Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SD04

Protein Details
Accession A0A317SD04    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
70-91YPPGETRTERRRRIRLAKKFADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
59-88KPRPRTGRPSKYPPGETRTERRRRIRLAKK
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9, cyto_nucl 9, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009057  Homeobox-like_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF13518  HTH_28  
Amino Acid Sequences MPKDPITGKRREATLVERVKVIEKHAAGKSYRAIGEEIGISKSEAQRIIQRWKEFEELKPRPRTGRPSKYPPGETRTERRRRIRLAKKFADAEDVKAGVGGEVEGSAVGGGEGMQLPIVSLTVDGQDLRNDVRVPGGAVKTDGGTRENESLNAGEGSGGGEGNDEVGDGATDPQAESEGATNQNSPTESAQDCGVIEGRERNDYVLHTVDGKEGEPAR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.49
3 0.44
4 0.41
5 0.4
6 0.41
7 0.39
8 0.36
9 0.33
10 0.28
11 0.33
12 0.35
13 0.39
14 0.34
15 0.36
16 0.36
17 0.33
18 0.33
19 0.27
20 0.25
21 0.2
22 0.21
23 0.2
24 0.18
25 0.14
26 0.13
27 0.12
28 0.14
29 0.16
30 0.17
31 0.16
32 0.17
33 0.23
34 0.28
35 0.38
36 0.41
37 0.42
38 0.42
39 0.44
40 0.49
41 0.44
42 0.45
43 0.46
44 0.48
45 0.54
46 0.58
47 0.57
48 0.56
49 0.6
50 0.63
51 0.63
52 0.66
53 0.65
54 0.67
55 0.74
56 0.75
57 0.75
58 0.7
59 0.65
60 0.61
61 0.58
62 0.58
63 0.6
64 0.63
65 0.65
66 0.69
67 0.71
68 0.73
69 0.79
70 0.8
71 0.8
72 0.8
73 0.77
74 0.73
75 0.68
76 0.59
77 0.56
78 0.45
79 0.37
80 0.29
81 0.24
82 0.19
83 0.17
84 0.16
85 0.08
86 0.08
87 0.05
88 0.03
89 0.03
90 0.03
91 0.02
92 0.02
93 0.02
94 0.02
95 0.02
96 0.02
97 0.02
98 0.02
99 0.02
100 0.02
101 0.02
102 0.02
103 0.02
104 0.03
105 0.03
106 0.02
107 0.02
108 0.03
109 0.03
110 0.04
111 0.04
112 0.05
113 0.05
114 0.06
115 0.07
116 0.09
117 0.08
118 0.08
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.12
123 0.12
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.11
128 0.12
129 0.12
130 0.09
131 0.1
132 0.12
133 0.15
134 0.15
135 0.15
136 0.15
137 0.14
138 0.14
139 0.13
140 0.1
141 0.07
142 0.07
143 0.07
144 0.06
145 0.05
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.04
151 0.04
152 0.03
153 0.04
154 0.04
155 0.04
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.1
166 0.12
167 0.13
168 0.14
169 0.14
170 0.16
171 0.16
172 0.17
173 0.16
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.18
178 0.17
179 0.16
180 0.16
181 0.16
182 0.12
183 0.14
184 0.18
185 0.2
186 0.22
187 0.23
188 0.22
189 0.22
190 0.23
191 0.25
192 0.22
193 0.21
194 0.2
195 0.2
196 0.21
197 0.21
198 0.19