FuNGI

A0A2Z6RWM4

Protein Details

Accession

A0A2Z6RWM4

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
58-84	DDDYEDDKRRDRKRHKGNKNDSSKFIL	Basic
246-265	LYSSKKFIKRLSPKEKQDLM	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
65-75	KRRDRKRHKGN
642-658	NHHRGGRGRDRGRGRGR

Subcellular Location(s)

nucl 25.5, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR005824 KOW IPR005100 NGN-domain IPR036735 NGN_dom_sf IPR014722 Rib_L2_dom2 IPR039659 SPT5 IPR024945 Spt5_C_dom IPR022581 Spt5_N IPR008991 Translation_prot_SH3-like_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003746 F:translation elongation factor activity GO:0032784 P:regulation of DNA-templated transcription elongation GO:0006357 P:regulation of transcription by RNA polymerase II
Pfam	View protein in Pfam PF12815 CTD PF03439 Spt5-NGN PF11942 Spt5_N

Amino Acid Sequences

MSKRKQNLSDDDESRLNETDGGWSAGEEGEEATQDQNEEYDDYDDYEQESEGLEEDEDDDYEDDKRRDRKRHKGNKNDSSKFILNEADVDDEEEEEEEDEDAIFGREDFIDNREIETELSAYHRDSTRHADMHIERSVFEEENFDAERVAQVLNERYRRAAGRLSDDDDDLTKPELASVDKLFAVKCRKGHVYHAIDKLENLKKLRSDPLKIKKVIAIDGIEDFVYIEADKEQDVQNAAMRCNKYLYSSKKFIKRLSPKEKQDLMAPKRPRLNIQMGSFVRINKRDEYYGDLARVTSYTIDELIEVEIIPRILVDQDGASLKRKRKDTDTYIKTYNRGYLKVKYKVKDLVYSNMDLLLQDVEDFLKAKFDNETIMMELSNVASKITVYEIQDEIKVLQGSLKGSVGTVTSVNDGVLTATDKDNSSKVFKVNSEECVKNINVHDYVQITNGPYQGQSGFVFNCDRHVMTMYLDHTNKQISIFAKDIKKCVQNSINNEFGGFRYFDLILLKDSSVGIIIDIRKAQKNYEYDVLNTENSLIKNVTAARIDKTLIDTKSQAFKKSDQVTTTKLESINNKQQSIYEVFRIYDSNIFVRTYDDDTNLGFSCFKAKDLKLKYESMRSSNNRVHDPIINIPGQRSRGSNNHHRGGRGRDRGRGRGRHIYQNPLLNKRVQASQGALKGYQGTVKGVYGNMADVEFDAKLTTIKVELGQLFYVNEKGEALDPVLPRNHDSSRNSMDMSSGLGSYSEPSWTTGLSKQQKSWGYSLGSAMTPNSHLLDNTNSGLNMEGSKTPALLHSGGSLSGSKTPALRNSSANSNNSASLGSKTPAWDLGSKTPAYGIMSDGRDGSKTPAWDSGSHTPHSSGIVGSGGSTSGNNSANSISNIFGGSGNSTTNATNSAMNMAPAETPGGYSTVATPAADVPNYPPVFTPANTSNLMPPTPRPFTPGNIPMTPANMVPQTPFATQHSANHAIHPGRDPKKPPDVKDFGEWLTPGIEVRIVPLDGIQSFENGRYDNRVGVVVRLERPNSGFIKLDESDGMTISVEQKYLKPTEVQRRDDIKVIFGEHKGELGFLAAIDNLEGVVRSQGGDHSFINIYYLAKYRGSEIEDLMQIS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.4
3	0.32
4	0.24
5	0.21
6	0.2
7	0.19
8	0.19
9	0.16
10	0.15
11	0.15
12	0.15
13	0.14
14	0.1
15	0.09
16	0.08
17	0.08
18	0.09
19	0.09
20	0.09
21	0.1
22	0.1
23	0.09
24	0.1
25	0.11
26	0.11
27	0.12
28	0.12
29	0.15
30	0.15
31	0.15
32	0.15
33	0.15
34	0.13
35	0.12
36	0.12
37	0.09
38	0.09
39	0.09
40	0.08
41	0.07
42	0.09
43	0.1
44	0.09
45	0.1
46	0.1
47	0.1
48	0.13
49	0.19
50	0.19
51	0.26
52	0.35
53	0.43
54	0.53
55	0.63
56	0.71
57	0.77
58	0.86
59	0.9
60	0.92
61	0.94
62	0.94
63	0.94
64	0.9
65	0.83
66	0.8
67	0.72
68	0.62
69	0.54
70	0.45
71	0.35
72	0.3
73	0.27
74	0.21
75	0.17
76	0.18
77	0.15
78	0.13
79	0.13
80	0.11
81	0.1
82	0.08
83	0.09
84	0.07
85	0.07
86	0.07
87	0.06
88	0.07
89	0.07
90	0.06
91	0.06
92	0.07
93	0.07
94	0.09
95	0.1
96	0.12
97	0.16
98	0.17
99	0.18
100	0.18
101	0.18
102	0.17
103	0.16
104	0.15
105	0.11
106	0.13
107	0.13
108	0.13
109	0.17
110	0.19
111	0.2
112	0.23
113	0.31
114	0.35
115	0.35
116	0.35
117	0.39
118	0.39
119	0.44
120	0.45
121	0.37
122	0.3
123	0.32
124	0.35
125	0.27
126	0.24
127	0.2
128	0.16
129	0.19
130	0.2
131	0.17
132	0.14
133	0.13
134	0.14
135	0.12
136	0.12
137	0.09
138	0.11
139	0.18
140	0.25
141	0.3
142	0.3
143	0.31
144	0.35
145	0.36
146	0.36
147	0.35
148	0.32
149	0.36
150	0.39
151	0.42
152	0.4
153	0.38
154	0.36
155	0.31
156	0.27
157	0.2
158	0.18
159	0.14
160	0.12
161	0.13
162	0.14
163	0.14
164	0.16
165	0.16
166	0.16
167	0.16
168	0.17
169	0.17
170	0.21
171	0.27
172	0.28
173	0.3
174	0.34
175	0.39
176	0.41
177	0.48
178	0.52
179	0.53
180	0.56
181	0.6
182	0.57
183	0.51
184	0.5
185	0.51
186	0.46
187	0.43
188	0.37
189	0.34
190	0.35
191	0.38
192	0.47
193	0.45
194	0.46
195	0.52
196	0.6
197	0.66
198	0.64
199	0.63
200	0.57
201	0.52
202	0.47
203	0.4
204	0.31
205	0.23
206	0.22
207	0.2
208	0.17
209	0.14
210	0.11
211	0.08
212	0.07
213	0.06
214	0.05
215	0.05
216	0.06
217	0.06
218	0.08
219	0.09
220	0.11
221	0.12
222	0.13
223	0.16
224	0.18
225	0.2
226	0.24
227	0.24
228	0.23
229	0.24
230	0.24
231	0.24
232	0.31
233	0.38
234	0.4
235	0.48
236	0.54
237	0.6
238	0.65
239	0.65
240	0.68
241	0.7
242	0.73
243	0.75
244	0.78
245	0.77
246	0.81
247	0.8
248	0.7
249	0.67
250	0.67
251	0.63
252	0.63
253	0.6
254	0.56
255	0.58
256	0.59
257	0.55
258	0.52
259	0.54
260	0.51
261	0.49
262	0.52
263	0.46
264	0.48
265	0.45
266	0.41
267	0.38
268	0.35
269	0.36
270	0.3
271	0.33
272	0.31
273	0.31
274	0.35
275	0.34
276	0.32
277	0.3
278	0.26
279	0.23
280	0.22
281	0.2
282	0.14
283	0.1
284	0.08
285	0.07
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.08
290	0.07
291	0.07
292	0.06
293	0.06
294	0.06
295	0.06
296	0.05
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.05
302	0.04
303	0.06
304	0.09
305	0.1
306	0.16
307	0.22
308	0.27
309	0.33
310	0.38
311	0.41
312	0.46
313	0.55
314	0.59
315	0.64
316	0.65
317	0.64
318	0.66
319	0.64
320	0.59
321	0.51
322	0.47
323	0.39
324	0.36
325	0.35
326	0.36
327	0.43
328	0.5
329	0.56
330	0.51
331	0.53
332	0.56
333	0.54
334	0.53
335	0.47
336	0.45
337	0.41
338	0.4
339	0.35
340	0.29
341	0.26
342	0.19
343	0.17
344	0.09
345	0.06
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.06
351	0.05
352	0.08
353	0.09
354	0.09
355	0.1
356	0.11
357	0.12
358	0.12
359	0.13
360	0.11
361	0.11
362	0.1
363	0.09
364	0.09
365	0.08
366	0.07
367	0.06
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.05
372	0.07
373	0.1
374	0.1
375	0.12
376	0.13
377	0.14
378	0.14
379	0.14
380	0.13
381	0.13
382	0.12
383	0.09
384	0.1
385	0.11
386	0.11
387	0.12
388	0.12
389	0.09
390	0.09
391	0.09
392	0.08
393	0.07
394	0.07
395	0.07
396	0.07
397	0.07
398	0.07
399	0.07
400	0.06
401	0.05
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.07
406	0.08
407	0.08
408	0.1
409	0.11
410	0.13
411	0.15
412	0.16
413	0.18
414	0.19
415	0.2
416	0.25
417	0.26
418	0.29
419	0.31
420	0.3
421	0.28
422	0.29
423	0.28
424	0.25
425	0.24
426	0.22
427	0.18
428	0.18
429	0.18
430	0.16
431	0.17
432	0.14
433	0.14
434	0.12
435	0.12
436	0.12
437	0.11
438	0.09
439	0.1
440	0.09
441	0.1
442	0.09
443	0.1
444	0.09
445	0.1
446	0.12
447	0.11
448	0.13
449	0.12
450	0.12
451	0.11
452	0.13
453	0.12
454	0.11
455	0.14
456	0.14
457	0.17
458	0.18
459	0.17
460	0.17
461	0.17
462	0.16
463	0.14
464	0.15
465	0.12
466	0.14
467	0.16
468	0.2
469	0.25
470	0.26
471	0.28
472	0.29
473	0.33
474	0.31
475	0.35
476	0.38
477	0.38
478	0.43
479	0.45
480	0.44
481	0.39
482	0.38
483	0.32
484	0.25
485	0.21
486	0.15
487	0.1
488	0.08
489	0.09
490	0.09
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.1
495	0.09
496	0.08
497	0.08
498	0.07
499	0.06
500	0.05
501	0.04
502	0.06
503	0.06
504	0.07
505	0.09
506	0.11
507	0.13
508	0.14
509	0.15
510	0.18
511	0.2
512	0.22
513	0.25
514	0.24
515	0.22
516	0.24
517	0.24
518	0.19
519	0.17
520	0.15
521	0.13
522	0.12
523	0.12
524	0.1
525	0.08
526	0.1
527	0.1
528	0.11
529	0.1
530	0.11
531	0.11
532	0.12
533	0.12
534	0.11
535	0.14
536	0.17
537	0.16
538	0.17
539	0.17
540	0.18
541	0.25
542	0.26
543	0.27
544	0.24
545	0.26
546	0.32
547	0.36
548	0.37
549	0.31
550	0.33
551	0.32
552	0.33
553	0.32
554	0.26
555	0.21
556	0.21
557	0.23
558	0.28
559	0.33
560	0.34
561	0.33
562	0.31
563	0.3
564	0.31
565	0.32
566	0.26
567	0.19
568	0.17
569	0.17
570	0.17
571	0.17
572	0.15
573	0.13
574	0.12
575	0.11
576	0.11
577	0.11
578	0.11
579	0.12
580	0.12
581	0.13
582	0.13
583	0.13
584	0.13
585	0.13
586	0.14
587	0.13
588	0.12
589	0.09
590	0.08
591	0.11
592	0.11
593	0.13
594	0.15
595	0.16
596	0.25
597	0.29
598	0.36
599	0.34
600	0.39
601	0.39
602	0.42
603	0.44
604	0.39
605	0.43
606	0.39
607	0.43
608	0.42
609	0.43
610	0.38
611	0.37
612	0.36
613	0.3
614	0.29
615	0.25
616	0.25
617	0.23
618	0.21
619	0.21
620	0.21
621	0.21
622	0.19
623	0.17
624	0.18
625	0.23
626	0.29
627	0.38
628	0.42
629	0.47
630	0.47
631	0.48
632	0.48
633	0.5
634	0.54
635	0.53
636	0.49
637	0.5
638	0.53
639	0.61
640	0.65
641	0.63
642	0.59
643	0.6
644	0.6
645	0.63
646	0.61
647	0.59
648	0.55
649	0.55
650	0.54
651	0.48
652	0.47
653	0.38
654	0.37
655	0.32
656	0.31
657	0.25
658	0.22
659	0.2
660	0.22
661	0.24
662	0.23
663	0.21
664	0.18
665	0.18
666	0.16
667	0.16
668	0.12
669	0.1
670	0.09
671	0.09
672	0.1
673	0.09
674	0.1
675	0.08
676	0.08
677	0.07
678	0.06
679	0.06
680	0.05
681	0.06
682	0.05
683	0.05
684	0.05
685	0.05
686	0.05
687	0.05
688	0.05
689	0.05
690	0.06
691	0.06
692	0.09
693	0.09
694	0.1
695	0.11
696	0.11
697	0.1
698	0.1
699	0.11
700	0.09
701	0.08
702	0.07
703	0.07
704	0.08
705	0.08
706	0.08
707	0.11
708	0.11
709	0.14
710	0.16
711	0.16
712	0.16
713	0.2
714	0.22
715	0.24
716	0.27
717	0.31
718	0.34
719	0.35
720	0.34
721	0.3
722	0.28
723	0.21
724	0.2
725	0.14
726	0.09
727	0.07
728	0.07
729	0.07
730	0.07
731	0.08
732	0.07
733	0.07
734	0.08
735	0.09
736	0.09
737	0.11
738	0.13
739	0.22
740	0.3
741	0.32
742	0.32
743	0.39
744	0.43
745	0.44
746	0.43
747	0.38
748	0.32
749	0.31
750	0.3
751	0.24
752	0.2
753	0.17
754	0.15
755	0.11
756	0.1
757	0.1
758	0.1
759	0.09
760	0.09
761	0.1
762	0.13
763	0.14
764	0.15
765	0.14
766	0.13
767	0.13
768	0.13
769	0.12
770	0.1
771	0.09
772	0.09
773	0.1
774	0.1
775	0.1
776	0.1
777	0.1
778	0.12
779	0.11
780	0.11
781	0.11
782	0.11
783	0.11
784	0.12
785	0.11
786	0.09
787	0.12
788	0.12
789	0.11
790	0.13
791	0.16
792	0.21
793	0.25
794	0.26
795	0.27
796	0.29
797	0.37
798	0.4
799	0.39
800	0.37
801	0.33
802	0.31
803	0.29
804	0.26
805	0.19
806	0.16
807	0.16
808	0.13
809	0.13
810	0.13
811	0.14
812	0.16
813	0.17
814	0.18
815	0.2
816	0.25
817	0.27
818	0.27
819	0.26
820	0.23
821	0.23
822	0.21
823	0.18
824	0.14
825	0.15
826	0.16
827	0.17
828	0.17
829	0.16
830	0.16
831	0.16
832	0.18
833	0.16
834	0.16
835	0.17
836	0.22
837	0.23
838	0.25
839	0.3
840	0.35
841	0.36
842	0.36
843	0.35
844	0.31
845	0.29
846	0.29
847	0.23
848	0.14
849	0.11
850	0.1
851	0.09
852	0.08
853	0.08
854	0.06
855	0.06
856	0.06
857	0.06
858	0.09
859	0.12
860	0.12
861	0.13
862	0.14
863	0.16
864	0.17
865	0.17
866	0.14
867	0.12
868	0.13
869	0.12
870	0.11
871	0.1
872	0.1
873	0.1
874	0.09
875	0.1
876	0.11
877	0.1
878	0.1
879	0.12
880	0.11
881	0.11
882	0.11
883	0.14
884	0.13
885	0.13
886	0.13
887	0.11
888	0.1
889	0.09
890	0.1
891	0.07
892	0.07
893	0.08
894	0.09
895	0.08
896	0.08
897	0.09
898	0.1
899	0.11
900	0.1
901	0.1
902	0.12
903	0.14
904	0.13
905	0.13
906	0.13
907	0.21
908	0.22
909	0.21
910	0.19
911	0.21
912	0.24
913	0.24
914	0.27
915	0.22
916	0.26
917	0.27
918	0.27
919	0.28
920	0.28
921	0.29
922	0.24
923	0.25
924	0.29
925	0.32
926	0.31
927	0.32
928	0.32
929	0.35
930	0.42
931	0.44
932	0.43
933	0.39
934	0.42
935	0.38
936	0.37
937	0.34
938	0.26
939	0.22
940	0.17
941	0.16
942	0.15
943	0.18
944	0.19
945	0.19
946	0.21
947	0.21
948	0.26
949	0.27
950	0.3
951	0.34
952	0.37
953	0.36
954	0.37
955	0.4
956	0.35
957	0.36
958	0.38
959	0.4
960	0.39
961	0.45
962	0.49
963	0.5
964	0.6
965	0.65
966	0.64
967	0.65
968	0.66
969	0.63
970	0.63
971	0.6
972	0.5
973	0.46
974	0.41
975	0.31
976	0.25
977	0.22
978	0.16
979	0.12
980	0.12
981	0.09
982	0.11
983	0.13
984	0.12
985	0.11
986	0.12
987	0.14
988	0.12
989	0.15
990	0.13
991	0.12
992	0.13
993	0.15
994	0.16
995	0.15
996	0.16
997	0.2
998	0.22
999	0.22
1000	0.22
1001	0.23
1002	0.22
1003	0.23
1004	0.27
1005	0.26
1006	0.3
1007	0.33
1008	0.33
1009	0.32
1010	0.34
1011	0.37
1012	0.34
1013	0.32
1014	0.29
1015	0.25
1016	0.3
1017	0.29
1018	0.28
1019	0.23
1020	0.23
1021	0.21
1022	0.19
1023	0.18
1024	0.12
1025	0.12
1026	0.14
1027	0.14
1028	0.13
1029	0.14
1030	0.15
1031	0.21
1032	0.23
1033	0.24
1034	0.27
1035	0.36
1036	0.46
1037	0.54
1038	0.58
1039	0.61
1040	0.65
1041	0.66
1042	0.66
1043	0.58
1044	0.5
1045	0.44
1046	0.42
1047	0.38
1048	0.33
1049	0.33
1050	0.26
1051	0.27
1052	0.23
1053	0.2
1054	0.16
1055	0.13
1056	0.11
1057	0.08
1058	0.09
1059	0.07
1060	0.07
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.05
1064	0.05
1065	0.05
1066	0.05
1067	0.06
1068	0.07
1069	0.07
1070	0.08
1071	0.12
1072	0.14
1073	0.17
1074	0.16
1075	0.19
1076	0.2
1077	0.19
1078	0.2
1079	0.18
1080	0.17
1081	0.17
1082	0.2
1083	0.19
1084	0.2
1085	0.21
1086	0.23
1087	0.26
1088	0.29
1089	0.28
1090	0.27
1091	0.29

A0A2Z6RWM4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer