Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SGG8

Protein Details
Accession A0A317SGG8    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
519-541GARVVHKKLRRLQDMQREHKRQYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
504-528RKRPAEEAEGIRTKAGARVVHKKLR
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10, cyto 8.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MSQYTPATLESLLSTLSIAGEADHASVLKHANNVLKSEKSHKRALHTKVVALINLDRYEDAFSVLSVPELAGEAALERAYCLYKLGRLEDALAAAVEGAGGDGRDERGLKHVEAQAAYRLEKFDQAAGIYAGLSRSEYQAENEDYDMSVNISATNAQLIWANGPAAAGGEDNKVDRSALDAFETAFNSACGAVARCAFGQALVLLKRARELGLQLEDLSEEERKVEVAPVLAQEAYVLAKMGRWEEALPDYNPHLSLITSAGSTTTAISSKAFLFQSKTLERNRAVLELEAGKVQAAKKLALAHLQNYPHDSEASVILAAAREGKVEKLAGRYPGDLGLSLTLAQLRMRSGNITGAIAAVESVISAAPEDQKYLPGVIGLLVGLYQHQGRRRHVKDILSKASEYWKNSPTPNHPLLRASAKAHLDKPTSADIDLHSAHSIFKILLTHSPSDPFATAGLLASTLSSPASPPPQHLQQKLTPLEKLISTIDAAALEAAGVAQPPPRKRPAEEAEGIRTKAGARVVHKKLRRLQDMQREHKRQYMTIKWDELTVKWTDTENQELVAATKIAREGIAFLTVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.08
4 0.07
5 0.06
6 0.05
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.1
14 0.12
15 0.13
16 0.15
17 0.18
18 0.24
19 0.26
20 0.3
21 0.33
22 0.35
23 0.37
24 0.45
25 0.5
26 0.49
27 0.56
28 0.56
29 0.61
30 0.66
31 0.69
32 0.7
33 0.64
34 0.61
35 0.6
36 0.57
37 0.48
38 0.42
39 0.38
40 0.32
41 0.29
42 0.27
43 0.2
44 0.19
45 0.21
46 0.18
47 0.17
48 0.12
49 0.11
50 0.12
51 0.12
52 0.11
53 0.09
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.05
59 0.05
60 0.05
61 0.06
62 0.06
63 0.05
64 0.05
65 0.07
66 0.08
67 0.08
68 0.1
69 0.11
70 0.14
71 0.18
72 0.2
73 0.21
74 0.21
75 0.23
76 0.21
77 0.2
78 0.17
79 0.13
80 0.1
81 0.08
82 0.07
83 0.05
84 0.04
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.05
91 0.07
92 0.08
93 0.09
94 0.14
95 0.18
96 0.18
97 0.23
98 0.26
99 0.28
100 0.28
101 0.29
102 0.29
103 0.29
104 0.29
105 0.24
106 0.22
107 0.2
108 0.21
109 0.21
110 0.17
111 0.15
112 0.15
113 0.15
114 0.13
115 0.12
116 0.1
117 0.09
118 0.08
119 0.07
120 0.08
121 0.07
122 0.08
123 0.1
124 0.11
125 0.12
126 0.17
127 0.19
128 0.19
129 0.18
130 0.18
131 0.16
132 0.15
133 0.14
134 0.09
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.08
147 0.08
148 0.08
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.05
155 0.05
156 0.06
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.08
161 0.08
162 0.08
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.12
169 0.13
170 0.14
171 0.11
172 0.1
173 0.09
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.06
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.09
185 0.08
186 0.08
187 0.07
188 0.1
189 0.09
190 0.12
191 0.12
192 0.12
193 0.13
194 0.13
195 0.13
196 0.1
197 0.11
198 0.13
199 0.15
200 0.15
201 0.14
202 0.14
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.09
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.08
216 0.08
217 0.09
218 0.08
219 0.08
220 0.06
221 0.06
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.07
232 0.09
233 0.12
234 0.13
235 0.13
236 0.14
237 0.14
238 0.14
239 0.14
240 0.13
241 0.1
242 0.08
243 0.08
244 0.07
245 0.07
246 0.06
247 0.06
248 0.06
249 0.06
250 0.06
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.07
258 0.1
259 0.1
260 0.11
261 0.13
262 0.14
263 0.19
264 0.21
265 0.25
266 0.24
267 0.29
268 0.28
269 0.29
270 0.28
271 0.24
272 0.22
273 0.18
274 0.17
275 0.13
276 0.13
277 0.1
278 0.09
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.1
286 0.12
287 0.13
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.19
292 0.2
293 0.19
294 0.19
295 0.19
296 0.15
297 0.15
298 0.13
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.06
303 0.06
304 0.05
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.05
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.07
314 0.09
315 0.11
316 0.13
317 0.16
318 0.17
319 0.18
320 0.17
321 0.18
322 0.17
323 0.13
324 0.11
325 0.08
326 0.07
327 0.07
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.07
334 0.07
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.1
339 0.11
340 0.1
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.06
346 0.04
347 0.03
348 0.02
349 0.03
350 0.02
351 0.02
352 0.03
353 0.03
354 0.06
355 0.07
356 0.09
357 0.09
358 0.1
359 0.11
360 0.11
361 0.11
362 0.08
363 0.08
364 0.06
365 0.06
366 0.05
367 0.04
368 0.03
369 0.03
370 0.03
371 0.04
372 0.06
373 0.08
374 0.15
375 0.21
376 0.27
377 0.38
378 0.41
379 0.47
380 0.51
381 0.57
382 0.59
383 0.63
384 0.64
385 0.56
386 0.54
387 0.47
388 0.5
389 0.46
390 0.41
391 0.37
392 0.34
393 0.35
394 0.38
395 0.43
396 0.41
397 0.45
398 0.48
399 0.46
400 0.43
401 0.42
402 0.42
403 0.41
404 0.37
405 0.31
406 0.31
407 0.32
408 0.34
409 0.36
410 0.38
411 0.35
412 0.33
413 0.34
414 0.32
415 0.29
416 0.26
417 0.23
418 0.18
419 0.2
420 0.2
421 0.18
422 0.14
423 0.13
424 0.13
425 0.12
426 0.12
427 0.08
428 0.09
429 0.09
430 0.1
431 0.14
432 0.18
433 0.2
434 0.2
435 0.22
436 0.22
437 0.22
438 0.21
439 0.17
440 0.14
441 0.12
442 0.11
443 0.09
444 0.08
445 0.06
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.09
454 0.16
455 0.17
456 0.21
457 0.27
458 0.36
459 0.44
460 0.48
461 0.5
462 0.48
463 0.56
464 0.58
465 0.55
466 0.46
467 0.41
468 0.39
469 0.33
470 0.31
471 0.23
472 0.18
473 0.15
474 0.14
475 0.13
476 0.11
477 0.1
478 0.08
479 0.06
480 0.05
481 0.04
482 0.04
483 0.03
484 0.03
485 0.04
486 0.08
487 0.14
488 0.19
489 0.25
490 0.33
491 0.37
492 0.4
493 0.5
494 0.53
495 0.56
496 0.59
497 0.58
498 0.59
499 0.6
500 0.57
501 0.47
502 0.4
503 0.32
504 0.29
505 0.28
506 0.25
507 0.26
508 0.36
509 0.45
510 0.54
511 0.58
512 0.64
513 0.67
514 0.72
515 0.74
516 0.72
517 0.73
518 0.75
519 0.8
520 0.82
521 0.84
522 0.81
523 0.76
524 0.75
525 0.68
526 0.62
527 0.61
528 0.6
529 0.58
530 0.58
531 0.6
532 0.54
533 0.55
534 0.52
535 0.43
536 0.38
537 0.31
538 0.26
539 0.23
540 0.24
541 0.24
542 0.26
543 0.32
544 0.28
545 0.26
546 0.26
547 0.24
548 0.24
549 0.21
550 0.18
551 0.11
552 0.13
553 0.13
554 0.13
555 0.13
556 0.12
557 0.12
558 0.13