FuNGI

A0A317SMY1

Protein Details

Accession

A0A317SMY1

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
220-240	GSEQDKKSKKSKKSSNASGPD	Hydrophilic
276-310	ASSDDSKKVKKPKKAKKTKRAKKAKKAKNAKDSSS	Basic
345-371	SSSESDPDKDRKRRKGKGAGKKVSKET	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
227-231	SKKSK
282-305	KKVKKPKKAKKTKRAKKAKKAKNA
353-374	KDRKRRKGKGAGKKVSKETDRE
382-386	NKRKR
481-486	KEKRRR

Subcellular Location(s)

nucl 12.5, mito_nucl 11.999, mito 10, cyto_nucl 9.166, cyto_mito 7.499

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MAKKSKKASPPAPLLVALVRQFLKDSGFKSTLKIFEVESVSSGTKPEELKNGAPNLKTIFEEWTSKEEEAEDSDSSSAADDEQSSSGESSDDSEDDGDDDDEKASDNEKEKEKGGEEEVTSSSDTVVGDKEKHSESNSSDSDSSGSSDSSDGEKEKDKKKSPSSSHSDSDSGKSDSGKSSSSLPSSSSSSSQAVEEDRGSKGSSDSSSSSSSLSSSSSSGSEQDKKSKKSKKSSNASGPDSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSSASSDDSKKVKKPKKAKKTKRAKKAKKAKNAKDSSSSDSDSSSSPSSSSSSSSPSSSSSSSSSSSSSSSGSSSESDPDKDRKRRKGKGAGKKVSKETDREVPANPSTNKRKRGDDVPNGDAKRSKQEASGSFRGSSATSASSSDGGQKNKMEFIPNKRFSRIEHEKILYADECVKDNTFEALRLPGNHYAVRAHQDLIVTKGKGFTKEKRRRGGPIEVEQSTFRQILSSSIIRVGYGVFLSPGNGLNVCSLCGLYHLV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.54
2	0.45
3	0.41
4	0.32
5	0.28
6	0.23
7	0.21
8	0.22
9	0.21
10	0.23
11	0.23
12	0.23
13	0.27
14	0.3
15	0.3
16	0.33
17	0.38
18	0.37
19	0.35
20	0.34
21	0.27
22	0.29
23	0.31
24	0.28
25	0.23
26	0.23
27	0.21
28	0.21
29	0.2
30	0.15
31	0.17
32	0.19
33	0.21
34	0.25
35	0.29
36	0.32
37	0.38
38	0.45
39	0.46
40	0.44
41	0.44
42	0.39
43	0.37
44	0.34
45	0.28
46	0.25
47	0.23
48	0.27
49	0.26
50	0.27
51	0.29
52	0.28
53	0.27
54	0.23
55	0.22
56	0.21
57	0.22
58	0.19
59	0.16
60	0.16
61	0.15
62	0.14
63	0.13
64	0.1
65	0.07
66	0.07
67	0.07
68	0.09
69	0.09
70	0.1
71	0.1
72	0.11
73	0.1
74	0.1
75	0.09
76	0.1
77	0.11
78	0.1
79	0.1
80	0.1
81	0.1
82	0.1
83	0.11
84	0.09
85	0.08
86	0.09
87	0.08
88	0.08
89	0.09
90	0.09
91	0.1
92	0.13
93	0.17
94	0.22
95	0.27
96	0.29
97	0.3
98	0.33
99	0.33
100	0.32
101	0.31
102	0.29
103	0.25
104	0.26
105	0.25
106	0.22
107	0.21
108	0.18
109	0.14
110	0.11
111	0.11
112	0.09
113	0.1
114	0.1
115	0.12
116	0.13
117	0.16
118	0.17
119	0.19
120	0.2
121	0.23
122	0.24
123	0.3
124	0.3
125	0.3
126	0.28
127	0.26
128	0.25
129	0.21
130	0.2
131	0.13
132	0.12
133	0.09
134	0.09
135	0.1
136	0.1
137	0.12
138	0.11
139	0.13
140	0.2
141	0.26
142	0.34
143	0.42
144	0.48
145	0.55
146	0.63
147	0.71
148	0.7
149	0.73
150	0.74
151	0.71
152	0.66
153	0.61
154	0.55
155	0.47
156	0.42
157	0.36
158	0.3
159	0.24
160	0.22
161	0.21
162	0.2
163	0.2
164	0.18
165	0.15
166	0.18
167	0.19
168	0.2
169	0.19
170	0.18
171	0.19
172	0.2
173	0.21
174	0.18
175	0.18
176	0.18
177	0.18
178	0.16
179	0.15
180	0.14
181	0.14
182	0.13
183	0.13
184	0.12
185	0.12
186	0.12
187	0.12
188	0.11
189	0.12
190	0.11
191	0.12
192	0.13
193	0.15
194	0.17
195	0.17
196	0.16
197	0.14
198	0.14
199	0.12
200	0.11
201	0.09
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.11
207	0.14
208	0.2
209	0.21
210	0.3
211	0.36
212	0.4
213	0.49
214	0.55
215	0.6
216	0.65
217	0.73
218	0.74
219	0.77
220	0.81
221	0.82
222	0.8
223	0.75
224	0.66
225	0.57
226	0.48
227	0.4
228	0.31
229	0.21
230	0.16
231	0.13
232	0.12
233	0.11
234	0.11
235	0.12
236	0.12
237	0.14
238	0.13
239	0.14
240	0.15
241	0.15
242	0.15
243	0.13
244	0.14
245	0.14
246	0.13
247	0.12
248	0.12
249	0.13
250	0.13
251	0.14
252	0.14
253	0.15
254	0.15
255	0.15
256	0.15
257	0.13
258	0.13
259	0.12
260	0.11
261	0.1
262	0.09
263	0.1
264	0.12
265	0.14
266	0.17
267	0.21
268	0.23
269	0.28
270	0.38
271	0.44
272	0.5
273	0.58
274	0.65
275	0.72
276	0.81
277	0.87
278	0.87
279	0.92
280	0.92
281	0.92
282	0.93
283	0.92
284	0.92
285	0.92
286	0.91
287	0.9
288	0.91
289	0.9
290	0.89
291	0.84
292	0.76
293	0.73
294	0.67
295	0.61
296	0.54
297	0.46
298	0.35
299	0.3
300	0.28
301	0.2
302	0.19
303	0.15
304	0.11
305	0.1
306	0.11
307	0.11
308	0.11
309	0.12
310	0.11
311	0.13
312	0.15
313	0.15
314	0.15
315	0.15
316	0.17
317	0.15
318	0.16
319	0.14
320	0.15
321	0.15
322	0.15
323	0.15
324	0.13
325	0.14
326	0.13
327	0.12
328	0.11
329	0.1
330	0.1
331	0.11
332	0.11
333	0.11
334	0.14
335	0.15
336	0.16
337	0.19
338	0.27
339	0.35
340	0.43
341	0.51
342	0.59
343	0.68
344	0.75
345	0.81
346	0.84
347	0.85
348	0.87
349	0.89
350	0.88
351	0.86
352	0.83
353	0.78
354	0.75
355	0.68
356	0.61
357	0.54
358	0.53
359	0.49
360	0.45
361	0.41
362	0.39
363	0.38
364	0.41
365	0.39
366	0.39
367	0.45
368	0.52
369	0.59
370	0.57
371	0.61
372	0.58
373	0.66
374	0.68
375	0.67
376	0.66
377	0.62
378	0.66
379	0.6
380	0.57
381	0.5
382	0.42
383	0.4
384	0.37
385	0.33
386	0.29
387	0.35
388	0.41
389	0.46
390	0.5
391	0.44
392	0.41
393	0.4
394	0.37
395	0.31
396	0.25
397	0.18
398	0.13
399	0.11
400	0.12
401	0.13
402	0.13
403	0.12
404	0.19
405	0.23
406	0.23
407	0.26
408	0.28
409	0.29
410	0.32
411	0.33
412	0.33
413	0.34
414	0.43
415	0.5
416	0.56
417	0.58
418	0.57
419	0.57
420	0.53
421	0.57
422	0.57
423	0.52
424	0.52
425	0.51
426	0.5
427	0.49
428	0.49
429	0.39
430	0.31
431	0.29
432	0.22
433	0.21
434	0.21
435	0.21
436	0.18
437	0.19
438	0.21
439	0.17
440	0.16
441	0.16
442	0.18
443	0.2
444	0.21
445	0.25
446	0.25
447	0.28
448	0.28
449	0.28
450	0.26
451	0.28
452	0.31
453	0.28
454	0.24
455	0.23
456	0.24
457	0.25
458	0.27
459	0.3
460	0.25
461	0.24
462	0.29
463	0.3
464	0.35
465	0.39
466	0.44
467	0.49
468	0.6
469	0.68
470	0.73
471	0.76
472	0.77
473	0.78
474	0.79
475	0.76
476	0.75
477	0.74
478	0.65
479	0.62
480	0.55
481	0.49
482	0.42
483	0.34
484	0.24
485	0.17
486	0.16
487	0.17
488	0.21
489	0.22
490	0.2
491	0.23
492	0.23
493	0.21
494	0.21
495	0.19
496	0.14
497	0.12
498	0.11
499	0.09
500	0.09
501	0.1
502	0.11
503	0.12
504	0.12
505	0.12
506	0.13
507	0.15
508	0.16
509	0.15
510	0.15
511	0.13
512	0.12

A0A317SMY1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer