Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SWH5

Protein Details
Accession A0A317SWH5    Localization Confidence High Confidence Score 19.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
43-68GSVNQPPRIHRIQKKSSKPIITRYPHHydrophilic
215-238NPQFHRPQHQFRQRQNNKNRSQHHHydrophilic
468-493HDGSDDRRPKRPAKVKKTRGNSPSNIBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
445-461KASEGGKEGSKKRGWHK
474-529RRPKRPAKVKKTRGNSPSNIAQPRVPPPQHHPLPPKPKVPGFRGGRGGRHPRHAPS
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10.5, mito 6, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences RTTESATVPTWSTSLSPQPCYNCGSTAHIAQFCPEPRRQVPAGSVNQPPRIHRIQKKSSKPIITRYPHPTQYPTTQPPAYQPSQPQAYPQQAQTQTAYPPQVPAQTYPPQASPSPVSPYPPQQQSQHWQQPYTYNAHQQWPQPSTQTQPHYTPPVATAPPTAAYGPHQPAAYQAYSQPTVHQSHPQPPQPHTRQPYYNYPQGAHAPPAHAPASFNPQFHRPQHQFRQRQNNKNRSQHHAPSFQQQPQRNASPAQAASGPSQAASQATANSRREPPPPKPPPCFPNTQAPITQFGKSGKIVYKPPERVEKPLAATFAETDAQRSEKASDSEKSAEQRVFSTRYFDEKGARIDGYLVKSREDGEPEDPVYNSVRTGGSMLSQPLEFALPDDPEKNGDAEFQRMLKELEYEAKMEIYGSLNGEDKKGPEEPLSVLSRPLSRGSGASGKASEGGKEGSKKRGWHKNLEDSSHDGSDDRRPKRPAKVKKTRGNSPSNIAQPRVPPPQHHPLPPKPKVPGFRGGRGGRHPRHAPSPARQYQVHREGGSGAGRSGGHGLSGDHIRPVT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.32
4 0.36
5 0.4
6 0.42
7 0.45
8 0.43
9 0.36
10 0.34
11 0.36
12 0.34
13 0.35
14 0.39
15 0.36
16 0.35
17 0.34
18 0.38
19 0.36
20 0.39
21 0.37
22 0.39
23 0.39
24 0.46
25 0.46
26 0.44
27 0.45
28 0.49
29 0.52
30 0.49
31 0.55
32 0.53
33 0.59
34 0.57
35 0.53
36 0.51
37 0.54
38 0.58
39 0.6
40 0.64
41 0.68
42 0.76
43 0.83
44 0.86
45 0.86
46 0.86
47 0.82
48 0.81
49 0.81
50 0.77
51 0.74
52 0.72
53 0.71
54 0.67
55 0.66
56 0.61
57 0.57
58 0.57
59 0.58
60 0.56
61 0.54
62 0.5
63 0.47
64 0.49
65 0.51
66 0.46
67 0.42
68 0.41
69 0.41
70 0.45
71 0.44
72 0.42
73 0.42
74 0.46
75 0.44
76 0.42
77 0.44
78 0.41
79 0.44
80 0.41
81 0.36
82 0.32
83 0.33
84 0.33
85 0.24
86 0.25
87 0.25
88 0.27
89 0.26
90 0.26
91 0.28
92 0.31
93 0.34
94 0.34
95 0.33
96 0.32
97 0.31
98 0.31
99 0.29
100 0.26
101 0.29
102 0.28
103 0.31
104 0.31
105 0.38
106 0.42
107 0.44
108 0.44
109 0.41
110 0.47
111 0.5
112 0.58
113 0.59
114 0.54
115 0.5
116 0.49
117 0.5
118 0.47
119 0.46
120 0.39
121 0.38
122 0.38
123 0.41
124 0.43
125 0.43
126 0.47
127 0.43
128 0.41
129 0.36
130 0.35
131 0.36
132 0.4
133 0.4
134 0.37
135 0.38
136 0.4
137 0.42
138 0.41
139 0.36
140 0.31
141 0.3
142 0.27
143 0.24
144 0.21
145 0.17
146 0.17
147 0.17
148 0.15
149 0.11
150 0.13
151 0.18
152 0.19
153 0.2
154 0.19
155 0.18
156 0.2
157 0.24
158 0.22
159 0.16
160 0.16
161 0.18
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.2
166 0.23
167 0.24
168 0.29
169 0.28
170 0.35
171 0.42
172 0.47
173 0.47
174 0.47
175 0.56
176 0.55
177 0.61
178 0.58
179 0.57
180 0.55
181 0.56
182 0.63
183 0.59
184 0.57
185 0.5
186 0.45
187 0.41
188 0.4
189 0.37
190 0.29
191 0.24
192 0.21
193 0.2
194 0.23
195 0.2
196 0.16
197 0.15
198 0.14
199 0.22
200 0.23
201 0.23
202 0.21
203 0.25
204 0.31
205 0.33
206 0.41
207 0.37
208 0.44
209 0.54
210 0.62
211 0.67
212 0.69
213 0.78
214 0.78
215 0.83
216 0.85
217 0.85
218 0.84
219 0.84
220 0.8
221 0.77
222 0.75
223 0.72
224 0.68
225 0.65
226 0.57
227 0.55
228 0.57
229 0.54
230 0.53
231 0.49
232 0.48
233 0.46
234 0.47
235 0.41
236 0.37
237 0.32
238 0.3
239 0.25
240 0.21
241 0.18
242 0.16
243 0.16
244 0.15
245 0.14
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.07
250 0.07
251 0.06
252 0.07
253 0.1
254 0.16
255 0.17
256 0.2
257 0.23
258 0.25
259 0.3
260 0.34
261 0.37
262 0.43
263 0.51
264 0.56
265 0.57
266 0.59
267 0.58
268 0.56
269 0.56
270 0.47
271 0.47
272 0.44
273 0.41
274 0.39
275 0.35
276 0.37
277 0.33
278 0.31
279 0.23
280 0.2
281 0.21
282 0.19
283 0.2
284 0.18
285 0.19
286 0.22
287 0.27
288 0.34
289 0.35
290 0.38
291 0.45
292 0.43
293 0.45
294 0.46
295 0.42
296 0.37
297 0.36
298 0.33
299 0.24
300 0.22
301 0.18
302 0.15
303 0.13
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.1
308 0.1
309 0.11
310 0.11
311 0.12
312 0.14
313 0.16
314 0.17
315 0.19
316 0.22
317 0.23
318 0.24
319 0.24
320 0.23
321 0.21
322 0.21
323 0.21
324 0.22
325 0.2
326 0.23
327 0.2
328 0.24
329 0.26
330 0.26
331 0.26
332 0.25
333 0.27
334 0.25
335 0.24
336 0.19
337 0.19
338 0.2
339 0.2
340 0.23
341 0.21
342 0.2
343 0.2
344 0.22
345 0.21
346 0.21
347 0.2
348 0.17
349 0.19
350 0.19
351 0.2
352 0.18
353 0.18
354 0.17
355 0.15
356 0.13
357 0.12
358 0.1
359 0.09
360 0.1
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.1
365 0.1
366 0.1
367 0.09
368 0.09
369 0.09
370 0.07
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.1
375 0.11
376 0.11
377 0.12
378 0.13
379 0.12
380 0.11
381 0.13
382 0.13
383 0.15
384 0.17
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.17
389 0.14
390 0.14
391 0.13
392 0.17
393 0.17
394 0.17
395 0.16
396 0.16
397 0.15
398 0.13
399 0.13
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.1
404 0.13
405 0.14
406 0.15
407 0.15
408 0.14
409 0.16
410 0.17
411 0.18
412 0.16
413 0.18
414 0.18
415 0.23
416 0.26
417 0.23
418 0.22
419 0.23
420 0.23
421 0.23
422 0.23
423 0.19
424 0.16
425 0.16
426 0.19
427 0.23
428 0.22
429 0.23
430 0.21
431 0.2
432 0.23
433 0.22
434 0.19
435 0.15
436 0.16
437 0.18
438 0.24
439 0.27
440 0.32
441 0.36
442 0.42
443 0.5
444 0.58
445 0.6
446 0.64
447 0.69
448 0.72
449 0.74
450 0.72
451 0.66
452 0.61
453 0.59
454 0.49
455 0.4
456 0.3
457 0.26
458 0.32
459 0.37
460 0.36
461 0.4
462 0.45
463 0.52
464 0.62
465 0.7
466 0.72
467 0.74
468 0.81
469 0.84
470 0.88
471 0.9
472 0.89
473 0.87
474 0.85
475 0.78
476 0.73
477 0.71
478 0.7
479 0.65
480 0.57
481 0.52
482 0.48
483 0.5
484 0.54
485 0.49
486 0.45
487 0.48
488 0.57
489 0.6
490 0.64
491 0.65
492 0.66
493 0.74
494 0.76
495 0.76
496 0.72
497 0.74
498 0.73
499 0.69
500 0.69
501 0.65
502 0.65
503 0.67
504 0.65
505 0.64
506 0.66
507 0.71
508 0.66
509 0.69
510 0.67
511 0.63
512 0.67
513 0.69
514 0.67
515 0.66
516 0.71
517 0.69
518 0.69
519 0.68
520 0.66
521 0.68
522 0.7
523 0.67
524 0.56
525 0.5
526 0.46
527 0.46
528 0.42
529 0.33
530 0.24
531 0.2
532 0.19
533 0.19
534 0.2
535 0.16
536 0.13
537 0.12
538 0.13
539 0.14
540 0.19
541 0.18