.07
252	0.08
253	0.07
254	0.07
255	0.07
256	0.07
257	0.07
258	0.07
259	0.08
260	0.07
261	0.08
262	0.08
263	0.09
264	0.08
265	0.09
266	0.11
267	0.11
268	0.12
269	0.17
270	0.27
271	0.27
272	0.3
273	0.32
274	0.34
275	0.35
276	0.42
277	0.46
278	0.44
279	0.5
280	0.51
281	0.5
282	0.46
283	0.46
284	0.4
285	0.31
286	0.25
287	0.21
288	0.16
289	0.16
290	0.15
291	0.13
292	0.12
293	0.11
294	0.14
295	0.13
296	0.19
297	0.28
298	0.37
299	0.44
300	0.48
301	0.5
302	0.54
303	0.56
304	0.52
305	0.53
306	0.48
307	0.43
308	0.48
309	0.52
310	0.47
311	0.48
312	0.51
313	0.42
314	0.39
315	0.41
316	0.35
317	0.3
318	0.32
319	0.37
320	0.39
321	0.45
322	0.44
323	0.42
324	0.42
325	0.45
326	0.42
327	0.44
328	0.41
329	0.37
330	0.4
331	0.39
332	0.36
333	0.3
334	0.27
335	0.17
336	0.12
337	0.09
338	0.06
339	0.04
340	0.04
341	0.03
342	0.03
343	0.03
344	0.02
345	0.03
346	0.03
347	0.03
348	0.03
349	0.03
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.05
355	0.07
356	0.09
357	0.09
358	0.08
359	0.08
360	0.08
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.08
370	0.09
371	0.12
372	0.15
373	0.2
374	0.28
375	0.34
376	0.36
377	0.43
378	0.49
379	0.54
380	0.55
381	0.51
382	0.44
383	0.4
384	0.38
385	0.32
386	0.26
387	0.19
388	0.17
389	0.17
390	0.16
391	0.14
392	0.15
393	0.15
394	0.15
395	0.14
396	0.16
397	0.18
398	0.2
399	0.23
400	0.24
401	0.26
402	0.32
403	0.36
404	0.39
405	0.46
406	0.5
407	0.55
408	0.59
409	0.6
410	0.61
411	0.64
412	0.63
413	0.62
414	0.64
415	0.63
416	0.68
417	0.73
418	0.75
419	0.78
420	0.79
421	0.82
422	0.79
423	0.77
424	0.74
425	0.71
426	0.63
427	0.54
428	0.5
429	0.41
430	0.36
431	0.31
432	0.25
433	0.17
434	0.15
435	0.13
436	0.13
437	0.11
438	0.11
439	0.11
440	0.13
441	0.14
442	0.14
443	0.13
444	0.11
445	0.12
446	0.13
447	0.12
448	0.1
449	0.1
450	0.12
451	0.17
452	0.19
453	0.23
454	0.26
455	0.3
456	0.32
457	0.4
458	0.46
459	0.49
460	0.55
461	0.58
462	0.58
463	0.56
464	0.58
465	0.57
466	0.59
467	0.58
468	0.56
469	0.52
470	0.53
471	0.53
472	0.49
473	0.44
474	0.37
475	0.35
476	0.35
477	0.34
478	0.3
479	0.29
480	0.29
481	0.34
482	0.38
483	0.39
484	0.36
485	0.38
486	0.39
487	0.39
488	0.38
489	0.33
490	0.34
491	0.35
492	0.39
493	0.42
494	0.42
495	0.45
496	0.47
497	0.49
498	0.47
499	0.47
500	0.44
501	0.43
502	0.41
503	0.37
504	0.35
505	0.3
506	0.3
507	0.24
508	0.21
509	0.2
510	0.21
511	0.24
512	0.31
513	0.37
514	0.39
515	0.47
516	0.58
517	0.64
518	0.7
519	0.77
520	0.8
521	0.86
522	0.85
523	0.84
524	0.8
525	0.74
526	0.71
527	0.64
528	0.56
529	0.49
530	0.45
531	0.37
532	0.32
533	0.28
534	0.24
535	0.23
536	0.24
537	0.22
538	0.19
539	0.17
540	0.22
541	0.26
542	0.29
543	0.32
544	0.36
545	0.41
546	0.48
547	0.54
548	0.52
549	0.5
550	0.48
551	0.5
552	0.47
553	0.4
554	0.33
555	0.27
556	0.23
557	0.19
558	0.16
559	0.09
560	0.04
561	0.04
562	0.04
563	0.03
564	0.03
565	0.03
566	0.03
567	0.03
568	0.03
569	0.03
570	0.03
571	0.03
572	0.04
573	0.08
574	0.1
575	0.11
576	0.17
577	0.2
578	0.24
579	0.31
580	0.39
581	0.45
582	0.53
583	0.61
584	0.58
585	0.59
586	0.61
587	0.57
588	0.51
589	0.44
590	0.37
591	0.34
592	0.34
593	0.31
594	0.25
595	0.23
596	0.25
597	0.24
598	0.22
599	0.18
600	0.18
601	0.19
602	0.2
603	0.22
604	0.2
605	0.19
606	0.2
607	0.17
608	0.15
609	0.16
610	0.18
611	0.17
612	0.15
613	0.16
614	0.18
615	0.2
616	0.22
617	0.21
618	0.2
619	0.21
620	0.22
621	0.24
622	0.26
623	0.27
624	0.26
625	0.26
626	0.26
627	0.24
628	0.25
629	0.23
630	0.23
631	0.23
632	0.23
633	0.24
634	0.25
635	0.26
636	0.27
637	0.27
638	0.23
639	0.2
640	0.22
641	0.2
642	0.19
643	0.2
644	0.18
645	0.18
646	0.21
647	0.23
648	0.19
649	0.18
650	0.17
651	0.14
652	0.13
653	0.13
654	0.09
655	0.09
656	0.09
657	0.14
658	0.16
659	0.16
660	0.17
661	0.2
662	0.22
663	0.23
664	0.27
665	0.26
666	0.32
667	0.39
668	0.45
669	0.46
670	0.55
671	0.64
672	0.63
673	0.62
674	0.55
675	0.49
676	0.44
677	0.48
678	0.45
679	0.38
680	0.36
681	0.35
682	0.35
683	0.34
684	0.33
685	0.25
686	0.19
687	0.18
688	0.19
689	0.21
690	0.22
691	0.23
692	0.29
693	0.31
694	0.3
695	0.33
696	0.35
697	0.4

A1CC45

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer