Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SXM9

Protein Details
Accession A0A317SXM9    Localization Confidence High Confidence Score 23.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-120DSQTTTAPGDKKRKRKKRDDREEIEDIYBasic
341-367ANDRKLRVTRAKTTRRNQTRKPDLPISHydrophilic
424-445SIKKGGSGKKAGKPRSRARAAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
103-110KKRKRKKR
344-375RKLRVTRAKTTRRNQTRKPDLPISGKRSPKGK
426-451KKGGSGKKAGKPRSRARAAAWRRKGN
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR047189  RRM2_Nop12p-like  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12670  RRM2_Nop12p_like  
Amino Acid Sequences MGKKGKWEKYSVTAPSTSKIDPSLASLFDSSFGAVQVPRKASIENVRSSGATEGEPEEDDRDLSEVEGSDPEDTSDDEAANNSQSGDDDDMEDSQTTTAPGDKKRKRKKRDDREEIEDIYLQKLQDAQEAEDKRRMSKKTKTNAEDGKSTESEEEDSDAEREKPPIKHESLTNPKDVELDKSSRTVFLGNVPSTTISSKIISIRFRSVAFSEQIPRKAAFITHKLHEKQQTVNAYVVYSTPAEAREALKLNGQVVLDRHIRVDSVAHPSPQDPKRCVFIGNLDFEAQEENLWRHFGTCGKVESVRIVRDSKTNVGKGFAYVQFEDPMSVDEALLLDSRKMANDRKLRVTRAKTTRRNQTRKPDLPISGKRSPKGKSVYVPKLDPKVKDTVSRAHKLLGRAGAAQLKSQSEVFEGLRASANTGSSIKKGGSGKKAGKPRSRARAAAWRRKGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.48
3 0.47
4 0.4
5 0.33
6 0.3
7 0.27
8 0.22
9 0.26
10 0.25
11 0.21
12 0.22
13 0.21
14 0.19
15 0.18
16 0.18
17 0.13
18 0.1
19 0.1
20 0.1
21 0.11
22 0.16
23 0.21
24 0.23
25 0.24
26 0.25
27 0.26
28 0.3
29 0.38
30 0.4
31 0.38
32 0.38
33 0.38
34 0.37
35 0.37
36 0.33
37 0.25
38 0.18
39 0.16
40 0.15
41 0.15
42 0.16
43 0.15
44 0.15
45 0.14
46 0.14
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.1
51 0.1
52 0.09
53 0.1
54 0.11
55 0.11
56 0.1
57 0.1
58 0.1
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.11
63 0.11
64 0.1
65 0.11
66 0.12
67 0.12
68 0.11
69 0.09
70 0.08
71 0.09
72 0.11
73 0.12
74 0.11
75 0.12
76 0.12
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.11
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.08
85 0.12
86 0.15
87 0.23
88 0.34
89 0.42
90 0.53
91 0.64
92 0.74
93 0.8
94 0.87
95 0.91
96 0.91
97 0.95
98 0.95
99 0.91
100 0.88
101 0.83
102 0.73
103 0.63
104 0.54
105 0.43
106 0.34
107 0.28
108 0.2
109 0.15
110 0.15
111 0.14
112 0.16
113 0.16
114 0.16
115 0.22
116 0.25
117 0.28
118 0.3
119 0.3
120 0.31
121 0.37
122 0.4
123 0.4
124 0.47
125 0.54
126 0.59
127 0.69
128 0.67
129 0.69
130 0.72
131 0.68
132 0.63
133 0.55
134 0.5
135 0.4
136 0.37
137 0.29
138 0.22
139 0.19
140 0.16
141 0.15
142 0.1
143 0.1
144 0.1
145 0.11
146 0.12
147 0.12
148 0.14
149 0.18
150 0.19
151 0.23
152 0.29
153 0.3
154 0.31
155 0.34
156 0.41
157 0.46
158 0.47
159 0.46
160 0.39
161 0.37
162 0.36
163 0.34
164 0.28
165 0.22
166 0.22
167 0.2
168 0.22
169 0.22
170 0.2
171 0.2
172 0.17
173 0.13
174 0.15
175 0.2
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.17
180 0.17
181 0.17
182 0.13
183 0.09
184 0.09
185 0.1
186 0.13
187 0.17
188 0.18
189 0.2
190 0.22
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.2
195 0.19
196 0.18
197 0.17
198 0.2
199 0.22
200 0.24
201 0.24
202 0.23
203 0.21
204 0.2
205 0.21
206 0.19
207 0.22
208 0.23
209 0.24
210 0.3
211 0.31
212 0.35
213 0.38
214 0.36
215 0.33
216 0.35
217 0.35
218 0.3
219 0.3
220 0.26
221 0.2
222 0.18
223 0.15
224 0.11
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.09
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.14
236 0.14
237 0.14
238 0.15
239 0.14
240 0.12
241 0.11
242 0.15
243 0.15
244 0.15
245 0.15
246 0.13
247 0.13
248 0.12
249 0.13
250 0.11
251 0.16
252 0.17
253 0.17
254 0.18
255 0.19
256 0.27
257 0.31
258 0.34
259 0.29
260 0.3
261 0.33
262 0.33
263 0.34
264 0.27
265 0.29
266 0.27
267 0.27
268 0.26
269 0.23
270 0.22
271 0.21
272 0.2
273 0.13
274 0.09
275 0.08
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.13
283 0.14
284 0.16
285 0.17
286 0.18
287 0.19
288 0.19
289 0.23
290 0.24
291 0.23
292 0.24
293 0.24
294 0.23
295 0.27
296 0.3
297 0.31
298 0.33
299 0.35
300 0.32
301 0.32
302 0.31
303 0.28
304 0.3
305 0.25
306 0.22
307 0.2
308 0.21
309 0.2
310 0.19
311 0.19
312 0.14
313 0.13
314 0.11
315 0.1
316 0.09
317 0.08
318 0.08
319 0.08
320 0.09
321 0.08
322 0.06
323 0.07
324 0.08
325 0.1
326 0.13
327 0.18
328 0.26
329 0.34
330 0.39
331 0.48
332 0.54
333 0.58
334 0.64
335 0.66
336 0.67
337 0.7
338 0.75
339 0.75
340 0.78
341 0.83
342 0.84
343 0.87
344 0.86
345 0.86
346 0.87
347 0.84
348 0.83
349 0.79
350 0.75
351 0.76
352 0.75
353 0.72
354 0.69
355 0.68
356 0.64
357 0.63
358 0.58
359 0.57
360 0.55
361 0.53
362 0.53
363 0.58
364 0.64
365 0.63
366 0.66
367 0.64
368 0.67
369 0.66
370 0.6
371 0.53
372 0.52
373 0.48
374 0.5
375 0.48
376 0.48
377 0.52
378 0.55
379 0.52
380 0.49
381 0.5
382 0.46
383 0.47
384 0.42
385 0.36
386 0.31
387 0.34
388 0.34
389 0.31
390 0.3
391 0.27
392 0.24
393 0.24
394 0.23
395 0.21
396 0.17
397 0.2
398 0.18
399 0.18
400 0.17
401 0.17
402 0.2
403 0.19
404 0.2
405 0.18
406 0.18
407 0.18
408 0.2
409 0.2
410 0.18
411 0.21
412 0.19
413 0.23
414 0.29
415 0.34
416 0.4
417 0.48
418 0.55
419 0.61
420 0.7
421 0.74
422 0.77
423 0.79
424 0.81
425 0.82
426 0.81
427 0.77
428 0.75
429 0.76
430 0.78
431 0.79