Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A317SDV6

Protein Details
Accession A0A317SDV6    Localization Confidence High Confidence Score 15.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MSSSRPKPKRPSAIDAAVRSHydrophilic
285-312ARLGTADKRRKKQANKNSWRQKKKAAANHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
238-252RRAKEAMEKREAEKR
292-309KRRKKQANKNSWRQKKKA
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.333, cyto 7, cyto_mito 6.833, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039905  CD2BP2/Lin1  
IPR003169  GYF  
IPR035445  GYF-like_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005682  C:U5 snRNP  
Pfam View protein in Pfam  
PF02213  GYF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50829  GYF  
Amino Acid Sequences MSSSRPKPKRPSAIDAAVRSGAGLPDSKRPKFDVRNPNELAPDAPDETDVFLEVDEGAIGKRRSNRNKVDIEGYESDSSEEGFDATHKTWRKDEEKTDKMEDKGDEGDDMFADFKSDGEDHDNKEGEKGRRKDVKFMDLEEIDGQDFASKREFVDIIDEDKGRGEGEDDSDEQDEQEIDPEVGAGGKKKGAPKIDAFNMQNEMDEGRFDEAGNFIRKAAEKDAVHDSWLEGVSRKDMRRAKEAMEKREAEKRERMKEEDAMPTSQVLADLIPCLEKGETILEALARLGTADKRRKKQANKNSWRQKKKAAANSEEMEVDKGKDGIDPIEARRKESVERITGAADRLLTRGQPEIYDESRESLIRQYCRETGEDWVELRALVTEDTAEKRWEFRWTDGRDGGNTHGPYDKSAMAIWNQHGFFDQGAEFREDGGNWTLVADFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.73
3 0.66
4 0.56
5 0.48
6 0.39
7 0.31
8 0.22
9 0.16
10 0.17
11 0.15
12 0.24
13 0.33
14 0.35
15 0.37
16 0.42
17 0.5
18 0.56
19 0.65
20 0.66
21 0.65
22 0.73
23 0.73
24 0.71
25 0.64
26 0.55
27 0.45
28 0.37
29 0.33
30 0.25
31 0.21
32 0.19
33 0.17
34 0.17
35 0.16
36 0.13
37 0.1
38 0.08
39 0.08
40 0.07
41 0.07
42 0.05
43 0.05
44 0.05
45 0.11
46 0.12
47 0.15
48 0.24
49 0.34
50 0.44
51 0.54
52 0.63
53 0.66
54 0.72
55 0.71
56 0.71
57 0.62
58 0.59
59 0.52
60 0.47
61 0.39
62 0.33
63 0.3
64 0.22
65 0.21
66 0.14
67 0.11
68 0.07
69 0.06
70 0.07
71 0.1
72 0.11
73 0.17
74 0.21
75 0.24
76 0.29
77 0.37
78 0.41
79 0.46
80 0.55
81 0.59
82 0.61
83 0.63
84 0.66
85 0.63
86 0.59
87 0.56
88 0.46
89 0.38
90 0.34
91 0.29
92 0.22
93 0.18
94 0.17
95 0.12
96 0.12
97 0.09
98 0.07
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.15
106 0.19
107 0.2
108 0.26
109 0.27
110 0.24
111 0.29
112 0.35
113 0.35
114 0.42
115 0.43
116 0.47
117 0.55
118 0.57
119 0.61
120 0.59
121 0.61
122 0.53
123 0.52
124 0.49
125 0.4
126 0.4
127 0.31
128 0.26
129 0.18
130 0.15
131 0.12
132 0.09
133 0.09
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.13
139 0.13
140 0.11
141 0.16
142 0.16
143 0.16
144 0.19
145 0.18
146 0.16
147 0.16
148 0.16
149 0.11
150 0.1
151 0.08
152 0.06
153 0.09
154 0.11
155 0.11
156 0.12
157 0.13
158 0.13
159 0.11
160 0.11
161 0.09
162 0.07
163 0.07
164 0.06
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.06
173 0.08
174 0.11
175 0.14
176 0.19
177 0.21
178 0.24
179 0.26
180 0.31
181 0.33
182 0.36
183 0.34
184 0.31
185 0.31
186 0.28
187 0.24
188 0.19
189 0.16
190 0.1
191 0.09
192 0.08
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.1
199 0.12
200 0.11
201 0.1
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.19
207 0.16
208 0.19
209 0.24
210 0.23
211 0.22
212 0.2
213 0.18
214 0.14
215 0.14
216 0.11
217 0.07
218 0.07
219 0.11
220 0.15
221 0.16
222 0.22
223 0.26
224 0.29
225 0.34
226 0.36
227 0.36
228 0.41
229 0.47
230 0.45
231 0.48
232 0.46
233 0.43
234 0.48
235 0.46
236 0.41
237 0.44
238 0.45
239 0.47
240 0.49
241 0.5
242 0.46
243 0.48
244 0.47
245 0.45
246 0.4
247 0.32
248 0.28
249 0.25
250 0.22
251 0.17
252 0.13
253 0.07
254 0.05
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.05
264 0.06
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.06
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.04
273 0.04
274 0.05
275 0.09
276 0.17
277 0.26
278 0.34
279 0.4
280 0.5
281 0.59
282 0.69
283 0.76
284 0.79
285 0.81
286 0.84
287 0.89
288 0.9
289 0.92
290 0.91
291 0.84
292 0.83
293 0.81
294 0.8
295 0.78
296 0.75
297 0.7
298 0.67
299 0.64
300 0.56
301 0.47
302 0.38
303 0.31
304 0.23
305 0.18
306 0.12
307 0.11
308 0.1
309 0.1
310 0.1
311 0.09
312 0.13
313 0.14
314 0.17
315 0.26
316 0.26
317 0.28
318 0.3
319 0.31
320 0.3
321 0.36
322 0.39
323 0.33
324 0.35
325 0.34
326 0.33
327 0.32
328 0.3
329 0.24
330 0.18
331 0.15
332 0.14
333 0.14
334 0.12
335 0.12
336 0.15
337 0.14
338 0.13
339 0.16
340 0.21
341 0.22
342 0.25
343 0.24
344 0.24
345 0.25
346 0.24
347 0.22
348 0.23
349 0.28
350 0.28
351 0.3
352 0.32
353 0.34
354 0.36
355 0.37
356 0.31
357 0.31
358 0.32
359 0.31
360 0.27
361 0.25
362 0.23
363 0.21
364 0.19
365 0.14
366 0.1
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.1
371 0.14
372 0.16
373 0.17
374 0.17
375 0.2
376 0.22
377 0.28
378 0.29
379 0.33
380 0.41
381 0.44
382 0.51
383 0.53
384 0.54
385 0.47
386 0.46
387 0.43
388 0.42
389 0.37
390 0.31
391 0.31
392 0.29
393 0.29
394 0.31
395 0.27
396 0.2
397 0.21
398 0.23
399 0.21
400 0.26
401 0.27
402 0.31
403 0.3
404 0.29
405 0.29
406 0.27
407 0.24
408 0.21
409 0.19
410 0.14
411 0.17
412 0.2
413 0.18
414 0.19
415 0.2
416 0.17
417 0.2
418 0.21
419 0.19
420 0.16
421 0.16